MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 142158

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008435	CGGCCG	2	12	131317	131328	0 %	0 %	50 %	50 %	115522144
3502	NC_008435	TCGG	2	8	131331	131338	0 %	25 %	50 %	25 %	115522144
3503	NC_008435	TCG	2	6	131344	131349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522144
3504	NC_008435	CGG	2	6	131393	131398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522144
3505	NC_008435	CGC	2	6	131441	131446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522144
3506	NC_008435	GGC	2	6	131489	131494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522144
3507	NC_008435	CGG	2	6	131528	131533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522144
3508	NC_008435	GCCT	2	8	131547	131554	0 %	25 %	25 %	50 %	115522144
3509	NC_008435	CTG	2	6	131585	131590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522144
3510	NC_008435	GC	3	6	131614	131619	0 %	0 %	50 %	50 %	115522144
3511	NC_008435	CG	3	6	131635	131640	0 %	0 %	50 %	50 %	115522144
3512	NC_008435	GTG	2	6	131658	131663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522144
3513	NC_008435	CG	3	6	131718	131723	0 %	0 %	50 %	50 %	115522144
3514	NC_008435	CGC	2	6	131800	131805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522144
3515	NC_008435	GCC	2	6	131879	131884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3516	NC_008435	CCG	2	6	131946	131951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3517	NC_008435	GGCG	2	8	131990	131997	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3518	NC_008435	GCC	2	6	132107	132112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3519	NC_008435	TCA	2	6	132131	132136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522145
3520	NC_008435	CTG	2	6	132140	132145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522145
3521	NC_008435	GGC	2	6	132164	132169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522145
3522	NC_008435	TCT	2	6	132186	132191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522145
3523	NC_008435	GC	3	6	132198	132203	0 %	0 %	50 %	50 %	115522145
3524	NC_008435	GCC	2	6	132222	132227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522145
3525	NC_008435	TCG	2	6	132231	132236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522145
3526	NC_008435	TGA	2	6	132322	132327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522145
3527	NC_008435	GAA	2	6	132389	132394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522145
3528	NC_008435	GCC	2	6	132431	132436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522145
3529	NC_008435	CCG	2	6	132452	132457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522145
3530	NC_008435	GCA	2	6	132580	132585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522145
3531	NC_008435	CAG	2	6	132590	132595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522145
3532	NC_008435	GGT	2	6	132625	132630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522145
3533	NC_008435	GCA	2	6	132631	132636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522145
3534	NC_008435	GAT	2	6	132650	132655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522145
3535	NC_008435	CTT	2	6	132662	132667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522145
3536	NC_008435	CCG	3	9	133000	133008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522145
3537	NC_008435	GC	3	6	133047	133052	0 %	0 %	50 %	50 %	115522145
3538	NC_008435	CGT	2	6	133056	133061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522145
3539	NC_008435	CGG	3	9	133096	133104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522145
3540	NC_008435	GCA	2	6	133126	133131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522145
3541	NC_008435	GGTC	2	8	133243	133250	0 %	25 %	50 %	25 %	115522145
3542	NC_008435	GAA	2	6	133277	133282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522145
3543	NC_008435	TGA	2	6	133294	133299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522145
3544	NC_008435	GC	3	6	133315	133320	0 %	0 %	50 %	50 %	115522145
3545	NC_008435	CCGG	2	8	133357	133364	0 %	0 %	50 %	50 %	115522145
3546	NC_008435	GAA	2	6	133406	133411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522145
3547	NC_008435	TCC	2	6	133413	133418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522145
3548	NC_008435	CAA	2	6	133460	133465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522145
3549	NC_008435	CGT	2	6	133528	133533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522145
3550	NC_008435	CAGC	2	8	133534	133541	25 %	0 %	25 %	50 %	115522145
3551	NC_008435	CTTG	2	8	133576	133583	0 %	50 %	25 %	25 %	115522145
3552	NC_008435	GGCA	2	8	133655	133662	25 %	0 %	50 %	25 %	115522145
3553	NC_008435	CGA	2	6	133664	133669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522145
3554	NC_008435	TCGG	2	8	133728	133735	0 %	25 %	50 %	25 %	115522145
3555	NC_008435	GCCGA	2	10	133770	133779	20 %	0 %	40 %	40 %	115522145
3556	NC_008435	GCG	2	6	133853	133858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522145
3557	NC_008435	CCT	2	6	133873	133878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522145
3558	NC_008435	AGAT	2	8	133962	133969	50 %	25 %	25 %	0 %	115522145
3559	NC_008435	TCG	2	6	133977	133982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522145
3560	NC_008435	TCG	2	6	133995	134000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522145
3561	NC_008435	CGC	2	6	134005	134010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522145
3562	NC_008435	GGC	2	6	134030	134035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522145
