MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL8

Total Repeats: 390

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008383	CGTT	2	8	537	544	0 %	50 %	25 %	25 %	116255068
2	NC_008383	CGAT	2	8	1450	1457	25 %	25 %	25 %	25 %	116255069
3	NC_008383	CCGT	2	8	1513	1520	0 %	25 %	25 %	50 %	116255069
4	NC_008383	TCGC	2	8	1562	1569	0 %	25 %	25 %	50 %	116255069
5	NC_008383	GCTG	2	8	1848	1855	0 %	25 %	50 %	25 %	116255069
6	NC_008383	GTTC	2	8	3078	3085	0 %	50 %	25 %	25 %	116255070
7	NC_008383	CGGA	2	8	3206	3213	25 %	0 %	50 %	25 %	116255070
8	NC_008383	TGCC	2	8	3357	3364	0 %	25 %	25 %	50 %	116255070
9	NC_008383	CCGA	2	8	3829	3836	25 %	0 %	25 %	50 %	116255071
10	NC_008383	TCAA	2	8	3925	3932	50 %	25 %	0 %	25 %	116255071
11	NC_008383	ACTC	2	8	4140	4147	25 %	25 %	0 %	50 %	116255071
12	NC_008383	CAGG	2	8	4219	4226	25 %	0 %	50 %	25 %	116255071
13	NC_008383	TCTT	2	8	4241	4248	0 %	75 %	0 %	25 %	116255071
14	NC_008383	ACCG	2	8	4374	4381	25 %	0 %	25 %	50 %	116255071
15	NC_008383	GAGC	2	8	4591	4598	25 %	0 %	50 %	25 %	116255071
16	NC_008383	CTCA	2	8	4849	4856	25 %	25 %	0 %	50 %	116255071
17	NC_008383	TTCG	2	8	5164	5171	0 %	50 %	25 %	25 %	116255071
18	NC_008383	AGCC	2	8	5340	5347	25 %	0 %	25 %	50 %	116255071
19	NC_008383	TCAC	2	8	5383	5390	25 %	25 %	0 %	50 %	116255071
20	NC_008383	TCCT	2	8	5545	5552	0 %	50 %	0 %	50 %	116255071
21	NC_008383	TTTC	2	8	5710	5717	0 %	75 %	0 %	25 %	116255071
22	NC_008383	TGAT	2	8	5816	5823	25 %	50 %	25 %	0 %	116255071
23	NC_008383	GCAG	2	8	6091	6098	25 %	0 %	50 %	25 %	116255071
24	NC_008383	TTCA	2	8	6312	6319	25 %	50 %	0 %	25 %	116255071
25	NC_008383	GCGG	2	8	6937	6944	0 %	0 %	75 %	25 %	116255072
26	NC_008383	TTCT	2	8	7122	7129	0 %	75 %	0 %	25 %	116255072
27	NC_008383	GGAT	2	8	7570	7577	25 %	25 %	50 %	0 %	116255072
28	NC_008383	CACG	2	8	7683	7690	25 %	0 %	25 %	50 %	116255072
29	NC_008383	AGCC	2	8	7767	7774	25 %	0 %	25 %	50 %	116255072
30	NC_008383	GTTG	2	8	7777	7784	0 %	50 %	50 %	0 %	116255072
31	NC_008383	ACGA	2	8	8032	8039	50 %	0 %	25 %	25 %	116255072
32	NC_008383	CCTG	2	8	8363	8370	0 %	25 %	25 %	50 %	116255072
33	NC_008383	TTCA	2	8	8607	8614	25 %	50 %	0 %	25 %	116255073
34	NC_008383	GCCA	2	8	8979	8986	25 %	0 %	25 %	50 %	116255073
35	NC_008383	TTCA	2	8	9964	9971	25 %	50 %	0 %	25 %	116255074
36	NC_008383	CATC	2	8	10157	10164	25 %	25 %	0 %	50 %	116255074
37	NC_008383	TCAC	2	8	10577	10584	25 %	25 %	0 %	50 %	116255074
38	NC_008383	CCAG	2	8	10922	10929	25 %	0 %	25 %	50 %	116255075
39	NC_008383	GATC	2	8	10968	10975	25 %	25 %	25 %	25 %	116255075
40	NC_008383	GATG	2	8	11133	11140	25 %	25 %	50 %	0 %	116255075
41	NC_008383	GTCG	2	8	11293	11300	0 %	25 %	50 %	25 %	116255075
42	NC_008383	TGGC	2	8	11487	11494	0 %	25 %	50 %	25 %	116255075
43	NC_008383	CGGC	2	8	11550	11557	0 %	0 %	50 %	50 %	116255075
44	NC_008383	AATC	2	8	11959	11966	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_008383	CCGG	2	8	12436	12443	0 %	0 %	50 %	50 %	116255076
46	NC_008383	CGGC	2	8	12475	12482	0 %	0 %	50 %	50 %	116255076
47	NC_008383	CGGC	2	8	12804	12811	0 %	0 %	50 %	50 %	116255076
48	NC_008383	GCTG	2	8	13437	13444	0 %	25 %	50 %	25 %	116255077
49	NC_008383	GATG	2	8	14502	14509	25 %	25 %	50 %	0 %	116255079
50	NC_008383	CCGC	2	8	15005	15012	0 %	0 %	25 %	75 %	116255079
