MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL9

Total Repeats: 8078

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008379	CGT	2	6	23	28	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249461
2	NC_008379	GAC	2	6	37	42	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249461
3	NC_008379	TCC	2	6	105	110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249461
4	NC_008379	A	8	8	118	125	100 %	0 %	0 %	0 %	116249461
5	NC_008379	TCGC	2	8	139	146	0 %	25 %	25 %	50 %	116249461
6	NC_008379	T	6	6	280	285	0 %	100 %	0 %	0 %	116249461
7	NC_008379	GTT	2	6	355	360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249461
8	NC_008379	CGT	2	6	363	368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249461
9	NC_008379	GAC	2	6	393	398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249461
10	NC_008379	CAC	2	6	399	404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249461
11	NC_008379	GCA	2	6	417	422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249461
12	NC_008379	TTGACC	2	12	455	466	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116249461
13	NC_008379	GAC	2	6	547	552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249461
14	NC_008379	CTT	2	6	687	692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249461
15	NC_008379	GGA	2	6	714	719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249461
16	NC_008379	ACG	2	6	734	739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249461
17	NC_008379	GTG	2	6	742	747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249461
18	NC_008379	GATGTC	2	12	843	854	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116249461
19	NC_008379	CG	3	6	1123	1128	0 %	0 %	50 %	50 %	116249461
20	NC_008379	CCG	2	6	1207	1212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_008379	TGA	2	6	1301	1306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249462
22	NC_008379	CCGA	2	8	1315	1322	25 %	0 %	25 %	50 %	116249462
23	NC_008379	GGC	2	6	1395	1400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249462
24	NC_008379	CAT	2	6	1463	1468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249462
25	NC_008379	TGG	2	6	1592	1597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249462
26	NC_008379	GAA	2	6	1637	1642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249462
27	NC_008379	ATC	2	6	1679	1684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249462
28	NC_008379	TCG	2	6	1685	1690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249462
29	NC_008379	GC	4	8	1711	1718	0 %	0 %	50 %	50 %	116249462
30	NC_008379	T	6	6	1729	1734	0 %	100 %	0 %	0 %	116249462
31	NC_008379	CG	3	6	1761	1766	0 %	0 %	50 %	50 %	116249462
32	NC_008379	TC	3	6	1797	1802	0 %	50 %	0 %	50 %	116249462
33	NC_008379	AGC	2	6	1884	1889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249462
34	NC_008379	GGA	2	6	1980	1985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249462
35	NC_008379	CGA	2	6	2004	2009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249462
36	NC_008379	CTG	2	6	2023	2028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249462
37	NC_008379	CGA	2	6	2094	2099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249462
38	NC_008379	CGC	2	6	2109	2114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249462
39	NC_008379	GACG	2	8	2128	2135	25 %	0 %	50 %	25 %	116249462
40	NC_008379	CAA	2	6	2239	2244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116249462
41	NC_008379	ACG	2	6	2277	2282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008379	CGT	2	6	2284	2289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008379	GAC	2	6	2426	2431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249463
44	NC_008379	GCG	2	6	2441	2446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249463
45	NC_008379	GCA	2	6	2512	2517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249463
46	NC_008379	GAC	2	6	2616	2621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249463
47	NC_008379	GC	3	6	2678	2683	0 %	0 %	50 %	50 %	116249463
48	NC_008379	GGC	2	6	2710	2715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249463
49	NC_008379	GGCC	2	8	2735	2742	0 %	0 %	50 %	50 %	116249463
50	NC_008379	GC	3	6	2781	2786	0 %	0 %	50 %	50 %	116249463
51	NC_008379	CAGGG	2	10	2792	2801	20 %	0 %	60 %	20 %	116249463
52	NC_008379	TCGAAA	2	12	2854	2865	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116249463
53	NC_008379	GCC	2	6	2871	2876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249463
54	NC_008379	TGC	2	6	2899	2904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249463
55	NC_008379	GCG	2	6	2958	2963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249463
56	NC_008379	GAA	2	6	2970	2975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249463
57	NC_008379	CTT	2	6	3021	3026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249463
58	NC_008379	CCG	2	6	3049	3054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249463
59	NC_008379	CAC	2	6	3064	3069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249463
60	NC_008379	CGA	2	6	3074	3079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249463
61	NC_008379	GC	3	6	3092	3097	0 %	0 %	50 %	50 %	116249463
62	NC_008379	A	8	8	3134	3141	100 %	0 %	0 %	0 %	116249463
63	NC_008379	TCC	2	6	3391	3396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249463
64	NC_008379	GGA	2	6	3429	3434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249463
65	NC_008379	GCC	2	6	3465	3470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249463
66	NC_008379	GTC	2	6	3471	3476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249463
67	NC_008379	CGC	2	6	3545	3550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249463
68	NC_008379	CGG	2	6	3599	3604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249463
69	NC_008379	GAGGG	2	10	3712	3721	20 %	0 %	80 %	0 %	116249463
70	NC_008379	TGCC	2	8	3748	3755	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_008379	TCC	2	6	3787	3792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_008379	CGGC	2	8	3800	3807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_008379	GTT	2	6	3861	3866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008379	TGG	2	6	3898	3903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008379	AAT	2	6	3997	4002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008379	TCG	2	6	4023	4028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008379	CGG	2	6	4061	4066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008379	TC	3	6	4141	4146	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_008379	GCG	2	6	4154	4159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_008379	GGCA	2	8	4198	4205	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_008379	TGA	2	6	4220	4225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008379	TGG	2	6	4230	4235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008379	TGG	2	6	4262	4267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249464
