MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 13919

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008435	CTCG	2	8	21	28	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008435	CGGA	2	8	458	465	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_008435	CGGT	2	8	586	593	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_008435	GCCG	2	8	1421	1428	0 %	0 %	50 %	50 %	115522031
5	NC_008435	CTCG	2	8	1528	1535	0 %	25 %	25 %	50 %	115522031
6	NC_008435	GCCC	2	8	2242	2249	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7	NC_008435	CGAC	2	8	2442	2449	25 %	0 %	25 %	50 %	115522032
8	NC_008435	CGGA	2	8	2550	2557	25 %	0 %	50 %	25 %	115522032
9	NC_008435	GCCG	2	8	2609	2616	0 %	0 %	50 %	50 %	115522032
10	NC_008435	ATCT	2	8	2780	2787	25 %	50 %	0 %	25 %	115522032
11	NC_008435	CAGC	2	8	4049	4056	25 %	0 %	25 %	50 %	115522033
12	NC_008435	TGGA	2	8	4284	4291	25 %	25 %	50 %	0 %	115522033
13	NC_008435	CGGC	2	8	4355	4362	0 %	0 %	50 %	50 %	115522033
14	NC_008435	CCCG	2	8	6463	6470	0 %	0 %	25 %	75 %	115522035
15	NC_008435	GGCC	2	8	6654	6661	0 %	0 %	50 %	50 %	115522035
16	NC_008435	GCCG	2	8	8668	8675	0 %	0 %	50 %	50 %	115522035
17	NC_008435	ACGC	2	8	8756	8763	25 %	0 %	25 %	50 %	115522035
18	NC_008435	TCGA	2	8	9276	9283	25 %	25 %	25 %	25 %	115522036
19	NC_008435	CGAT	2	8	9522	9529	25 %	25 %	25 %	25 %	115522036
20	NC_008435	GCCA	2	8	9687	9694	25 %	0 %	25 %	50 %	115522036
21	NC_008435	CCCG	2	8	10052	10059	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22	NC_008435	CGAT	2	8	10244	10251	25 %	25 %	25 %	25 %	115522037
23	NC_008435	GCCG	2	8	10339	10346	0 %	0 %	50 %	50 %	115522037
24	NC_008435	GCTG	2	8	10605	10612	0 %	25 %	50 %	25 %	115522037
25	NC_008435	GACC	2	8	10689	10696	25 %	0 %	25 %	50 %	115522037
26	NC_008435	GGCT	2	8	10775	10782	0 %	25 %	50 %	25 %	115522037
27	NC_008435	TCGA	2	8	11368	11375	25 %	25 %	25 %	25 %	115522038
28	NC_008435	CCGA	2	8	11681	11688	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_008435	GCCG	2	8	11955	11962	0 %	0 %	50 %	50 %	115522039
30	NC_008435	AATG	2	8	11982	11989	50 %	25 %	25 %	0 %	115522039
31	NC_008435	GATC	2	8	12274	12281	25 %	25 %	25 %	25 %	115522040
32	NC_008435	CGGC	2	8	12296	12303	0 %	0 %	50 %	50 %	115522040
33	NC_008435	AGCG	2	8	12974	12981	25 %	0 %	50 %	25 %	115522042
34	NC_008435	GCGG	2	8	14564	14571	0 %	0 %	75 %	25 %	115522042
35	NC_008435	CGAT	2	8	14634	14641	25 %	25 %	25 %	25 %	115522042
36	NC_008435	GGCC	2	8	15065	15072	0 %	0 %	50 %	50 %	115522043
37	NC_008435	GATG	2	8	15862	15869	25 %	25 %	50 %	0 %	115522044
38	NC_008435	AGCG	2	8	17254	17261	25 %	0 %	50 %	25 %	115522045
39	NC_008435	CGAG	2	8	17393	17400	25 %	0 %	50 %	25 %	115522045
40	NC_008435	GGTT	2	8	18044	18051	0 %	50 %	50 %	0 %	115522047
41	NC_008435	TCGG	2	8	18121	18128	0 %	25 %	50 %	25 %	115522047
42	NC_008435	CGAG	2	8	18497	18504	25 %	0 %	50 %	25 %	115522047
43	NC_008435	CGGC	2	8	18592	18599	0 %	0 %	50 %	50 %	115522047
44	NC_008435	CGAG	2	8	18968	18975	25 %	0 %	50 %	25 %	115522048
45	NC_008435	GGCC	2	8	19451	19458	0 %	0 %	50 %	50 %	115522048
46	NC_008435	CCGC	2	8	19526	19533	0 %	0 %	25 %	75 %	115522048
47	NC_008435	GCCG	2	8	20057	20064	0 %	0 %	50 %	50 %	115522048
48	NC_008435	GAGC	2	8	20599	20606	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_008435	GCCG	2	8	21551	21558	0 %	0 %	50 %	50 %	115522049
