MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029 plasmid pRSPH01

Total Repeats: 393

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009040	GCCC	2	8	5020	5027	0 %	0 %	25 %	75 %	126464807
2	NC_009040	GCCA	2	8	5495	5502	25 %	0 %	25 %	50 %	126464807
3	NC_009040	CCGG	2	8	5681	5688	0 %	0 %	50 %	50 %	126464807
4	NC_009040	GCCC	2	8	6001	6008	0 %	0 %	25 %	75 %	126464807
5	NC_009040	GGTC	2	8	6306	6313	0 %	25 %	50 %	25 %	126464807
6	NC_009040	GGCC	2	8	6355	6362	0 %	0 %	50 %	50 %	126464807
7	NC_009040	CCCG	2	8	6419	6426	0 %	0 %	25 %	75 %	126464807
8	NC_009040	CGCC	2	8	6766	6773	0 %	0 %	25 %	75 %	126464807
9	NC_009040	GGGA	2	8	6827	6834	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009040	CGCC	2	8	6840	6847	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11	NC_009040	GCGG	2	8	7192	7199	0 %	0 %	75 %	25 %	126464808
12	NC_009040	CCGG	2	8	7295	7302	0 %	0 %	50 %	50 %	126464808
13	NC_009040	TCGC	2	8	7972	7979	0 %	25 %	25 %	50 %	126464808
14	NC_009040	GCCC	2	8	7986	7993	0 %	0 %	25 %	75 %	126464808
15	NC_009040	GCAG	2	8	8033	8040	25 %	0 %	50 %	25 %	126464808
16	NC_009040	CGGG	2	8	8190	8197	0 %	0 %	75 %	25 %	126464808
17	NC_009040	CGCC	2	8	8319	8326	0 %	0 %	25 %	75 %	126464808
18	NC_009040	CGGC	2	8	9600	9607	0 %	0 %	50 %	50 %	126464809
19	NC_009040	GGGC	2	8	9962	9969	0 %	0 %	75 %	25 %	126464809
20	NC_009040	CGCC	2	8	9985	9992	0 %	0 %	25 %	75 %	126464809
21	NC_009040	GGGC	2	8	10022	10029	0 %	0 %	75 %	25 %	126464809
22	NC_009040	GCGG	2	8	10073	10080	0 %	0 %	75 %	25 %	126464809
23	NC_009040	CCCG	2	8	10175	10182	0 %	0 %	25 %	75 %	126464809
24	NC_009040	GCCG	2	8	10284	10291	0 %	0 %	50 %	50 %	126464809
25	NC_009040	TCCG	2	8	10686	10693	0 %	25 %	25 %	50 %	126464810
26	NC_009040	CTCG	2	8	10885	10892	0 %	25 %	25 %	50 %	126464810
27	NC_009040	GACG	2	8	10940	10947	25 %	0 %	50 %	25 %	126464810
28	NC_009040	CGGC	2	8	10973	10980	0 %	0 %	50 %	50 %	126464810
29	NC_009040	GCGA	2	8	11122	11129	25 %	0 %	50 %	25 %	126464811
30	NC_009040	GCCC	2	8	11306	11313	0 %	0 %	25 %	75 %	126464811
31	NC_009040	CGCC	2	8	11561	11568	0 %	0 %	25 %	75 %	126464811
32	NC_009040	GGTC	2	8	11579	11586	0 %	25 %	50 %	25 %	126464811
33	NC_009040	GCGG	2	8	12239	12246	0 %	0 %	75 %	25 %	126464812
34	NC_009040	TCGC	2	8	12288	12295	0 %	25 %	25 %	50 %	126464812
35	NC_009040	CGGC	2	8	12350	12357	0 %	0 %	50 %	50 %	126464812
36	NC_009040	CGCC	2	8	12589	12596	0 %	0 %	25 %	75 %	126464812
37	NC_009040	GCCG	2	8	12755	12762	0 %	0 %	50 %	50 %	126464812
38	NC_009040	GTCG	2	8	12795	12802	0 %	25 %	50 %	25 %	126464812
39	NC_009040	GCCG	2	8	13352	13359	0 %	0 %	50 %	50 %	126464813
40	NC_009040	GCCC	2	8	13446	13453	0 %	0 %	25 %	75 %	126464813
41	NC_009040	CGGG	2	8	13641	13648	0 %	0 %	75 %	25 %	126464813
42	NC_009040	CCGT	2	8	13836	13843	0 %	25 %	25 %	50 %	126464813
43	NC_009040	CGGT	2	8	14021	14028	0 %	25 %	50 %	25 %	126464813
44	NC_009040	GGCC	2	8	15000	15007	0 %	0 %	50 %	50 %	126464815
45	NC_009040	AGGC	2	8	15178	15185	25 %	0 %	50 %	25 %	126464815
46	NC_009040	GCCC	2	8	15212	15219	0 %	0 %	25 %	75 %	126464815
47	NC_009040	GTCG	2	8	15453	15460	0 %	25 %	50 %	25 %	126464815
48	NC_009040	CGGT	2	8	15927	15934	0 %	25 %	50 %	25 %	126464816
49	NC_009040	CCCA	2	8	16434	16441	25 %	0 %	0 %	75 %	126464816
50	NC_009040	GCGG	2	8	16448	16455	0 %	0 %	75 %	25 %	126464816
