MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 118531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008380	GGC	2	6	43008	43013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249805
1002	NC_008380	CCG	2	6	43031	43036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249805
1003	NC_008380	GAT	2	6	43088	43093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249806
1004	NC_008380	TTC	2	6	43156	43161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249806
1005	NC_008380	CGG	2	6	43313	43318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249806
1006	NC_008380	GAA	2	6	43341	43346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249806
1007	NC_008380	GCC	2	6	43371	43376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249806
1008	NC_008380	CG	3	6	43388	43393	0 %	0 %	50 %	50 %	116249806
1009	NC_008380	GCA	2	6	43397	43402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249806
1010	NC_008380	CGA	2	6	43439	43444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249806
1011	NC_008380	GCA	2	6	43460	43465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249806
1012	NC_008380	CGT	2	6	43466	43471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249806
1013	NC_008380	GCA	2	6	43601	43606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249806
1014	NC_008380	GGT	2	6	43632	43637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249806
1015	NC_008380	GGT	2	6	43698	43703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249806
1016	NC_008380	CCACCG	2	12	43712	43723	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	116249806
1017	NC_008380	AGC	2	6	43828	43833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249806
1018	NC_008380	AGAT	2	8	43846	43853	50 %	25 %	25 %	0 %	116249806
1019	NC_008380	TCG	2	6	43864	43869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249806
1020	NC_008380	TCG	2	6	43909	43914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249806
1021	NC_008380	GAAGA	2	10	43963	43972	60 %	0 %	40 %	0 %	116249806
1022	NC_008380	GCC	2	6	44178	44183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249807
1023	NC_008380	CCG	2	6	44215	44220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249807
1024	NC_008380	CTT	2	6	44239	44244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249807
1025	NC_008380	CTT	2	6	44252	44257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249807
1026	NC_008380	CGC	2	6	44258	44263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249807
1027	NC_008380	GCC	2	6	44273	44278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249807
1028	NC_008380	CGA	2	6	44332	44337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249807
1029	NC_008380	CCT	2	6	44499	44504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249808
1030	NC_008380	CGA	2	6	44514	44519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249808
1031	NC_008380	TCG	2	6	44522	44527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249808
1032	NC_008380	CGC	2	6	44538	44543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249808
1033	NC_008380	CAG	2	6	44641	44646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249808
1034	NC_008380	CG	3	6	44658	44663	0 %	0 %	50 %	50 %	116249808
1035	NC_008380	CCA	2	6	44664	44669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249808
1036	NC_008380	GCC	2	6	44713	44718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249808
1037	NC_008380	CGC	2	6	44751	44756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249808
1038	NC_008380	TGCG	2	8	44765	44772	0 %	25 %	50 %	25 %	116249808
1039	NC_008380	TCGA	2	8	44786	44793	25 %	25 %	25 %	25 %	116249808
1040	NC_008380	AAC	2	6	44794	44799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116249808
1041	NC_008380	CGC	2	6	44931	44936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249808
1042	NC_008380	GCCG	2	8	45046	45053	0 %	0 %	50 %	50 %	116249808
1043	NC_008380	CAT	2	6	45054	45059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249808
1044	NC_008380	CGA	2	6	45093	45098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249808
1045	NC_008380	GAC	2	6	45121	45126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249808
1046	NC_008380	GCC	2	6	45200	45205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249809
1047	NC_008380	GCG	2	6	45304	45309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249809
1048	NC_008380	TCG	2	6	45314	45319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249809
1049	NC_008380	AG	3	6	45320	45325	50 %	0 %	50 %	0 %	116249809
1050	NC_008380	GCC	2	6	45331	45336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249809
1051	NC_008380	GAT	2	6	45433	45438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249809
1052	NC_008380	GAT	2	6	45478	45483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249809
1053	NC_008380	GCC	2	6	45526	45531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249809
1054	NC_008380	CGC	2	6	45629	45634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249809
1055	NC_008380	CG	3	6	45639	45644	0 %	0 %	50 %	50 %	116249809
1056	NC_008380	GCC	3	9	45679	45687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249809
1057	NC_008380	GGC	2	6	45823	45828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249809
1058	NC_008380	CTG	2	6	45853	45858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249809