50	NC_008435	GTAA	2	8	21664	21671	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008435	CGGC	2	8	21958	21965	0 %	0 %	50 %	50 %	115522050
52	NC_008435	GCTT	2	8	21993	22000	0 %	50 %	25 %	25 %	115522050
53	NC_008435	GCGA	2	8	22627	22634	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_008435	CGAT	2	8	22693	22700	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_008435	TCGA	2	8	23232	23239	25 %	25 %	25 %	25 %	115522051
56	NC_008435	CCGC	2	8	23400	23407	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
57	NC_008435	CGGC	2	8	23418	23425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_008435	CGGC	2	8	23478	23485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008435	CGGC	2	8	23797	23804	0 %	0 %	50 %	50 %	115522052
60	NC_008435	CCGC	2	8	23938	23945	0 %	0 %	25 %	75 %	115522052
61	NC_008435	CCGC	2	8	24108	24115	0 %	0 %	25 %	75 %	115522052
62	NC_008435	TCCC	2	8	24289	24296	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
63	NC_008435	CATC	2	8	25648	25655	25 %	25 %	0 %	50 %	115522054
64	NC_008435	CGGT	2	8	27146	27153	0 %	25 %	50 %	25 %	115522054
65	NC_008435	GCAG	2	8	28407	28414	25 %	0 %	50 %	25 %	115522055
66	NC_008435	CCCG	2	8	28747	28754	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
67	NC_008435	TCGG	2	8	29185	29192	0 %	25 %	50 %	25 %	115522056
68	NC_008435	GATC	2	8	30092	30099	25 %	25 %	25 %	25 %	115522056
69	NC_008435	GGAA	2	8	30429	30436	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008435	TCCA	2	8	30486	30493	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_008435	GATG	2	8	31059	31066	25 %	25 %	50 %	0 %	115522057
72	NC_008435	GATC	2	8	31674	31681	25 %	25 %	25 %	25 %	115522057
73	NC_008435	AGCG	2	8	32057	32064	25 %	0 %	50 %	25 %	115522057
74	NC_008435	CAGC	2	8	32110	32117	25 %	0 %	25 %	50 %	115522057
75	NC_008435	CGGC	2	8	32216	32223	0 %	0 %	50 %	50 %	115522057
76	NC_008435	CGGT	2	8	32285	32292	0 %	25 %	50 %	25 %	115522057
77	NC_008435	CCGG	2	8	32494	32501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_008435	GGCG	2	8	32705	32712	0 %	0 %	75 %	25 %	115522058
79	NC_008435	CCCG	2	8	32931	32938	0 %	0 %	25 %	75 %	115522058
80	NC_008435	CACC	2	8	33333	33340	25 %	0 %	0 %	75 %	115522058
81	NC_008435	TCCA	2	8	33718	33725	25 %	25 %	0 %	50 %	115522058
82	NC_008435	GTCG	2	8	33774	33781	0 %	25 %	50 %	25 %	115522058
83	NC_008435	GCTG	2	8	34331	34338	0 %	25 %	50 %	25 %	115522059
84	NC_008435	GATC	2	8	34816	34823	25 %	25 %	25 %	25 %	115522060
85	NC_008435	GGCG	2	8	34889	34896	0 %	0 %	75 %	25 %	115522060
86	NC_008435	GTTC	2	8	34950	34957	0 %	50 %	25 %	25 %	115522060
87	NC_008435	CGGC	2	8	34988	34995	0 %	0 %	50 %	50 %	115522060
88	NC_008435	CGAG	2	8	35128	35135	25 %	0 %	50 %	25 %	115522060
89	NC_008435	CAGC	2	8	35198	35205	25 %	0 %	25 %	50 %	115522060
90	NC_008435	GGAT	2	8	35572	35579	25 %	25 %	50 %	0 %	115522061
91	NC_008435	GCGG	2	8	35782	35789	0 %	0 %	75 %	25 %	115522062
92	NC_008435	TCGG	2	8	36543	36550	0 %	25 %	50 %	25 %	115522063
93	NC_008435	GCCG	2	8	37076	37083	0 %	0 %	50 %	50 %	115522063
94	NC_008435	GCCG	2	8	37214	37221	0 %	0 %	50 %	50 %	115522063
95	NC_008435	TCGC	2	8	38254	38261	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_008435	TACC	2	8	38303	38310	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_008435	CGCC	2	8	38356	38363	0 %	0 %	25 %	75 %	115522064
