MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL10

Total Repeats: 10578

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008381	GAC	2	6	267867	267872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254705
5502	NC_008381	GGC	2	6	267901	267906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254705
5503	NC_008381	TCGAGG	2	12	267907	267918	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116254705
5504	NC_008381	ATG	2	6	267934	267939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254705
5505	NC_008381	GCC	2	6	268057	268062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254705
5506	NC_008381	TCGT	2	8	268090	268097	0 %	50 %	25 %	25 %	116254705
5507	NC_008381	GCTT	2	8	268121	268128	0 %	50 %	25 %	25 %	116254705
5508	NC_008381	CGAG	2	8	268138	268145	25 %	0 %	50 %	25 %	116254705
5509	NC_008381	TCT	2	6	268168	268173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254705
5510	NC_008381	CG	3	6	268193	268198	0 %	0 %	50 %	50 %	116254705
5511	NC_008381	CCGG	2	8	268212	268219	0 %	0 %	50 %	50 %	116254705
5512	NC_008381	CGTC	2	8	268284	268291	0 %	25 %	25 %	50 %	116254705
5513	NC_008381	TTC	2	6	268306	268311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254705
5514	NC_008381	A	7	7	268355	268361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_008381	CA	3	6	268404	268409	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5516	NC_008381	A	6	6	268424	268429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_008381	AAC	2	6	268507	268512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116254706
5518	NC_008381	GCT	2	6	268528	268533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254706
5519	NC_008381	TC	3	6	268544	268549	0 %	50 %	0 %	50 %	116254706
5520	NC_008381	GAA	2	6	268559	268564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254706
5521	NC_008381	GCAGA	2	10	268667	268676	40 %	0 %	40 %	20 %	116254706
5522	NC_008381	GCG	2	6	268694	268699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254706
5523	NC_008381	ATCT	2	8	268742	268749	25 %	50 %	0 %	25 %	116254706
5524	NC_008381	GCC	2	6	268760	268765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254706
5525	NC_008381	GCCT	2	8	268803	268810	0 %	25 %	25 %	50 %	116254706
5526	NC_008381	TCC	2	6	268814	268819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254706
5527	NC_008381	GGCC	2	8	268930	268937	0 %	0 %	50 %	50 %	116254706
5528	NC_008381	CAA	2	6	268945	268950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116254706
5529	NC_008381	GGA	2	6	268966	268971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254706
5530	NC_008381	AAG	2	6	268988	268993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254706
5531	NC_008381	CGC	2	6	268996	269001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254706
5532	NC_008381	TCG	2	6	269031	269036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254706
5533	NC_008381	GCC	2	6	269084	269089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254706
5534	NC_008381	GCC	2	6	269159	269164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254706
5535	NC_008381	CCAT	2	8	269190	269197	25 %	25 %	0 %	50 %	116254706
5536	NC_008381	CGGCAA	2	12	269212	269223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254706
5537	NC_008381	TGA	2	6	269265	269270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254706
5538	NC_008381	CTG	2	6	269291	269296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254706
5539	NC_008381	GTG	2	6	269352	269357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254706
5540	NC_008381	CGG	2	6	269371	269376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254706
5541	NC_008381	TCA	2	6	269391	269396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254706
5542	NC_008381	GAAGA	2	10	269408	269417	60 %	0 %	40 %	0 %	116254706
5543	NC_008381	AGC	2	6	269460	269465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254706
5544	NC_008381	GC	3	6	269576	269581	0 %	0 %	50 %	50 %	116254706
5545	NC_008381	CGA	2	6	269665	269670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254706
5546	NC_008381	AGG	2	6	269812	269817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_008381	GC	3	6	269854	269859	0 %	0 %	50 %	50 %	116254707
5548	NC_008381	GCCTT	2	10	269898	269907	0 %	40 %	20 %	40 %	116254707
5549	NC_008381	TCG	2	6	269931	269936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254707
5550	NC_008381	GCT	2	6	270079	270084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254707
5551	NC_008381	TGG	2	6	270117	270122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254707
5552	NC_008381	CCTTT	2	10	270123	270132	0 %	60 %	0 %	40 %	116254707
5553	NC_008381	GCT	2	6	270136	270141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254707
5554	NC_008381	T	7	7	270169	270175	0 %	100 %	0 %	0 %	116254707
5555	NC_008381	TGT	2	6	270196	270201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254707
5556	NC_008381	GGC	2	6	270214	270219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254707
5557	NC_008381	GCT	2	6	270238	270243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254707
5558	NC_008381	GCG	2	6	270255	270260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254707
