MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 118531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008380	CCG	2	6	236642	236647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249966
5502	NC_008380	GCC	2	6	236706	236711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249967
5503	NC_008380	CGGT	2	8	236755	236762	0 %	25 %	50 %	25 %	116249967
5504	NC_008380	GCCGA	2	10	236841	236850	20 %	0 %	40 %	40 %	116249967
5505	NC_008380	GCG	2	6	236875	236880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249967
5506	NC_008380	GAA	2	6	236882	236887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249967
5507	NC_008380	TCG	2	6	236890	236895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249967
5508	NC_008380	GCG	2	6	236938	236943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249967
5509	NC_008380	GCC	2	6	236947	236952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249967
5510	NC_008380	AGA	2	6	236953	236958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249967
5511	NC_008380	GAA	2	6	237014	237019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249967
5512	NC_008380	CTT	2	6	237039	237044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249967
5513	NC_008380	CGC	2	6	237094	237099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249968
5514	NC_008380	CGG	2	6	237106	237111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249968
5515	NC_008380	TCG	2	6	237159	237164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249968
5516	NC_008380	CCGT	2	8	237180	237187	0 %	25 %	25 %	50 %	116249968
5517	NC_008380	GTC	2	6	237248	237253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249968
5518	NC_008380	GCCG	2	8	237254	237261	0 %	0 %	50 %	50 %	116249968
5519	NC_008380	CGG	2	6	237265	237270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249968
5520	NC_008380	GTC	2	6	237278	237283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249968
5521	NC_008380	ATT	2	6	237303	237308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116249968
5522	NC_008380	CGA	2	6	237409	237414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249968
5523	NC_008380	GCC	2	6	237418	237423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249968
5524	NC_008380	TCG	2	6	237504	237509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249968
5525	NC_008380	ATG	2	6	237525	237530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249968
5526	NC_008380	GCG	2	6	237560	237565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249968
5527	NC_008380	GCCG	2	8	237628	237635	0 %	0 %	50 %	50 %	116249968
5528	NC_008380	GC	3	6	237647	237652	0 %	0 %	50 %	50 %	116249968
5529	NC_008380	TCA	2	6	237696	237701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249968
5530	NC_008380	GCC	2	6	237731	237736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249968
5531	NC_008380	GGCA	2	8	237757	237764	25 %	0 %	50 %	25 %	116249968
5532	NC_008380	GAA	2	6	237788	237793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249968
5533	NC_008380	CGG	2	6	237814	237819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249968
5534	NC_008380	CGC	2	6	237829	237834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249968
5535	NC_008380	GAT	2	6	237867	237872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249968
5536	NC_008380	ATG	2	6	237929	237934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_008380	CAT	2	6	237963	237968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_008380	CGG	2	6	238012	238017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249969
5539	NC_008380	TCT	2	6	238031	238036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249969
5540	NC_008380	GAT	2	6	238056	238061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249969
5541	NC_008380	TCG	2	6	238147	238152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249969
5542	NC_008380	CGT	2	6	238202	238207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249969
5543	NC_008380	CGC	2	6	238244	238249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249969
5544	NC_008380	GCT	2	6	238313	238318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249969
5545	NC_008380	GC	3	6	238361	238366	0 %	0 %	50 %	50 %	116249969
5546	NC_008380	CTG	2	6	238386	238391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249969
5547	NC_008380	TCA	2	6	238396	238401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249969
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5550	NC_008380	CAT	2	6	238532	238537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249969
5551	NC_008380	GCCG	2	8	238580	238587	0 %	0 %	50 %	50 %	116249969
5552	NC_008380	TGC	2	6	238610	238615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249969
5553	NC_008380	CAT	2	6	238640	238645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249969
5554	NC_008380	CGA	2	6	238700	238705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249969
5555	NC_008380	CTGT	2	8	238710	238717	0 %	50 %	25 %	25 %	116249969
5556	NC_008380	GCG	2	6	238746	238751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249969
5557	NC_008380	ATC	2	6	238780	238785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249970
5558	NC_008380	CGA	2	6	238803	238808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249970
5559	NC_008380	CGC	2	6	238815	238820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249970
5560	NC_008380	CGG	2	6	239016	239021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249970
5561	NC_008380	CGC	3	9	239058	239066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249970
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5589	NC_008380	GAG	2	6	240028	240033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249970