98	NC_008435	GTGG	2	8	39047	39054	0 %	25 %	75 %	0 %	115522064
99	NC_008435	GTCG	2	8	39071	39078	0 %	25 %	50 %	25 %	115522064
100	NC_008435	CTTC	2	8	39292	39299	0 %	50 %	0 %	50 %	115522064
101	NC_008435	AGAA	2	8	40254	40261	75 %	0 %	25 %	0 %	115522065
102	NC_008435	GCGG	2	8	40658	40665	0 %	0 %	75 %	25 %	115522066
103	NC_008435	GATC	2	8	40998	41005	25 %	25 %	25 %	25 %	115522066
104	NC_008435	TCGG	2	8	41707	41714	0 %	25 %	50 %	25 %	115522067
105	NC_008435	CTGG	2	8	42524	42531	0 %	25 %	50 %	25 %	115522068
106	NC_008435	CGGT	2	8	42549	42556	0 %	25 %	50 %	25 %	115522068
107	NC_008435	CGCC	2	8	42595	42602	0 %	0 %	25 %	75 %	115522068
108	NC_008435	AGCA	2	8	43108	43115	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_008435	TCGG	2	8	43420	43427	0 %	25 %	50 %	25 %	115522069
110	NC_008435	AACC	2	8	44008	44015	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_008435	GCCG	2	8	44960	44967	0 %	0 %	50 %	50 %	115522070
112	NC_008435	CGAT	2	8	45100	45107	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_008435	TGCA	2	8	45413	45420	25 %	25 %	25 %	25 %	115522071
114	NC_008435	TCGC	2	8	45474	45481	0 %	25 %	25 %	50 %	115522071
115	NC_008435	CGAT	2	8	46067	46074	25 %	25 %	25 %	25 %	115522071
116	NC_008435	TGGC	2	8	46283	46290	0 %	25 %	50 %	25 %	115522071
117	NC_008435	CCGC	2	8	46566	46573	0 %	0 %	25 %	75 %	115522072
118	NC_008435	CGCC	2	8	46639	46646	0 %	0 %	25 %	75 %	115522072
119	NC_008435	CGGC	2	8	46872	46879	0 %	0 %	50 %	50 %	115522073
120	NC_008435	CAGG	2	8	48557	48564	25 %	0 %	50 %	25 %	115522075
121	NC_008435	GACC	2	8	49157	49164	25 %	0 %	25 %	50 %	115522075
122	NC_008435	CGCC	2	8	49577	49584	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
123	NC_008435	CGGC	2	8	49999	50006	0 %	0 %	50 %	50 %	115522076
124	NC_008435	GCCG	2	8	50334	50341	0 %	0 %	50 %	50 %	115522076
125	NC_008435	TCGA	2	8	50947	50954	25 %	25 %	25 %	25 %	115522076
126	NC_008435	TCAC	2	8	51461	51468	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_008435	GCCG	2	8	52113	52120	0 %	0 %	50 %	50 %	115522077
128	NC_008435	CGGC	2	8	52287	52294	0 %	0 %	50 %	50 %	115522077
129	NC_008435	CCGC	2	8	52627	52634	0 %	0 %	25 %	75 %	115522078
130	NC_008435	CGCC	2	8	52770	52777	0 %	0 %	25 %	75 %	115522078
131	NC_008435	CAAC	2	8	54226	54233	50 %	0 %	0 %	50 %	115522081
132	NC_008435	GCCA	2	8	55478	55485	25 %	0 %	25 %	50 %	115522083
133	NC_008435	CGGC	2	8	55787	55794	0 %	0 %	50 %	50 %	115522083
134	NC_008435	CGGC	2	8	55909	55916	0 %	0 %	50 %	50 %	115522083
135	NC_008435	GGCA	2	8	56033	56040	25 %	0 %	50 %	25 %	115522083
136	NC_008435	GCAG	2	8	56380	56387	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_008435	GAAC	2	8	56448	56455	50 %	0 %	25 %	25 %	115522084
138	NC_008435	TCAA	2	8	57203	57210	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_008435	GACG	2	8	57339	57346	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_008435	GACC	2	8	57595	57602	25 %	0 %	25 %	50 %	115522085
141	NC_008435	CGAG	2	8	57759	57766	25 %	0 %	50 %	25 %	115522085
142	NC_008435	CGAA	2	8	57816	57823	50 %	0 %	25 %	25 %	115522085
143	NC_008435	GCCG	2	8	58651	58658	0 %	0 %	50 %	50 %	115522086
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