MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL10

Total Repeats: 10578

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008381	GTC	2	6	288869	288874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254722
6002	NC_008381	TCT	2	6	288897	288902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254722
6003	NC_008381	GCT	2	6	288931	288936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254722
6004	NC_008381	CGG	2	6	288939	288944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254722
6005	NC_008381	GCC	2	6	288969	288974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254722
6006	NC_008381	GGCG	2	8	288994	289001	0 %	0 %	75 %	25 %	116254722
6007	NC_008381	AGG	2	6	289080	289085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254722
6008	NC_008381	ATTC	2	8	289203	289210	25 %	50 %	0 %	25 %	116254723
6009	NC_008381	AGC	2	6	289220	289225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254723
6010	NC_008381	CCT	2	6	289241	289246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254723
6011	NC_008381	ACG	2	6	289249	289254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254723
6012	NC_008381	CGG	2	6	289309	289314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254723
6013	NC_008381	CGT	2	6	289338	289343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254723
6014	NC_008381	CAT	2	6	289377	289382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254723
6015	NC_008381	GCG	3	9	289480	289488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254723
6016	NC_008381	GGC	2	6	289504	289509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254723
6017	NC_008381	CGC	2	6	289527	289532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254723
6018	NC_008381	CAGC	2	8	289590	289597	25 %	0 %	25 %	50 %	116254723
6019	NC_008381	CTG	2	6	289648	289653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254723
6020	NC_008381	GTGA	2	8	289654	289661	25 %	25 %	50 %	0 %	116254723
6021	NC_008381	C	7	7	289696	289702	0 %	0 %	0 %	100 %	116254723
6022	NC_008381	GAA	2	6	289744	289749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254723
6023	NC_008381	CGGTC	2	10	289812	289821	0 %	20 %	40 %	40 %	116254723
6024	NC_008381	ACC	2	6	289871	289876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254723
6025	NC_008381	CCG	2	6	289935	289940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254723
6026	NC_008381	AAT	2	6	290024	290029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116254723
6027	NC_008381	GCG	2	6	290058	290063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_008381	GA	3	6	290086	290091	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_008381	GCCG	2	8	290181	290188	0 %	0 %	50 %	50 %	116254724
6030	NC_008381	GCT	3	9	290190	290198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254724
6031	NC_008381	CTG	2	6	290287	290292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254724
6032	NC_008381	GCT	2	6	290325	290330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254724
6033	NC_008381	CG	3	6	290335	290340	0 %	0 %	50 %	50 %	116254724
6034	NC_008381	TGA	2	6	290348	290353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254724
6035	NC_008381	TTC	2	6	290374	290379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254724
6036	NC_008381	TCAGG	2	10	290430	290439	20 %	20 %	40 %	20 %	116254724
6037	NC_008381	GC	3	6	290480	290485	0 %	0 %	50 %	50 %	116254724
6038	NC_008381	ACG	2	6	290524	290529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254724
6039	NC_008381	TGG	2	6	290548	290553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254724
6040	NC_008381	ACT	2	6	290579	290584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254724
6041	NC_008381	ACG	2	6	290585	290590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254724
6042	NC_008381	CCGC	2	8	290648	290655	0 %	0 %	25 %	75 %	116254724
6043	NC_008381	CGC	2	6	290729	290734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254724
6044	NC_008381	GCA	2	6	290774	290779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254724
6045	NC_008381	TCG	2	6	290810	290815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254724
6046	NC_008381	TCG	3	9	290828	290836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254724
6047	NC_008381	ATC	2	6	290918	290923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254724
6048	NC_008381	ATC	2	6	290956	290961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254724
6049	NC_008381	CAT	2	6	290967	290972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254724
6050	NC_008381	CAT	2	6	290991	290996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254724
6051	NC_008381	GCG	2	6	291007	291012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254724
6052	NC_008381	CGG	2	6	291048	291053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254724
6053	NC_008381	GCC	2	6	291162	291167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254724
6054	NC_008381	CAT	2	6	291174	291179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254724
6055	NC_008381	AAG	2	6	291181	291186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254724