51	NC_008383	CGGC	2	8	15196	15203	0 %	0 %	50 %	50 %	116255080
52	NC_008383	GACG	2	8	15572	15579	25 %	0 %	50 %	25 %	116255080
53	NC_008383	TCGC	2	8	16114	16121	0 %	25 %	25 %	50 %	116255080
54	NC_008383	CCTG	2	8	16484	16491	0 %	25 %	25 %	50 %	116255080
55	NC_008383	TGGG	2	8	16560	16567	0 %	25 %	75 %	0 %	116255080
56	NC_008383	CCTT	2	8	16741	16748	0 %	50 %	0 %	50 %	116255080
57	NC_008383	TCCC	2	8	16833	16840	0 %	25 %	0 %	75 %	116255080
58	NC_008383	CGGA	2	8	17232	17239	25 %	0 %	50 %	25 %	116255080
59	NC_008383	CTTG	2	8	17930	17937	0 %	50 %	25 %	25 %	116255081
60	NC_008383	AGCG	2	8	18184	18191	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_008383	GCGT	2	8	18295	18302	0 %	25 %	50 %	25 %	116255082
62	NC_008383	CAGC	2	8	18835	18842	25 %	0 %	25 %	50 %	116255082
63	NC_008383	GTTC	2	8	19120	19127	0 %	50 %	25 %	25 %	116255082
64	NC_008383	GCCG	2	8	19749	19756	0 %	0 %	50 %	50 %	116255083
65	NC_008383	CGAC	2	8	19766	19773	25 %	0 %	25 %	50 %	116255083
66	NC_008383	CACC	2	8	19940	19947	25 %	0 %	0 %	75 %	116255083
67	NC_008383	CAAG	2	8	20645	20652	50 %	0 %	25 %	25 %	116255084
68	NC_008383	CGAT	2	8	20768	20775	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_008383	GTGC	2	8	22412	22419	0 %	25 %	50 %	25 %	116255087
70	NC_008383	ACCG	2	8	22496	22503	25 %	0 %	25 %	50 %	116255087
71	NC_008383	GCTG	2	8	22614	22621	0 %	25 %	50 %	25 %	116255087
72	NC_008383	TTCA	2	8	22938	22945	25 %	50 %	0 %	25 %	116255087
73	NC_008383	GGAA	2	8	23394	23401	50 %	0 %	50 %	0 %	116255088
74	NC_008383	GCGA	2	8	23495	23502	25 %	0 %	50 %	25 %	116255088
75	NC_008383	GCGG	2	8	23971	23978	0 %	0 %	75 %	25 %	116255088
76	NC_008383	AAGG	2	8	24133	24140	50 %	0 %	50 %	0 %	116255089
77	NC_008383	CGCA	2	8	25674	25681	25 %	0 %	25 %	50 %	116255090
78	NC_008383	CGGC	2	8	26106	26113	0 %	0 %	50 %	50 %	116255090
79	NC_008383	TTCC	2	8	26290	26297	0 %	50 %	0 %	50 %	116255090
80	NC_008383	ATGC	2	8	26537	26544	25 %	25 %	25 %	25 %	116255090
81	NC_008383	GCCT	2	8	26965	26972	0 %	25 %	25 %	50 %	116255091
82	NC_008383	CGGC	2	8	27262	27269	0 %	0 %	50 %	50 %	116255091
83	NC_008383	TCGA	2	8	28187	28194	25 %	25 %	25 %	25 %	116255092
84	NC_008383	TTGA	2	8	28199	28206	25 %	50 %	25 %	0 %	116255092
85	NC_008383	CTTC	2	8	28308	28315	0 %	50 %	0 %	50 %	116255092
86	NC_008383	AGCG	2	8	30403	30410	25 %	0 %	50 %	25 %	116255094
87	NC_008383	GGCC	2	8	30547	30554	0 %	0 %	50 %	50 %	116255094
88	NC_008383	TCCT	2	8	31544	31551	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_008383	AGCG	2	8	31677	31684	25 %	0 %	50 %	25 %	116255096
90	NC_008383	GACA	2	8	31913	31920	50 %	0 %	25 %	25 %	116255096
91	NC_008383	CGCA	2	8	32597	32604	25 %	0 %	25 %	50 %	116255096
92	NC_008383	AGCA	2	8	32677	32684	50 %	0 %	25 %	25 %	116255096
93	NC_008383	GCGG	2	8	32948	32955	0 %	0 %	75 %	25 %	116255096
94	NC_008383	ATCA	2	8	33036	33043	50 %	25 %	0 %	25 %	116255096
95	NC_008383	TGGT	2	8	33088	33095	0 %	50 %	50 %	0 %	116255096
96	NC_008383	CCAG	2	8	33476	33483	25 %	0 %	25 %	50 %	116255097
97	NC_008383	GCAA	2	8	35120	35127	50 %	0 %	25 %	25 %	116255098
98	NC_008383	GCAA	2	8	35171	35178	50 %	0 %	25 %	25 %	116255098
99	NC_008383	CGGT	2	8	35665	35672	0 %	25 %	50 %	25 %	116255099
100	NC_008383	CGAG	2	8	35906	35913	25 %	0 %	50 %	25 %	116255099
