MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029 plasmid pRSPH01

Total Repeats: 3260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009040	CGA	2	6	33635	33640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464829
1002	NC_009040	CGG	2	6	33650	33655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464829
1003	NC_009040	CGA	2	6	33725	33730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464829
1004	NC_009040	GGCGG	2	10	33738	33747	0 %	0 %	80 %	20 %	126464829
1005	NC_009040	CGGCT	2	10	33786	33795	0 %	20 %	40 %	40 %	126464829
1006	NC_009040	ATCG	2	8	33863	33870	25 %	25 %	25 %	25 %	126464829
1007	NC_009040	CGGG	2	8	33934	33941	0 %	0 %	75 %	25 %	126464829
1008	NC_009040	GGGGC	3	15	33962	33976	0 %	0 %	80 %	20 %	126464829
1009	NC_009040	TGC	2	6	33982	33987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464829
1010	NC_009040	CGG	2	6	34016	34021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464829
1011	NC_009040	CTG	2	6	34035	34040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464829
1012	NC_009040	CGG	2	6	34043	34048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464829
1013	NC_009040	TGG	2	6	34093	34098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126464829
1014	NC_009040	GCGGG	2	10	34099	34108	0 %	0 %	80 %	20 %	126464829
1015	NC_009040	CGG	4	12	34124	34135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464829
1016	NC_009040	GGCG	2	8	34202	34209	0 %	0 %	75 %	25 %	126464829
1017	NC_009040	TCC	2	6	34338	34343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126464829
1018	NC_009040	CGA	2	6	34358	34363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464829
1019	NC_009040	GCC	2	6	34378	34383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_009040	CGGC	2	8	34384	34391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_009040	GCG	2	6	34425	34430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_009040	GAC	2	6	34506	34511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464830
1023	NC_009040	CCCTCG	2	12	34532	34543	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	126464830
1024	NC_009040	GGC	2	6	34557	34562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464830
1025	NC_009040	CGGCCC	2	12	34578	34589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464830
1026	NC_009040	CGC	3	9	34617	34625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464830
1027	NC_009040	CG	3	6	34654	34659	0 %	0 %	50 %	50 %	126464830
1028	NC_009040	CCT	2	6	34685	34690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126464830
1029	NC_009040	TGA	2	6	34694	34699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126464830
1030	NC_009040	TCG	2	6	34796	34801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464830
1031	NC_009040	CG	3	6	34800	34805	0 %	0 %	50 %	50 %	126464830
1032	NC_009040	GCC	2	6	34897	34902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464830
1033	NC_009040	GGC	2	6	34928	34933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464830
1034	NC_009040	CGGT	2	8	35030	35037	0 %	25 %	50 %	25 %	126464830
1035	NC_009040	AT	3	6	35079	35084	50 %	50 %	0 %	0 %	126464830
1036	NC_009040	AGG	2	6	35118	35123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126464830
1037	NC_009040	GGCA	2	8	35165	35172	25 %	0 %	50 %	25 %	126464830
1038	NC_009040	CGAC	2	8	35213	35220	25 %	0 %	25 %	50 %	126464830
1039	NC_009040	TGC	2	6	35327	35332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464830
1040	NC_009040	GTCCGG	2	12	35353	35364	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	126464830
1041	NC_009040	CG	3	6	35381	35386	0 %	0 %	50 %	50 %	126464830
1042	NC_009040	CGCC	2	8	35404	35411	0 %	0 %	25 %	75 %	126464830
1043	NC_009040	CCTG	2	8	35453	35460	0 %	25 %	25 %	50 %	126464830
1044	NC_009040	CCG	2	6	35499	35504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464830
1045	NC_009040	CGG	2	6	35558	35563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464830
1046	NC_009040	G	6	6	35643	35648	0 %	0 %	100 %	0 %	126464830
1047	NC_009040	CTA	2	6	35712	35717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464830
1048	NC_009040	GTT	2	6	35835	35840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_009040	TTCTGC	2	12	35861	35872	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_009040	AGA	2	6	35873	35878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_009040	CG	3	6	36055	36060	0 %	0 %	50 %	50 %	126464831
1052	NC_009040	GACG	2	8	36123	36130	25 %	0 %	50 %	25 %	126464831
1053	NC_009040	GCG	2	6	36221	36226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464831
1054	NC_009040	GGC	2	6	36230	36235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464831
1055	NC_009040	GCG	2	6	36240	36245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464831
1056	NC_009040	GCAA	2	8	36252	36259	50 %	0 %	25 %	25 %	126464831
1057	NC_009040	GCC	2	6	36293	36298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464831
1058	NC_009040	ACGGA	2	10	36345	36354	40 %	0 %	40 %	20 %	126464831
