MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL10

Total Repeats: 10578

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008381	ATA	2	6	222187	222192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116254661
4502	NC_008381	GA	3	6	222218	222223	50 %	0 %	50 %	0 %	116254662
4503	NC_008381	TCG	2	6	222252	222257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254662
4504	NC_008381	TCC	2	6	222323	222328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254662
4505	NC_008381	GCA	2	6	222364	222369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254662
4506	NC_008381	GCG	2	6	222392	222397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254662
4507	NC_008381	TGCT	2	8	222417	222424	0 %	50 %	25 %	25 %	116254662
4508	NC_008381	GC	3	6	222488	222493	0 %	0 %	50 %	50 %	116254662
4509	NC_008381	ATG	2	6	222495	222500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254662
4510	NC_008381	TCT	2	6	222502	222507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_008381	GAT	2	6	222547	222552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_008381	GCC	2	6	222557	222562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4513	NC_008381	CCA	2	6	222677	222682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4514	NC_008381	AGCGA	2	10	222694	222703	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4515	NC_008381	CGG	2	6	222755	222760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4516	NC_008381	ATC	2	6	222794	222799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254663
4517	NC_008381	CCG	2	6	222848	222853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254663
4518	NC_008381	CGC	2	6	222861	222866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254663
4519	NC_008381	GCTC	2	8	222952	222959	0 %	25 %	25 %	50 %	116254663
4520	NC_008381	GCC	2	6	223000	223005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254663
4521	NC_008381	GCC	2	6	223111	223116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254663
4522	NC_008381	TGA	3	9	223205	223213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254663
4523	NC_008381	GCC	2	6	223296	223301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254663
4524	NC_008381	GGCC	2	8	223368	223375	0 %	0 %	50 %	50 %	116254663
4525	NC_008381	CCGA	2	8	223429	223436	25 %	0 %	25 %	50 %	116254663
4526	NC_008381	CG	3	6	223487	223492	0 %	0 %	50 %	50 %	116254663
4527	NC_008381	CGG	2	6	223537	223542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254663
4528	NC_008381	ACG	2	6	223631	223636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254663
4529	NC_008381	TCG	2	6	223688	223693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254663
4530	NC_008381	TGG	2	6	223760	223765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254663
4531	NC_008381	GC	3	6	223807	223812	0 %	0 %	50 %	50 %	116254663
4532	NC_008381	GATC	2	8	223868	223875	25 %	25 %	25 %	25 %	116254663
4533	NC_008381	TGCCGG	2	12	223977	223988	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116254663
4534	NC_008381	GGC	2	6	224004	224009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254663
4535	NC_008381	GGC	2	6	224191	224196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254663
4536	NC_008381	GTC	2	6	224207	224212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254663
4537	NC_008381	TCG	2	6	224225	224230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254663
4538	NC_008381	GC	3	6	224303	224308	0 %	0 %	50 %	50 %	116254663
4539	NC_008381	TCGA	2	8	224392	224399	25 %	25 %	25 %	25 %	116254663
4540	NC_008381	CG	3	6	224473	224478	0 %	0 %	50 %	50 %	116254663
4541	NC_008381	CGACG	2	10	224560	224569	20 %	0 %	40 %	40 %	116254663
4542	NC_008381	GC	3	6	224574	224579	0 %	0 %	50 %	50 %	116254663
4543	NC_008381	AC	3	6	224664	224669	50 %	0 %	0 %	50 %	116254663
4544	NC_008381	CAA	2	6	224679	224684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116254663
4545	NC_008381	CG	4	8	224700	224707	0 %	0 %	50 %	50 %	116254663
4546	NC_008381	ACG	2	6	224896	224901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254663
4547	NC_008381	CGA	3	9	224951	224959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254663
4548	NC_008381	GAG	2	6	225001	225006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254663
4549	NC_008381	GC	3	6	225045	225050	0 %	0 %	50 %	50 %	116254663
4550	NC_008381	GAC	2	6	225087	225092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254663
4551	NC_008381	GGA	2	6	225132	225137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254663
4552	NC_008381	CGG	2	6	225209	225214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254663
4553	NC_008381	GCC	2	6	225240	225245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254663
4554	NC_008381	GCA	2	6	225263	225268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254663
4555	NC_008381	GGC	2	6	225277	225282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254663
4556	NC_008381	CGC	2	6	225313	225318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254663
4557	NC_008381	AGC	2	6	225416	225421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254663
4558	NC_008381	ACG	2	6	225440	225445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254663
4559	NC_008381	GCC	2	6	225734	225739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254663
4560	NC_008381	GCT	2	6	225750	225755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254663
4561	NC_008381	CGA	2	6	225765	225770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254663
4562	NC_008381	TCG	2	6	225797	225802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254663
4563	NC_008381	GGC	2	6	225810	225815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254663
4564	NC_008381	GCC	2	6	225827	225832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254663
4565	NC_008381	CG	3	6	225994	225999	0 %	0 %	50 %	50 %	116254663
4566	NC_008381	CAG	2	6	226009	226014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254663