5559	NC_008381	GCT	2	6	270271	270276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254707
5560	NC_008381	GCGCG	2	10	270277	270286	0 %	0 %	60 %	40 %	116254707
5561	NC_008381	CAT	2	6	270289	270294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254707
5562	NC_008381	GC	3	6	270300	270305	0 %	0 %	50 %	50 %	116254707
5563	NC_008381	CGT	2	6	270340	270345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254707
5564	NC_008381	GTC	2	6	270356	270361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254707
5565	NC_008381	GAT	2	6	270382	270387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254707
5566	NC_008381	TCC	2	6	270390	270395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254707
5567	NC_008381	ACG	2	6	270420	270425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254707
5568	NC_008381	GCC	2	6	270434	270439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254707
5569	NC_008381	TGA	2	6	270492	270497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254707
5570	NC_008381	GGT	2	6	270505	270510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254707
5571	NC_008381	TTC	2	6	270560	270565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254707
5572	NC_008381	ATC	2	6	270566	270571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254707
5573	NC_008381	GGC	2	6	270578	270583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254707
5574	NC_008381	CGG	2	6	270603	270608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254707
5575	NC_008381	ATCT	2	8	270617	270624	25 %	50 %	0 %	25 %	116254707
5576	NC_008381	CGT	2	6	270627	270632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254707
5577	NC_008381	TCG	2	6	270681	270686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254707
5578	NC_008381	TGG	2	6	270690	270695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254707
5579	NC_008381	CTG	2	6	270719	270724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254707
5580	NC_008381	GGA	2	6	270736	270741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254707
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5582	NC_008381	TCT	2	6	270839	270844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254708
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5584	NC_008381	TCT	2	6	270920	270925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254708
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5587	NC_008381	CGG	2	6	271052	271057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254708
5588	NC_008381	GCT	2	6	271095	271100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254708
5589	NC_008381	GAT	3	9	271122	271130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254708
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5591	NC_008381	TCCTGA	2	12	271160	271171	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116254708
5592	NC_008381	ATG	2	6	271249	271254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254708
5593	NC_008381	GCG	2	6	271294	271299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254708
5594	NC_008381	CGA	2	6	271322	271327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254708
5595	NC_008381	TGC	2	6	271343	271348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254708
5596	NC_008381	CGC	2	6	271416	271421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254708
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5600	NC_008381	CGGC	2	8	271598	271605	0 %	0 %	50 %	50 %	116254708
5601	NC_008381	TGC	2	6	271676	271681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254709
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5604	NC_008381	GCCG	2	8	271838	271845	0 %	0 %	50 %	50 %	116254709
5605	NC_008381	GCA	2	6	271886	271891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254709
5606	NC_008381	TTC	2	6	271893	271898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254709
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5608	NC_008381	TCG	2	6	271987	271992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254709
5609	NC_008381	CGC	2	6	272046	272051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254709
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5612	NC_008381	ATC	2	6	272193	272198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254709
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5614	NC_008381	TCG	2	6	272323	272328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254709
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5621	NC_008381	GCC	2	6	272575	272580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254709
5622	NC_008381	GGC	2	6	272595	272600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254709
5623	NC_008381	GC	3	6	272773	272778	0 %	0 %	50 %	50 %	116254709
5624	NC_008381	CG	3	6	272791	272796	0 %	0 %	50 %	50 %	116254709
5625	NC_008381	ATT	2	6	272806	272811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116254709
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5634	NC_008381	CAGG	2	8	273113	273120	25 %	0 %	50 %	25 %	116254709
5635	NC_008381	TCGATC	2	12	273148	273159	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116254709
