MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 142158

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008435	GAT	2	6	18723	18728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522047
502	NC_008435	TTC	2	6	18733	18738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522047
503	NC_008435	GC	3	6	18872	18877	0 %	0 %	50 %	50 %	115522048
504	NC_008435	CGC	2	6	18893	18898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522048
505	NC_008435	CCG	2	6	18899	18904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522048
506	NC_008435	GAT	2	6	18909	18914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522048
507	NC_008435	CGAG	2	8	18968	18975	25 %	0 %	50 %	25 %	115522048
508	NC_008435	GC	3	6	19133	19138	0 %	0 %	50 %	50 %	115522048
509	NC_008435	CCCAG	2	10	19157	19166	20 %	0 %	20 %	60 %	115522048
510	NC_008435	GAC	2	6	19221	19226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522048
511	NC_008435	CAT	2	6	19236	19241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522048
512	NC_008435	ACC	2	6	19282	19287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522048
513	NC_008435	GCA	2	6	19295	19300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522048
514	NC_008435	TCA	2	6	19340	19345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522048
515	NC_008435	GCC	2	6	19359	19364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522048
516	NC_008435	GGCC	2	8	19451	19458	0 %	0 %	50 %	50 %	115522048
517	NC_008435	GAT	2	6	19491	19496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522048
518	NC_008435	CCGC	2	8	19526	19533	0 %	0 %	25 %	75 %	115522048
519	NC_008435	AGT	2	6	19544	19549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522048
520	NC_008435	ATG	2	6	19552	19557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522048
521	NC_008435	CGG	2	6	19568	19573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522048
522	NC_008435	GAA	2	6	19578	19583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522048
523	NC_008435	ACC	2	6	19604	19609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522048
524	NC_008435	CGC	2	6	19631	19636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522048
525	NC_008435	GAA	2	6	19662	19667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522048
526	NC_008435	GCA	2	6	19700	19705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522048
527	NC_008435	TGA	3	9	19715	19723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522048
528	NC_008435	TCA	2	6	19781	19786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522048
529	NC_008435	CAG	2	6	19794	19799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522048
530	NC_008435	ACC	2	6	19804	19809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522048
531	NC_008435	TCT	2	6	19973	19978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522048
532	NC_008435	CAC	2	6	19980	19985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522048
533	NC_008435	CAG	2	6	20001	20006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522048
534	NC_008435	GCC	2	6	20013	20018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522048
535	NC_008435	ACC	2	6	20029	20034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522048
536	NC_008435	GCCG	2	8	20057	20064	0 %	0 %	50 %	50 %	115522048
537	NC_008435	GAT	2	6	20115	20120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522048
538	NC_008435	CGC	2	6	20229	20234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522048
539	NC_008435	ATG	2	6	20290	20295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522048
540	NC_008435	GAA	2	6	20367	20372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522048
541	NC_008435	C	6	6	20383	20388	0 %	0 %	0 %	100 %	115522048
542	NC_008435	TCT	2	6	20438	20443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_008435	ACAGC	2	10	20525	20534	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
544	NC_008435	GAGC	2	8	20599	20606	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
545	NC_008435	GCC	2	6	20657	20662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_008435	CTGGCG	2	12	20688	20699	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	115522049
547	NC_008435	GCG	2	6	20744	20749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522049
548	NC_008435	CGC	2	6	20762	20767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522049
549	NC_008435	GC	3	6	20766	20771	0 %	0 %	50 %	50 %	115522049
550	NC_008435	GATCA	2	10	20772	20781	40 %	20 %	20 %	20 %	115522049
551	NC_008435	CG	3	6	20897	20902	0 %	0 %	50 %	50 %	115522049
552	NC_008435	CG	3	6	20928	20933	0 %	0 %	50 %	50 %	115522049
553	NC_008435	TCG	2	6	20938	20943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522049
554	NC_008435	GCC	2	6	20967	20972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522049
555	NC_008435	GC	3	6	21143	21148	0 %	0 %	50 %	50 %	115522049
556	NC_008435	CAC	2	6	21192	21197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522049
557	NC_008435	CCG	2	6	21238	21243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522049
558	NC_008435	CCG	2	6	21332	21337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522049
559	NC_008435	CGT	2	6	21356	21361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522049
560	NC_008435	CAG	2	6	21423	21428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522049
561	NC_008435	CGG	2	6	21432	21437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522049
562	NC_008435	TGA	2	6	21470	21475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522049
563	NC_008435	GC	3	6	21487	21492	0 %	0 %	50 %	50 %	115522049
564	NC_008435	CGG	2	6	21497	21502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522049
565	NC_008435	ACG	2	6	21504	21509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522049
566	NC_008435	GCA	2	6	21545	21550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522049
567	NC_008435	GCCG	2	8	21551	21558	0 %	0 %	50 %	50 %	115522049
568	NC_008435	GCC	2	6	21567	21572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522049
569	NC_008435	CAC	2	6	21588	21593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522049
570	NC_008435	ATCCGC	2	12	21598	21609	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	115522049
571	NC_008435	GCT	2	6	21642	21647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_008435	GTAA	2	8	21664	21671	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
573	NC_008435	TGC	2	6	21726	21731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_008435	CAC	2	6	21793	21798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_008435	GCG	2	6	21809	21814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_008435	CGCTG	2	10	21815	21824	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
577	NC_008435	GCT	2	6	21922	21927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522050
578	NC_008435	CGGC	2	8	21958	21965	0 %	0 %	50 %	50 %	115522050
