MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Roseobacter denitrificans plasmid pTB1

Total Repeats: 2058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008386	TTAT	2	8	26373	26380	25 %	75 %	0 %	0 %	115345557
502	NC_008386	AGA	2	6	26446	26451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_008386	CCG	2	6	26494	26499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_008386	CTG	2	6	26533	26538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345558
505	NC_008386	CT	3	6	26541	26546	0 %	50 %	0 %	50 %	115345558
506	NC_008386	GAC	2	6	26547	26552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345558
507	NC_008386	GCC	2	6	26634	26639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345558
508	NC_008386	AGC	2	6	26720	26725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345558
509	NC_008386	TAT	2	6	26784	26789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	115345558
510	NC_008386	CGC	2	6	26794	26799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345558
511	NC_008386	CTG	2	6	26829	26834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345558
512	NC_008386	AGC	2	6	26868	26873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345558
513	NC_008386	GCTG	2	8	26982	26989	0 %	25 %	50 %	25 %	115345558
514	NC_008386	GC	3	6	27002	27007	0 %	0 %	50 %	50 %	115345558
515	NC_008386	GAT	2	6	27021	27026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345558
516	NC_008386	GAC	2	6	27086	27091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345558
517	NC_008386	CAG	2	6	27177	27182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345558
518	NC_008386	GC	3	6	27272	27277	0 %	0 %	50 %	50 %	115345558
519	NC_008386	CGC	2	6	27328	27333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345558
520	NC_008386	TGT	2	6	27340	27345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345558
521	NC_008386	GACC	2	8	27377	27384	25 %	0 %	25 %	50 %	115345558
522	NC_008386	CGT	2	6	27393	27398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345558
523	NC_008386	CG	4	8	27428	27435	0 %	0 %	50 %	50 %	115345558
524	NC_008386	GGC	2	6	27445	27450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345558
525	NC_008386	CAT	2	6	27475	27480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345558
526	NC_008386	ATGG	2	8	27589	27596	25 %	25 %	50 %	0 %	115345559
527	NC_008386	CG	3	6	27654	27659	0 %	0 %	50 %	50 %	115345559
528	NC_008386	CGA	2	6	27694	27699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345559
529	NC_008386	TGGT	2	8	27714	27721	0 %	50 %	50 %	0 %	115345559
530	NC_008386	CGG	2	6	27748	27753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345559
531	NC_008386	GAGATG	2	12	27836	27847	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	115345559
532	NC_008386	ATC	2	6	27870	27875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345559
533	NC_008386	AGG	2	6	27915	27920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115345559
534	NC_008386	CTG	2	6	27932	27937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345559
535	NC_008386	GC	3	6	27993	27998	0 %	0 %	50 %	50 %	115345559
536	NC_008386	GAC	2	6	28012	28017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345559
537	NC_008386	TTGGCG	2	12	28077	28088	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	115345559
538	NC_008386	TCG	2	6	28236	28241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_008386	C	6	6	28292	28297	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
540	NC_008386	CAG	2	6	28327	28332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_008386	AAG	2	6	28345	28350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_008386	ATGC	2	8	28467	28474	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
543	NC_008386	GCGA	2	8	28487	28494	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
544	NC_008386	A	6	6	28566	28571	100 %	0 %	0 %	0 %	115345560
545	NC_008386	GGC	2	6	28707	28712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345560
546	NC_008386	GGT	2	6	28770	28775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345560
547	NC_008386	TCG	2	6	28792	28797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345560
548	NC_008386	CAC	2	6	28948	28953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345561
549	NC_008386	CTA	2	6	28985	28990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345561
550	NC_008386	GAT	2	6	29135	29140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345561
551	NC_008386	GAAGCA	2	12	29250	29261	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	115345561
552	NC_008386	GAA	2	6	29292	29297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345561
553	NC_008386	GCT	2	6	29383	29388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_008386	GT	3	6	29429	29434	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
555	NC_008386	TCA	2	6	29458	29463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345562
556	NC_008386	T	7	7	29488	29494	0 %	100 %	0 %	0 %	115345562
557	NC_008386	T	6	6	29505	29510	0 %	100 %	0 %	0 %	115345562
558	NC_008386	TGG	2	6	29602	29607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345562
559	NC_008386	AAGAA	2	10	29609	29618	80 %	0 %	20 %	0 %	115345562
560	NC_008386	GA	4	8	29735	29742	50 %	0 %	50 %	0 %	115345562
561	NC_008386	ATC	2	6	29766	29771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345562
562	NC_008386	GCC	2	6	29781	29786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345562
563	NC_008386	ACC	2	6	29790	29795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345562
564	NC_008386	CTG	2	6	29834	29839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345562
565	NC_008386	CG	3	6	29877	29882	0 %	0 %	50 %	50 %	115345562
