MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL10

Total Repeats: 10578

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008381	CGG	2	6	198568	198573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254640
4002	NC_008381	AGG	2	6	198622	198627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254640
4003	NC_008381	GGA	2	6	198742	198747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254640
4004	NC_008381	ACGA	2	8	198786	198793	50 %	0 %	25 %	25 %	116254640
4005	NC_008381	TA	3	6	198811	198816	50 %	50 %	0 %	0 %	116254640
4006	NC_008381	GA	4	8	198817	198824	50 %	0 %	50 %	0 %	116254640
4007	NC_008381	TCA	2	6	198835	198840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254640
4008	NC_008381	GCC	2	6	198842	198847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254640
4009	NC_008381	TCCC	2	8	198911	198918	0 %	25 %	0 %	75 %	116254640
4010	NC_008381	ACC	2	6	198957	198962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254640
4011	NC_008381	GCG	2	6	199020	199025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254640
4012	NC_008381	AAG	2	6	199088	199093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254640
4013	NC_008381	TTG	2	6	199164	199169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254640
4014	NC_008381	GCC	2	6	199211	199216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254640
4015	NC_008381	CA	3	6	199226	199231	50 %	0 %	0 %	50 %	116254640
4016	NC_008381	GAC	2	6	199382	199387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254640
4017	NC_008381	CTA	2	6	199432	199437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254640
4018	NC_008381	CGAG	2	8	199455	199462	25 %	0 %	50 %	25 %	116254640
4019	NC_008381	GCC	2	6	199493	199498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254640
4020	NC_008381	GAT	2	6	199544	199549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254640
4021	NC_008381	TCA	2	6	199581	199586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254640
4022	NC_008381	CGA	2	6	199610	199615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254640
4023	NC_008381	GCA	2	6	199765	199770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254640
4024	NC_008381	GCG	2	6	199803	199808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254640
4025	NC_008381	GC	3	6	199949	199954	0 %	0 %	50 %	50 %	116254641
4026	NC_008381	CGC	2	6	200073	200078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254641
4027	NC_008381	CAG	2	6	200129	200134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254641
4028	NC_008381	TCG	2	6	200186	200191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254641
4029	NC_008381	GCCGAG	2	12	200229	200240	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	116254641
4030	NC_008381	TCC	2	6	200329	200334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254641
4031	NC_008381	CGGC	2	8	200430	200437	0 %	0 %	50 %	50 %	116254641
4032	NC_008381	CAA	2	6	200460	200465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116254641
4033	NC_008381	CCG	2	6	200470	200475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254641
4034	NC_008381	AGT	2	6	200628	200633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254641
4035	NC_008381	GAG	2	6	200682	200687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254641
4036	NC_008381	GAG	2	6	200832	200837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254641
4037	NC_008381	GCC	2	6	200862	200867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254641
4038	NC_008381	AGC	2	6	200917	200922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254641
4039	NC_008381	T	6	6	200968	200973	0 %	100 %	0 %	0 %	116254641
4040	NC_008381	CTC	2	6	200991	200996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4041	NC_008381	GCT	2	6	200997	201002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254642
4042	NC_008381	GC	3	6	201129	201134	0 %	0 %	50 %	50 %	116254642
4043	NC_008381	C	6	6	201220	201225	0 %	0 %	0 %	100 %	116254642
4044	NC_008381	CAT	2	6	201259	201264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254642
4045	NC_008381	GA	3	6	201266	201271	50 %	0 %	50 %	0 %	116254642
4046	NC_008381	CGG	2	6	201276	201281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254642
4047	NC_008381	TGA	2	6	201307	201312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254642
4048	NC_008381	CG	3	6	201376	201381	0 %	0 %	50 %	50 %	116254642
4049	NC_008381	C	6	6	201512	201517	0 %	0 %	0 %	100 %	116254642
4050	NC_008381	CGGT	2	8	201594	201601	0 %	25 %	50 %	25 %	116254642
4051	NC_008381	ATG	2	6	201753	201758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254642
4052	NC_008381	TCG	2	6	201853	201858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254642
4053	NC_008381	TGTCG	2	10	202002	202011	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4054	NC_008381	CAC	2	6	202026	202031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4055	NC_008381	AAT	2	6	202115	202120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_008381	GAT	2	6	202309	202314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_008381	GCT	2	6	202372	202377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_008381	CTG	2	6	202495	202500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_008381	GCCAGC	2	12	202502	202513	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4060	NC_008381	ACA	2	6	202534	202539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_008381	TCA	2	6	202553	202558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_008381	GGA	2	6	202748	202753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_008381	AAAT	2	8	202754	202761	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_008381	AGG	2	6	202766	202771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_008381	ACA	2	6	202824	202829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_008381	CTT	2	6	202983	202988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254643