1059	NC_009040	GGC	2	6	36398	36403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464831
1060	NC_009040	GAGC	2	8	36470	36477	25 %	0 %	50 %	25 %	126464831
1061	NC_009040	CG	3	6	36479	36484	0 %	0 %	50 %	50 %	126464831
1062	NC_009040	GCCAC	2	10	36505	36514	20 %	0 %	20 %	60 %	126464831
1063	NC_009040	TCC	2	6	36622	36627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126464832
1064	NC_009040	GAA	2	6	36667	36672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126464832
1065	NC_009040	CT	3	6	36682	36687	0 %	50 %	0 %	50 %	126464832
1066	NC_009040	GTC	2	6	36755	36760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464832
1067	NC_009040	AAG	2	6	36828	36833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126464832
1068	NC_009040	TTCG	2	8	36848	36855	0 %	50 %	25 %	25 %	126464832
1069	NC_009040	CGA	2	6	36943	36948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464832
1070	NC_009040	CACG	2	8	36955	36962	25 %	0 %	25 %	50 %	126464832
1071	NC_009040	GCA	3	9	37012	37020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464832
1072	NC_009040	CGAG	2	8	37039	37046	25 %	0 %	50 %	25 %	126464832
1073	NC_009040	CGC	2	6	37091	37096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464832
1074	NC_009040	CCG	2	6	37122	37127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464832
1075	NC_009040	GCC	2	6	37245	37250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464832
1076	NC_009040	CGATC	2	10	37256	37265	20 %	20 %	20 %	40 %	126464832
1077	NC_009040	TGCA	2	8	37358	37365	25 %	25 %	25 %	25 %	126464832
1078	NC_009040	TTC	2	6	37376	37381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126464832
1079	NC_009040	GA	3	6	37395	37400	50 %	0 %	50 %	0 %	126464832
1080	NC_009040	CCG	2	6	37405	37410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464832
1081	NC_009040	TCA	2	6	37449	37454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464832
1082	NC_009040	CCA	2	6	37466	37471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126464832
1083	NC_009040	AGT	2	6	37525	37530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126464832
1084	NC_009040	CTT	2	6	37543	37548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126464832
1085	NC_009040	CG	3	6	37581	37586	0 %	0 %	50 %	50 %	126464832
1086	NC_009040	TGC	2	6	37663	37668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464832
1087	NC_009040	TC	3	6	37708	37713	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1088	NC_009040	CGGT	2	8	37719	37726	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1089	NC_009040	GCGG	2	8	37798	37805	0 %	0 %	75 %	25 %	126464833
1090	NC_009040	CG	3	6	37889	37894	0 %	0 %	50 %	50 %	126464833
1091	NC_009040	CTC	2	6	37907	37912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126464833
1092	NC_009040	CAG	2	6	37931	37936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464833
1093	NC_009040	TCC	2	6	37998	38003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126464833
1094	NC_009040	CCG	2	6	38008	38013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464833
1095	NC_009040	GCC	2	6	38021	38026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464833
1096	NC_009040	CG	3	6	38054	38059	0 %	0 %	50 %	50 %	126464833
1097	NC_009040	CGA	2	6	38143	38148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464833
1098	NC_009040	GCC	2	6	38170	38175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464833
1099	NC_009040	GAA	2	6	38195	38200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126464833
1100	NC_009040	CTT	2	6	38264	38269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126464833
1101	NC_009040	GAG	2	6	38349	38354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126464833
1102	NC_009040	CAT	2	6	38363	38368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464833
1103	NC_009040	GCC	2	6	38386	38391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464833
1104	NC_009040	GC	3	6	38442	38447	0 %	0 %	50 %	50 %	126464833
1105	NC_009040	CGCC	2	8	38470	38477	0 %	0 %	25 %	75 %	126464833
1106	NC_009040	GCA	3	9	38584	38592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464833
1107	NC_009040	GCC	2	6	38602	38607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464833
1108	NC_009040	CGT	2	6	38620	38625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464833
1109	NC_009040	CGT	2	6	38641	38646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464833
1110	NC_009040	CAG	2	6	38672	38677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464833
1111	NC_009040	GC	3	6	38681	38686	0 %	0 %	50 %	50 %	126464833
1112	NC_009040	GCCG	2	8	38705	38712	0 %	0 %	50 %	50 %	126464833
