MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 142158

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_008435	GCA	2	6	630528	630533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522600
16503	NC_008435	CCG	2	6	630578	630583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16504	NC_008435	CAC	2	6	630591	630596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522601
16505	NC_008435	TAG	2	6	630597	630602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522601
16506	NC_008435	TCT	2	6	630645	630650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522601
16507	NC_008435	CCACG	2	10	630673	630682	20 %	0 %	20 %	60 %	115522601
16508	NC_008435	TTCG	2	8	630920	630927	0 %	50 %	25 %	25 %	115522601
16509	NC_008435	CAA	2	6	630985	630990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522601
16510	NC_008435	ATCC	2	8	631034	631041	25 %	25 %	0 %	50 %	115522601
16511	NC_008435	AGGAT	2	10	631119	631128	40 %	20 %	40 %	0 %	115522601
16512	NC_008435	TCG	2	6	631152	631157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522601
16513	NC_008435	TCGA	2	8	631213	631220	25 %	25 %	25 %	25 %	115522601
16514	NC_008435	TCA	2	6	631350	631355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522601
16515	NC_008435	AC	3	6	631376	631381	50 %	0 %	0 %	50 %	115522601
16516	NC_008435	GC	3	6	631420	631425	0 %	0 %	50 %	50 %	115522601
16517	NC_008435	GTG	2	6	631430	631435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522601
16518	NC_008435	CTAT	2	8	631470	631477	25 %	50 %	0 %	25 %	115522601
16519	NC_008435	CAC	2	6	631523	631528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522601
16520	NC_008435	CTTT	2	8	631615	631622	0 %	75 %	0 %	25 %	115522602
16521	NC_008435	CAG	2	6	631643	631648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522602
16522	NC_008435	AAC	2	6	631756	631761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522602
16523	NC_008435	ACG	2	6	631812	631817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522602
16524	NC_008435	CG	3	6	631816	631821	0 %	0 %	50 %	50 %	115522602
16525	NC_008435	TAG	2	6	631829	631834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522602
16526	NC_008435	GAT	2	6	632047	632052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522602
16527	NC_008435	GC	3	6	632208	632213	0 %	0 %	50 %	50 %	115522602
16528	NC_008435	GTT	2	6	632299	632304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115522602
16529	NC_008435	GCCC	2	8	632439	632446	0 %	0 %	25 %	75 %	115522602
16530	NC_008435	CT	3	6	632452	632457	0 %	50 %	0 %	50 %	115522602
16531	NC_008435	CGT	2	6	632724	632729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522602
16532	NC_008435	ACT	2	6	632856	632861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522603
16533	NC_008435	GAT	2	6	632865	632870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522603
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16535	NC_008435	ACTC	2	8	632952	632959	25 %	25 %	0 %	50 %	115522603
16536	NC_008435	AAT	2	6	632968	632973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115522603
16537	NC_008435	TC	3	6	633087	633092	0 %	50 %	0 %	50 %	115522603
16538	NC_008435	GA	3	6	633222	633227	50 %	0 %	50 %	0 %	115522603
16539	NC_008435	AAG	2	6	633263	633268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522603
16540	NC_008435	GGC	2	6	633316	633321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522603
16541	NC_008435	CAG	2	6	633357	633362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522603
16542	NC_008435	ACGT	2	8	633372	633379	25 %	25 %	25 %	25 %	115522603
16543	NC_008435	CAC	2	6	633393	633398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522603
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16545	NC_008435	C	6	6	633506	633511	0 %	0 %	0 %	100 %	115522603
16546	NC_008435	GTC	2	6	633522	633527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522603
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16551	NC_008435	TGC	2	6	634123	634128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522603
16552	NC_008435	GATA	2	8	634132	634139	50 %	25 %	25 %	0 %	115522603
16553	NC_008435	AGT	2	6	634140	634145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522603
16554	NC_008435	ATT	2	6	634298	634303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	115522603
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16560	NC_008435	TCAA	2	8	634622	634629	50 %	25 %	0 %	25 %	115522603
16561	NC_008435	CGG	2	6	634788	634793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522603
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16564	NC_008435	T	6	6	634854	634859	0 %	100 %	0 %	0 %	115522603
16565	NC_008435	GCC	2	6	634951	634956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522603
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16572	NC_008435	GCA	2	6	635240	635245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16573	NC_008435	TAG	2	6	635248	635253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16575	NC_008435	TGCG	2	8	635451	635458	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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16577	NC_008435	CTCAG	2	10	635520	635529	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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16579	NC_008435	GAAG	2	8	635638	635645	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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16589	NC_008435	CCG	2	6	635960	635965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16591	NC_008435	TTG	2	6	636024	636029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16592	NC_008435	TG	3	6	636028	636033	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16593	NC_008435	GGCT	2	8	636108	636115	0 %	25 %	50 %	25 %	115522604
16594	NC_008435	CG	3	6	636158	636163	0 %	0 %	50 %	50 %	115522604
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16602	NC_008435	GCAG	2	8	636419	636426	25 %	0 %	50 %	25 %	115522604
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16611	NC_008435	GGC	2	6	637163	637168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16612	NC_008435	CG	3	6	637177	637182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16615	NC_008435	CCG	2	6	637306	637311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16621	NC_008435	CCG	2	6	637481	637486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16622	NC_008435	CAA	2	6	637530	637535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16623	NC_008435	TCT	2	6	637682	637687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522605
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16867	NC_008435	AGCCC	2	10	649315	649324	20 %	0 %	20 %	60 %	115522613
16868	NC_008435	GCA	2	6	649330	649335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522613
16869	NC_008435	GTC	2	6	649428	649433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522613
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16871	NC_008435	GAC	2	6	649472	649477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522614
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16874	NC_008435	GAC	3	9	649721	649729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522614
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16884	NC_008435	GCCG	2	8	650051	650058	0 %	0 %	50 %	50 %	115522614
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16897	NC_008435	GCG	2	6	650659	650664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16898	NC_008435	GCA	2	6	650698	650703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16901	NC_008435	CGG	2	6	650820	650825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522615
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16903	NC_008435	CG	5	10	650920	650929	0 %	0 %	50 %	50 %	115522615
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16985	NC_008435	CG	3	6	654052	654057	0 %	0 %	50 %	50 %	115522617
16986	NC_008435	TGA	2	6	654106	654111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522617
16987	NC_008435	CG	4	8	654133	654140	0 %	0 %	50 %	50 %	115522617
16988	NC_008435	CCG	3	9	654147	654155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522617
16989	NC_008435	ATA	2	6	654224	654229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115522617
16990	NC_008435	CAGG	2	8	654287	654294	25 %	0 %	50 %	25 %	115522617
16991	NC_008435	TGAT	2	8	654315	654322	25 %	50 %	25 %	0 %	115522617
16992	NC_008435	CCG	2	6	654358	654363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522617
16993	NC_008435	CGG	2	6	654373	654378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522617
16994	NC_008435	CG	3	6	654404	654409	0 %	0 %	50 %	50 %	115522617
16995	NC_008435	CAA	2	6	654437	654442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522617
16996	NC_008435	AGTTCG	2	12	654498	654509	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	115522617
16997	NC_008435	GATC	2	8	654514	654521	25 %	25 %	25 %	25 %	115522617
16998	NC_008435	CCG	2	6	654529	654534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522617
16999	NC_008435	GCG	2	6	654537	654542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522617
17000	NC_008435	CGC	2	6	654571	654576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522617

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