84	NC_008379	GA	3	6	4272	4277	50 %	0 %	50 %	0 %	116249464
85	NC_008379	TCA	2	6	4361	4366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249464
86	NC_008379	CG	3	6	4382	4387	0 %	0 %	50 %	50 %	116249464
87	NC_008379	AGC	2	6	4507	4512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249464
88	NC_008379	TTC	2	6	4516	4521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249464
89	NC_008379	CGTA	2	8	4566	4573	25 %	25 %	25 %	25 %	116249464
90	NC_008379	CGT	2	6	4594	4599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249464
91	NC_008379	G	6	6	4619	4624	0 %	0 %	100 %	0 %	116249464
92	NC_008379	CTG	2	6	4632	4637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249464
93	NC_008379	CTC	2	6	4698	4703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249464
94	NC_008379	TCG	2	6	4792	4797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249464
95	NC_008379	GCG	2	6	5017	5022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249464
96	NC_008379	GCC	2	6	5046	5051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249464
97	NC_008379	GCA	2	6	5054	5059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249464
98	NC_008379	GTG	2	6	5092	5097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249464
99	NC_008379	CCG	2	6	5119	5124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249464
100	NC_008379	TG	3	6	5128	5133	0 %	50 %	50 %	0 %	116249464
101	NC_008379	TTA	2	6	5143	5148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116249464
102	NC_008379	CG	3	6	5158	5163	0 %	0 %	50 %	50 %	116249464
103	NC_008379	GTC	2	6	5169	5174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249464
104	NC_008379	GCA	2	6	5210	5215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249464
105	NC_008379	CGA	2	6	5231	5236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249464
106	NC_008379	GTC	2	6	5311	5316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249464
107	NC_008379	CGT	2	6	5325	5330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249464
108	NC_008379	GCA	2	6	5348	5353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249464
109	NC_008379	GCC	2	6	5363	5368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249464
110	NC_008379	CGGC	2	8	5399	5406	0 %	0 %	50 %	50 %	116249464
111	NC_008379	CGG	2	6	5452	5457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249464
112	NC_008379	CGGA	2	8	5528	5535	25 %	0 %	50 %	25 %	116249464
113	NC_008379	CGG	2	6	5667	5672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249464
114	NC_008379	GCG	2	6	5675	5680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249464
115	NC_008379	TCG	2	6	5704	5709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249464
116	NC_008379	GCG	2	6	5758	5763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249464
117	NC_008379	TCC	2	6	5767	5772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249464
118	NC_008379	TGT	2	6	5783	5788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249464
119	NC_008379	CTGC	2	8	5816	5823	0 %	25 %	25 %	50 %	116249464
120	NC_008379	AGA	2	6	5836	5841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249464
121	NC_008379	GGGGA	2	10	5893	5902	20 %	0 %	80 %	0 %	116249464
122	NC_008379	TTC	2	6	5908	5913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249464
123	NC_008379	GAATC	2	10	5920	5929	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_008379	GC	3	6	5979	5984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_008379	CGC	2	6	6018	6023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_008379	CGCGG	2	10	6044	6053	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
127	NC_008379	CGG	2	6	6144	6149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008379	CAG	2	6	6157	6162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_008379	CCA	2	6	6187	6192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_008379	CAT	2	6	6317	6322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_008379	GAT	2	6	6332	6337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008379	AGC	2	6	6561	6566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249465
133	NC_008379	CGG	2	6	6580	6585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249465
134	NC_008379	CCT	2	6	6721	6726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249465
135	NC_008379	CGT	2	6	6728	6733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249465
136	NC_008379	GCC	2	6	6802	6807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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268	NC_008379	GCT	2	6	12911	12916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249471
269	NC_008379	GAC	2	6	12959	12964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249471
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289	NC_008379	ATG	2	6	13786	13791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249471
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293	NC_008379	CGA	2	6	13914	13919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249472
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326	NC_008379	CGA	3	9	15461	15469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249473
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330	NC_008379	TAG	2	6	15706	15711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249473
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379	NC_008379	ACG	2	6	17967	17972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249476
380	NC_008379	AGC	2	6	17973	17978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249476
381	NC_008379	CGA	2	6	17983	17988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249476
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391	NC_008379	GAC	2	6	18316	18321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249477
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393	NC_008379	CCCA	2	8	18434	18441	25 %	0 %	0 %	75 %	116249477
394	NC_008379	CAT	2	6	18517	18522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249477
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