4567	NC_008381	T	6	6	226092	226097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_008381	GAT	2	6	226125	226130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_008381	TCT	2	6	226148	226153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_008381	CCT	2	6	226190	226195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4571	NC_008381	AAC	2	6	226242	226247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_008381	CGC	2	6	226264	226269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4573	NC_008381	CTT	2	6	226324	226329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4574	NC_008381	TTG	2	6	226334	226339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_008381	CGG	2	6	226367	226372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4576	NC_008381	AGCCT	2	10	226395	226404	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4577	NC_008381	GGCG	2	8	226438	226445	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4578	NC_008381	TA	3	6	226516	226521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_008381	CAC	2	6	226559	226564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254664
4580	NC_008381	CCT	2	6	226589	226594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254664
4581	NC_008381	GAG	2	6	226674	226679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254664
4582	NC_008381	GGC	2	6	226733	226738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254664
4583	NC_008381	TG	3	6	226838	226843	0 %	50 %	50 %	0 %	116254664
4584	NC_008381	GCATC	2	10	226943	226952	20 %	20 %	20 %	40 %	116254664
4585	NC_008381	TCG	2	6	226993	226998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254664
4586	NC_008381	CCG	2	6	227063	227068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254664
4587	NC_008381	CGA	2	6	227084	227089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254664
4588	NC_008381	GC	3	6	227199	227204	0 %	0 %	50 %	50 %	116254665
4589	NC_008381	GCT	2	6	227208	227213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254665
4590	NC_008381	CTG	2	6	227389	227394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254665
4591	NC_008381	GGC	2	6	227530	227535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254665
4592	NC_008381	GTTCGT	2	12	227536	227547	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	116254665
4593	NC_008381	CCA	2	6	227555	227560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254665
4594	NC_008381	GC	4	8	227567	227574	0 %	0 %	50 %	50 %	116254665
4595	NC_008381	GCC	2	6	227744	227749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254665
4596	NC_008381	GGCG	2	8	227915	227922	0 %	0 %	75 %	25 %	116254665
4597	NC_008381	GGC	2	6	227943	227948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254665
4598	NC_008381	CAC	2	6	227951	227956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254665
4599	NC_008381	GGT	2	6	227970	227975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254665
4600	NC_008381	AGC	2	6	228071	228076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254665
4601	NC_008381	CCGT	2	8	228157	228164	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4602	NC_008381	ACG	2	6	228167	228172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_008381	CGA	2	6	228180	228185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_008381	CCG	2	6	228284	228289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4605	NC_008381	AGCGAT	2	12	228356	228367	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4606	NC_008381	GC	3	6	228449	228454	0 %	0 %	50 %	50 %	116254666
4607	NC_008381	CTC	2	6	228485	228490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254666
4608	NC_008381	TTC	2	6	228545	228550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254666
4609	NC_008381	GAA	2	6	228568	228573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254666
4610	NC_008381	ATG	2	6	228600	228605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254666
4611	NC_008381	AAG	2	6	228746	228751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_008381	T	7	7	228812	228818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_008381	GGATC	2	10	228900	228909	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4614	NC_008381	TCT	2	6	228935	228940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254667
4615	NC_008381	CGG	2	6	228973	228978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254667
4616	NC_008381	GCC	2	6	229005	229010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254667
4617	NC_008381	CAT	2	6	229053	229058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254667
4618	NC_008381	TCT	2	6	229106	229111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254667
4619	NC_008381	CGG	2	6	229142	229147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254667
4620	NC_008381	TGC	2	6	229153	229158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254667
4621	NC_008381	TCT	2	6	229196	229201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254667
4622	NC_008381	GGC	2	6	229251	229256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254667
4623	NC_008381	CG	3	6	229270	229275	0 %	0 %	50 %	50 %	116254667
4624	NC_008381	GCT	2	6	229398	229403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254667
4625	NC_008381	CGG	2	6	229544	229549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254667
4626	NC_008381	CGC	2	6	229580	229585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254667
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4628	NC_008381	GGC	2	6	229685	229690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254667
4629	NC_008381	TGC	2	6	229750	229755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254667
4630	NC_008381	CGG	2	6	229762	229767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254667
4631	NC_008381	CCG	2	6	229799	229804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254667
4632	NC_008381	GCC	2	6	229848	229853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254667
4633	NC_008381	GCT	2	6	229874	229879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254667