3563	NC_008435	CCT	2	6	134077	134082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522145
3564	NC_008435	GCT	2	6	134089	134094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522145
3565	NC_008435	GC	3	6	134118	134123	0 %	0 %	50 %	50 %	115522145
3566	NC_008435	CGT	2	6	134134	134139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522145
3567	NC_008435	GC	3	6	134174	134179	0 %	0 %	50 %	50 %	115522145
3568	NC_008435	TCG	3	9	134181	134189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522145
3569	NC_008435	AGCGCC	2	12	134250	134261	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	115522145
3570	NC_008435	GGC	2	6	134270	134275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522145
3571	NC_008435	CGT	2	6	134281	134286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522145
3572	NC_008435	TCGC	2	8	134389	134396	0 %	25 %	25 %	50 %	115522145
3573	NC_008435	AGC	2	6	134406	134411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522145
3574	NC_008435	CG	3	6	134496	134501	0 %	0 %	50 %	50 %	115522145
3575	NC_008435	AGC	2	6	134508	134513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522145
3576	NC_008435	GTT	2	6	134525	134530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115522145
3577	NC_008435	GC	3	6	134555	134560	0 %	0 %	50 %	50 %	115522145
3578	NC_008435	GCG	2	6	134565	134570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522145
3579	NC_008435	CGC	2	6	134620	134625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522145
3580	NC_008435	TTG	2	6	134628	134633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115522145
3581	NC_008435	AGC	2	6	134682	134687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522145
3582	NC_008435	GC	3	6	134699	134704	0 %	0 %	50 %	50 %	115522145
3583	NC_008435	CGC	2	6	134741	134746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522145
3584	NC_008435	CGG	2	6	134788	134793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522145
3585	NC_008435	GCT	3	9	134803	134811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522145
3586	NC_008435	GAG	2	6	134819	134824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522145
3587	NC_008435	TCG	2	6	134874	134879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522145
3588	NC_008435	TGG	2	6	134913	134918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522145
3589	NC_008435	CTG	2	6	134930	134935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522145
3590	NC_008435	GCG	2	6	134953	134958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522145
3591	NC_008435	GGCT	2	8	134975	134982	0 %	25 %	50 %	25 %	115522145
3592	NC_008435	CG	3	6	135029	135034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3593	NC_008435	CCAT	2	8	135068	135075	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3594	NC_008435	TCG	2	6	135084	135089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_008435	AGC	2	6	135140	135145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_008435	CG	3	6	135290	135295	0 %	0 %	50 %	50 %	115522146
3597	NC_008435	GGC	2	6	135334	135339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522146
3598	NC_008435	GCT	2	6	135369	135374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522146
3599	NC_008435	GGC	2	6	135400	135405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522146
3600	NC_008435	CG	3	6	135433	135438	0 %	0 %	50 %	50 %	115522146
3601	NC_008435	GCC	2	6	135456	135461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522146
3602	NC_008435	CGG	3	9	135492	135500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522146
3603	NC_008435	GGC	2	6	135523	135528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522146
3604	NC_008435	CGG	2	6	135531	135536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522146
3605	NC_008435	CGG	2	6	135546	135551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522146
3606	NC_008435	CGC	2	6	135552	135557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522146
3607	NC_008435	GCA	2	6	135560	135565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522146
3608	NC_008435	GCG	2	6	135572	135577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522146
3609	NC_008435	CTG	2	6	135589	135594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522146
3610	NC_008435	CAG	2	6	135604	135609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522146
3611	NC_008435	CAA	2	6	135654	135659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522146
3612	NC_008435	GC	3	6	135686	135691	0 %	0 %	50 %	50 %	115522146
3613	NC_008435	GTC	2	6	135717	135722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522146
3614	NC_008435	GCT	2	6	135747	135752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522146
3615	NC_008435	CAGC	2	8	135762	135769	25 %	0 %	25 %	50 %	115522146
3616	NC_008435	GATC	2	8	135783	135790	25 %	25 %	25 %	25 %	115522146
3617	NC_008435	CCGA	2	8	135814	135821	25 %	0 %	25 %	50 %	115522146
3618	NC_008435	CGA	3	9	135819	135827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522146
3619	NC_008435	CG	3	6	135862	135867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3620	NC_008435	GGC	2	6	135877	135882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_008435	GC	3	6	135881	135886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3622	NC_008435	GAC	2	6	135930	135935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_008435	GCCCG	2	10	136005	136014	0 %	0 %	40 %	60 %	115522147
3624	NC_008435	CAC	2	6	136038	136043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522147
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3626	NC_008435	TCG	2	6	136067	136072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522147
