MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 142158

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008435	TTC	2	6	36960	36965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522063
1002	NC_008435	GCG	3	9	36981	36989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522063
1003	NC_008435	GCCG	2	8	37076	37083	0 %	0 %	50 %	50 %	115522063
1004	NC_008435	CGC	2	6	37118	37123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522063
1005	NC_008435	GGT	2	6	37145	37150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522063
1006	NC_008435	CGT	2	6	37195	37200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522063
1007	NC_008435	GCCG	2	8	37214	37221	0 %	0 %	50 %	50 %	115522063
1008	NC_008435	CGC	2	6	37241	37246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522063
1009	NC_008435	GCC	3	9	37247	37255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522063
1010	NC_008435	GGC	2	6	37274	37279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522063
1011	NC_008435	CGA	2	6	37291	37296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522063
1012	NC_008435	CGC	2	6	37309	37314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522063
1013	NC_008435	CCG	3	9	37336	37344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522063
1014	NC_008435	TCG	2	6	37437	37442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522063
1015	NC_008435	GGC	2	6	37517	37522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522063
1016	NC_008435	TGA	2	6	37537	37542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522063
1017	NC_008435	CCA	2	6	37564	37569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522063
1018	NC_008435	GTC	2	6	37586	37591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522063
1019	NC_008435	GCC	2	6	37604	37609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522063
1020	NC_008435	CAG	2	6	37637	37642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522063
1021	NC_008435	CCGCG	2	10	37643	37652	0 %	0 %	40 %	60 %	115522063
1022	NC_008435	ACG	2	6	37692	37697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522063
1023	NC_008435	GCG	2	6	37745	37750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522063
1024	NC_008435	CGG	2	6	37759	37764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522063
1025	NC_008435	CGCGG	2	10	37859	37868	0 %	0 %	60 %	40 %	115522063
1026	NC_008435	ATC	2	6	38064	38069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522063
1027	NC_008435	GC	3	6	38190	38195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1028	NC_008435	CAA	2	6	38232	38237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_008435	TCGC	2	8	38254	38261	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1030	NC_008435	GC	4	8	38272	38279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_008435	TACC	2	8	38303	38310	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_008435	CGCC	2	8	38356	38363	0 %	0 %	25 %	75 %	115522064
1033	NC_008435	CAG	2	6	38366	38371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522064
1034	NC_008435	CCG	2	6	38452	38457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522064
1035	NC_008435	AGT	2	6	38542	38547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522064
1036	NC_008435	GCA	2	6	38620	38625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522064
1037	NC_008435	GCA	2	6	38752	38757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522064
1038	NC_008435	GAT	2	6	38801	38806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522064
1039	NC_008435	GGC	2	6	38842	38847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522064
1040	NC_008435	CGA	2	6	38926	38931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522064
1041	NC_008435	ACCGC	2	10	38932	38941	20 %	0 %	20 %	60 %	115522064
1042	NC_008435	GTC	2	6	38966	38971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522064
1043	NC_008435	GTGG	2	8	39047	39054	0 %	25 %	75 %	0 %	115522064
1044	NC_008435	GTCG	2	8	39071	39078	0 %	25 %	50 %	25 %	115522064
1045	NC_008435	CGG	3	9	39115	39123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522064
1046	NC_008435	GCC	2	6	39149	39154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522064
1047	NC_008435	TCG	2	6	39159	39164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522064
1048	NC_008435	CTG	2	6	39170	39175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522064
1049	NC_008435	CTTC	2	8	39292	39299	0 %	50 %	0 %	50 %	115522064
1050	NC_008435	CG	3	6	39329	39334	0 %	0 %	50 %	50 %	115522064
1051	NC_008435	GCG	2	6	39340	39345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522064
1052	NC_008435	GCC	2	6	39365	39370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522064
1053	NC_008435	GGC	2	6	39401	39406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522064
1054	NC_008435	TCG	2	6	39489	39494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522064
1055	NC_008435	TCG	2	6	39504	39509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522064
1056	NC_008435	AC	3	6	39538	39543	50 %	0 %	0 %	50 %	115522064
1057	NC_008435	C	6	6	39591	39596	0 %	0 %	0 %	100 %	115522064
1058	NC_008435	GGT	2	6	39673	39678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_008435	CGG	2	6	39712	39717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_008435	CGC	2	6	39758	39763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522065
1061	NC_008435	CAGCCG	2	12	39800	39811	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	115522065
1062	NC_008435	CG	4	8	39850	39857	0 %	0 %	50 %	50 %	115522065
1063	NC_008435	GAA	2	6	39950	39955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522065
1064	NC_008435	CCG	2	6	39960	39965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522065
1065	NC_008435	GAC	2	6	39989	39994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522065
1066	NC_008435	GGC	2	6	40019	40024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522065
1067	NC_008435	GCC	2	6	40027	40032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522065
1068	NC_008435	GGC	3	9	40035	40043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522065
1069	NC_008435	GCC	2	6	40050	40055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522065
1070	NC_008435	CG	3	6	40123	40128	0 %	0 %	50 %	50 %	115522065
1071	NC_008435	CAC	2	6	40134	40139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522065
1072	NC_008435	TGG	2	6	40149	40154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522065