4067	NC_008381	CAG	2	6	202990	202995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254643
4068	NC_008381	CGG	2	6	203010	203015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254643
4069	NC_008381	G	6	6	203014	203019	0 %	0 %	100 %	0 %	116254643
4070	NC_008381	ACA	2	6	203066	203071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116254643
4071	NC_008381	AC	3	6	203132	203137	50 %	0 %	0 %	50 %	116254643
4072	NC_008381	CAGC	2	8	203171	203178	25 %	0 %	25 %	50 %	116254643
4073	NC_008381	AGC	2	6	203209	203214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254643
4074	NC_008381	GAC	2	6	203232	203237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254643
4075	NC_008381	CAC	2	6	203310	203315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254643
4076	NC_008381	CGC	2	6	203330	203335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254643
4077	NC_008381	TCGGC	2	10	203348	203357	0 %	20 %	40 %	40 %	116254643
4078	NC_008381	GGC	2	6	203371	203376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254643
4079	NC_008381	TGA	2	6	203480	203485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254643
4080	NC_008381	GGC	2	6	203530	203535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254643
4081	NC_008381	GAA	2	6	203616	203621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254644
4082	NC_008381	GCC	4	12	203658	203669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254644
4083	NC_008381	ATC	2	6	203734	203739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254644
4084	NC_008381	GAC	2	6	203757	203762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254644
4085	NC_008381	TGC	2	6	203804	203809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254644
4086	NC_008381	GGC	2	6	203937	203942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254644
4087	NC_008381	TC	3	6	203967	203972	0 %	50 %	0 %	50 %	116254644
4088	NC_008381	GCC	2	6	203980	203985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254644
4089	NC_008381	CAC	2	6	204033	204038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254644
4090	NC_008381	CGCC	2	8	204098	204105	0 %	0 %	25 %	75 %	116254644
4091	NC_008381	GCG	2	6	204185	204190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254644
4092	NC_008381	TCG	2	6	204191	204196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254644
4093	NC_008381	AAC	2	6	204202	204207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116254644
4094	NC_008381	TGC	2	6	204349	204354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254644
4095	NC_008381	AGG	2	6	204420	204425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254644
4096	NC_008381	ATC	2	6	204447	204452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_008381	TTGCCA	2	12	204566	204577	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_008381	CCG	2	6	204667	204672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4099	NC_008381	AGC	2	6	204695	204700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_008381	TCG	2	6	204740	204745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_008381	TCG	2	6	204788	204793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254645
4102	NC_008381	CCG	2	6	204803	204808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254645
4103	NC_008381	ACA	2	6	204837	204842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116254645
4104	NC_008381	GCC	2	6	204863	204868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254645
4105	NC_008381	GGC	2	6	204881	204886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254645
4106	NC_008381	TCT	2	6	204928	204933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254645
4107	NC_008381	CCGC	2	8	204976	204983	0 %	0 %	25 %	75 %	116254645
4108	NC_008381	CG	3	6	204987	204992	0 %	0 %	50 %	50 %	116254645
4109	NC_008381	CGG	2	6	205035	205040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254645
4110	NC_008381	GAAA	2	8	205043	205050	75 %	0 %	25 %	0 %	116254645
4111	NC_008381	CGG	2	6	205124	205129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_008381	GC	3	6	205171	205176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4113	NC_008381	GGC	2	6	205215	205220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_008381	TAGAA	2	10	205230	205239	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_008381	TGTT	2	8	205343	205350	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_008381	TGCC	2	8	205471	205478	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4117	NC_008381	GGC	2	6	205487	205492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_008381	GAT	2	6	205572	205577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_008381	GCGA	2	8	205629	205636	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4120	NC_008381	CAT	2	6	205660	205665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_008381	GCG	2	6	205754	205759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_008381	AAG	2	6	205775	205780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_008381	TCG	3	9	205803	205811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_008381	TGG	2	6	205836	205841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_008381	GAC	2	6	205875	205880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_008381	GTT	2	6	205933	205938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_008381	GAA	2	6	205965	205970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4129	NC_008381	GTC	2	6	206234	206239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4243	NC_008381	GTC	2	6	210781	210786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254650
