MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 142158

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008435	GAA	2	6	172002	172007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522177
4502	NC_008435	GCC	2	6	172041	172046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522177
4503	NC_008435	TCG	2	6	172087	172092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522177
4504	NC_008435	GGC	2	6	172097	172102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522177
4505	NC_008435	AAG	2	6	172110	172115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522177
4506	NC_008435	GGC	2	6	172187	172192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522177
4507	NC_008435	AAGGC	2	10	172195	172204	40 %	0 %	40 %	20 %	115522177
4508	NC_008435	GCGAT	2	10	172216	172225	20 %	20 %	40 %	20 %	115522177
4509	NC_008435	GAA	2	6	172226	172231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522177
4510	NC_008435	CGC	2	6	172244	172249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522177
4511	NC_008435	GGT	2	6	172322	172327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522177
4512	NC_008435	GAG	2	6	172329	172334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522177
4513	NC_008435	GAA	2	6	172337	172342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522177
4514	NC_008435	GAA	3	9	172367	172375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522177
4515	NC_008435	CGG	2	6	172400	172405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522177
4516	NC_008435	CTT	2	6	172415	172420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522177
4517	NC_008435	CCG	2	6	172453	172458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522177
4518	NC_008435	TCA	2	6	172519	172524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522177
4519	NC_008435	GC	3	6	172631	172636	0 %	0 %	50 %	50 %	115522177
4520	NC_008435	GCCG	2	8	172664	172671	0 %	0 %	50 %	50 %	115522177
4521	NC_008435	CCG	2	6	172726	172731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522177
4522	NC_008435	AAG	2	6	172752	172757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522177
4523	NC_008435	TTTC	2	8	172767	172774	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4524	NC_008435	CG	4	8	172783	172790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4525	NC_008435	TCGCT	2	10	172867	172876	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4526	NC_008435	CG	4	8	172895	172902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4527	NC_008435	CTG	2	6	172942	172947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_008435	CCG	2	6	172971	172976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522178
4529	NC_008435	TC	3	6	172977	172982	0 %	50 %	0 %	50 %	115522178
4530	NC_008435	CCG	4	12	173040	173051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522178
4531	NC_008435	TGC	2	6	173079	173084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522178
4532	NC_008435	GGC	2	6	173180	173185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522178
4533	NC_008435	TGG	2	6	173199	173204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522178
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4535	NC_008435	GCCG	2	8	173299	173306	0 %	0 %	50 %	50 %	115522178
4536	NC_008435	TGGA	2	8	173408	173415	25 %	25 %	50 %	0 %	115522178
4537	NC_008435	CGC	2	6	173416	173421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522178
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4543	NC_008435	ACCTCG	2	12	173657	173668	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	115522178
4544	NC_008435	GCT	2	6	173674	173679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522178
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4552	NC_008435	CTCGGC	2	12	174119	174130	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	115522178
4553	NC_008435	GC	4	8	174239	174246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4554	NC_008435	GCG	2	6	174253	174258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_008435	CG	3	6	174308	174313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4556	NC_008435	GC	4	8	174319	174326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4557	NC_008435	TCG	3	9	174358	174366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522179
4558	NC_008435	GCC	2	6	174413	174418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522179
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4560	NC_008435	CGG	2	6	174452	174457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522179
4561	NC_008435	AGC	2	6	174485	174490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522179
4562	NC_008435	AAG	2	6	174508	174513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522179
4563	NC_008435	GCCT	2	8	174537	174544	0 %	25 %	25 %	50 %	115522179
4564	NC_008435	GCCA	2	8	174561	174568	25 %	0 %	25 %	50 %	115522179
4565	NC_008435	GAC	2	6	174576	174581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522179
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4567	NC_008435	CAG	2	6	174648	174653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522179
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4571	NC_008435	CGC	2	6	174721	174726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522179
4572	NC_008435	GATC	2	8	174728	174735	25 %	25 %	25 %	25 %	115522179
4573	NC_008435	CGA	2	6	174749	174754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4574	NC_008435	TCG	2	6	174774	174779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4575	NC_008435	GTC	2	6	174789	174794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4576	NC_008435	CATC	2	8	174815	174822	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4577	NC_008435	CAGA	2	8	174831	174838	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4578	NC_008435	ACT	2	6	174896	174901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522180
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4582	NC_008435	GGCGC	2	10	175083	175092	0 %	0 %	60 %	40 %	115522180
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4596	NC_008435	TGGCG	2	10	175560	175569	0 %	20 %	60 %	20 %	115522180
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4601	NC_008435	CGGCG	2	10	175670	175679	0 %	0 %	60 %	40 %	115522180
4602	NC_008435	AGC	2	6	175693	175698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522180
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4604	NC_008435	CGC	3	9	175773	175781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4605	NC_008435	CGG	2	6	175799	175804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522181
4606	NC_008435	GCC	2	6	175846	175851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522181
4607	NC_008435	CCG	2	6	175876	175881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522181
