MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Roseobacter denitrificans plasmid pTB1

Total Repeats: 2058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008386	CCCA	2	8	78669	78676	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1502	NC_008386	GGC	3	9	78677	78685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_008386	TG	3	6	78778	78783	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_008386	CCCCG	2	10	78868	78877	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1505	NC_008386	TC	3	6	78908	78913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1506	NC_008386	GCC	2	6	78917	78922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1507	NC_008386	TTCCT	2	10	78923	78932	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1508	NC_008386	ATA	2	6	79025	79030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_008386	GCC	2	6	79064	79069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1510	NC_008386	AGC	2	6	79079	79084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_008386	A	7	7	79123	79129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_008386	TGC	2	6	79134	79139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_008386	TCG	3	9	79229	79237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_008386	T	6	6	79313	79318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_008386	ACC	2	6	79360	79365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345609
1516	NC_008386	TCC	2	6	79383	79388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115345609
1517	NC_008386	TC	3	6	79409	79414	0 %	50 %	0 %	50 %	115345609
1518	NC_008386	CAT	2	6	79513	79518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345609
1519	NC_008386	CCGA	2	8	79542	79549	25 %	0 %	25 %	50 %	115345609
1520	NC_008386	CGG	2	6	79672	79677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345609
1521	NC_008386	TC	3	6	79688	79693	0 %	50 %	0 %	50 %	115345609
1522	NC_008386	AGG	2	6	79792	79797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115345609
1523	NC_008386	GCTG	2	8	79875	79882	0 %	25 %	50 %	25 %	115345609
1524	NC_008386	GA	3	6	79890	79895	50 %	0 %	50 %	0 %	115345609
1525	NC_008386	TGCCGG	2	12	79926	79937	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	115345609
1526	NC_008386	CAC	2	6	79939	79944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345609
1527	NC_008386	ACA	2	6	80063	80068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115345609
1528	NC_008386	GGC	2	6	80117	80122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345609
1529	NC_008386	ATG	2	6	80165	80170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345609
1530	NC_008386	TTG	2	6	80202	80207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345609
1531	NC_008386	TCT	2	6	80250	80255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345609
1532	NC_008386	GCA	2	6	80304	80309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345609
1533	NC_008386	GACCT	2	10	80331	80340	20 %	20 %	20 %	40 %	115345609
1534	NC_008386	GCG	2	6	80402	80407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345609
1535	NC_008386	GC	3	6	80436	80441	0 %	0 %	50 %	50 %	115345609
1536	NC_008386	GCT	2	6	80446	80451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345609
1537	NC_008386	CGT	2	6	80502	80507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345609
1538	NC_008386	CG	3	6	80556	80561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1539	NC_008386	TG	3	6	80604	80609	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_008386	GCT	2	6	80622	80627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_008386	TGG	2	6	80693	80698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_008386	CAG	2	6	80724	80729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_008386	GCG	2	6	80745	80750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_008386	GC	4	8	80798	80805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1545	NC_008386	GGC	2	6	80848	80853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_008386	GCC	2	6	80861	80866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1547	NC_008386	GTTC	2	8	80867	80874	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1548	NC_008386	GC	3	6	80878	80883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1549	NC_008386	TGC	2	6	80980	80985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_008386	TTG	2	6	81019	81024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_008386	GGA	2	6	81025	81030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_008386	AGC	2	6	81037	81042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_008386	TTA	2	6	81095	81100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_008386	GA	4	8	81133	81140	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_008386	CAA	2	6	81236	81241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_008386	TCA	2	6	81271	81276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345610
1557	NC_008386	T	6	6	81304	81309	0 %	100 %	0 %	0 %	115345610
1558	NC_008386	GAAT	2	8	81318	81325	50 %	25 %	25 %	0 %	115345610
1559	NC_008386	CTT	2	6	81387	81392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345610
1560	NC_008386	CTT	2	6	81396	81401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345610
1561	NC_008386	TGA	3	9	81415	81423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345610
1562	NC_008386	CCA	2	6	81433	81438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345610
1563	NC_008386	TCAT	2	8	81452	81459	25 %	50 %	0 %	25 %	115345610
1564	NC_008386	CAC	2	6	81465	81470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345610
1565	NC_008386	GC	4	8	81484	81491	0 %	0 %	50 %	50 %	115345610
1566	NC_008386	CAT	2	6	81538	81543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345610
