MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL11

Total Repeats: 15688

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_008384	TTCG	2	8	104476	104483	0 %	50 %	25 %	25 %	116255290
2502	NC_008384	CGT	2	6	104533	104538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255290
2503	NC_008384	GGC	2	6	104559	104564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255290
2504	NC_008384	ACT	2	6	104569	104574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255290
2505	NC_008384	GC	3	6	104620	104625	0 %	0 %	50 %	50 %	116255290
2506	NC_008384	TGCCG	2	10	104629	104638	0 %	20 %	40 %	40 %	116255290
2507	NC_008384	GGC	2	6	104677	104682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255290
2508	NC_008384	GGC	2	6	104689	104694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255290
2509	NC_008384	TGA	2	6	104709	104714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_008384	AGG	2	6	104748	104753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_008384	GCA	2	6	104761	104766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2512	NC_008384	GC	3	6	104850	104855	0 %	0 %	50 %	50 %	116255291
2513	NC_008384	GAG	2	6	104903	104908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255291
2514	NC_008384	TCCC	2	8	104932	104939	0 %	25 %	0 %	75 %	116255291
2515	NC_008384	GC	3	6	104969	104974	0 %	0 %	50 %	50 %	116255291
2516	NC_008384	CATC	2	8	105034	105041	25 %	25 %	0 %	50 %	116255291
2517	NC_008384	GC	3	6	105091	105096	0 %	0 %	50 %	50 %	116255291
2518	NC_008384	CGG	2	6	105118	105123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255291
2519	NC_008384	CCG	2	6	105128	105133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255291
2520	NC_008384	TGA	2	6	105168	105173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255291
2521	NC_008384	CCG	2	6	105178	105183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255291
2522	NC_008384	CGG	2	6	105202	105207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255291
2523	NC_008384	CGA	2	6	105232	105237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255291
2524	NC_008384	GTGA	2	8	105277	105284	25 %	25 %	50 %	0 %	116255291
2525	NC_008384	CGTC	2	8	105304	105311	0 %	25 %	25 %	50 %	116255292
2526	NC_008384	GGC	2	6	105369	105374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255292
2527	NC_008384	TCG	2	6	105398	105403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255292
2528	NC_008384	TCG	2	6	105422	105427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255292
2529	NC_008384	GGC	2	6	105495	105500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255292
2530	NC_008384	GGA	2	6	105520	105525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255292
2531	NC_008384	CGA	2	6	105567	105572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255292
2532	NC_008384	GCC	3	9	105583	105591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255292
2533	NC_008384	CAT	2	6	105601	105606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255292
2534	NC_008384	CGA	2	6	105638	105643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255292
2535	NC_008384	GC	3	6	105646	105651	0 %	0 %	50 %	50 %	116255292
2536	NC_008384	GCT	2	6	105670	105675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255292
2537	NC_008384	GCG	2	6	105748	105753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255292
2538	NC_008384	GCG	3	9	105785	105793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255292
2539	NC_008384	TCG	2	6	105839	105844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255292
2540	NC_008384	GTG	2	6	105871	105876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255292
2541	NC_008384	ACCG	2	8	105910	105917	25 %	0 %	25 %	50 %	116255292
2542	NC_008384	TGC	2	6	105939	105944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255292
2543	NC_008384	AGC	2	6	105952	105957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2544	NC_008384	GCCGGC	2	12	105963	105974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2545	NC_008384	CGC	2	6	106018	106023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255293
2546	NC_008384	GAT	2	6	106041	106046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255293
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2548	NC_008384	CG	3	6	106173	106178	0 %	0 %	50 %	50 %	116255293
2549	NC_008384	CGT	2	6	106201	106206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255293
2550	NC_008384	TGGCG	2	10	106244	106253	0 %	20 %	60 %	20 %	116255293
2551	NC_008384	CGA	2	6	106298	106303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255293
2552	NC_008384	TCG	2	6	106310	106315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255293
2553	NC_008384	GCC	2	6	106336	106341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255293
2554	NC_008384	GCC	2	6	106351	106356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255293
2555	NC_008384	CGC	2	6	106393	106398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255293
2556	NC_008384	CGG	3	9	106429	106437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255293
2557	NC_008384	GCG	2	6	106456	106461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255293
2558	NC_008384	GGC	2	6	106462	106467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255293
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2560	NC_008384	GC	3	6	106554	106559	0 %	0 %	50 %	50 %	116255293
2561	NC_008384	AAG	2	6	106573	106578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255293
2562	NC_008384	GC	3	6	106588	106593	0 %	0 %	50 %	50 %	116255293
2563	NC_008384	AGA	2	6	106610	106615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255293
2564	NC_008384	TCC	2	6	106636	106641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2565	NC_008384	GCCG	2	8	106664	106671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2566	NC_008384	CTT	2	6	106675	106680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2567	NC_008384	CGA	2	6	106704	106709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2568	NC_008384	AGC	3	9	106731	106739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2569	NC_008384	GCC	2	6	106801	106806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2570	NC_008384	GGT	2	6	106807	106812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_008384	CGG	2	6	106934	106939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2572	NC_008384	CCTG	2	8	106959	106966	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2573	NC_008384	GC	3	6	106977	106982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2574	NC_008384	CGT	2	6	106991	106996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2575	NC_008384	T	7	7	107170	107176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_008384	GAT	2	6	107193	107198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2578	NC_008384	ACC	2	6	107369	107374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2579	NC_008384	AAT	2	6	107421	107426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_008384	ACC	2	6	107461	107466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2581	NC_008384	GCT	2	6	107467	107472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2582	NC_008384	GAT	2	6	107568	107573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_008384	GAA	2	6	107641	107646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_008384	CTG	2	6	107661	107666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2585	NC_008384	GAG	2	6	107693	107698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2587	NC_008384	GAT	2	6	107775	107780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_008384	CGAAAC	2	12	107804	107815	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2589	NC_008384	GCC	2	6	107817	107822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2590	NC_008384	CTG	2	6	107854	107859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2591	NC_008384	GC	3	6	107997	108002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2592	NC_008384	GGC	2	6	108022	108027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2593	NC_008384	ATC	2	6	108052	108057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2594	NC_008384	TGG	2	6	108146	108151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_008384	AACG	2	8	108222	108229	50 %	0 %	25 %	25 %	116255294
