MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 142158

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_008435	CGA	2	6	605985	605990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522582
16002	NC_008435	TTC	2	6	605998	606003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522582
16003	NC_008435	CGA	2	6	606006	606011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522582
16004	NC_008435	CGC	2	6	606017	606022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522582
16005	NC_008435	GCC	2	6	606054	606059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522582
16006	NC_008435	CG	5	10	606201	606210	0 %	0 %	50 %	50 %	115522582
16007	NC_008435	CGT	2	6	606383	606388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522582
16008	NC_008435	CCA	2	6	606428	606433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522582
16009	NC_008435	CG	3	6	606451	606456	0 %	0 %	50 %	50 %	115522582
16010	NC_008435	GCA	2	6	606595	606600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16011	NC_008435	CCG	2	6	606669	606674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16012	NC_008435	TCA	2	6	606677	606682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16013	NC_008435	CGG	2	6	606688	606693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16014	NC_008435	GAA	2	6	606736	606741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522583
16015	NC_008435	AAC	2	6	606804	606809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522583
16016	NC_008435	GTG	2	6	606852	606857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522583
16017	NC_008435	AAT	2	6	606872	606877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115522583
16018	NC_008435	CGC	2	6	606898	606903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522583
16019	NC_008435	GCCG	2	8	606929	606936	0 %	0 %	50 %	50 %	115522583
16020	NC_008435	GCCT	2	8	606962	606969	0 %	25 %	25 %	50 %	115522583
16021	NC_008435	ATC	2	6	607031	607036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16022	NC_008435	ATCT	2	8	607041	607048	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16023	NC_008435	CCG	2	6	607069	607074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522584
16024	NC_008435	GCC	2	6	607080	607085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522584
16025	NC_008435	GCA	2	6	607153	607158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522584
16026	NC_008435	CGCTTG	2	12	607182	607193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522584
16027	NC_008435	CTT	2	6	607211	607216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522584
16028	NC_008435	CAGCAC	2	12	607316	607327	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	115522584
16029	NC_008435	CAT	2	6	607384	607389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522584
16030	NC_008435	ACG	2	6	607395	607400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522584
16031	NC_008435	GCCG	2	8	607408	607415	0 %	0 %	50 %	50 %	115522584
16032	NC_008435	TGA	2	6	607423	607428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522584
16033	NC_008435	CTT	2	6	607489	607494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16034	NC_008435	GCC	2	6	607534	607539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16035	NC_008435	GC	3	6	607594	607599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16036	NC_008435	ACG	2	6	607620	607625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16037	NC_008435	CG	3	6	607691	607696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16038	NC_008435	GCG	2	6	607721	607726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16039	NC_008435	GCCA	2	8	607748	607755	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16040	NC_008435	AACC	2	8	607775	607782	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16041	NC_008435	TGT	2	6	607794	607799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16042	NC_008435	CGA	2	6	607839	607844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522585
16043	NC_008435	GGCGC	2	10	607876	607885	0 %	0 %	60 %	40 %	115522585
16044	NC_008435	GTCG	2	8	607893	607900	0 %	25 %	50 %	25 %	115522585
16045	NC_008435	ACA	2	6	607913	607918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522585
16046	NC_008435	GAC	2	6	607930	607935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522585
16047	NC_008435	GGC	3	9	608100	608108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522585
16048	NC_008435	GGT	2	6	608109	608114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522585
16049	NC_008435	CGC	2	6	608161	608166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522585
16050	NC_008435	CGG	3	9	608211	608219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522585
16051	NC_008435	CTGC	2	8	608343	608350	0 %	25 %	25 %	50 %	115522585
16052	NC_008435	CGG	2	6	608406	608411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522585
16053	NC_008435	GCG	2	6	608426	608431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522585
16054	NC_008435	GAA	2	6	608448	608453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522585
16055	NC_008435	GAG	3	9	608509	608517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522585
16056	NC_008435	CG	3	6	608522	608527	0 %	0 %	50 %	50 %	115522585
16057	NC_008435	TCG	2	6	608570	608575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522585
16058	NC_008435	TCA	2	6	608633	608638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522585
16059	NC_008435	TCGA	2	8	608650	608657	25 %	25 %	25 %	25 %	115522585
16060	NC_008435	AGC	2	6	608692	608697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522585
16061	NC_008435	GCA	2	6	608814	608819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522585
16062	NC_008435	AAG	2	6	608992	608997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522585
16063	NC_008435	GGC	2	6	609104	609109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16064	NC_008435	TCCC	2	8	609206	609213	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
16065	NC_008435	CCG	2	6	609279	609284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16066	NC_008435	TCG	2	6	609396	609401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522586
16067	NC_008435	CG	3	6	609432	609437	0 %	0 %	50 %	50 %	115522586
16068	NC_008435	CG	4	8	609463	609470	0 %	0 %	50 %	50 %	115522586
16069	NC_008435	CG	3	6	609566	609571	0 %	0 %	50 %	50 %	115522586
16070	NC_008435	GC	3	6	609615	609620	0 %	0 %	50 %	50 %	115522586
16071	NC_008435	TCG	2	6	609639	609644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522586
16072	NC_008435	CCG	2	6	609666	609671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522586
