MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 118531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
118001	NC_008380	GGA	2	6	5032215	5032220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118002	NC_008380	GCC	2	6	5032268	5032273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118003	NC_008380	TACTT	2	10	5032333	5032342	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
118004	NC_008380	ATC	2	6	5032386	5032391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118005	NC_008380	TCT	2	6	5032432	5032437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254447
118006	NC_008380	TCGATC	2	12	5032452	5032463	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116254447
118007	NC_008380	AGA	2	6	5032498	5032503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254447
118008	NC_008380	CAGC	2	8	5032544	5032551	25 %	0 %	25 %	50 %	116254447
118009	NC_008380	CAG	2	6	5032571	5032576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254447
118010	NC_008380	GGAT	2	8	5032614	5032621	25 %	25 %	50 %	0 %	116254447
118011	NC_008380	CGG	2	6	5032708	5032713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254447
118012	NC_008380	CGTC	2	8	5032791	5032798	0 %	25 %	25 %	50 %	116254447
118013	NC_008380	AGGGCG	2	12	5032861	5032872	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	116254447
118014	NC_008380	GCC	2	6	5032917	5032922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254447
118015	NC_008380	GC	3	6	5032928	5032933	0 %	0 %	50 %	50 %	116254447
118016	NC_008380	GAC	2	6	5033001	5033006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254447
118017	NC_008380	GC	3	6	5033044	5033049	0 %	0 %	50 %	50 %	116254447
118018	NC_008380	GGC	2	6	5033058	5033063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254447
118019	NC_008380	C	6	6	5033094	5033099	0 %	0 %	0 %	100 %	116254447
118020	NC_008380	GCA	2	6	5033164	5033169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254447
118021	NC_008380	GCA	2	6	5033332	5033337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254447
118022	NC_008380	AGC	2	6	5033343	5033348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254447
118023	NC_008380	CG	3	6	5033362	5033367	0 %	0 %	50 %	50 %	116254447
118024	NC_008380	GCC	2	6	5033384	5033389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254447
118025	NC_008380	GCC	2	6	5033433	5033438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254447
118026	NC_008380	GC	4	8	5033454	5033461	0 %	0 %	50 %	50 %	116254447
118027	NC_008380	GCC	2	6	5033516	5033521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254447
118028	NC_008380	GCG	2	6	5033582	5033587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254447
118029	NC_008380	ACC	2	6	5033616	5033621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254447
118030	NC_008380	ATGG	2	8	5033699	5033706	25 %	25 %	50 %	0 %	116254447
118031	NC_008380	CG	3	6	5033726	5033731	0 %	0 %	50 %	50 %	116254447
118032	NC_008380	GGC	2	6	5033732	5033737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254447
118033	NC_008380	CAGC	2	8	5033777	5033784	25 %	0 %	25 %	50 %	116254447
118034	NC_008380	GTGAAG	2	12	5033826	5033837	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	116254447
118035	NC_008380	CCGT	2	8	5033882	5033889	0 %	25 %	25 %	50 %	116254447
118036	NC_008380	TCG	2	6	5033898	5033903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254447
118037	NC_008380	TGC	2	6	5033920	5033925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254447
118038	NC_008380	GCA	2	6	5033992	5033997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254447
118039	NC_008380	ACGCG	2	10	5033998	5034007	20 %	0 %	40 %	40 %	116254447
118040	NC_008380	GC	3	6	5034015	5034020	0 %	0 %	50 %	50 %	116254447
118041	NC_008380	ACAT	2	8	5034036	5034043	50 %	25 %	0 %	25 %	116254447
118042	NC_008380	AATT	2	8	5034139	5034146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118043	NC_008380	CGG	2	6	5034199	5034204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118044	NC_008380	CGC	2	6	5034262	5034267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118045	NC_008380	CGC	2	6	5034297	5034302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254448
118046	NC_008380	CCG	2	6	5034307	5034312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254448
118047	NC_008380	TGG	2	6	5034361	5034366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254448
118048	NC_008380	GCC	2	6	5034399	5034404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254448
118049	NC_008380	CGA	2	6	5034475	5034480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254448
118050	NC_008380	A	6	6	5034517	5034522	100 %	0 %	0 %	0 %	116254448
118051	NC_008380	GCC	2	6	5034530	5034535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254448
118052	NC_008380	GCA	2	6	5034562	5034567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254448
118053	NC_008380	GCC	2	6	5034582	5034587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254448
118054	NC_008380	AGA	2	6	5034653	5034658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254448
118055	NC_008380	GTC	2	6	5034708	5034713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254448
118056	NC_008380	GCC	2	6	5034812	5034817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254448
118057	NC_008380	CGG	2	6	5034865	5034870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254448