51	NC_009040	TCGA	2	8	16512	16519	25 %	25 %	25 %	25 %	126464816
52	NC_009040	GGTG	2	8	16567	16574	0 %	25 %	75 %	0 %	126464816
53	NC_009040	AGGC	2	8	16665	16672	25 %	0 %	50 %	25 %	126464816
54	NC_009040	GGCG	2	8	17020	17027	0 %	0 %	75 %	25 %	126464817
55	NC_009040	GATC	2	8	17224	17231	25 %	25 %	25 %	25 %	126464817
56	NC_009040	GCCA	2	8	17433	17440	25 %	0 %	25 %	50 %	126464818
57	NC_009040	CCCG	3	12	17740	17751	0 %	0 %	25 %	75 %	126464818
58	NC_009040	GGCG	2	8	18169	18176	0 %	0 %	75 %	25 %	126464818
59	NC_009040	CGCC	2	8	18978	18985	0 %	0 %	25 %	75 %	126464819
60	NC_009040	GGTG	2	8	19072	19079	0 %	25 %	75 %	0 %	126464819
61	NC_009040	CGAG	2	8	19279	19286	25 %	0 %	50 %	25 %	126464819
62	NC_009040	CCGC	2	8	19430	19437	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
63	NC_009040	CCGG	2	8	19491	19498	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009040	CGTC	2	8	19687	19694	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009040	GCAG	2	8	19884	19891	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009040	GCCC	2	8	20115	20122	0 %	0 %	25 %	75 %	126464820
67	NC_009040	GATC	2	8	20629	20636	25 %	25 %	25 %	25 %	126464820
68	NC_009040	TCGA	2	8	21149	21156	25 %	25 %	25 %	25 %	126464820
69	NC_009040	GCCC	2	8	21755	21762	0 %	0 %	25 %	75 %	126464821
70	NC_009040	GGCT	2	8	21888	21895	0 %	25 %	50 %	25 %	126464821
71	NC_009040	GCCG	2	8	22105	22112	0 %	0 %	50 %	50 %	126464821
72	NC_009040	GGCC	2	8	22163	22170	0 %	0 %	50 %	50 %	126464821
73	NC_009040	CGTC	2	8	22527	22534	0 %	25 %	25 %	50 %	126464821
74	NC_009040	GAGC	2	8	22900	22907	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_009040	GCTC	2	8	23053	23060	0 %	25 %	25 %	50 %	126464822
76	NC_009040	GCCC	2	8	23723	23730	0 %	0 %	25 %	75 %	126464822
77	NC_009040	CGTT	2	8	24223	24230	0 %	50 %	25 %	25 %	126464823
78	NC_009040	GCCC	2	8	24809	24816	0 %	0 %	25 %	75 %	126464823
79	NC_009040	CGCC	2	8	25058	25065	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
80	NC_009040	GCCG	2	8	25104	25111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_009040	CGGG	2	8	25408	25415	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
82	NC_009040	GCCG	2	8	25419	25426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_009040	GACG	2	8	25688	25695	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_009040	CGGT	2	8	25769	25776	0 %	25 %	50 %	25 %	126464824
85	NC_009040	TCCT	2	8	25889	25896	0 %	50 %	0 %	50 %	126464824
86	NC_009040	TGTC	2	8	26452	26459	0 %	50 %	25 %	25 %	126464824
87	NC_009040	TGAA	2	8	26505	26512	50 %	25 %	25 %	0 %	126464824
88	NC_009040	CATT	2	8	26566	26573	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_009040	GCCC	2	8	26929	26936	0 %	0 %	25 %	75 %	126464825
90	NC_009040	CGAG	2	8	27666	27673	25 %	0 %	50 %	25 %	126464825
91	NC_009040	GCCC	2	8	28169	28176	0 %	0 %	25 %	75 %	126464825
92	NC_009040	ATCT	2	8	29228	29235	25 %	50 %	0 %	25 %	126464826
93	NC_009040	TGCC	2	8	29395	29402	0 %	25 %	25 %	50 %	126464826
94	NC_009040	CCTG	2	8	29625	29632	0 %	25 %	25 %	50 %	126464826
95	NC_009040	CGCC	2	8	29818	29825	0 %	0 %	25 %	75 %	126464826
96	NC_009040	GGGC	2	8	30610	30617	0 %	0 %	75 %	25 %	126464827
97	NC_009040	GGTG	2	8	30929	30936	0 %	25 %	75 %	0 %	126464827
98	NC_009040	TCGG	2	8	31216	31223	0 %	25 %	50 %	25 %	126464827
99	NC_009040	GCCC	2	8	31251	31258	0 %	0 %	25 %	75 %	126464827
