MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 118531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008380	CGT	2	6	197410	197415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249928
4502	NC_008380	GAT	2	6	197482	197487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249928
4503	NC_008380	CTCGGC	2	12	197528	197539	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116249928
4504	NC_008380	CGG	2	6	197548	197553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249928
4505	NC_008380	TCG	2	6	197595	197600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249928
4506	NC_008380	CAC	2	6	197605	197610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249928
4507	NC_008380	GTCG	2	8	197623	197630	0 %	25 %	50 %	25 %	116249928
4508	NC_008380	GAT	2	6	197641	197646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249928
4509	NC_008380	GCT	2	6	197653	197658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249928
4510	NC_008380	GCC	2	6	197682	197687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249928
4511	NC_008380	CTG	2	6	197744	197749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249928
4512	NC_008380	CGT	2	6	197755	197760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249928
4513	NC_008380	GAA	2	6	197770	197775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249928
4514	NC_008380	GGA	2	6	197812	197817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249928
4515	NC_008380	CCAT	2	8	197904	197911	25 %	25 %	0 %	50 %	116249928
4516	NC_008380	TCG	2	6	197997	198002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249928
4517	NC_008380	TCG	2	6	198006	198011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249928
4518	NC_008380	TGA	2	6	198027	198032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249928
4519	NC_008380	GCC	2	6	198089	198094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249928
4520	NC_008380	CATC	2	8	198097	198104	25 %	25 %	0 %	50 %	116249928
4521	NC_008380	CGTC	2	8	198122	198129	0 %	25 %	25 %	50 %	116249928
4522	NC_008380	TCA	2	6	198138	198143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249928
4523	NC_008380	TGC	2	6	198261	198266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249928
4524	NC_008380	GCG	2	6	198276	198281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249928
4525	NC_008380	GCC	2	6	198360	198365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249928
4526	NC_008380	CCG	2	6	198387	198392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249928
4527	NC_008380	GAG	2	6	198395	198400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249928
4528	NC_008380	GGAAGA	2	12	198409	198420	50 %	0 %	50 %	0 %	116249928
4529	NC_008380	GTC	2	6	198494	198499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249928
4530	NC_008380	A	6	6	198509	198514	100 %	0 %	0 %	0 %	116249928
4531	NC_008380	CCT	2	6	198522	198527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249928
4532	NC_008380	GCC	2	6	198537	198542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249928
4533	NC_008380	CGC	2	6	198562	198567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249928
4534	NC_008380	TGG	2	6	198573	198578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249928
4535	NC_008380	TCG	2	6	198600	198605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249928
4536	NC_008380	CGG	2	6	198669	198674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_008380	CAGC	2	8	198714	198721	25 %	0 %	25 %	50 %	116249929
4538	NC_008380	CCG	2	6	198752	198757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249929
4539	NC_008380	TCG	2	6	198773	198778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249929
4540	NC_008380	CAGC	2	8	198789	198796	25 %	0 %	25 %	50 %	116249929
4541	NC_008380	GC	3	6	198876	198881	0 %	0 %	50 %	50 %	116249929
4542	NC_008380	GC	3	6	198986	198991	0 %	0 %	50 %	50 %	116249929
4543	NC_008380	CGC	2	6	199003	199008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249929
4544	NC_008380	ATC	2	6	199028	199033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249929
4545	NC_008380	GCA	2	6	199037	199042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249929
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4547	NC_008380	TGC	2	6	199083	199088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249929
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4549	NC_008380	GC	3	6	199196	199201	0 %	0 %	50 %	50 %	116249929
4550	NC_008380	ATC	2	6	199260	199265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249930
4551	NC_008380	CCA	2	6	199306	199311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249930
4552	NC_008380	CGT	2	6	199312	199317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249930
4553	NC_008380	CGC	2	6	199321	199326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249930
4554	NC_008380	CG	3	6	199384	199389	0 %	0 %	50 %	50 %	116249930
4555	NC_008380	GCCG	2	8	199396	199403	0 %	0 %	50 %	50 %	116249930
4556	NC_008380	GCGG	2	8	199418	199425	0 %	0 %	75 %	25 %	116249930
4557	NC_008380	TGA	2	6	199432	199437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249930
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4559	NC_008380	CGA	3	9	199495	199503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249930
4560	NC_008380	CCA	2	6	199568	199573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249930
4561	NC_008380	GGC	2	6	199601	199606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249930
4562	NC_008380	GGAG	2	8	199615	199622	25 %	0 %	75 %	0 %	116249930
4563	NC_008380	GAT	2	6	199630	199635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249930
4564	NC_008380	TGA	2	6	199663	199668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249930