566	NC_008386	GGC	2	6	29971	29976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345562
567	NC_008386	CAC	2	6	30010	30015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345562
568	NC_008386	GGGA	2	8	30089	30096	25 %	0 %	75 %	0 %	115345562
569	NC_008386	TGGC	2	8	30157	30164	0 %	25 %	50 %	25 %	115345562
570	NC_008386	TTC	2	6	30235	30240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345562
571	NC_008386	ATC	2	6	30271	30276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345562
572	NC_008386	CGG	2	6	30286	30291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345562
573	NC_008386	GC	3	6	30446	30451	0 %	0 %	50 %	50 %	115345562
574	NC_008386	TGA	2	6	30549	30554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345562
575	NC_008386	GTT	2	6	30564	30569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345562
576	NC_008386	CGA	2	6	30582	30587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345562
577	NC_008386	AAG	2	6	30746	30751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345562
578	NC_008386	GAC	2	6	30769	30774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345562
579	NC_008386	GCAC	2	8	30834	30841	25 %	0 %	25 %	50 %	115345562
580	NC_008386	GCG	2	6	30923	30928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345562
581	NC_008386	ATGGT	2	10	31300	31309	20 %	40 %	40 %	0 %	115345562
582	NC_008386	GCC	2	6	31320	31325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345562
583	NC_008386	TGACA	2	10	31326	31335	40 %	20 %	20 %	20 %	115345562
584	NC_008386	CTG	2	6	31336	31341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345562
585	NC_008386	CGC	2	6	31342	31347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345562
586	NC_008386	TGG	2	6	31397	31402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345562
587	NC_008386	GGC	2	6	31404	31409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345562
588	NC_008386	GAA	2	6	31435	31440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345562
589	NC_008386	GA	3	6	31514	31519	50 %	0 %	50 %	0 %	115345562
590	NC_008386	CG	3	6	31543	31548	0 %	0 %	50 %	50 %	115345562
591	NC_008386	ATCAG	2	10	31633	31642	40 %	20 %	20 %	20 %	115345562
592	NC_008386	TCT	2	6	31657	31662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345562
593	NC_008386	GAA	2	6	31690	31695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345562
594	NC_008386	AGA	2	6	31698	31703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345562
595	NC_008386	TGG	2	6	31775	31780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345562
596	NC_008386	AGC	2	6	31811	31816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345562
597	NC_008386	GCA	2	6	31824	31829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345562
598	NC_008386	ATG	2	6	31886	31891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345562
599	NC_008386	CTTG	2	8	31896	31903	0 %	50 %	25 %	25 %	115345562
600	NC_008386	ATG	2	6	31910	31915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345562
601	NC_008386	AGGGG	2	10	31965	31974	20 %	0 %	80 %	0 %	115345562
602	NC_008386	GCGG	2	8	32026	32033	0 %	0 %	75 %	25 %	115345563
603	NC_008386	GTC	2	6	32036	32041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345563
604	NC_008386	GAA	2	6	32090	32095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345563
605	NC_008386	CTT	2	6	32176	32181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345563
606	NC_008386	GGTT	2	8	32196	32203	0 %	50 %	50 %	0 %	115345563
607	NC_008386	TGG	2	6	32220	32225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345563
608	NC_008386	GC	3	6	32303	32308	0 %	0 %	50 %	50 %	115345563
609	NC_008386	TGG	2	6	32335	32340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345563
610	NC_008386	GAA	2	6	32447	32452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345563
611	NC_008386	GCT	2	6	32534	32539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345563
612	NC_008386	GAT	2	6	32612	32617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345563
613	NC_008386	ATC	2	6	32631	32636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345563
614	NC_008386	TG	3	6	32656	32661	0 %	50 %	50 %	0 %	115345563
615	NC_008386	TGA	2	6	32695	32700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345563
616	NC_008386	CGC	2	6	32849	32854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345563
617	NC_008386	TTG	2	6	32919	32924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345563
618	NC_008386	TGTT	2	8	32973	32980	0 %	75 %	25 %	0 %	115345563
619	NC_008386	CGC	2	6	33096	33101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345563
620	NC_008386	AGA	2	6	33196	33201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345563
621	NC_008386	GAC	2	6	33209	33214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345563
622	NC_008386	GGA	2	6	33226	33231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115345563
623	NC_008386	TGG	2	6	33250	33255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345563
624	NC_008386	GAT	2	6	33260	33265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345563
625	NC_008386	AGC	2	6	33292	33297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345564
626	NC_008386	CAG	2	6	33340	33345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345564
627	NC_008386	GC	4	8	33373	33380	0 %	0 %	50 %	50 %	115345564
628	NC_008386	TCG	2	6	33416	33421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345564
629	NC_008386	TC	3	6	33470	33475	0 %	50 %	0 %	50 %	115345564
630	NC_008386	GGC	2	6	33499	33504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345564
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634	NC_008386	CG	3	6	33723	33728	0 %	0 %	50 %	50 %	115345564
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