100	NC_009040	GGGC	2	8	31321	31328	0 %	0 %	75 %	25 %	126464827
101	NC_009040	CTGG	2	8	31366	31373	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_009040	GGGC	2	8	31378	31385	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
103	NC_009040	GGGC	2	8	31429	31436	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
104	NC_009040	GGCA	2	8	31511	31518	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_009040	CTTC	2	8	32538	32545	0 %	50 %	0 %	50 %	126464828
106	NC_009040	GCGG	2	8	32574	32581	0 %	0 %	75 %	25 %	126464828
107	NC_009040	CGGG	2	8	32946	32953	0 %	0 %	75 %	25 %	126464828
108	NC_009040	GCCC	2	8	33262	33269	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
109	NC_009040	CGGC	2	8	33511	33518	0 %	0 %	50 %	50 %	126464829
110	NC_009040	ATCG	2	8	33863	33870	25 %	25 %	25 %	25 %	126464829
111	NC_009040	CGGG	2	8	33934	33941	0 %	0 %	75 %	25 %	126464829
112	NC_009040	GGCG	2	8	34202	34209	0 %	0 %	75 %	25 %	126464829
113	NC_009040	CGGC	2	8	34384	34391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_009040	CGGT	2	8	35030	35037	0 %	25 %	50 %	25 %	126464830
115	NC_009040	GGCA	2	8	35165	35172	25 %	0 %	50 %	25 %	126464830
116	NC_009040	CGAC	2	8	35213	35220	25 %	0 %	25 %	50 %	126464830
117	NC_009040	CGCC	2	8	35404	35411	0 %	0 %	25 %	75 %	126464830
118	NC_009040	CCTG	2	8	35453	35460	0 %	25 %	25 %	50 %	126464830
119	NC_009040	GACG	2	8	36123	36130	25 %	0 %	50 %	25 %	126464831
120	NC_009040	GCAA	2	8	36252	36259	50 %	0 %	25 %	25 %	126464831
121	NC_009040	GAGC	2	8	36470	36477	25 %	0 %	50 %	25 %	126464831
122	NC_009040	TTCG	2	8	36848	36855	0 %	50 %	25 %	25 %	126464832
123	NC_009040	CACG	2	8	36955	36962	25 %	0 %	25 %	50 %	126464832
124	NC_009040	CGAG	2	8	37039	37046	25 %	0 %	50 %	25 %	126464832
125	NC_009040	TGCA	2	8	37358	37365	25 %	25 %	25 %	25 %	126464832
126	NC_009040	CGGT	2	8	37719	37726	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_009040	GCGG	2	8	37798	37805	0 %	0 %	75 %	25 %	126464833
128	NC_009040	CGCC	2	8	38470	38477	0 %	0 %	25 %	75 %	126464833
129	NC_009040	GCCG	2	8	38705	38712	0 %	0 %	50 %	50 %	126464833
130	NC_009040	GGGC	2	8	38792	38799	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
131	NC_009040	GGGC	2	8	38817	38824	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
132	NC_009040	CGAC	2	8	38841	38848	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_009040	CCCG	2	8	38901	38908	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
134	NC_009040	TCGC	2	8	39094	39101	0 %	25 %	25 %	50 %	126464834
135	NC_009040	ACGA	2	8	39163	39170	50 %	0 %	25 %	25 %	126464834
136	NC_009040	GGGC	2	8	39494	39501	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
137	NC_009040	GCCC	2	8	39900	39907	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
138	NC_009040	GCCC	2	8	40180	40187	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
139	NC_009040	GAGG	2	8	40213	40220	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009040	CTCC	2	8	40756	40763	0 %	25 %	0 %	75 %	126464835
141	NC_009040	TCGG	2	8	41510	41517	0 %	25 %	50 %	25 %	126464835
142	NC_009040	GCTC	2	8	41982	41989	0 %	25 %	25 %	50 %	126464835
143	NC_009040	CGCC	2	8	42556	42563	0 %	0 %	25 %	75 %	126464837
144	NC_009040	CCCG	2	8	42578	42585	0 %	0 %	25 %	75 %	126464837
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.