2596	NC_008384	GAG	2	6	108315	108320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255294
2597	NC_008384	GCGA	2	8	108405	108412	25 %	0 %	50 %	25 %	116255294
2598	NC_008384	GAA	2	6	108498	108503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255294
2599	NC_008384	GGC	2	6	108504	108509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255294
2600	NC_008384	CTT	2	6	108522	108527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255294
2601	NC_008384	CAG	2	6	108580	108585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255294
2602	NC_008384	GGCC	2	8	108627	108634	0 %	0 %	50 %	50 %	116255294
2603	NC_008384	TAG	2	6	108716	108721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255294
2604	NC_008384	TGA	2	6	108772	108777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255294
2605	NC_008384	GAA	2	6	108884	108889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_008384	CGGC	2	8	108890	108897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2607	NC_008384	CTG	2	6	109044	109049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255295
2608	NC_008384	AGTG	2	8	109063	109070	25 %	25 %	50 %	0 %	116255295
2609	NC_008384	TCA	2	6	109073	109078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255295
2610	NC_008384	CTT	2	6	109086	109091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255295
2611	NC_008384	GCCA	2	8	109097	109104	25 %	0 %	25 %	50 %	116255295
2612	NC_008384	TTC	2	6	109108	109113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255295
2613	NC_008384	TGT	2	6	109312	109317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255295
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2615	NC_008384	AG	3	6	109409	109414	50 %	0 %	50 %	0 %	116255295
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2617	NC_008384	ATC	2	6	109446	109451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255295
2618	NC_008384	GA	3	6	109543	109548	50 %	0 %	50 %	0 %	116255295
2619	NC_008384	TGT	2	6	109556	109561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255295
2620	NC_008384	CGGCG	2	10	109586	109595	0 %	0 %	60 %	40 %	116255295
2621	NC_008384	TAG	2	6	109596	109601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255295
2622	NC_008384	TCG	2	6	109639	109644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255295
2623	NC_008384	GCCT	2	8	109737	109744	0 %	25 %	25 %	50 %	116255295
2624	NC_008384	GAT	2	6	109752	109757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255295
2625	NC_008384	GCG	2	6	109758	109763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255295
2626	NC_008384	TGGC	2	8	109888	109895	0 %	25 %	50 %	25 %	116255295
2627	NC_008384	TGC	2	6	109903	109908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255295
2628	NC_008384	GGC	2	6	109937	109942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255295
2629	NC_008384	CTTG	2	8	109943	109950	0 %	50 %	25 %	25 %	116255295
2630	NC_008384	CG	3	6	110031	110036	0 %	0 %	50 %	50 %	116255295
2631	NC_008384	GAA	2	6	110037	110042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255295
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2639	NC_008384	TTGC	2	8	110391	110398	0 %	50 %	25 %	25 %	116255295
2640	NC_008384	CAT	2	6	110448	110453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255295
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2647	NC_008384	GTC	2	6	110910	110915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2649	NC_008384	TCG	2	6	111023	111028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2650	NC_008384	TTG	2	6	111031	111036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2651	NC_008384	TCG	2	6	111047	111052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2652	NC_008384	AAC	2	6	111143	111148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2653	NC_008384	CGA	2	6	111198	111203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2655	NC_008384	GCA	2	6	111320	111325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2657	NC_008384	CG	3	6	111417	111422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2658	NC_008384	CTA	2	6	111476	111481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2737	NC_008384	CCGAT	2	10	115010	115019	20 %	20 %	20 %	40 %	116255298
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2742	NC_008384	TGG	2	6	115362	115367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255298
2743	NC_008384	CAAC	2	8	115380	115387	50 %	0 %	0 %	50 %	116255298
2744	NC_008384	AGC	2	6	115425	115430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255298
2745	NC_008384	GAC	2	6	115491	115496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255298
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2747	NC_008384	CTT	2	6	115834	115839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255299
2748	NC_008384	ATC	2	6	115888	115893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255299
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2868	NC_008384	CGT	2	6	121752	121757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2869	NC_008384	ATG	2	6	121800	121805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2870	NC_008384	GCT	2	6	121933	121938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2872	NC_008384	AAC	2	6	122101	122106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2873	NC_008384	GT	3	6	122249	122254	0 %	50 %	50 %	0 %	116255303
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2880	NC_008384	AGCG	2	8	122518	122525	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2881	NC_008384	T	6	6	122536	122541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2991	NC_008384	GCA	2	6	127457	127462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2992	NC_008384	ACG	2	6	127533	127538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255311
2993	NC_008384	GCA	2	6	127596	127601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255311
2994	NC_008384	CGC	2	6	127616	127621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255311
2995	NC_008384	GCGA	2	8	127663	127670	25 %	0 %	50 %	25 %	116255311
2996	NC_008384	GAAC	2	8	127725	127732	50 %	0 %	25 %	25 %	116255311
2997	NC_008384	TGCGGC	2	12	127776	127787	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116255311
2998	NC_008384	CGT	2	6	127826	127831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255311
2999	NC_008384	CGG	2	6	127838	127843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255311
3000	NC_008384	CAT	2	6	127887	127892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255311

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