4634	NC_008381	TCG	2	6	229900	229905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254667
4635	NC_008381	A	6	6	229919	229924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4636	NC_008381	CAT	2	6	229962	229967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254668
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4646	NC_008381	TCGA	2	8	230266	230273	25 %	25 %	25 %	25 %	116254668
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4654	NC_008381	GAG	2	6	230653	230658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254668
4655	NC_008381	TCG	2	6	230750	230755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254668
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4728	NC_008381	GCCGC	2	10	233705	233714	0 %	0 %	40 %	60 %	116254671
4729	NC_008381	TGC	2	6	233734	233739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254671
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4732	NC_008381	ATC	2	6	233916	233921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254671
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4736	NC_008381	CGAC	2	8	234055	234062	25 %	0 %	25 %	50 %	116254671
4737	NC_008381	GCG	2	6	234090	234095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254671
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4740	NC_008381	GC	3	6	234248	234253	0 %	0 %	50 %	50 %	116254671
4741	NC_008381	TCG	2	6	234307	234312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254671
4742	NC_008381	ACA	2	6	234316	234321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116254671
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4744	NC_008381	GCT	2	6	234503	234508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254671
4745	NC_008381	CGG	2	6	234560	234565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254671
4746	NC_008381	CAG	3	9	234567	234575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254671
4747	NC_008381	TGC	2	6	234616	234621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254671
4748	NC_008381	CGA	2	6	234626	234631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254671
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4753	NC_008381	GTC	2	6	234762	234767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254671
4754	NC_008381	GCT	2	6	234907	234912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4755	NC_008381	AATAAC	2	12	234920	234931	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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4766	NC_008381	AACGC	2	10	235646	235655	40 %	0 %	20 %	40 %	116254672
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4770	NC_008381	GTC	2	6	235784	235789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254672
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4773	NC_008381	TGC	2	6	235932	235937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4774	NC_008381	CCTG	2	8	235945	235952	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4775	NC_008381	CTG	2	6	236001	236006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254673
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4838	NC_008381	GA	3	6	238712	238717	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4839	NC_008381	AG	3	6	238770	238775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4843	NC_008381	CGA	2	6	238984	238989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254676
4844	NC_008381	ATC	2	6	239012	239017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254676
4845	NC_008381	GATC	2	8	239074	239081	25 %	25 %	25 %	25 %	116254676
4846	NC_008381	TCA	2	6	239109	239114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254676
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4850	NC_008381	GGC	2	6	239296	239301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254676
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4855	NC_008381	CTG	2	6	239476	239481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4856	NC_008381	TTC	2	6	239513	239518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4858	NC_008381	AGG	2	6	239576	239581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4859	NC_008381	GCT	2	6	239631	239636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254677
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4861	NC_008381	GAC	2	6	239689	239694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254677
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4863	NC_008381	GAG	2	6	239762	239767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254677
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4984	NC_008381	CAG	2	6	245012	245017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254684
4985	NC_008381	CGA	2	6	245045	245050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254684
4986	NC_008381	GTG	2	6	245067	245072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254684
4987	NC_008381	TGC	2	6	245131	245136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254684
4988	NC_008381	TCG	2	6	245146	245151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254684
4989	NC_008381	GT	3	6	245202	245207	0 %	50 %	50 %	0 %	116254684
4990	NC_008381	GAT	2	6	245228	245233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254684
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4992	NC_008381	GCC	2	6	245327	245332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254684
4993	NC_008381	CT	3	6	245464	245469	0 %	50 %	0 %	50 %	116254684
4994	NC_008381	TGG	2	6	245523	245528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254684
4995	NC_008381	CATC	2	8	245531	245538	25 %	25 %	0 %	50 %	116254684
4996	NC_008381	CGTT	2	8	245597	245604	0 %	50 %	25 %	25 %	116254684
4997	NC_008381	GAG	2	6	245637	245642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254684
4998	NC_008381	CG	3	6	245677	245682	0 %	0 %	50 %	50 %	116254684
4999	NC_008381	CCCGT	2	10	245846	245855	0 %	20 %	20 %	60 %	116254684
5000	NC_008381	GAG	2	6	245958	245963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254684

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