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3628	NC_008435	CGA	2	6	136136	136141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522147
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3636	NC_008435	CGA	2	6	136530	136535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522148
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3653	NC_008435	GCA	2	6	137201	137206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3655	NC_008435	TCG	2	6	137251	137256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522149
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3737	NC_008435	GC	3	6	140264	140269	0 %	0 %	50 %	50 %	115522151
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3740	NC_008435	CCG	2	6	140375	140380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3741	NC_008435	GAC	2	6	140431	140436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3742	NC_008435	TGA	2	6	140500	140505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522152
3743	NC_008435	CGC	2	6	140775	140780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522152
3744	NC_008435	GCT	3	9	140804	140812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522152
3745	NC_008435	A	6	6	140936	140941	100 %	0 %	0 %	0 %	115522152
3746	NC_008435	CGT	2	6	141002	141007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522152
3747	NC_008435	CGC	2	6	141095	141100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522152
3748	NC_008435	GCG	2	6	141160	141165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522152
3749	NC_008435	GCG	2	6	141176	141181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522152
3750	NC_008435	CGAC	2	8	141281	141288	25 %	0 %	25 %	50 %	115522153
3751	NC_008435	TTG	2	6	141320	141325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115522153
3752	NC_008435	GCT	2	6	141334	141339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522153
3753	NC_008435	GCG	2	6	141351	141356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522153
3754	NC_008435	CGG	2	6	141384	141389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522153
3755	NC_008435	CGG	2	6	141426	141431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522153
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3757	NC_008435	CCGA	2	8	141537	141544	25 %	0 %	25 %	50 %	115522153
3758	NC_008435	GCGA	2	8	141647	141654	25 %	0 %	50 %	25 %	115522153
3759	NC_008435	CT	3	6	141665	141670	0 %	50 %	0 %	50 %	115522153
3760	NC_008435	GC	3	6	141734	141739	0 %	0 %	50 %	50 %	115522153
3761	NC_008435	GGC	2	6	141742	141747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522153
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3763	NC_008435	CGCTGG	2	12	141798	141809	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	115522153
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3765	NC_008435	CCGC	2	8	141885	141892	0 %	0 %	25 %	75 %	115522153
3766	NC_008435	CGGCG	2	10	141910	141919	0 %	0 %	60 %	40 %	115522153
3767	NC_008435	GCG	2	6	141929	141934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522153
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3770	NC_008435	TCG	2	6	142001	142006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522153
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3774	NC_008435	CGGC	2	8	142156	142163	0 %	0 %	50 %	50 %	115522153
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3782	NC_008435	GC	3	6	142406	142411	0 %	0 %	50 %	50 %	115522153
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3785	NC_008435	GC	3	6	142514	142519	0 %	0 %	50 %	50 %	115522153
3786	NC_008435	GTTC	2	8	142530	142537	0 %	50 %	25 %	25 %	115522153
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3792	NC_008435	AGG	2	6	142826	142831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3793	NC_008435	CAT	2	6	142856	142861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522154
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3802	NC_008435	GC	4	8	143195	143202	0 %	0 %	50 %	50 %	115522154
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3838	NC_008435	GCG	2	6	144895	144900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522157
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3861	NC_008435	GC	4	8	145769	145776	0 %	0 %	50 %	50 %	115522157
3862	NC_008435	CGG	2	6	145799	145804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522157
3863	NC_008435	GCCAG	2	10	145892	145901	20 %	0 %	40 %	40 %	115522157
3864	NC_008435	CG	3	6	145950	145955	0 %	0 %	50 %	50 %	115522157
3865	NC_008435	CGC	2	6	145958	145963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522157
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3991	NC_008435	CCG	2	6	151534	151539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522160
3992	NC_008435	CGA	2	6	151547	151552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522160
3993	NC_008435	CGC	2	6	151556	151561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522160
3994	NC_008435	GC	3	6	151560	151565	0 %	0 %	50 %	50 %	115522160
3995	NC_008435	CAA	2	6	151586	151591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522160
3996	NC_008435	GGT	2	6	151616	151621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522160
3997	NC_008435	CGG	2	6	151663	151668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522160
3998	NC_008435	CGAT	2	8	151687	151694	25 %	25 %	25 %	25 %	115522160
3999	NC_008435	CGC	2	6	151750	151755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522160
4000	NC_008435	CGC	2	6	151771	151776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522160

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