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5642	NC_008381	AGG	2	6	273577	273582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254709
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5649	NC_008381	GCG	2	6	273945	273950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254710
5650	NC_008381	GCT	2	6	273971	273976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254710
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5652	NC_008381	GGC	2	6	274002	274007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254710
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5654	NC_008381	CGA	2	6	274067	274072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254710
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5669	NC_008381	CGAAG	2	10	274502	274511	40 %	0 %	40 %	20 %	116254710
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5672	NC_008381	CGGCG	2	10	274812	274821	0 %	0 %	60 %	40 %	116254711
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5690	NC_008381	ATG	2	6	275714	275719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5692	NC_008381	CGAAA	2	10	275769	275778	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5693	NC_008381	AACG	2	8	275790	275797	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5694	NC_008381	ACG	2	6	275816	275821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254712
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5707	NC_008381	CGA	2	6	276333	276338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254712
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5710	NC_008381	CGCAG	2	10	276435	276444	20 %	0 %	40 %	40 %	116254712
5711	NC_008381	AT	3	6	276465	276470	50 %	50 %	0 %	0 %	116254712
5712	NC_008381	CCGG	2	8	276486	276493	0 %	0 %	50 %	50 %	116254712
5713	NC_008381	CGA	2	6	276516	276521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5719	NC_008381	GTC	2	6	276709	276714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254713
5720	NC_008381	GATA	2	8	276717	276724	50 %	25 %	25 %	0 %	116254713
5721	NC_008381	AGCG	2	8	276830	276837	25 %	0 %	50 %	25 %	116254713
5722	NC_008381	CAT	2	6	276862	276867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254713
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5725	NC_008381	GCC	2	6	276935	276940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254713
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5729	NC_008381	TCG	2	6	277082	277087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254713
5730	NC_008381	GCG	2	6	277150	277155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254713
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5734	NC_008381	CAT	2	6	277302	277307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254713
5735	NC_008381	GCC	2	6	277333	277338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254713
5736	NC_008381	GA	3	6	277376	277381	50 %	0 %	50 %	0 %	116254713
5737	NC_008381	GCC	2	6	277399	277404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254713
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5740	NC_008381	GCT	2	6	277561	277566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254713
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5742	NC_008381	CGG	3	9	277709	277717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254713
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5865	NC_008381	GTC	2	6	282750	282755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5866	NC_008381	ACGATA	2	12	282778	282789	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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5868	NC_008381	GGA	2	6	282928	282933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5985	NC_008381	GAT	2	6	288133	288138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254721
5986	NC_008381	GCT	2	6	288166	288171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254722
5987	NC_008381	TGC	2	6	288339	288344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254722
5988	NC_008381	CGA	2	6	288357	288362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254722
5989	NC_008381	GCG	2	6	288363	288368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254722
5990	NC_008381	CGCAGC	2	12	288380	288391	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	116254722
5991	NC_008381	GGC	2	6	288392	288397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254722
5992	NC_008381	CGC	2	6	288409	288414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254722
5993	NC_008381	CGA	2	6	288433	288438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254722
5994	NC_008381	CAT	2	6	288511	288516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254722
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5996	NC_008381	GCATCG	2	12	288657	288668	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116254722
5997	NC_008381	CCT	2	6	288757	288762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254722
5998	NC_008381	TCG	2	6	288801	288806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254722
5999	NC_008381	GTC	2	6	288821	288826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254722
6000	NC_008381	ATGT	2	8	288854	288861	25 %	50 %	25 %	0 %	116254722

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