1073	NC_008435	CGGCCG	2	12	40181	40192	0 %	0 %	50 %	50 %	115522065
1074	NC_008435	CGG	2	6	40231	40236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522065
1075	NC_008435	AGAA	2	8	40254	40261	75 %	0 %	25 %	0 %	115522065
1076	NC_008435	CAG	2	6	40283	40288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522065
1077	NC_008435	ACC	2	6	40314	40319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522065
1078	NC_008435	CGC	2	6	40385	40390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522065
1079	NC_008435	GAA	2	6	40430	40435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522065
1080	NC_008435	GTCCG	2	10	40519	40528	0 %	20 %	40 %	40 %	115522065
1081	NC_008435	CGG	2	6	40603	40608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522066
1082	NC_008435	GCG	2	6	40623	40628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522066
1083	NC_008435	GGC	2	6	40631	40636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522066
1084	NC_008435	GCG	2	6	40650	40655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522066
1085	NC_008435	GCGG	2	8	40658	40665	0 %	0 %	75 %	25 %	115522066
1086	NC_008435	CGC	2	6	40685	40690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522066
1087	NC_008435	GGC	2	6	40691	40696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522066
1088	NC_008435	ATC	2	6	40727	40732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522066
1089	NC_008435	GCC	2	6	40864	40869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522066
1090	NC_008435	CAG	2	6	40882	40887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522066
1091	NC_008435	CCA	3	9	40917	40925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522066
1092	NC_008435	AGCCGA	2	12	40965	40976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522066
1093	NC_008435	ATG	2	6	40979	40984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522066
1094	NC_008435	CGT	2	6	40992	40997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522066
1095	NC_008435	GATC	2	8	40998	41005	25 %	25 %	25 %	25 %	115522066
1096	NC_008435	ACG	2	6	41054	41059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522066
1097	NC_008435	CGG	2	6	41064	41069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522066
1098	NC_008435	CGC	2	6	41074	41079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522066
1099	NC_008435	GAA	2	6	41083	41088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522066
1100	NC_008435	GGC	2	6	41109	41114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522066
1101	NC_008435	CGT	2	6	41142	41147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522067
1102	NC_008435	CGC	2	6	41199	41204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522067
1103	NC_008435	CAA	2	6	41205	41210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522067
1104	NC_008435	TGC	2	6	41290	41295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522067
1105	NC_008435	GC	3	6	41331	41336	0 %	0 %	50 %	50 %	115522067
1106	NC_008435	CAGCGT	2	12	41409	41420	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	115522067
1107	NC_008435	GC	3	6	41431	41436	0 %	0 %	50 %	50 %	115522067
1108	NC_008435	CG	3	6	41440	41445	0 %	0 %	50 %	50 %	115522067
1109	NC_008435	CCG	2	6	41474	41479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522067
1110	NC_008435	GC	3	6	41535	41540	0 %	0 %	50 %	50 %	115522067
1111	NC_008435	GCC	2	6	41591	41596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522067
1112	NC_008435	GCA	2	6	41648	41653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522067
1113	NC_008435	TCGG	2	8	41707	41714	0 %	25 %	50 %	25 %	115522067
1114	NC_008435	CAT	2	6	41715	41720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522067
1115	NC_008435	CATCGC	2	12	41735	41746	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	115522068
1116	NC_008435	GC	3	6	41745	41750	0 %	0 %	50 %	50 %	115522068
1117	NC_008435	GGC	2	6	41807	41812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522068
1118	NC_008435	CG	3	6	41827	41832	0 %	0 %	50 %	50 %	115522068
1119	NC_008435	CAG	2	6	41984	41989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522068
1120	NC_008435	GCA	2	6	42088	42093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522068
1121	NC_008435	TCG	2	6	42144	42149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522068
1122	NC_008435	TCG	2	6	42189	42194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522068
1123	NC_008435	CAC	2	6	42215	42220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522068
1124	NC_008435	GCG	2	6	42242	42247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522068
1125	NC_008435	CCCATC	2	12	42327	42338	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	115522068
1126	NC_008435	CAC	2	6	42341	42346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522068
1127	NC_008435	GTT	2	6	42362	42367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115522068
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1129	NC_008435	CCA	2	6	42427	42432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522068
1130	NC_008435	CGA	2	6	42442	42447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522068
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1133	NC_008435	CGGT	2	8	42549	42556	0 %	25 %	50 %	25 %	115522068
1134	NC_008435	GC	4	8	42586	42593	0 %	0 %	50 %	50 %	115522068
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1145	NC_008435	CCA	2	6	42975	42980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1146	NC_008435	TGG	2	6	42991	42996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1237	NC_008435	CCGC	2	8	46566	46573	0 %	0 %	25 %	75 %	115522072
1238	NC_008435	GCG	2	6	46583	46588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522072
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1246	NC_008435	CGGC	2	8	46872	46879	0 %	0 %	50 %	50 %	115522073
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1253	NC_008435	GGGCT	2	10	47151	47160	0 %	20 %	60 %	20 %	115522073
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1496	NC_008435	TCAA	2	8	57203	57210	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1497	NC_008435	CG	3	6	57301	57306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1498	NC_008435	GACG	2	8	57339	57346	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1499	NC_008435	GAA	2	6	57351	57356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1500	NC_008435	GGC	2	6	57360	57365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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