4608	NC_008435	GCAGC	2	10	175890	175899	20 %	0 %	40 %	40 %	115522181
4609	NC_008435	CG	3	6	175900	175905	0 %	0 %	50 %	50 %	115522181
4610	NC_008435	GTG	2	6	175906	175911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522181
4611	NC_008435	GCGG	2	8	175956	175963	0 %	0 %	75 %	25 %	115522181
4612	NC_008435	TCGATC	2	12	175969	175980	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	115522181
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4614	NC_008435	GTCG	2	8	176061	176068	0 %	25 %	50 %	25 %	115522181
4615	NC_008435	G	6	6	176100	176105	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_008435	TCGC	2	8	176111	176118	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4617	NC_008435	GGGC	2	8	176143	176150	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4618	NC_008435	GTC	2	6	176281	176286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522182
4619	NC_008435	CG	5	10	176294	176303	0 %	0 %	50 %	50 %	115522182
4620	NC_008435	GGCG	2	8	176390	176397	0 %	0 %	75 %	25 %	115522182
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4622	NC_008435	CCCGGC	2	12	176484	176495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522182
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4624	NC_008435	CGC	2	6	176546	176551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522182
4625	NC_008435	GC	4	8	176643	176650	0 %	0 %	50 %	50 %	115522182
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4749	NC_008435	GCT	2	6	181538	181543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522188
4750	NC_008435	GC	3	6	181575	181580	0 %	0 %	50 %	50 %	115522188
4751	NC_008435	TCG	2	6	181639	181644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522188
4752	NC_008435	CAC	2	6	181742	181747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522188
4753	NC_008435	CGG	2	6	181757	181762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522188
4754	NC_008435	CGG	2	6	181774	181779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522188
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4763	NC_008435	CGC	2	6	182159	182164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522188
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4772	NC_008435	CGGC	2	8	182614	182621	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4773	NC_008435	CGTC	2	8	182684	182691	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4774	NC_008435	TGC	2	6	182713	182718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4775	NC_008435	CGG	2	6	182775	182780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4776	NC_008435	GGCG	2	8	182785	182792	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4777	NC_008435	CCG	2	6	182821	182826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4778	NC_008435	CGA	2	6	182835	182840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4779	NC_008435	GTG	2	6	182973	182978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522189
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4781	NC_008435	TGG	2	6	182995	183000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522189
4782	NC_008435	TGC	2	6	183022	183027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522189
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4788	NC_008435	TGG	2	6	183268	183273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522189
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4801	NC_008435	GCG	2	6	183589	183594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522189
4802	NC_008435	GCG	2	6	183607	183612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522189
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4805	NC_008435	TGC	2	6	183751	183756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522189
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4807	NC_008435	CG	3	6	183887	183892	0 %	0 %	50 %	50 %	115522189
4808	NC_008435	CGG	2	6	183904	183909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522189
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4811	NC_008435	CGC	2	6	184007	184012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522189
4812	NC_008435	CAT	2	6	184061	184066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522189
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4815	NC_008435	CGCC	2	8	184148	184155	0 %	0 %	25 %	75 %	115522189
4816	NC_008435	CCTGC	2	10	184184	184193	0 %	20 %	20 %	60 %	115522189
4817	NC_008435	TGA	2	6	184222	184227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522189
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4819	NC_008435	CGC	2	6	184376	184381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522189
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4823	NC_008435	CG	3	6	184482	184487	0 %	0 %	50 %	50 %	115522189
4824	NC_008435	GGCTCG	2	12	184492	184503	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	115522189
4825	NC_008435	GCT	2	6	184514	184519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522189
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4827	NC_008435	CTG	2	6	184539	184544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522189
4828	NC_008435	CGG	3	9	184550	184558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522189
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4832	NC_008435	CGA	2	6	184727	184732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522189
4833	NC_008435	TTG	2	6	184734	184739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115522189
4834	NC_008435	ATTTC	2	10	184750	184759	20 %	60 %	0 %	20 %	115522189
4835	NC_008435	GC	4	8	184884	184891	0 %	0 %	50 %	50 %	115522189
4836	NC_008435	GCG	2	6	184915	184920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522189
4837	NC_008435	GCGCTG	2	12	184944	184955	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	115522189
4838	NC_008435	TCGC	2	8	184970	184977	0 %	25 %	25 %	50 %	115522189
4839	NC_008435	GAT	2	6	185015	185020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522189
4840	NC_008435	TGA	2	6	185053	185058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522189
4841	NC_008435	AGC	2	6	185101	185106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522189
4842	NC_008435	GCCGAG	2	12	185118	185129	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	115522189
4843	NC_008435	T	7	7	185150	185156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4844	NC_008435	CTC	2	6	185171	185176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4845	NC_008435	TTCG	2	8	185194	185201	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4846	NC_008435	CGCC	2	8	185240	185247	0 %	0 %	25 %	75 %	115522190
4847	NC_008435	CGA	2	6	185369	185374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522190
