MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 118531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008380	GCCG	2	8	257036	257043	0 %	0 %	50 %	50 %	116249989
6002	NC_008380	CGC	2	6	257065	257070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249989
6003	NC_008380	CGG	2	6	257146	257151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249989
6004	NC_008380	TGA	2	6	257158	257163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249989
6005	NC_008380	CGC	2	6	257180	257185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249989
6006	NC_008380	TCTT	2	8	257212	257219	0 %	75 %	0 %	25 %	116249989
6007	NC_008380	CGA	2	6	257242	257247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249989
6008	NC_008380	TGGCC	2	10	257285	257294	0 %	20 %	40 %	40 %	116249989
6009	NC_008380	CGA	2	6	257330	257335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249989
6010	NC_008380	GCGCC	2	10	257391	257400	0 %	0 %	40 %	60 %	116249989
6011	NC_008380	AAG	2	6	257421	257426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249989
6012	NC_008380	TCG	2	6	257446	257451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249989
6013	NC_008380	CGG	2	6	257474	257479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249989
6014	NC_008380	CTG	2	6	257494	257499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249989
6015	NC_008380	TGC	2	6	257506	257511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249989
6016	NC_008380	TGA	2	6	257512	257517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249989
6017	NC_008380	GCG	2	6	257530	257535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249989
6018	NC_008380	TGA	2	6	257560	257565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249989
6019	NC_008380	GTC	2	6	257610	257615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249989
6020	NC_008380	CCGGC	2	10	257642	257651	0 %	0 %	40 %	60 %	116249989
6021	NC_008380	CGA	2	6	257744	257749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249989
6022	NC_008380	GCT	2	6	257762	257767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249989
6023	NC_008380	CTT	2	6	257828	257833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249989
6024	NC_008380	TGACC	2	10	257858	257867	20 %	20 %	20 %	40 %	116249989
6025	NC_008380	CGA	2	6	257885	257890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249989
6026	NC_008380	GCCG	2	8	257966	257973	0 %	0 %	50 %	50 %	116249989
6027	NC_008380	CCG	2	6	257995	258000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249989
6028	NC_008380	GTG	3	9	258094	258102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249989
6029	NC_008380	CG	3	6	258117	258122	0 %	0 %	50 %	50 %	116249989
6030	NC_008380	CGCGC	2	10	258204	258213	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6031	NC_008380	GGC	2	6	258251	258256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_008380	GCC	2	6	258264	258269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6033	NC_008380	TGCATG	2	12	258273	258284	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6034	NC_008380	TGGCG	2	10	258378	258387	0 %	20 %	60 %	20 %	116249990
6035	NC_008380	CTG	2	6	258442	258447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249990
6036	NC_008380	GCC	3	9	258462	258470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249990
6037	NC_008380	GCC	2	6	258490	258495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249990
6038	NC_008380	CGA	2	6	258573	258578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249990
6039	NC_008380	ATC	2	6	258598	258603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249990
6040	NC_008380	CGG	2	6	258615	258620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249990
6041	NC_008380	CCG	2	6	258666	258671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249990
6042	NC_008380	GCC	2	6	258712	258717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249991
6043	NC_008380	GCC	2	6	258927	258932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249991
6044	NC_008380	GGCC	2	8	258978	258985	0 %	0 %	50 %	50 %	116249991
6045	NC_008380	GGC	2	6	258986	258991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249991
6046	NC_008380	GC	3	6	259107	259112	0 %	0 %	50 %	50 %	116249991
6047	NC_008380	TCG	2	6	259207	259212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249991
6048	NC_008380	TGA	2	6	259297	259302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249991
6049	NC_008380	GGC	2	6	259337	259342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249991
6050	NC_008380	CCG	2	6	259376	259381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249991
6051	NC_008380	GC	3	6	259470	259475	0 %	0 %	50 %	50 %	116249991
6052	NC_008380	GGCT	2	8	259506	259513	0 %	25 %	50 %	25 %	116249991
6053	NC_008380	ACCG	2	8	259523	259530	25 %	0 %	25 %	50 %	116249991
6054	NC_008380	CCGA	2	8	259538	259545	25 %	0 %	25 %	50 %	116249991
6055	NC_008380	GTC	2	6	259635	259640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249992
6056	NC_008380	CGA	2	6	259652	259657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249992
6057	NC_008380	GGC	2	6	259707	259712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249992
6058	NC_008380	GCT	2	6	259715	259720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249992
6059	NC_008380	GAT	2	6	259809	259814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249992
6060	NC_008380	CGC	2	6	259913	259918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249992
6061	NC_008380	TTC	2	6	259977	259982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249992
6062	NC_008380	GCCG	2	8	260085	260092	0 %	0 %	50 %	50 %	116249992
6063	NC_008380	TCG	2	6	260134	260139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249992
6064	NC_008380	ATCC	2	8	260208	260215	25 %	25 %	0 %	50 %	116249992
6065	NC_008380	CGG	2	6	260229	260234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249992
6066	NC_008380	GC	3	6	260304	260309	0 %	0 %	50 %	50 %	116249992
6067	NC_008380	ATA	2	6	260334	260339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116249992
6068	NC_008380	CGG	2	6	260396	260401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249992