1113	NC_009040	GCG	2	6	38786	38791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_009040	GGGC	2	8	38792	38799	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1115	NC_009040	GGGC	2	8	38817	38824	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1116	NC_009040	CCGCGC	2	12	38827	38838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_009040	CGAC	2	8	38841	38848	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_009040	CG	3	6	38865	38870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_009040	CGA	2	6	38882	38887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_009040	CGC	2	6	38893	38898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_009040	CCCG	2	8	38901	38908	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1122	NC_009040	CGG	2	6	38941	38946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_009040	CGC	2	6	38952	38957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1124	NC_009040	GCT	2	6	38991	38996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_009040	GCC	2	6	39000	39005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_009040	GCG	2	6	39065	39070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126464834
1127	NC_009040	TCGC	2	8	39094	39101	0 %	25 %	25 %	50 %	126464834
1128	NC_009040	GAG	2	6	39117	39122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126464834
1129	NC_009040	CCA	2	6	39125	39130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126464834
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1262	NC_009040	CTCG	2	8	43647	43654	0 %	25 %	25 %	50 %	126464838
1263	NC_009040	CTG	2	6	43693	43698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464838
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1270	NC_009040	CTG	2	6	44099	44104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464840
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1372	NC_009040	CT	3	6	47917	47922	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1373	NC_009040	C	7	7	47942	47948	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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1375	NC_009040	A	8	8	48135	48142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1376	NC_009040	TGG	2	6	48176	48181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1379	NC_009040	TA	3	6	48411	48416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1380	NC_009040	TAC	2	6	48463	48468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1381	NC_009040	GCC	2	6	48511	48516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1382	NC_009040	AATT	2	8	48535	48542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1383	NC_009040	GGC	2	6	48554	48559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1384	NC_009040	GGA	2	6	48586	48591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1385	NC_009040	CGC	2	6	48619	48624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1386	NC_009040	GGCC	2	8	48750	48757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1387	NC_009040	TG	3	6	48763	48768	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1388	NC_009040	TG	4	8	48777	48784	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1389	NC_009040	GTC	2	6	48909	48914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464843
1390	NC_009040	TCG	2	6	48922	48927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464843
1391	NC_009040	CTTC	2	8	48939	48946	0 %	50 %	0 %	50 %	126464843
1392	NC_009040	GCAC	2	8	48972	48979	25 %	0 %	25 %	50 %	126464843
1393	NC_009040	AT	3	6	49023	49028	50 %	50 %	0 %	0 %	126464843
1394	NC_009040	GCC	3	9	49054	49062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464843
1395	NC_009040	GGCT	2	8	49073	49080	0 %	25 %	50 %	25 %	126464843
1396	NC_009040	GC	3	6	49161	49166	0 %	0 %	50 %	50 %	126464843
1397	NC_009040	GCC	2	6	49182	49187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126464843
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1403	NC_009040	CGG	2	6	49521	49526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1405	NC_009040	GGT	2	6	49576	49581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1406	NC_009040	CGG	2	6	49597	49602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1411	NC_009040	GCTG	2	8	49694	49701	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1412	NC_009040	CTC	2	6	49746	49751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1413	NC_009040	CTGG	2	8	49754	49761	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1414	NC_009040	CGGAGG	2	12	49765	49776	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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1417	NC_009040	AAT	2	6	49902	49907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1422	NC_009040	ATGA	2	8	50272	50279	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_009040	GAA	2	6	50374	50379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1424	NC_009040	GTA	2	6	50409	50414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1431	NC_009040	TGT	2	6	50952	50957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1440	NC_009040	CG	3	6	51553	51558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1441	NC_009040	CGT	2	6	51669	51674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464846
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1499	NC_009040	GAC	2	6	54334	54339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464846
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