MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL11

Total Repeats: 15688

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008384	GC	3	6	150928	150933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3502	NC_008384	TCC	2	6	150934	150939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3503	NC_008384	GC	3	6	150953	150958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3504	NC_008384	ACG	2	6	151157	151162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255339
3505	NC_008384	GTG	2	6	151199	151204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255339
3506	NC_008384	TCG	2	6	151253	151258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255339
3507	NC_008384	GCG	2	6	151335	151340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255339
3508	NC_008384	TCT	2	6	151375	151380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255339
3509	NC_008384	GCA	2	6	151432	151437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255339
3510	NC_008384	GACG	2	8	151497	151504	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3511	NC_008384	CAT	2	6	151586	151591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255340
3512	NC_008384	AGC	2	6	151703	151708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255340
3513	NC_008384	GGA	2	6	151748	151753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255340
3514	NC_008384	TCG	3	9	151780	151788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255340
3515	NC_008384	CCG	2	6	151825	151830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255340
3516	NC_008384	ATGA	2	8	151899	151906	50 %	25 %	25 %	0 %	116255340
3517	NC_008384	CCG	2	6	151912	151917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255340
3518	NC_008384	GAT	2	6	151934	151939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255340
3519	NC_008384	GATG	2	8	152135	152142	25 %	25 %	50 %	0 %	116255340
3520	NC_008384	CG	3	6	152202	152207	0 %	0 %	50 %	50 %	116255340
3521	NC_008384	GTT	2	6	152235	152240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255340
3522	NC_008384	CG	4	8	152326	152333	0 %	0 %	50 %	50 %	116255340
3523	NC_008384	GGC	2	6	152409	152414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255340
3524	NC_008384	CT	3	6	152421	152426	0 %	50 %	0 %	50 %	116255340
3525	NC_008384	ATCCT	2	10	152452	152461	20 %	40 %	0 %	40 %	116255340
3526	NC_008384	AC	3	6	152553	152558	50 %	0 %	0 %	50 %	116255340
3527	NC_008384	GC	3	6	152652	152657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3528	NC_008384	GCC	2	6	152741	152746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3529	NC_008384	CGGC	2	8	152834	152841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3530	NC_008384	CG	3	6	152972	152977	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3531	NC_008384	ACA	2	6	152978	152983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_008384	TCG	2	6	152984	152989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_008384	CGGG	2	8	153010	153017	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3534	NC_008384	GGC	2	6	153025	153030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_008384	GTG	2	6	153038	153043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_008384	GCCTTC	2	12	153200	153211	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3537	NC_008384	GGC	2	6	153284	153289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255341
3538	NC_008384	TTC	2	6	153298	153303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255341
3539	NC_008384	TGG	2	6	153305	153310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255341
3540	NC_008384	TTGGCC	2	12	153346	153357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255341
3541	NC_008384	CTT	2	6	153419	153424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255341
3542	NC_008384	GGT	2	6	153469	153474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255341
3543	NC_008384	GGCT	2	8	153486	153493	0 %	25 %	50 %	25 %	116255341
3544	NC_008384	GC	4	8	153546	153553	0 %	0 %	50 %	50 %	116255341
3545	NC_008384	ATCA	2	8	153707	153714	50 %	25 %	0 %	25 %	116255342
3546	NC_008384	CGAA	2	8	153787	153794	50 %	0 %	25 %	25 %	116255342
3547	NC_008384	AAT	2	6	153832	153837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116255342
3548	NC_008384	AAG	2	6	153894	153899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255342
3549	NC_008384	TAA	2	6	153930	153935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116255342
3550	NC_008384	T	6	6	153955	153960	0 %	100 %	0 %	0 %	116255342
3551	NC_008384	TGA	2	6	153966	153971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255342
3552	NC_008384	GTC	2	6	153977	153982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255342
3553	NC_008384	TTC	3	9	153995	154003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255342
3554	NC_008384	CT	3	6	154068	154073	0 %	50 %	0 %	50 %	116255342