101	NC_008383	GGCG	2	8	35957	35964	0 %	0 %	75 %	25 %	116255099
102	NC_008383	CGGT	2	8	36211	36218	0 %	25 %	50 %	25 %	116255099
103	NC_008383	ACCG	2	8	36283	36290	25 %	0 %	25 %	50 %	116255099
104	NC_008383	CCGA	2	8	36857	36864	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_008383	TGGA	2	8	36971	36978	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008383	ATTT	2	8	37043	37050	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008383	GATC	2	8	37147	37154	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_008383	AGAT	2	8	37500	37507	50 %	25 %	25 %	0 %	116255100
109	NC_008383	CGTG	2	8	37534	37541	0 %	25 %	50 %	25 %	116255100
110	NC_008383	CTTG	2	8	37667	37674	0 %	50 %	25 %	25 %	116255100
111	NC_008383	TCGG	2	8	37797	37804	0 %	25 %	50 %	25 %	116255100
112	NC_008383	TTTA	2	8	37924	37931	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008383	TCGC	2	8	38437	38444	0 %	25 %	25 %	50 %	116255101
114	NC_008383	ATAA	2	8	39831	39838	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008383	CTGA	2	8	40066	40073	25 %	25 %	25 %	25 %	116255103
116	NC_008383	CCGG	2	8	40379	40386	0 %	0 %	50 %	50 %	116255103
117	NC_008383	AGCG	2	8	41279	41286	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_008383	TCGA	2	8	41582	41589	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_008383	ACCG	2	8	41639	41646	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_008383	TCCA	2	8	41657	41664	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_008383	GATC	2	8	41824	41831	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_008383	CATG	2	8	41875	41882	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_008383	ATCG	2	8	42858	42865	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_008383	CTGC	2	8	43228	43235	0 %	25 %	25 %	50 %	116255104
125	NC_008383	GCTT	2	8	43262	43269	0 %	50 %	25 %	25 %	116255104
126	NC_008383	CCGA	2	8	43397	43404	25 %	0 %	25 %	50 %	116255104
127	NC_008383	GCAC	2	8	43502	43509	25 %	0 %	25 %	50 %	116255104
128	NC_008383	GACG	2	8	43554	43561	25 %	0 %	50 %	25 %	116255104
129	NC_008383	CATG	2	8	43928	43935	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_008383	GCGA	2	8	44168	44175	25 %	0 %	50 %	25 %	116255105
131	NC_008383	GTCG	2	8	44341	44348	0 %	25 %	50 %	25 %	116255105
132	NC_008383	GACC	2	8	44962	44969	25 %	0 %	25 %	50 %	116255105
133	NC_008383	GGCC	2	8	45088	45095	0 %	0 %	50 %	50 %	116255105
134	NC_008383	TGGG	2	8	45113	45120	0 %	25 %	75 %	0 %	116255105
135	NC_008383	GGCG	2	8	45263	45270	0 %	0 %	75 %	25 %	116255105
136	NC_008383	TTGA	2	8	45564	45571	25 %	50 %	25 %	0 %	116255106
137	NC_008383	CGCT	2	8	46206	46213	0 %	25 %	25 %	50 %	116255106
138	NC_008383	TGGC	2	8	46278	46285	0 %	25 %	50 %	25 %	116255106
139	NC_008383	CGGG	2	8	47593	47600	0 %	0 %	75 %	25 %	116255107
140	NC_008383	GCTC	2	8	47696	47703	0 %	25 %	25 %	50 %	116255107
141	NC_008383	CCAT	2	8	48130	48137	25 %	25 %	0 %	50 %	116255107
142	NC_008383	GATG	2	8	48215	48222	25 %	25 %	50 %	0 %	116255107
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388	NC_008383	CCTC	2	8	146213	146220	0 %	25 %	0 %	75 %	116255199
389	NC_008383	TCGA	2	8	146245	146252	25 %	25 %	25 %	25 %	116255199
390	NC_008383	AGAC	2	8	147130	147137	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.