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4246	NC_008381	TCGG	2	8	210853	210860	0 %	25 %	50 %	25 %	116254650
4247	NC_008381	GT	3	6	210892	210897	0 %	50 %	50 %	0 %	116254650
4248	NC_008381	CAG	2	6	210925	210930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254650
4249	NC_008381	CT	3	6	210950	210955	0 %	50 %	0 %	50 %	116254650
4250	NC_008381	CGA	2	6	211059	211064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254650
4251	NC_008381	ATC	2	6	211147	211152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254650
4252	NC_008381	GTCG	2	8	211191	211198	0 %	25 %	50 %	25 %	116254650
4253	NC_008381	CGT	2	6	211248	211253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254650
4254	NC_008381	CGA	2	6	211382	211387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254650
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4258	NC_008381	TGC	2	6	211627	211632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254651
4259	NC_008381	GTG	2	6	211656	211661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254651
4260	NC_008381	GCG	3	9	211761	211769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254651
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4262	NC_008381	ACG	2	6	211873	211878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254651
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4264	NC_008381	TCG	2	6	211993	211998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254651
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4269	NC_008381	AGCC	2	8	212153	212160	25 %	0 %	25 %	50 %	116254652
4270	NC_008381	GTT	2	6	212242	212247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254652
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4273	NC_008381	CAT	2	6	212476	212481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254652
4274	NC_008381	TGC	2	6	212515	212520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254652
4275	NC_008381	CG	3	6	212523	212528	0 %	0 %	50 %	50 %	116254652
4276	NC_008381	GAT	2	6	212551	212556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254652
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4280	NC_008381	GCT	2	6	212737	212742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254652
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4282	NC_008381	CTG	2	6	212750	212755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254652
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4286	NC_008381	CGG	2	6	212892	212897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254652
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4292	NC_008381	TC	3	6	213100	213105	0 %	50 %	0 %	50 %	116254652
4293	NC_008381	ATC	2	6	213110	213115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254652
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4327	NC_008381	CCG	2	6	214837	214842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254654
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4338	NC_008381	CGC	2	6	215296	215301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4340	NC_008381	TAT	2	6	215433	215438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4341	NC_008381	GAA	2	6	215462	215467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4342	NC_008381	ATG	2	6	215507	215512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4356	NC_008381	AATT	2	8	216374	216381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4357	NC_008381	CT	3	6	216467	216472	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4358	NC_008381	CGC	2	6	216473	216478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4359	NC_008381	TGT	2	6	216578	216583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4360	NC_008381	TTG	2	6	216638	216643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4361	NC_008381	AT	3	6	216668	216673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4362	NC_008381	T	8	8	216692	216699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4363	NC_008381	AT	3	6	216701	216706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4364	NC_008381	GTTTT	2	10	216731	216740	0 %	80 %	20 %	0 %	116254657
4365	NC_008381	T	6	6	216737	216742	0 %	100 %	0 %	0 %	116254657
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4490	NC_008381	TC	3	6	221825	221830	0 %	50 %	0 %	50 %	116254661
4491	NC_008381	CGGC	2	8	221833	221840	0 %	0 %	50 %	50 %	116254661
4492	NC_008381	GC	3	6	221844	221849	0 %	0 %	50 %	50 %	116254661
4493	NC_008381	TCGC	2	8	221869	221876	0 %	25 %	25 %	50 %	116254661
4494	NC_008381	AGC	2	6	221920	221925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254661
4495	NC_008381	ACG	2	6	221926	221931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254661
4496	NC_008381	CTG	3	9	221980	221988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254661
4497	NC_008381	ACGATG	2	12	222034	222045	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116254661
4498	NC_008381	CGA	2	6	222107	222112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254661
4499	NC_008381	GCC	2	6	222133	222138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254661
4500	NC_008381	CAT	2	6	222144	222149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254661

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