579	NC_008435	GCTT	2	8	21993	22000	0 %	50 %	25 %	25 %	115522050
580	NC_008435	GAT	2	6	22055	22060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522050
581	NC_008435	CG	3	6	22096	22101	0 %	0 %	50 %	50 %	115522050
582	NC_008435	CG	3	6	22118	22123	0 %	0 %	50 %	50 %	115522050
583	NC_008435	CGC	2	6	22148	22153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522050
584	NC_008435	GAA	2	6	22193	22198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522050
585	NC_008435	CG	3	6	22213	22218	0 %	0 %	50 %	50 %	115522050
586	NC_008435	GCA	2	6	22219	22224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522050
587	NC_008435	CGC	2	6	22232	22237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522050
588	NC_008435	GGT	2	6	22301	22306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522050
589	NC_008435	GCG	2	6	22360	22365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522050
590	NC_008435	CGT	2	6	22378	22383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522050
591	NC_008435	ACC	2	6	22395	22400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522050
592	NC_008435	GCC	2	6	22442	22447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522050
593	NC_008435	CGG	2	6	22522	22527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522050
594	NC_008435	GCGTT	2	10	22587	22596	0 %	40 %	40 %	20 %	115522050
595	NC_008435	GTC	2	6	22618	22623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_008435	GCGA	2	8	22627	22634	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
597	NC_008435	GCTTC	2	10	22672	22681	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
598	NC_008435	CGAT	2	8	22693	22700	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
599	NC_008435	GAA	2	6	22754	22759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522051
600	NC_008435	TCG	2	6	22764	22769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522051
601	NC_008435	CGA	2	6	22771	22776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522051
602	NC_008435	GCT	2	6	22852	22857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522051
603	NC_008435	TTG	2	6	22876	22881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115522051
604	NC_008435	GAC	2	6	22893	22898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522051
605	NC_008435	GCG	2	6	22911	22916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522051
606	NC_008435	TTC	2	6	22935	22940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522051
607	NC_008435	GCT	2	6	22965	22970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522051
608	NC_008435	CTG	2	6	22997	23002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522051
609	NC_008435	CGC	2	6	23003	23008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522051
610	NC_008435	CCGCG	2	10	23011	23020	0 %	0 %	40 %	60 %	115522051
611	NC_008435	GTT	2	6	23162	23167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115522051
612	NC_008435	CGC	2	6	23182	23187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522051
613	NC_008435	TCGA	2	8	23232	23239	25 %	25 %	25 %	25 %	115522051
614	NC_008435	GCG	2	6	23301	23306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522051
615	NC_008435	CGG	2	6	23312	23317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_008435	GCC	3	9	23347	23355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_008435	CAT	2	6	23376	23381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_008435	CCGC	2	8	23400	23407	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
619	NC_008435	GC	3	6	23406	23411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
620	NC_008435	CGGC	2	8	23418	23425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
621	NC_008435	CGGC	2	8	23478	23485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
622	NC_008435	CGC	2	6	23494	23499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_008435	ATG	2	6	23525	23530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522052
624	NC_008435	CAA	2	6	23584	23589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522052
625	NC_008435	ATG	2	6	23672	23677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522052
626	NC_008435	ATC	2	6	23765	23770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522052
627	NC_008435	CAT	2	6	23776	23781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522052
628	NC_008435	CGGC	2	8	23797	23804	0 %	0 %	50 %	50 %	115522052
629	NC_008435	CGC	2	6	23811	23816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522052
630	NC_008435	TGC	2	6	23886	23891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522052
631	NC_008435	GCT	2	6	23896	23901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522052
632	NC_008435	GC	4	8	23920	23927	0 %	0 %	50 %	50 %	115522052
633	NC_008435	CCGC	2	8	23938	23945	0 %	0 %	25 %	75 %	115522052
634	NC_008435	CGG	2	6	23964	23969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522052
635	NC_008435	TCG	2	6	23982	23987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522052
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638	NC_008435	GCC	2	6	24101	24106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522052
639	NC_008435	CCGC	2	8	24108	24115	0 %	0 %	25 %	75 %	115522052
640	NC_008435	CG	3	6	24241	24246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
641	NC_008435	GC	4	8	24267	24274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
642	NC_008435	TCCC	2	8	24289	24296	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
643	NC_008435	T	6	6	24360	24365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
644	NC_008435	GC	3	6	24420	24425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
645	NC_008435	CTTCGC	2	12	24438	24449	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	115522053
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649	NC_008435	CGG	2	6	24575	24580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522053
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652	NC_008435	CGC	2	6	24701	24706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522053
653	NC_008435	CGG	2	6	24725	24730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522053
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669	NC_008435	CG	3	6	25244	25249	0 %	0 %	50 %	50 %	115522053
670	NC_008435	CG	3	6	25251	25256	0 %	0 %	50 %	50 %	115522053
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673	NC_008435	CCG	3	9	25426	25434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522054
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679	NC_008435	CATC	2	8	25648	25655	25 %	25 %	0 %	50 %	115522054
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755	NC_008435	CGG	2	6	28395	28400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522055
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999	NC_008435	CCA	2	6	36934	36939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522063
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