1059	NC_008380	GCC	2	6	45889	45894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249809
1060	NC_008380	GTC	2	6	45925	45930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_008380	GCC	2	6	46010	46015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249810
1062	NC_008380	AGG	2	6	46031	46036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249810
1063	NC_008380	GGTC	2	8	46236	46243	0 %	25 %	50 %	25 %	116249810
1064	NC_008380	GA	3	6	46244	46249	50 %	0 %	50 %	0 %	116249810
1065	NC_008380	CGG	2	6	46263	46268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249810
1066	NC_008380	CGGC	2	8	46292	46299	0 %	0 %	50 %	50 %	116249810
1067	NC_008380	GCC	2	6	46443	46448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249810
1068	NC_008380	CGT	2	6	46458	46463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249810
1069	NC_008380	ATC	2	6	46484	46489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249810
1070	NC_008380	CTTT	2	8	46498	46505	0 %	75 %	0 %	25 %	116249811
1071	NC_008380	TCG	2	6	46549	46554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249811
1072	NC_008380	CGG	2	6	46558	46563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249811
1073	NC_008380	GCC	2	6	46572	46577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249811
1074	NC_008380	G	6	6	46599	46604	0 %	0 %	100 %	0 %	116249811
1075	NC_008380	CCG	2	6	46684	46689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_008380	GAT	2	6	46707	46712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_008380	ATG	2	6	46768	46773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_008380	CAT	2	6	46802	46807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_008380	GGC	2	6	46823	46828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_008380	AGCC	2	8	46838	46845	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1081	NC_008380	TGT	2	6	47004	47009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249812
1082	NC_008380	CGA	2	6	47016	47021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249812
1083	NC_008380	CGG	2	6	47076	47081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249812
1084	NC_008380	ATC	2	6	47209	47214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249812
1085	NC_008380	CGA	2	6	47226	47231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249812
1086	NC_008380	TCT	2	6	47268	47273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249812
1087	NC_008380	CG	3	6	47280	47285	0 %	0 %	50 %	50 %	116249812
1088	NC_008380	CTT	2	6	47332	47337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249812
1089	NC_008380	ACGAT	2	10	47426	47435	40 %	20 %	20 %	20 %	116249812
1090	NC_008380	TCC	2	6	47450	47455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249812
1091	NC_008380	GGC	2	6	47500	47505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249812
1092	NC_008380	TCC	2	6	47580	47585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249813
1093	NC_008380	CGT	2	6	47669	47674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249813
1094	NC_008380	GCC	2	6	47689	47694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249813
1095	NC_008380	CAG	2	6	47717	47722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249813
1096	NC_008380	GCA	2	6	47770	47775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249813
1097	NC_008380	GACC	2	8	47807	47814	25 %	0 %	25 %	50 %	116249813
1098	NC_008380	CAG	2	6	47829	47834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249813
1099	NC_008380	CCG	2	6	47846	47851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249813
1100	NC_008380	CAC	2	6	47879	47884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249813
1101	NC_008380	GCA	2	6	47894	47899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249813
1102	NC_008380	CAG	2	6	47937	47942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249813
1103	NC_008380	AGC	2	6	47968	47973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249813
1104	NC_008380	GCC	2	6	48021	48026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249813
1105	NC_008380	GCC	2	6	48061	48066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_008380	GATC	2	8	48129	48136	25 %	25 %	25 %	25 %	116249814
1107	NC_008380	CG	3	6	48154	48159	0 %	0 %	50 %	50 %	116249814
1108	NC_008380	TTG	2	6	48197	48202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249814
1109	NC_008380	GAA	2	6	48259	48264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249814
1110	NC_008380	GC	3	6	48303	48308	0 %	0 %	50 %	50 %	116249814
1111	NC_008380	CGGC	2	8	48334	48341	0 %	0 %	50 %	50 %	116249814
1112	NC_008380	TCGTC	2	10	48369	48378	0 %	40 %	20 %	40 %	116249814
1113	NC_008380	GATC	2	8	48387	48394	25 %	25 %	25 %	25 %	116249814
1114	NC_008380	ATG	2	6	48478	48483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249814
1115	NC_008380	GTC	2	6	48484	48489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249814
1116	NC_008380	GAA	2	6	48565	48570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249814
1117	NC_008380	TCG	2	6	48588	48593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249814
1118	NC_008380	ACGGAA	2	12	48617	48628	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	116249814
1119	NC_008380	ACA	2	6	48850	48855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116249815