118058	NC_008380	GCC	2	6	5034915	5034920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254448
118059	NC_008380	CACC	2	8	5034929	5034936	25 %	0 %	0 %	75 %	116254448
118060	NC_008380	TCG	2	6	5034945	5034950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254448
118061	NC_008380	CGAG	2	8	5034958	5034965	25 %	0 %	50 %	25 %	116254448
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118066	NC_008380	CGG	2	6	5035215	5035220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254448
118067	NC_008380	ACG	2	6	5035247	5035252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254448
118068	NC_008380	TGC	2	6	5035331	5035336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254448
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118070	NC_008380	CAG	2	6	5035391	5035396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254448
118071	NC_008380	CGT	2	6	5035436	5035441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254448
118072	NC_008380	CGA	2	6	5035546	5035551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254448
118073	NC_008380	GCA	2	6	5035554	5035559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254448
118074	NC_008380	GCC	2	6	5035569	5035574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254448
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118079	NC_008380	TGA	3	9	5035878	5035886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254449
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118081	NC_008380	CG	3	6	5036025	5036030	0 %	0 %	50 %	50 %	116254449
118082	NC_008380	GGC	2	6	5036059	5036064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254449
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118084	NC_008380	ATC	2	6	5036078	5036083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254449
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118086	NC_008380	CGA	2	6	5036097	5036102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254449
118087	NC_008380	TGT	2	6	5036118	5036123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254449
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118098	NC_008380	GAA	2	6	5036500	5036505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254449
118099	NC_008380	CGG	2	6	5036514	5036519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254449
118100	NC_008380	ATC	2	6	5036534	5036539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254449
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118103	NC_008380	ATCTCC	2	12	5036634	5036645	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
118104	NC_008380	TCA	2	6	5036701	5036706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118105	NC_008380	ACA	2	6	5036758	5036763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116254450
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118109	NC_008380	CGG	2	6	5036900	5036905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254450
118110	NC_008380	AGCCG	2	10	5036906	5036915	20 %	0 %	40 %	40 %	116254450
118111	NC_008380	CGAT	2	8	5036950	5036957	25 %	25 %	25 %	25 %	116254450
118112	NC_008380	GCA	2	6	5036993	5036998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118113	NC_008380	GCC	2	6	5037101	5037106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118114	NC_008380	GAA	2	6	5037110	5037115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118115	NC_008380	TCG	2	6	5037184	5037189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254451
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118220	NC_008380	GCCACC	2	12	5042564	5042575	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	116254454
118221	NC_008380	CGA	2	6	5042598	5042603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254454
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118225	NC_008380	TCG	2	6	5042756	5042761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254454
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118227	NC_008380	GGC	2	6	5042782	5042787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254454
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118341	NC_008380	GTG	2	6	5047579	5047584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254458
118342	NC_008380	TCG	2	6	5047603	5047608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254458
118343	NC_008380	GCT	2	6	5047619	5047624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254458
118344	NC_008380	GCC	2	6	5047644	5047649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254458
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118349	NC_008380	CG	3	6	5047817	5047822	0 %	0 %	50 %	50 %	116254458
118350	NC_008380	CGG	2	6	5047844	5047849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254458
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118365	NC_008380	GTT	2	6	5048409	5048414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118366	NC_008380	GCT	2	6	5048474	5048479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254459
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118372	NC_008380	TGC	2	6	5048617	5048622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254459
118373	NC_008380	GC	4	8	5048737	5048744	0 %	0 %	50 %	50 %	116254459
118374	NC_008380	GCA	2	6	5048767	5048772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254459
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118376	NC_008380	GCT	2	6	5048891	5048896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254459
