MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL11

Total Repeats: 15688

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008384	GATC	2	8	21882	21889	25 %	25 %	25 %	25 %	116255214
502	NC_008384	TCG	2	6	21937	21942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_008384	ATG	2	6	21957	21962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255215
504	NC_008384	GCC	2	6	22109	22114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255215
505	NC_008384	GGA	2	6	22116	22121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255215
506	NC_008384	ATC	2	6	22148	22153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255215
507	NC_008384	GGT	2	6	22398	22403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255215
508	NC_008384	GAC	3	9	22451	22459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_008384	GC	3	6	22554	22559	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
510	NC_008384	GCC	2	6	22584	22589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_008384	T	6	6	22590	22595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_008384	TCG	2	6	22677	22682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255216
513	NC_008384	CCA	2	6	22776	22781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255216
514	NC_008384	GCG	2	6	22789	22794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255216
515	NC_008384	GAT	2	6	22805	22810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255216
516	NC_008384	AG	3	6	22821	22826	50 %	0 %	50 %	0 %	116255216
517	NC_008384	TCG	2	6	22833	22838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255216
518	NC_008384	CGGC	2	8	23005	23012	0 %	0 %	50 %	50 %	116255216
519	NC_008384	CGT	2	6	23038	23043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_008384	GTG	2	6	23066	23071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_008384	CG	3	6	23155	23160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
522	NC_008384	GGCC	2	8	23259	23266	0 %	0 %	50 %	50 %	116255217
523	NC_008384	GC	3	6	23317	23322	0 %	0 %	50 %	50 %	116255217
524	NC_008384	TTC	2	6	23335	23340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255217
525	NC_008384	GGTG	2	8	23344	23351	0 %	25 %	75 %	0 %	116255217
526	NC_008384	ATC	3	9	23366	23374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255217
527	NC_008384	ATC	2	6	23425	23430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255217
528	NC_008384	CG	3	6	23459	23464	0 %	0 %	50 %	50 %	116255217
529	NC_008384	CTG	2	6	23503	23508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255217
530	NC_008384	TCGC	2	8	23536	23543	0 %	25 %	25 %	50 %	116255217
531	NC_008384	CGT	2	6	23577	23582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255217
532	NC_008384	TTG	2	6	23600	23605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255217
533	NC_008384	TCC	2	6	23633	23638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255217
534	NC_008384	TCG	2	6	23642	23647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255217
535	NC_008384	CGA	2	6	23712	23717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255217
536	NC_008384	CGA	2	6	23721	23726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255217
537	NC_008384	CGG	2	6	23784	23789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255217
538	NC_008384	TCG	2	6	23795	23800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255217
539	NC_008384	GGC	2	6	23823	23828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255217
540	NC_008384	CGC	2	6	24017	24022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_008384	CG	3	6	24051	24056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
542	NC_008384	ATC	2	6	24061	24066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_008384	CGA	2	6	24095	24100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_008384	CCG	2	6	24111	24116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_008384	CTT	2	6	24151	24156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255218
546	NC_008384	CTGC	2	8	24218	24225	0 %	25 %	25 %	50 %	116255218
547	NC_008384	ATA	2	6	24258	24263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116255218
548	NC_008384	CTT	2	6	24289	24294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255218
549	NC_008384	CGG	2	6	24460	24465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255218
550	NC_008384	GCC	2	6	24467	24472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255218
551	NC_008384	CG	3	6	24486	24491	0 %	0 %	50 %	50 %	116255218
552	NC_008384	GCC	2	6	24524	24529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255218
553	NC_008384	GCT	2	6	24541	24546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255218
554	NC_008384	TCT	2	6	24555	24560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255218
555	NC_008384	GCG	2	6	24621	24626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255218
556	NC_008384	CGC	2	6	24646	24651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255218
557	NC_008384	CGG	2	6	24699	24704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255218
558	NC_008384	GCAGCG	2	12	24711	24722	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	116255218
559	NC_008384	GGC	2	6	24739	24744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255218
560	NC_008384	CTG	2	6	24752	24757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255218
561	NC_008384	CGG	2	6	24793	24798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255218
562	NC_008384	CTT	2	6	24913	24918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255218
563	NC_008384	GGCT	2	8	24938	24945	0 %	25 %	50 %	25 %	116255218
564	NC_008384	GTC	2	6	25010	25015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255218
565	NC_008384	GGT	2	6	25021	25026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255218
566	NC_008384	CGA	2	6	25107	25112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255218
567	NC_008384	TCG	2	6	25160	25165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255218
568	NC_008384	CGC	2	6	25192	25197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255218
569	NC_008384	TCT	2	6	25221	25226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255218