6056	NC_008381	CTG	2	6	291208	291213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254724
6057	NC_008381	CCG	2	6	291253	291258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254724
6058	NC_008381	GCG	2	6	291308	291313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254724
6059	NC_008381	CCG	2	6	291368	291373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254724
6060	NC_008381	GCC	2	6	291404	291409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254724
6061	NC_008381	CTG	2	6	291421	291426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254724
6062	NC_008381	CGA	2	6	291432	291437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254724
6063	NC_008381	TGA	2	6	291531	291536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254724
6064	NC_008381	CG	3	6	291559	291564	0 %	0 %	50 %	50 %	116254724
6065	NC_008381	GCCC	2	8	291570	291577	0 %	0 %	25 %	75 %	116254724
6066	NC_008381	TGC	2	6	291578	291583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254724
6067	NC_008381	CGT	2	6	291594	291599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254724
6068	NC_008381	CGA	2	6	291606	291611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254724
6069	NC_008381	CGG	2	6	291692	291697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254724
6070	NC_008381	GTC	2	6	291712	291717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254724
6071	NC_008381	CGG	2	6	291735	291740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254724
6072	NC_008381	GAG	2	6	291745	291750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254724
6073	NC_008381	TCT	2	6	291791	291796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254724
6074	NC_008381	CGC	3	9	291881	291889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254724
6075	NC_008381	GCGT	2	8	291893	291900	0 %	25 %	50 %	25 %	116254724
6076	NC_008381	GC	3	6	291909	291914	0 %	0 %	50 %	50 %	116254724
6077	NC_008381	CGC	2	6	291931	291936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254724
6078	NC_008381	TC	3	6	291948	291953	0 %	50 %	0 %	50 %	116254724
6079	NC_008381	TGA	2	6	291958	291963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254724
6080	NC_008381	GCCCG	2	10	292199	292208	0 %	0 %	40 %	60 %	116254725
6081	NC_008381	CTT	2	6	292226	292231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254725
6082	NC_008381	GTT	2	6	292233	292238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254725
6083	NC_008381	GCG	2	6	292239	292244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254725
6084	NC_008381	GGCTT	2	10	292266	292275	0 %	40 %	40 %	20 %	116254725
6085	NC_008381	GGCGC	2	10	292321	292330	0 %	0 %	60 %	40 %	116254725
6086	NC_008381	CGG	2	6	292393	292398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254725
6087	NC_008381	GC	3	6	292416	292421	0 %	0 %	50 %	50 %	116254725
6088	NC_008381	CGATC	2	10	292447	292456	20 %	20 %	20 %	40 %	116254725
6089	NC_008381	ATCCCG	2	12	292470	292481	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116254725
6090	NC_008381	CTG	2	6	292549	292554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254725
6091	NC_008381	GC	3	6	292609	292614	0 %	0 %	50 %	50 %	116254725
6092	NC_008381	CGA	2	6	292639	292644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254725
6093	NC_008381	CGC	2	6	292792	292797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254725
6094	NC_008381	GAAC	2	8	292817	292824	50 %	0 %	25 %	25 %	116254726
6095	NC_008381	CTG	2	6	292845	292850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254726
6096	NC_008381	GAT	2	6	292868	292873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254726
6097	NC_008381	GCG	2	6	292884	292889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254726
6098	NC_008381	CTG	2	6	292965	292970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254726
6099	NC_008381	CGC	2	6	293005	293010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254726
6100	NC_008381	CGC	2	6	293021	293026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254726
6101	NC_008381	GC	3	6	293025	293030	0 %	0 %	50 %	50 %	116254726
6102	NC_008381	TCG	2	6	293053	293058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254726
6103	NC_008381	GGCA	2	8	293066	293073	25 %	0 %	50 %	25 %	116254726
6104	NC_008381	CCCG	2	8	293091	293098	0 %	0 %	25 %	75 %	116254726
6105	NC_008381	CGA	2	6	293105	293110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254726
6106	NC_008381	GCC	2	6	293145	293150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254726
6107	NC_008381	TCG	3	9	293164	293172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254726
6108	NC_008381	GCT	2	6	293180	293185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254726
6109	NC_008381	CAT	2	6	293211	293216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254726
6110	NC_008381	CGG	2	6	293228	293233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254726
6111	NC_008381	CG	3	6	293250	293255	0 %	0 %	50 %	50 %	116254726
6112	NC_008381	TCG	2	6	293296	293301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254726
6113	NC_008381	TC	3	6	293455	293460	0 %	50 %	0 %	50 %	116254726