1567	NC_008386	GAC	2	6	81652	81657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345610
1568	NC_008386	AAC	2	6	81842	81847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115345610
1569	NC_008386	CG	3	6	81859	81864	0 %	0 %	50 %	50 %	115345610
1570	NC_008386	ATC	2	6	81938	81943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345610
1571	NC_008386	TGA	2	6	82050	82055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345610
1572	NC_008386	CCG	2	6	82059	82064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345610
1573	NC_008386	CCG	2	6	82126	82131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345610
1574	NC_008386	AAT	2	6	82165	82170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115345610
1575	NC_008386	TGGG	2	8	82217	82224	0 %	25 %	75 %	0 %	115345610
1576	NC_008386	T	7	7	82249	82255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_008386	ACC	2	6	82457	82462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345611
1578	NC_008386	GCT	2	6	82514	82519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345611
1579	NC_008386	GAG	2	6	82546	82551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115345611
1580	NC_008386	TTC	2	6	82570	82575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345611
1581	NC_008386	CG	3	6	82613	82618	0 %	0 %	50 %	50 %	115345611
1582	NC_008386	CGC	2	6	82666	82671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345611
1583	NC_008386	GAT	2	6	82675	82680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345611
1584	NC_008386	CTT	2	6	82698	82703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345611
1585	NC_008386	CCGC	2	8	82793	82800	0 %	0 %	25 %	75 %	115345611
1586	NC_008386	GC	4	8	82823	82830	0 %	0 %	50 %	50 %	115345611
1587	NC_008386	GCG	2	6	82882	82887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345611
1588	NC_008386	TGC	2	6	83111	83116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345612
1589	NC_008386	CG	3	6	83204	83209	0 %	0 %	50 %	50 %	115345612
1590	NC_008386	GTT	2	6	83231	83236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345612
1591	NC_008386	AG	3	6	83285	83290	50 %	0 %	50 %	0 %	115345612
1592	NC_008386	TG	3	6	83320	83325	0 %	50 %	50 %	0 %	115345612
1593	NC_008386	CTG	2	6	83359	83364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345612
1594	NC_008386	CGA	2	6	83393	83398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345612
1595	NC_008386	TGA	2	6	83435	83440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345612
1596	NC_008386	GC	3	6	83467	83472	0 %	0 %	50 %	50 %	115345612
1597	NC_008386	GCC	2	6	83524	83529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345612
1598	NC_008386	CG	3	6	83530	83535	0 %	0 %	50 %	50 %	115345612
1599	NC_008386	CAA	2	6	83545	83550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115345612
1600	NC_008386	GCC	2	6	83583	83588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345612
1601	NC_008386	CGG	2	6	83614	83619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345612
1602	NC_008386	ATG	2	6	83682	83687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345612
1603	NC_008386	CG	3	6	83693	83698	0 %	0 %	50 %	50 %	115345612
1604	NC_008386	TGCTG	2	10	83868	83877	0 %	40 %	40 %	20 %	115345612
1605	NC_008386	CGG	2	6	83878	83883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345612
1606	NC_008386	AGC	2	6	83961	83966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345612
1607	NC_008386	CCGT	2	8	83995	84002	0 %	25 %	25 %	50 %	115345612
1608	NC_008386	GCC	2	6	84014	84019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345612
1609	NC_008386	TCA	2	6	84025	84030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345612
1610	NC_008386	GGT	2	6	84053	84058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345612
1611	NC_008386	GCC	2	6	84156	84161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345612
1612	NC_008386	GCG	2	6	84294	84299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345612
1613	NC_008386	TGT	2	6	84350	84355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345612
1614	NC_008386	AC	3	6	84451	84456	50 %	0 %	0 %	50 %	115345612
1615	NC_008386	ATC	2	6	84479	84484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345612
1616	NC_008386	GC	3	6	84516	84521	0 %	0 %	50 %	50 %	115345612
1617	NC_008386	TGT	2	6	84541	84546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345612
1618	NC_008386	GGCA	2	8	84590	84597	25 %	0 %	50 %	25 %	115345612
1619	NC_008386	CGCGG	2	10	84601	84610	0 %	0 %	60 %	40 %	115345612
1620	NC_008386	GAT	2	6	84623	84628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345612
1621	NC_008386	GTC	2	6	84687	84692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345612
1622	NC_008386	CGG	2	6	84694	84699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345612
1623	NC_008386	ACA	2	6	84741	84746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115345612
1624	NC_008386	TG	3	6	84758	84763	0 %	50 %	50 %	0 %	115345612
1625	NC_008386	TGC	2	6	84794	84799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345612
1626	NC_008386	GTA	2	6	84851	84856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345612
1627	NC_008386	CGC	2	6	84892	84897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345612
1628	NC_008386	AAC	2	6	84900	84905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115345612
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1630	NC_008386	CAC	2	6	84947	84952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345612
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1883	NC_008386	CG	3	6	99035	99040	0 %	0 %	50 %	50 %	115345629
1884	NC_008386	AT	4	8	99130	99137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1996	NC_008386	A	6	6	103863	103868	100 %	0 %	0 %	0 %	115345634
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