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118378	NC_008380	CGA	2	6	5048948	5048953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254459
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118392	NC_008380	CTG	2	6	5049833	5049838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254460
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118405	NC_008380	TCG	2	6	5050666	5050671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254461
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118409	NC_008380	GA	3	6	5050954	5050959	50 %	0 %	50 %	0 %	116254462
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118414	NC_008380	CGC	2	6	5051299	5051304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254462
118415	NC_008380	CG	3	6	5051308	5051313	0 %	0 %	50 %	50 %	116254462
118416	NC_008380	GCG	2	6	5051342	5051347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254462
118417	NC_008380	CGTGA	2	10	5051434	5051443	20 %	20 %	40 %	20 %	116254462
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118419	NC_008380	GCT	2	6	5051505	5051510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254462
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118421	NC_008380	TGA	2	6	5051717	5051722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254462
118422	NC_008380	CCG	2	6	5051738	5051743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254462
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118424	NC_008380	AAGA	2	8	5051802	5051809	75 %	0 %	25 %	0 %	116254462
118425	NC_008380	TCGA	2	8	5051851	5051858	25 %	25 %	25 %	25 %	116254462
118426	NC_008380	ATG	2	6	5051914	5051919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254462
118427	NC_008380	ATG	2	6	5051929	5051934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254462
118428	NC_008380	GTC	2	6	5051950	5051955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254462
118429	NC_008380	CTC	2	6	5052021	5052026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254462
118430	NC_008380	CGGG	2	8	5052079	5052086	0 %	0 %	75 %	25 %	116254462
118431	NC_008380	CAATC	2	10	5052141	5052150	40 %	20 %	0 %	40 %	116254462
118432	NC_008380	ACC	2	6	5052235	5052240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254462
118433	NC_008380	ATC	2	6	5052261	5052266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254462
118434	NC_008380	GAT	2	6	5052327	5052332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254462
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118437	NC_008380	TGAAT	2	10	5052446	5052455	40 %	40 %	20 %	0 %	116254462
118438	NC_008380	GCGAC	2	10	5052469	5052478	20 %	0 %	40 %	40 %	116254462
118439	NC_008380	CCAT	2	8	5052487	5052494	25 %	25 %	0 %	50 %	116254462
118440	NC_008380	GC	3	6	5052609	5052614	0 %	0 %	50 %	50 %	116254462
118441	NC_008380	GCC	2	6	5052645	5052650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254462
118442	NC_008380	ATCACA	2	12	5052655	5052666	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	116254462
118443	NC_008380	CCG	2	6	5052842	5052847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254463
118444	NC_008380	GCT	2	6	5052857	5052862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254463
118445	NC_008380	GCT	2	6	5052913	5052918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254463
118446	NC_008380	TC	3	6	5052987	5052992	0 %	50 %	0 %	50 %	116254463
118447	NC_008380	CCG	2	6	5053011	5053016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254463
118448	NC_008380	CTT	2	6	5053092	5053097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254463
118449	NC_008380	GTC	2	6	5053134	5053139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254463
118450	NC_008380	CG	5	10	5053202	5053211	0 %	0 %	50 %	50 %	116254463
118451	NC_008380	GGT	2	6	5053320	5053325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254463
118452	NC_008380	ACC	2	6	5053414	5053419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254463
118453	NC_008380	GAT	2	6	5053434	5053439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254463
118454	NC_008380	GCCG	2	8	5053443	5053450	0 %	0 %	50 %	50 %	116254463
118455	NC_008380	GCC	3	9	5053453	5053461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254463
118456	NC_008380	TCC	2	6	5053537	5053542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254463
118457	NC_008380	GC	3	6	5053571	5053576	0 %	0 %	50 %	50 %	116254463
118458	NC_008380	CGG	2	6	5053735	5053740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254463
118459	NC_008380	A	6	6	5053875	5053880	100 %	0 %	0 %	0 %	116254463
118460	NC_008380	ATCG	2	8	5053896	5053903	25 %	25 %	25 %	25 %	116254463
118461	NC_008380	GCC	2	6	5053948	5053953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254463
118462	NC_008380	CGA	2	6	5053964	5053969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254463
118463	NC_008380	AT	3	6	5054052	5054057	50 %	50 %	0 %	0 %	116254463
118464	NC_008380	AATCGA	2	12	5054096	5054107	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118465	NC_008380	CAT	2	6	5054134	5054139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118466	NC_008380	ATCGA	2	10	5054191	5054200	40 %	20 %	20 %	20 %	116254464
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118500	NC_008380	GCT	2	6	5055602	5055607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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