6114	NC_008381	CGC	2	6	293487	293492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254726
6115	NC_008381	TCA	2	6	293539	293544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254726
6116	NC_008381	GC	4	8	293550	293557	0 %	0 %	50 %	50 %	116254726
6117	NC_008381	CGA	2	6	293567	293572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254726
6118	NC_008381	GGC	2	6	293573	293578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254726
6119	NC_008381	GCT	2	6	293579	293584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254726
6120	NC_008381	CGC	2	6	293695	293700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254726
6121	NC_008381	TGC	2	6	293702	293707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254726
6122	NC_008381	CA	3	6	293712	293717	50 %	0 %	0 %	50 %	116254726
6123	NC_008381	TGG	2	6	293749	293754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254726
6124	NC_008381	CGGC	2	8	293762	293769	0 %	0 %	50 %	50 %	116254726
6125	NC_008381	CG	3	6	293803	293808	0 %	0 %	50 %	50 %	116254726
6126	NC_008381	GATCGA	2	12	293881	293892	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116254727
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6129	NC_008381	GCT	2	6	294119	294124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254727
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6132	NC_008381	CCTG	2	8	294196	294203	0 %	25 %	25 %	50 %	116254727
6133	NC_008381	GCC	2	6	294215	294220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254727
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6163	NC_008381	ACC	2	6	295480	295485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6242	NC_008381	TCG	2	6	298155	298160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254728
6243	NC_008381	CTG	2	6	298176	298181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254728
6244	NC_008381	ACC	2	6	298218	298223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254728
6245	NC_008381	TCG	2	6	298287	298292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254728
6246	NC_008381	CTG	2	6	298301	298306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254728
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6282	NC_008381	GACG	2	8	300351	300358	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6283	NC_008381	TGAA	2	8	300362	300369	50 %	25 %	25 %	0 %	116254730
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6328	NC_008381	GCTTT	2	10	302423	302432	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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6333	NC_008381	CCGGT	2	10	302576	302585	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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6349	NC_008381	CGA	2	6	303309	303314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6351	NC_008381	CCTT	2	8	303393	303400	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6352	NC_008381	CTG	2	6	303452	303457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6353	NC_008381	CGA	2	6	303470	303475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6354	NC_008381	CAT	2	6	303596	303601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254733
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6360	NC_008381	TGCCGG	2	12	303864	303875	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116254733
6361	NC_008381	CA	3	6	303905	303910	50 %	0 %	0 %	50 %	116254733
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6481	NC_008381	AGGCA	2	10	309411	309420	40 %	0 %	40 %	20 %	116254737
6482	NC_008381	CTT	2	6	309458	309463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254737
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6484	NC_008381	CGA	2	6	309511	309516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254737
6485	NC_008381	TCA	2	6	309517	309522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254737
6486	NC_008381	CGGC	2	8	309528	309535	0 %	0 %	50 %	50 %	116254737
6487	NC_008381	ATG	2	6	309555	309560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254737
6488	NC_008381	TCA	2	6	309579	309584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254737
6489	NC_008381	GGC	2	6	309596	309601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254737
6490	NC_008381	AGC	2	6	309642	309647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254737
6491	NC_008381	CTTGCC	2	12	309671	309682	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	116254737
6492	NC_008381	CG	3	6	309694	309699	0 %	0 %	50 %	50 %	116254737
6493	NC_008381	ATG	2	6	309828	309833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254737
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6495	NC_008381	GCC	2	6	309949	309954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254738
6496	NC_008381	GCA	2	6	310013	310018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254738
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6498	NC_008381	GC	4	8	310079	310086	0 %	0 %	50 %	50 %	116254738
6499	NC_008381	TTGC	2	8	310159	310166	0 %	50 %	25 %	25 %	116254738
6500	NC_008381	GCA	2	6	310182	310187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254738

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