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4849	NC_008435	GCA	2	6	185483	185488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522190
4850	NC_008435	TGC	2	6	185503	185508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522190
4851	NC_008435	GAC	2	6	185523	185528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522190
4852	NC_008435	CGG	2	6	185561	185566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522190
4853	NC_008435	CGA	2	6	185567	185572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522190
4854	NC_008435	CGGC	2	8	185668	185675	0 %	0 %	50 %	50 %	115522190
4855	NC_008435	ATC	2	6	185688	185693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522190
4856	NC_008435	GAG	2	6	185832	185837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522190
4857	NC_008435	GC	4	8	185882	185889	0 %	0 %	50 %	50 %	115522190
4858	NC_008435	CGG	2	6	185897	185902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522190
4859	NC_008435	CAA	2	6	185912	185917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522190
4860	NC_008435	GTG	2	6	185961	185966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522190
4861	NC_008435	ATG	2	6	185967	185972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522190
4862	NC_008435	GCA	2	6	185987	185992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522190
4863	NC_008435	ACG	2	6	186037	186042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522190
4864	NC_008435	AGC	3	9	186046	186054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522190
4865	NC_008435	CGC	2	6	186062	186067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522190
4866	NC_008435	GC	3	6	186066	186071	0 %	0 %	50 %	50 %	115522190
4867	NC_008435	CCG	2	6	186073	186078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522190
4868	NC_008435	ACC	2	6	186157	186162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522190
4869	NC_008435	ACC	2	6	186237	186242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522190
4870	NC_008435	GCC	2	6	186252	186257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522190
4871	NC_008435	CGC	2	6	186263	186268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522190
4872	NC_008435	GAC	2	6	186384	186389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522191
4873	NC_008435	AAGA	2	8	186429	186436	75 %	0 %	25 %	0 %	115522191
4874	NC_008435	GCC	2	6	186478	186483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522191
4875	NC_008435	CGC	2	6	186484	186489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522191
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4877	NC_008435	GGC	2	6	186594	186599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522191
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4900	NC_008435	CG	3	6	187291	187296	0 %	0 %	50 %	50 %	115522191
4901	NC_008435	ACC	2	6	187311	187316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522191
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4903	NC_008435	GA	3	6	187447	187452	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4904	NC_008435	GC	3	6	187495	187500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4905	NC_008435	GCTGC	2	10	187508	187517	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4906	NC_008435	GCTT	2	8	187615	187622	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4907	NC_008435	CGC	2	6	187629	187634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4908	NC_008435	CCG	2	6	187733	187738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4909	NC_008435	GAT	2	6	187756	187761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4910	NC_008435	GTG	2	6	187783	187788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4911	NC_008435	AAC	4	12	187816	187827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522192
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4913	NC_008435	AAC	3	9	187861	187869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522192
4914	NC_008435	AAT	2	6	187870	187875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115522192
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4933	NC_008435	GCG	2	6	188447	188452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522192
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4936	NC_008435	CGCC	2	8	188479	188486	0 %	0 %	25 %	75 %	115522192
4937	NC_008435	GCC	2	6	188509	188514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522192
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4941	NC_008435	CGT	3	9	188677	188685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522193
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4950	NC_008435	GTC	2	6	189089	189094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522193
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4960	NC_008435	GCCG	2	8	189540	189547	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4961	NC_008435	GCC	2	6	189575	189580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522194
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4977	NC_008435	CGA	2	6	190191	190196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522194
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4982	NC_008435	CGA	2	6	190246	190251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522194
4983	NC_008435	ATG	2	6	190336	190341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522194
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4986	NC_008435	GC	3	6	190489	190494	0 %	0 %	50 %	50 %	115522195
4987	NC_008435	GCATC	2	10	190512	190521	20 %	20 %	20 %	40 %	115522195
4988	NC_008435	ACT	2	6	190541	190546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522195
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4990	NC_008435	CGACGG	2	12	190578	190589	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	115522195
4991	NC_008435	GCC	2	6	190650	190655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522195
4992	NC_008435	GCG	3	9	190679	190687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522195
4993	NC_008435	GGC	2	6	190746	190751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522195
4994	NC_008435	CGC	2	6	190763	190768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522195
4995	NC_008435	CACT	2	8	190801	190808	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4996	NC_008435	CT	3	6	190807	190812	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4997	NC_008435	CAAG	2	8	190851	190858	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4998	NC_008435	CTCG	2	8	190861	190868	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4999	NC_008435	CCG	2	6	190959	190964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522196
5000	NC_008435	CGC	2	6	190980	190985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522196

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