MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL10

Total Repeats: 10578

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_008381	TTG	2	6	484738	484743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254907
10502	NC_008381	GC	4	8	484832	484839	0 %	0 %	50 %	50 %	116254907
10503	NC_008381	GAA	2	6	484847	484852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254907
10504	NC_008381	CGA	2	6	484865	484870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254907
10505	NC_008381	TTG	2	6	484876	484881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254907
10506	NC_008381	GATC	2	8	484883	484890	25 %	25 %	25 %	25 %	116254907
10507	NC_008381	TGTCGA	2	12	484910	484921	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116254907
10508	NC_008381	CGG	2	6	484943	484948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254907
10509	NC_008381	CACC	2	8	484973	484980	25 %	0 %	0 %	75 %	116254907
10510	NC_008381	GGC	2	6	485062	485067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10511	NC_008381	CG	3	6	485101	485106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10512	NC_008381	GATTC	2	10	485157	485166	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10513	NC_008381	GAA	2	6	485173	485178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254908
10514	NC_008381	CTCCC	2	10	485183	485192	0 %	20 %	0 %	80 %	116254908
10515	NC_008381	TCT	2	6	485245	485250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254908
10516	NC_008381	GCA	2	6	485260	485265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254908
10517	NC_008381	ACA	2	6	485298	485303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116254908
10518	NC_008381	GGA	2	6	485314	485319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254908
10519	NC_008381	CGC	2	6	485323	485328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254908
10520	NC_008381	CGA	2	6	485377	485382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254908
10521	NC_008381	GCC	2	6	485404	485409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254908
10522	NC_008381	CCG	2	6	485414	485419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254908
10523	NC_008381	TCCG	2	8	485551	485558	0 %	25 %	25 %	50 %	116254908
10524	NC_008381	CCG	2	6	485629	485634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254908
10525	NC_008381	GCCG	2	8	485680	485687	0 %	0 %	50 %	50 %	116254908
10526	NC_008381	CGG	2	6	485717	485722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254908
10527	NC_008381	TGC	2	6	485733	485738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254908
10528	NC_008381	GAC	2	6	485755	485760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254908
10529	NC_008381	GAC	2	6	485770	485775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254908
10530	NC_008381	TCG	2	6	485850	485855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254908
10531	NC_008381	CTG	2	6	485870	485875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254908
10532	NC_008381	GAC	2	6	485912	485917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254908
10533	NC_008381	GC	3	6	485922	485927	0 %	0 %	50 %	50 %	116254908
10534	NC_008381	ATA	2	6	485937	485942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116254908
10535	NC_008381	CA	3	6	485953	485958	50 %	0 %	0 %	50 %	116254908
10536	NC_008381	CGG	2	6	485962	485967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254908
10537	NC_008381	CAC	2	6	485989	485994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254908
10538	NC_008381	CTG	2	6	486026	486031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254908
10539	NC_008381	CGG	2	6	486034	486039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254908
10540	NC_008381	CGC	2	6	486064	486069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254908
10541	NC_008381	CGA	2	6	486289	486294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254908
10542	NC_008381	AGG	2	6	486381	486386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254908
10543	NC_008381	CAG	2	6	486449	486454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254908
10544	NC_008381	C	6	6	486462	486467	0 %	0 %	0 %	100 %	116254908
10545	NC_008381	CGA	2	6	486485	486490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254908
10546	NC_008381	TACG	2	8	486513	486520	25 %	25 %	25 %	25 %	116254908
10547	NC_008381	GAA	2	6	486565	486570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254908
10548	NC_008381	GCT	2	6	486574	486579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254908
10549	NC_008381	GC	3	6	486698	486703	0 %	0 %	50 %	50 %	116254908
10550	NC_008381	TGA	2	6	486720	486725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254908
10551	NC_008381	TC	3	6	486809	486814	0 %	50 %	0 %	50 %	116254908
10552	NC_008381	CCA	2	6	486819	486824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254908
10553	NC_008381	CCA	2	6	486851	486856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10554	NC_008381	TCA	2	6	486861	486866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10555	NC_008381	CTGC	2	8	486880	486887	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10556	NC_008381	AGG	2	6	487023	487028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10557	NC_008381	CGC	2	6	487032	487037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10558	NC_008381	ATG	2	6	487048	487053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10559	NC_008381	GCC	2	6	487130	487135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10560	NC_008381	GTT	2	6	487159	487164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10561	NC_008381	CAA	2	6	487206	487211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116254909
10562	NC_008381	GCTC	2	8	487216	487223	0 %	25 %	25 %	50 %	116254909
10563	NC_008381	TCCCC	2	10	487296	487305	0 %	20 %	0 %	80 %	116254909
10564	NC_008381	GCA	2	6	487315	487320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254909
10565	NC_008381	CGC	2	6	487401	487406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254909
10566	NC_008381	CTC	2	6	487457	487462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254909
10567	NC_008381	GC	3	6	487470	487475	0 %	0 %	50 %	50 %	116254909
10568	NC_008381	CGC	3	9	487501	487509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254909
10569	NC_008381	CCCTC	2	10	487539	487548	0 %	20 %	0 %	80 %	116254909
10570	NC_008381	GTC	2	6	487705	487710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254909
10571	NC_008381	ACG	2	6	487739	487744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254909
10572	NC_008381	CCGT	2	8	487792	487799	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10573	NC_008381	TCC	2	6	487827	487832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10574	NC_008381	ACG	2	6	487905	487910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10575	NC_008381	TGC	2	6	487930	487935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10576	NC_008381	GATG	2	8	487956	487963	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10577	NC_008381	GCC	2	6	487972	487977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10578	NC_008381	T	6	6	488022	488027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.