3555	NC_008384	CGA	2	6	154077	154082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255342
3556	NC_008384	GTT	2	6	154143	154148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255342
3557	NC_008384	AGC	2	6	154208	154213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255342
3558	NC_008384	AGGC	2	8	154254	154261	25 %	0 %	50 %	25 %	116255342
3559	NC_008384	GCC	2	6	154262	154267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255342
3560	NC_008384	CCAA	2	8	154277	154284	50 %	0 %	0 %	50 %	116255342
3561	NC_008384	TGT	2	6	154444	154449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255343
3562	NC_008384	GCG	2	6	154460	154465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255343
3563	NC_008384	TGCGG	2	10	154469	154478	0 %	20 %	60 %	20 %	116255343
3564	NC_008384	GCA	2	6	154494	154499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255343
3565	NC_008384	CAGC	2	8	154546	154553	25 %	0 %	25 %	50 %	116255343
3566	NC_008384	CGA	2	6	154627	154632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255343
3567	NC_008384	TTCA	2	8	154642	154649	25 %	50 %	0 %	25 %	116255343
3568	NC_008384	GCC	2	6	154665	154670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255343
3569	NC_008384	GGTCC	2	10	154738	154747	0 %	20 %	40 %	40 %	116255343
3570	NC_008384	ATC	2	6	154799	154804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255343
3571	NC_008384	CTC	2	6	154819	154824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255343
3572	NC_008384	CGA	2	6	154878	154883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255343
3573	NC_008384	ATC	2	6	154906	154911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255343
3574	NC_008384	GAC	2	6	154912	154917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255343
3575	NC_008384	CCA	2	6	154989	154994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255343
3576	NC_008384	TCGC	2	8	155025	155032	0 %	25 %	25 %	50 %	116255343
3577	NC_008384	CCG	2	6	155039	155044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255343
3578	NC_008384	TCC	2	6	155066	155071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255343
3579	NC_008384	AGC	2	6	155123	155128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255343
3580	NC_008384	GCG	2	6	155152	155157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255343
3581	NC_008384	TCGC	2	8	155182	155189	0 %	25 %	25 %	50 %	116255343
3582	NC_008384	CGCC	2	8	155260	155267	0 %	0 %	25 %	75 %	116255343
3583	NC_008384	CTCAT	2	10	155273	155282	20 %	40 %	0 %	40 %	116255343
3584	NC_008384	TCA	2	6	155289	155294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_008384	CAC	2	6	155329	155334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255344
3586	NC_008384	GCA	2	6	155359	155364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255344
3587	NC_008384	GCATC	2	10	155372	155381	20 %	20 %	20 %	40 %	116255344
3588	NC_008384	GCC	2	6	155454	155459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255344
3589	NC_008384	TGCC	2	8	155531	155538	0 %	25 %	25 %	50 %	116255344
3590	NC_008384	GAT	2	6	155559	155564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255344
3591	NC_008384	ATT	2	6	155636	155641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_008384	CCAT	2	8	155663	155670	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3593	NC_008384	TTC	2	6	155711	155716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_008384	TCGC	2	8	155729	155736	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3595	NC_008384	GCC	2	6	155770	155775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3596	NC_008384	CCA	2	6	155798	155803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3597	NC_008384	TCG	2	6	155825	155830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_008384	CAC	2	6	155856	155861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3599	NC_008384	GAT	2	6	155881	155886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_008384	CAT	2	6	155986	155991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_008384	CTTG	2	8	156019	156026	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3602	NC_008384	CCG	2	6	156100	156105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3603	NC_008384	TTC	2	6	156163	156168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_008384	GT	3	6	156350	156355	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_008384	GAT	2	6	156365	156370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_008384	TGAG	2	8	156420	156427	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_008384	GCC	2	6	156466	156471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3608	NC_008384	TGAC	2	8	156477	156484	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3609	NC_008384	GCT	2	6	156517	156522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_008384	GAA	2	6	156605	156610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255345