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5601	NC_008380	TCCT	2	8	240623	240630	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5602	NC_008380	GAAC	2	8	240722	240729	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5603	NC_008380	AAGG	2	8	240760	240767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_008380	ATG	2	6	240820	240825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249972
5605	NC_008380	TCGA	2	8	240850	240857	25 %	25 %	25 %	25 %	116249972
5606	NC_008380	GCGCG	2	10	240884	240893	0 %	0 %	60 %	40 %	116249972
5607	NC_008380	GCAG	2	8	240923	240930	25 %	0 %	50 %	25 %	116249972
5608	NC_008380	CGC	2	6	240975	240980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249972
5609	NC_008380	CGA	3	9	241013	241021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249972
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5611	NC_008380	CG	4	8	241115	241122	0 %	0 %	50 %	50 %	116249972
5612	NC_008380	AGC	2	6	241150	241155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249972
5613	NC_008380	GC	3	6	241165	241170	0 %	0 %	50 %	50 %	116249972
5614	NC_008380	CGAAG	2	10	241176	241185	40 %	0 %	40 %	20 %	116249972
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5616	NC_008380	AGCAG	2	10	241280	241289	40 %	0 %	40 %	20 %	116249972
5617	NC_008380	GCA	2	6	241304	241309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249972
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5620	NC_008380	GAT	2	6	241376	241381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249972
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5622	NC_008380	TTTC	2	8	241434	241441	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5744	NC_008380	CAG	2	6	247592	247597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249980
5745	NC_008380	GCGCT	2	10	247619	247628	0 %	20 %	40 %	40 %	116249980
5746	NC_008380	GCAGGA	2	12	247642	247653	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	116249980
5747	NC_008380	GCC	2	6	247661	247666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249980
5748	NC_008380	CTG	2	6	247673	247678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249980
5749	NC_008380	GCG	2	6	247680	247685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249980
5750	NC_008380	ATC	2	6	247700	247705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249980
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5752	NC_008380	GCA	2	6	247745	247750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249980
5753	NC_008380	GCG	2	6	247791	247796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249981
5754	NC_008380	AGGCG	2	10	247884	247893	20 %	0 %	60 %	20 %	116249981
5755	NC_008380	CG	3	6	247892	247897	0 %	0 %	50 %	50 %	116249981
5756	NC_008380	CAA	2	6	247968	247973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116249981
5757	NC_008380	CGT	3	9	247977	247985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249981
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5759	NC_008380	TCCGA	2	10	248020	248029	20 %	20 %	20 %	40 %	116249981
5760	NC_008380	AAG	2	6	248080	248085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249981
5761	NC_008380	TCTTCG	2	12	248102	248113	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	116249981
5762	NC_008380	ATCGAG	2	12	248146	248157	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116249981
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5764	NC_008380	GGC	2	6	248283	248288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249981
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5766	NC_008380	CGA	2	6	248324	248329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249981
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5768	NC_008380	GTC	2	6	248407	248412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249981
5769	NC_008380	CCT	2	6	248415	248420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249981
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5773	NC_008380	GCGACG	2	12	248569	248580	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	116249981
5774	NC_008380	CGG	3	9	248583	248591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249981
5775	NC_008380	GGC	2	6	248595	248600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249981
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5777	NC_008380	GTC	2	6	248668	248673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249981
5778	NC_008380	GCCGA	2	10	248683	248692	20 %	0 %	40 %	40 %	116249981
5779	NC_008380	CAG	2	6	248740	248745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249981
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5782	NC_008380	GGCC	2	8	248964	248971	0 %	0 %	50 %	50 %	116249981
5783	NC_008380	GGC	2	6	249001	249006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249981
5784	NC_008380	GCT	2	6	249030	249035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249981
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5787	NC_008380	CCGG	2	8	249138	249145	0 %	0 %	50 %	50 %	116249981
5788	NC_008380	CTT	2	6	249180	249185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249981
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5797	NC_008380	ATC	2	6	249477	249482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249982
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5800	NC_008380	CGC	2	6	249619	249624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249982
5801	NC_008380	CGG	2	6	249640	249645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249982
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5807	NC_008380	ACCA	2	8	249837	249844	50 %	0 %	0 %	50 %	116249982
5808	NC_008380	ACT	2	6	249847	249852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249982