16073	NC_008435	GCCACG	2	12	609680	609691	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	115522586
16074	NC_008435	TTC	2	6	609751	609756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522586
16075	NC_008435	AGC	2	6	609834	609839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522586
16076	NC_008435	CCT	2	6	609943	609948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522586
16077	NC_008435	AAG	2	6	610001	610006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522586
16078	NC_008435	AG	3	6	610127	610132	50 %	0 %	50 %	0 %	115522586
16079	NC_008435	TCAAGG	2	12	610212	610223	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	115522586
16080	NC_008435	AGC	2	6	610264	610269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522586
16081	NC_008435	GC	3	6	610331	610336	0 %	0 %	50 %	50 %	115522586
16082	NC_008435	ACGA	2	8	610469	610476	50 %	0 %	25 %	25 %	115522586
16083	NC_008435	A	6	6	610565	610570	100 %	0 %	0 %	0 %	115522586
16084	NC_008435	GATCA	2	10	610584	610593	40 %	20 %	20 %	20 %	115522586
16085	NC_008435	AAG	2	6	610607	610612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522586
16086	NC_008435	TGT	2	6	610717	610722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115522586
16087	NC_008435	CCA	2	6	610737	610742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522586
16088	NC_008435	AAAGCC	2	12	610798	610809	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	115522586
16089	NC_008435	GCG	2	6	610917	610922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522586
16090	NC_008435	AAG	2	6	610954	610959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522587
16091	NC_008435	CGG	2	6	611012	611017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522587
16092	NC_008435	TGT	2	6	611021	611026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115522587
16093	NC_008435	GC	3	6	611053	611058	0 %	0 %	50 %	50 %	115522587
16094	NC_008435	TCA	2	6	611096	611101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522587
16095	NC_008435	TTC	2	6	611128	611133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522587
16096	NC_008435	GC	3	6	611258	611263	0 %	0 %	50 %	50 %	115522587
16097	NC_008435	AAAT	2	8	611301	611308	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16098	NC_008435	GCC	3	9	611319	611327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16099	NC_008435	GAT	2	6	611372	611377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16100	NC_008435	CAT	2	6	611448	611453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522588
16101	NC_008435	CCGC	2	8	611498	611505	0 %	0 %	25 %	75 %	115522588
16102	NC_008435	GGC	2	6	611532	611537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522588
16103	NC_008435	GC	3	6	611536	611541	0 %	0 %	50 %	50 %	115522588
16104	NC_008435	CGC	2	6	611555	611560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522588
16105	NC_008435	CGT	2	6	611650	611655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522588
16106	NC_008435	CAG	2	6	611710	611715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522588
16107	NC_008435	TCA	2	6	611813	611818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522588
16108	NC_008435	CCT	2	6	611819	611824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522588
16109	NC_008435	GCC	2	6	611833	611838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522588
16110	NC_008435	CGCAT	2	10	611860	611869	20 %	20 %	20 %	40 %	115522588
16111	NC_008435	GTC	2	6	611878	611883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522588
16112	NC_008435	CGA	2	6	611886	611891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522588
16113	NC_008435	AAG	2	6	611917	611922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522588
16114	NC_008435	A	7	7	611940	611946	100 %	0 %	0 %	0 %	115522588
16115	NC_008435	TGA	2	6	612042	612047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522588
16116	NC_008435	TTC	2	6	612052	612057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522588
16117	NC_008435	GAC	2	6	612093	612098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522588
16118	NC_008435	CGT	2	6	612127	612132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522588
16119	NC_008435	GTC	2	6	612351	612356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522588
16120	NC_008435	GCG	2	6	612361	612366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522588
16121	NC_008435	ATT	2	6	612367	612372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	115522588
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16242	NC_008435	GTTTC	2	10	619052	619061	0 %	60 %	20 %	20 %	115522591
16243	NC_008435	AG	3	6	619073	619078	50 %	0 %	50 %	0 %	115522591
16244	NC_008435	AAG	2	6	619080	619085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522591
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16279	NC_008435	GA	3	6	620644	620649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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16281	NC_008435	GTA	2	6	620729	620734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16283	NC_008435	CCTA	2	8	620922	620929	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16284	NC_008435	CG	3	6	620935	620940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16363	NC_008435	GGA	2	6	624082	624087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522596
16364	NC_008435	TCGA	2	8	624100	624107	25 %	25 %	25 %	25 %	115522596
16365	NC_008435	GC	4	8	624136	624143	0 %	0 %	50 %	50 %	115522596
16366	NC_008435	GGC	2	6	624146	624151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522596
16367	NC_008435	CTT	2	6	624159	624164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522596
16368	NC_008435	CCT	2	6	624167	624172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522596
16369	NC_008435	CTG	2	6	624177	624182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522596
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16393	NC_008435	GCG	2	6	625380	625385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16394	NC_008435	GACC	2	8	625392	625399	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16395	NC_008435	TAC	2	6	625435	625440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16401	NC_008435	GCA	2	6	625641	625646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16403	NC_008435	GC	3	6	625765	625770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16490	NC_008435	ATGC	2	8	629909	629916	25 %	25 %	25 %	25 %	115522600
16491	NC_008435	CT	3	6	629927	629932	0 %	50 %	0 %	50 %	115522600
16492	NC_008435	GCC	2	6	629984	629989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522600
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