3611	NC_008384	CTG	2	6	156611	156616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255345
3612	NC_008384	CCGCGG	2	12	156700	156711	0 %	0 %	50 %	50 %	116255345
3613	NC_008384	AG	3	6	156735	156740	50 %	0 %	50 %	0 %	116255345
3614	NC_008384	TGAA	2	8	156756	156763	50 %	25 %	25 %	0 %	116255345
3615	NC_008384	GCG	2	6	156775	156780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255345
3616	NC_008384	GGT	2	6	156830	156835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255345
3617	NC_008384	CG	3	6	156863	156868	0 %	0 %	50 %	50 %	116255345
3618	NC_008384	CG	3	6	156880	156885	0 %	0 %	50 %	50 %	116255345
3619	NC_008384	GCTG	2	8	156994	157001	0 %	25 %	50 %	25 %	116255345
3620	NC_008384	CG	3	6	157069	157074	0 %	0 %	50 %	50 %	116255345
3621	NC_008384	ACG	2	6	157098	157103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255345
3622	NC_008384	ACGGCG	2	12	157122	157133	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	116255345
3623	NC_008384	GCC	2	6	157145	157150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255345
3624	NC_008384	CGC	2	6	157273	157278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255345
3625	NC_008384	TGA	2	6	157315	157320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255345
3626	NC_008384	GCC	2	6	157385	157390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255345
3627	NC_008384	GCG	2	6	157619	157624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255345
3628	NC_008384	GTT	2	6	157684	157689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_008384	TTA	2	6	157753	157758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_008384	TCA	2	6	157769	157774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3631	NC_008384	GCG	3	9	157777	157785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3632	NC_008384	GTC	2	6	157787	157792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3633	NC_008384	TGA	2	6	157909	157914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3634	NC_008384	GGA	2	6	158014	158019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255346
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3664	NC_008384	ACG	2	6	159924	159929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3689	NC_008384	ATG	2	6	160948	160953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255349
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3728	NC_008384	GACA	2	8	163086	163093	50 %	0 %	25 %	25 %	116255351
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3731	NC_008384	GTCGA	2	10	163339	163348	20 %	20 %	40 %	20 %	116255351
3732	NC_008384	AGA	2	6	163367	163372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255351
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3735	NC_008384	GCG	2	6	163490	163495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255351
3736	NC_008384	CGGC	2	8	163499	163506	0 %	0 %	50 %	50 %	116255351
3737	NC_008384	AGCA	2	8	163542	163549	50 %	0 %	25 %	25 %	116255351
3738	NC_008384	CCAG	2	8	163552	163559	25 %	0 %	25 %	50 %	116255351
3739	NC_008384	TGTC	2	8	163613	163620	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3740	NC_008384	CAT	2	6	163703	163708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255352
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3743	NC_008384	GGGCG	2	10	164090	164099	0 %	0 %	80 %	20 %	116255352
3744	NC_008384	GGC	2	6	164154	164159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255352
3745	NC_008384	ACG	2	6	164269	164274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255352
3746	NC_008384	CTT	2	6	164321	164326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255352
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3748	NC_008384	GCCT	2	8	164466	164473	0 %	25 %	25 %	50 %	116255352
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3853	NC_008384	TAG	2	6	170048	170053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3991	NC_008384	GCG	2	6	177543	177548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255365
3992	NC_008384	GCC	2	6	177585	177590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255365
3993	NC_008384	TCG	2	6	177628	177633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255365
3994	NC_008384	GGC	2	6	177646	177651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255365
3995	NC_008384	ACA	2	6	177761	177766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255365
3996	NC_008384	GCCG	2	8	177785	177792	0 %	0 %	50 %	50 %	116255365
3997	NC_008384	CGC	2	6	177842	177847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255365
3998	NC_008384	GCG	2	6	177939	177944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255365
3999	NC_008384	GCA	2	6	177945	177950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255365
4000	NC_008384	GAT	2	6	178112	178117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255365

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