570	NC_008384	CCG	2	6	25236	25241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255218
571	NC_008384	GCC	2	6	25250	25255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255218
572	NC_008384	GCC	2	6	25308	25313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255218
573	NC_008384	GCC	2	6	25316	25321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255218
574	NC_008384	CGC	3	9	25324	25332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255218
575	NC_008384	CAT	2	6	25372	25377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_008384	CGA	2	6	25480	25485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255219
577	NC_008384	CTT	2	6	25645	25650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255219
578	NC_008384	GC	3	6	25704	25709	0 %	0 %	50 %	50 %	116255219
579	NC_008384	CGA	2	6	25779	25784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255219
580	NC_008384	CTT	2	6	25828	25833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255219
581	NC_008384	CGG	2	6	25945	25950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255219
582	NC_008384	TGC	2	6	25953	25958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255219
583	NC_008384	CTT	2	6	26047	26052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255219
584	NC_008384	CGGC	2	8	26062	26069	0 %	0 %	50 %	50 %	116255219
585	NC_008384	ATG	2	6	26091	26096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255219
586	NC_008384	CG	3	6	26187	26192	0 %	0 %	50 %	50 %	116255219
587	NC_008384	TGC	2	6	26193	26198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255219
588	NC_008384	CAT	2	6	26311	26316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255219
589	NC_008384	GCC	2	6	26417	26422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255219
590	NC_008384	CTG	2	6	26426	26431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255219
591	NC_008384	GCC	2	6	26486	26491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255219
592	NC_008384	GCCT	2	8	26523	26530	0 %	25 %	25 %	50 %	116255219
593	NC_008384	GCG	2	6	26558	26563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255219
594	NC_008384	GCC	2	6	26570	26575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255219
595	NC_008384	TCGG	2	8	26582	26589	0 %	25 %	50 %	25 %	116255219
596	NC_008384	CGG	2	6	26596	26601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255219
597	NC_008384	TCG	2	6	26604	26609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255219
598	NC_008384	CGT	2	6	26617	26622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255219
599	NC_008384	AGCG	2	8	26638	26645	25 %	0 %	50 %	25 %	116255219
600	NC_008384	GCA	2	6	26646	26651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255219
601	NC_008384	TTC	2	6	26666	26671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255219
602	NC_008384	GCC	2	6	26675	26680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255219
603	NC_008384	TGC	2	6	26686	26691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255219
604	NC_008384	CTG	2	6	26699	26704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255219
605	NC_008384	TCG	2	6	26709	26714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255219
606	NC_008384	CT	3	6	26791	26796	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
607	NC_008384	ATT	2	6	26942	26947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_008384	AAT	2	6	27080	27085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_008384	TTA	2	6	27092	27097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_008384	TCC	2	6	27116	27121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_008384	ACG	2	6	27151	27156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_008384	TAT	2	6	27191	27196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116255220
613	NC_008384	ATG	2	6	27207	27212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255220
614	NC_008384	CCG	2	6	27215	27220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255220
615	NC_008384	GGC	2	6	27249	27254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255220
616	NC_008384	GCA	2	6	27261	27266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255220
617	NC_008384	GC	3	6	27284	27289	0 %	0 %	50 %	50 %	116255220
618	NC_008384	GCTGG	2	10	27326	27335	0 %	20 %	60 %	20 %	116255220
619	NC_008384	TGC	2	6	27365	27370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255220
620	NC_008384	AGA	2	6	27373	27378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255220
621	NC_008384	TTC	2	6	27384	27389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255220
622	NC_008384	GAG	2	6	27390	27395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255220
623	NC_008384	CGG	2	6	27422	27427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255220
624	NC_008384	CGG	2	6	27457	27462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255220
625	NC_008384	GC	3	6	27510	27515	0 %	0 %	50 %	50 %	116255220
626	NC_008384	CCG	2	6	27517	27522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255220
627	NC_008384	GAA	2	6	27584	27589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255220
628	NC_008384	CACCAA	2	12	27776	27787	50 %	0 %	0 %	50 %	116255220
629	NC_008384	GAC	2	6	27807	27812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255220
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649	NC_008384	GA	3	6	28982	28987	50 %	0 %	50 %	0 %	116255221
650	NC_008384	ATTC	2	8	28997	29004	25 %	50 %	0 %	25 %	116255221
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754	NC_008384	ACCGG	2	10	33054	33063	20 %	0 %	40 %	40 %	116255225
755	NC_008384	CGC	2	6	33148	33153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255225
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764	NC_008384	CGG	2	6	33571	33576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255226
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999	NC_008384	GCG	2	6	42274	42279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255234
1000	NC_008384	GCT	2	6	42297	42302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255234

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