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5812	NC_008380	TGG	2	6	249913	249918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249982
5813	NC_008380	GCG	2	6	249950	249955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249982
5814	NC_008380	GAC	5	15	249980	249994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249982
5815	NC_008380	CGGAA	2	10	250028	250037	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5816	NC_008380	GAG	2	6	250091	250096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249983
5817	NC_008380	GCA	2	6	250177	250182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249983
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5821	NC_008380	TCA	2	6	250296	250301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249983
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5823	NC_008380	GTC	2	6	250382	250387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249983
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5825	NC_008380	AT	3	6	250450	250455	50 %	50 %	0 %	0 %	116249983
5826	NC_008380	GCA	2	6	250536	250541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249983
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5829	NC_008380	CGA	2	6	250735	250740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249983
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5832	NC_008380	GCT	2	6	250804	250809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249983
5833	NC_008380	GCAGC	2	10	250864	250873	20 %	0 %	40 %	40 %	116249983
5834	NC_008380	GC	3	6	250872	250877	0 %	0 %	50 %	50 %	116249983
5835	NC_008380	GCAT	2	8	250900	250907	25 %	25 %	25 %	25 %	116249983
5836	NC_008380	CGA	2	6	250942	250947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249983
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5839	NC_008380	GATC	2	8	251119	251126	25 %	25 %	25 %	25 %	116249983
5840	NC_008380	CGC	2	6	251167	251172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249983
5841	NC_008380	GAT	2	6	251185	251190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249983
5842	NC_008380	CGG	2	6	251217	251222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249983
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5846	NC_008380	CCT	2	6	251299	251304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249983
5847	NC_008380	G	7	7	251390	251396	0 %	0 %	100 %	0 %	116249984
5848	NC_008380	CTC	2	6	251403	251408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249984
5849	NC_008380	CGC	2	6	251409	251414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249984
5850	NC_008380	GCC	3	9	251423	251431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249984
5851	NC_008380	CG	3	6	251469	251474	0 %	0 %	50 %	50 %	116249984
5852	NC_008380	CAG	2	6	251486	251491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249984
5853	NC_008380	CGC	2	6	251514	251519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249984
5854	NC_008380	GCCCG	2	10	251529	251538	0 %	0 %	40 %	60 %	116249984
5855	NC_008380	TC	3	6	251599	251604	0 %	50 %	0 %	50 %	116249984
5856	NC_008380	GGA	2	6	251638	251643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249984
5857	NC_008380	CAT	2	6	251665	251670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249984
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5859	NC_008380	ACG	2	6	251733	251738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249984
5860	NC_008380	GC	3	6	251771	251776	0 %	0 %	50 %	50 %	116249984
5861	NC_008380	GAC	2	6	251777	251782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249984
5862	NC_008380	CAT	2	6	251791	251796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249984
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5864	NC_008380	TC	3	6	251881	251886	0 %	50 %	0 %	50 %	116249984
5865	NC_008380	GCC	2	6	251916	251921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249984
5866	NC_008380	CGA	2	6	251926	251931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249984
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5868	NC_008380	CG	3	6	251970	251975	0 %	0 %	50 %	50 %	116249984
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5984	NC_008380	GGCC	2	8	256253	256260	0 %	0 %	50 %	50 %	116249988
5985	NC_008380	GCC	3	9	256258	256266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249988
5986	NC_008380	GGC	2	6	256281	256286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249988
5987	NC_008380	CTG	2	6	256323	256328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249988
5988	NC_008380	GCA	2	6	256367	256372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249988
5989	NC_008380	CG	3	6	256403	256408	0 %	0 %	50 %	50 %	116249988
5990	NC_008380	TGT	2	6	256506	256511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249988
5991	NC_008380	GTC	2	6	256525	256530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249988
5992	NC_008380	AGC	2	6	256555	256560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249988
5993	NC_008380	TGG	2	6	256598	256603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249988
5994	NC_008380	AGGC	2	8	256610	256617	25 %	0 %	50 %	25 %	116249988
5995	NC_008380	CCG	2	6	256748	256753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5996	NC_008380	GA	3	6	256785	256790	50 %	0 %	50 %	0 %	116249989
5997	NC_008380	CGAT	2	8	256867	256874	25 %	25 %	25 %	25 %	116249989
5998	NC_008380	GC	3	6	256893	256898	0 %	0 %	50 %	50 %	116249989
5999	NC_008380	GCT	3	9	256928	256936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249989
6000	NC_008380	CGG	2	6	256961	256966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249989

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