1120	NC_008380	GGC	2	6	48874	48879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249815
1121	NC_008380	GGT	2	6	48882	48887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249815
1122	NC_008380	GGCG	2	8	48891	48898	0 %	0 %	75 %	25 %	116249815
1123	NC_008380	AAG	2	6	49033	49038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249815
1124	NC_008380	ATG	2	6	49129	49134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249815
1125	NC_008380	TCG	2	6	49136	49141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249815
1126	NC_008380	ACG	2	6	49204	49209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249815
1127	NC_008380	CGG	2	6	49221	49226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249815
1128	NC_008380	GCC	2	6	49243	49248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249815
1129	NC_008380	CGC	2	6	49291	49296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249815
1130	NC_008380	CGC	2	6	49308	49313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249815
1131	NC_008380	CGT	2	6	49341	49346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249815
1132	NC_008380	TGG	2	6	49454	49459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249816
1133	NC_008380	GGC	2	6	49564	49569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249816
1134	NC_008380	CGA	2	6	49576	49581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249816
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1136	NC_008380	GC	3	6	49719	49724	0 %	0 %	50 %	50 %	116249816
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1140	NC_008380	TGCGC	2	10	49956	49965	0 %	20 %	40 %	40 %	116249817
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1144	NC_008380	TGA	2	6	50030	50035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249817
1145	NC_008380	CGC	2	6	50071	50076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249817
1146	NC_008380	TCA	2	6	50102	50107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249817
1147	NC_008380	CCA	2	6	50117	50122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249817
1148	NC_008380	ATC	2	6	50164	50169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249817
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1151	NC_008380	GAG	2	6	50251	50256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249817
1152	NC_008380	CAC	2	6	50280	50285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249817
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1157	NC_008380	CGA	2	6	50526	50531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249817
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1167	NC_008380	CG	3	6	50911	50916	0 %	0 %	50 %	50 %	116249817
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1174	NC_008380	CG	3	6	51353	51358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1175	NC_008380	GTTTT	2	10	51377	51386	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1178	NC_008380	GCCG	2	8	51547	51554	0 %	0 %	50 %	50 %	116249818
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1200	NC_008380	GC	3	6	52300	52305	0 %	0 %	50 %	50 %	116249818
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1230	NC_008380	GAC	2	6	53812	53817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249819
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1233	NC_008380	ATT	2	6	53888	53893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1234	NC_008380	TGAA	2	8	53907	53914	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1235	NC_008380	GCA	2	6	53929	53934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1236	NC_008380	TCG	2	6	54020	54025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249820
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1242	NC_008380	CGG	2	6	54182	54187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249820
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1244	NC_008380	CCTG	2	8	54231	54238	0 %	25 %	25 %	50 %	116249820
1245	NC_008380	TCG	2	6	54308	54313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249820
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1248	NC_008380	ATG	2	6	54374	54379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249820
1249	NC_008380	TACGG	2	10	54385	54394	20 %	20 %	40 %	20 %	116249820
1250	NC_008380	GCG	2	6	54449	54454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249820
1251	NC_008380	GTC	2	6	54559	54564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249820
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1370	NC_008380	AGC	2	6	59280	59285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249824
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1494	NC_008380	AC	3	6	64974	64979	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1495	NC_008380	AGG	2	6	65033	65038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1496	NC_008380	CCT	2	6	65115	65120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1497	NC_008380	CGC	2	6	65245	65250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1498	NC_008380	ACG	2	6	65264	65269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1499	NC_008380	TCTT	2	8	65299	65306	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1500	NC_008380	CG	3	6	65337	65342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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