6069	NC_008380	CCG	2	6	260416	260421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249992
6070	NC_008380	CGG	2	6	260453	260458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249992
6071	NC_008380	GCC	2	6	260461	260466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249992
6072	NC_008380	CCG	2	6	260488	260493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249992
6073	NC_008380	GGA	2	6	260550	260555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249992
6074	NC_008380	GGT	2	6	260577	260582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249992
6075	NC_008380	GCG	2	6	260620	260625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249992
6076	NC_008380	GC	4	8	260788	260795	0 %	0 %	50 %	50 %	116249992
6077	NC_008380	GTAGAG	2	12	260808	260819	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	116249992
6078	NC_008380	GGC	2	6	260841	260846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249992
6079	NC_008380	CATGG	2	10	260943	260952	20 %	20 %	40 %	20 %	116249992
6080	NC_008380	GGA	2	6	260974	260979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_008380	CTCGC	2	10	260989	260998	0 %	20 %	20 %	60 %	116249993
6082	NC_008380	GCCA	2	8	261082	261089	25 %	0 %	25 %	50 %	116249993
6083	NC_008380	CGG	2	6	261147	261152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249993
6084	NC_008380	GAT	2	6	261228	261233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249993
6085	NC_008380	TGA	2	6	261239	261244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249993
6086	NC_008380	GCA	2	6	261251	261256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249993
6087	NC_008380	GC	4	8	261295	261302	0 %	0 %	50 %	50 %	116249993
6088	NC_008380	GGC	2	6	261451	261456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249993
6089	NC_008380	CAG	2	6	261486	261491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249993
6090	NC_008380	CCG	2	6	261550	261555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249993
6091	NC_008380	GCG	2	6	261662	261667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249993
6092	NC_008380	GAT	2	6	261681	261686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249993
6093	NC_008380	CGG	2	6	261699	261704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249993
6094	NC_008380	CAG	2	6	261726	261731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249993
6095	NC_008380	CAG	2	6	261744	261749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249993
6096	NC_008380	GAT	2	6	261753	261758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249993
6097	NC_008380	GCC	2	6	261853	261858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249994
6098	NC_008380	GATC	2	8	261872	261879	25 %	25 %	25 %	25 %	116249994
6099	NC_008380	GA	3	6	261889	261894	50 %	0 %	50 %	0 %	116249994
6100	NC_008380	CGA	2	6	261896	261901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249994
6101	NC_008380	TCA	2	6	261908	261913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249994
6102	NC_008380	GAA	2	6	261930	261935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249994
6103	NC_008380	GAT	2	6	261957	261962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249994
6104	NC_008380	CCA	2	6	262025	262030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249994
6105	NC_008380	CGA	2	6	262043	262048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249994
6106	NC_008380	ATC	2	6	262069	262074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249994
6107	NC_008380	CCG	2	6	262187	262192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249994
6108	NC_008380	GC	3	6	262194	262199	0 %	0 %	50 %	50 %	116249994
6109	NC_008380	CGCC	2	8	262214	262221	0 %	0 %	25 %	75 %	116249994
6110	NC_008380	CGG	2	6	262241	262246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249994
6111	NC_008380	CCG	2	6	262300	262305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249994
6112	NC_008380	TCG	2	6	262325	262330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249994
6113	NC_008380	GAT	2	6	262338	262343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249994
6114	NC_008380	CAG	2	6	262347	262352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249994
6115	NC_008380	AGGC	2	8	262364	262371	25 %	0 %	50 %	25 %	116249994
6116	NC_008380	CCG	2	6	262420	262425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249994
6117	NC_008380	GGC	2	6	262434	262439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249994
6118	NC_008380	CGA	2	6	262520	262525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249994
6119	NC_008380	GCA	3	9	262607	262615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249994
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6121	NC_008380	GAC	3	9	262740	262748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249994
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6486	NC_008380	ATGT	2	8	277322	277329	25 %	50 %	25 %	0 %	116250005
6487	NC_008380	TCCGC	2	10	277369	277378	0 %	20 %	20 %	60 %	116250005
6488	NC_008380	CGGTG	2	10	277392	277401	0 %	20 %	60 %	20 %	116250005
6489	NC_008380	CGAT	2	8	277499	277506	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6490	NC_008380	CGA	2	6	277507	277512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6491	NC_008380	CGG	2	6	277540	277545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6492	NC_008380	TGAG	2	8	277598	277605	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6493	NC_008380	CGT	2	6	277633	277638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6494	NC_008380	TCG	2	6	277661	277666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6495	NC_008380	CGA	2	6	277795	277800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6496	NC_008380	GCC	2	6	277838	277843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116250006
6497	NC_008380	GAG	2	6	277848	277853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116250006
6498	NC_008380	CGGT	2	8	277896	277903	0 %	25 %	50 %	25 %	116250006
6499	NC_008380	CGA	3	9	278014	278022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250006
6500	NC_008380	AGC	2	6	278026	278031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116250006

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