4565	NC_008380	CGG	2	6	199671	199676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249930
4566	NC_008380	TCA	2	6	199723	199728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249930
4567	NC_008380	CGA	4	12	199756	199767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249930
4568	NC_008380	CGGCTC	2	12	199783	199794	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116249930
4569	NC_008380	CAT	2	6	199814	199819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249930
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4571	NC_008380	GCGG	2	8	199942	199949	0 %	0 %	75 %	25 %	116249931
4572	NC_008380	TCG	2	6	200000	200005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249931
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4579	NC_008380	CGA	2	6	200358	200363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249931
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4589	NC_008380	GTG	2	6	200678	200683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249931
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4592	NC_008380	CG	3	6	201022	201027	0 %	0 %	50 %	50 %	116249932
4593	NC_008380	CGGC	2	8	201065	201072	0 %	0 %	50 %	50 %	116249932
4594	NC_008380	TCA	2	6	201109	201114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249932
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4597	NC_008380	GCGCC	2	10	201239	201248	0 %	0 %	40 %	60 %	116249932
4598	NC_008380	CG	3	6	201269	201274	0 %	0 %	50 %	50 %	116249932
4599	NC_008380	ACC	2	6	201294	201299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249932
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4601	NC_008380	A	7	7	201350	201356	100 %	0 %	0 %	0 %	116249932
4602	NC_008380	TGCG	2	8	201399	201406	0 %	25 %	50 %	25 %	116249932
4603	NC_008380	GGA	2	6	201452	201457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249932
4604	NC_008380	GCGA	2	8	201459	201466	25 %	0 %	50 %	25 %	116249932
4605	NC_008380	GCG	2	6	201500	201505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249932
4606	NC_008380	CGG	2	6	201511	201516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249932
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4608	NC_008380	GCT	2	6	201544	201549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249932
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4612	NC_008380	AG	3	6	201649	201654	50 %	0 %	50 %	0 %	116249932
4613	NC_008380	G	6	6	201692	201697	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_008380	GGC	2	6	201718	201723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_008380	ATG	3	9	201766	201774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_008380	T	6	6	201796	201801	0 %	100 %	0 %	0 %	116249933
4617	NC_008380	CG	3	6	201809	201814	0 %	0 %	50 %	50 %	116249933
4618	NC_008380	GAG	2	6	201855	201860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249933
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4620	NC_008380	AGC	2	6	201919	201924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249933
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4622	NC_008380	ACCG	2	8	202068	202075	25 %	0 %	25 %	50 %	116249933
4623	NC_008380	GCT	2	6	202091	202096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249933
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4745	NC_008380	GAC	2	6	206810	206815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249937
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4748	NC_008380	GCGG	2	8	206855	206862	0 %	0 %	75 %	25 %	116249937
4749	NC_008380	TGA	2	6	206884	206889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249937
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4751	NC_008380	TCG	2	6	206973	206978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249937
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4755	NC_008380	GAT	2	6	207163	207168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249937
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4757	NC_008380	CTG	2	6	207224	207229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249937
4758	NC_008380	ATC	2	6	207234	207239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249937
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4763	NC_008380	ACG	2	6	207452	207457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249937
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4772	NC_008380	ACG	2	6	207796	207801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249938
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4862	NC_008380	AGGG	2	8	211302	211309	25 %	0 %	75 %	0 %	116249942
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4864	NC_008380	AAG	2	6	211346	211351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249942
4865	NC_008380	GCC	2	6	211355	211360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249942
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4868	NC_008380	AGCG	2	8	211520	211527	25 %	0 %	50 %	25 %	116249942
4869	NC_008380	CGC	2	6	211624	211629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249942
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4985	NC_008380	AGC	2	6	216408	216413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249948
4986	NC_008380	GGC	2	6	216414	216419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249948
4987	NC_008380	ATG	2	6	216423	216428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249948
4988	NC_008380	AGC	2	6	216444	216449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249948
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4990	NC_008380	AGC	2	6	216474	216479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249948
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