MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL9

Total Repeats: 8078

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008379	CGC	2	6	181980	181985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249615
4002	NC_008379	TCA	2	6	181997	182002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249615
4003	NC_008379	TCG	2	6	182027	182032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249615
4004	NC_008379	CAG	2	6	182134	182139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249615
4005	NC_008379	GGGA	2	8	182238	182245	25 %	0 %	75 %	0 %	116249616
4006	NC_008379	CGCC	3	12	182252	182263	0 %	0 %	25 %	75 %	116249616
4007	NC_008379	GCC	2	6	182267	182272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249616
4008	NC_008379	CG	3	6	182316	182321	0 %	0 %	50 %	50 %	116249616
4009	NC_008379	GC	3	6	182334	182339	0 %	0 %	50 %	50 %	116249616
4010	NC_008379	ATC	2	6	182379	182384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249616
4011	NC_008379	TCG	2	6	182397	182402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249616
4012	NC_008379	TGA	2	6	182405	182410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249616
4013	NC_008379	GGT	2	6	182411	182416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249616
4014	NC_008379	CAC	2	6	182438	182443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249616
4015	NC_008379	GTT	2	6	182457	182462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249616
4016	NC_008379	ATC	2	6	182481	182486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249616
4017	NC_008379	GTG	2	6	182514	182519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249616
4018	NC_008379	CAG	3	9	182577	182585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249616
4019	NC_008379	GA	3	6	182665	182670	50 %	0 %	50 %	0 %	116249616
4020	NC_008379	TGC	2	6	182683	182688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249616
4021	NC_008379	AGC	2	6	182746	182751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249616
4022	NC_008379	GCG	2	6	182778	182783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249616
4023	NC_008379	AGG	2	6	182794	182799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249616
4024	NC_008379	GCT	2	6	182888	182893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249616
4025	NC_008379	CGCC	2	8	182906	182913	0 %	0 %	25 %	75 %	116249616
4026	NC_008379	CCG	2	6	182935	182940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249616
4027	NC_008379	GGCCG	2	10	182946	182955	0 %	0 %	60 %	40 %	116249616
4028	NC_008379	GCC	2	6	182961	182966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249616
4029	NC_008379	CCG	2	6	183017	183022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249616
4030	NC_008379	CGC	2	6	183023	183028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249616
4031	NC_008379	TGG	2	6	183040	183045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249616
4032	NC_008379	GAG	2	6	183075	183080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249616
4033	NC_008379	CCG	2	6	183127	183132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249616
4034	NC_008379	CGT	2	6	183137	183142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249616
4035	NC_008379	TCGG	2	8	183162	183169	0 %	25 %	50 %	25 %	116249616
4036	NC_008379	GTG	2	6	183174	183179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249616
4037	NC_008379	TCAG	2	8	183352	183359	25 %	25 %	25 %	25 %	116249616
4038	NC_008379	CAG	2	6	183378	183383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249616
4039	NC_008379	AGCC	2	8	183402	183409	25 %	0 %	25 %	50 %	116249616
4040	NC_008379	GCC	2	6	183411	183416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249616
4041	NC_008379	CTT	2	6	183419	183424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249616
4042	NC_008379	GCT	2	6	183482	183487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249616
4043	NC_008379	GCT	2	6	183557	183562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249616
4044	NC_008379	ATT	2	6	183648	183653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_008379	CGGCC	2	10	183670	183679	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4046	NC_008379	CGC	2	6	183741	183746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4047	NC_008379	ACG	2	6	183809	183814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249617
4048	NC_008379	CAT	2	6	183819	183824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249617
4049	NC_008379	GGC	2	6	183826	183831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249617
4050	NC_008379	CCA	2	6	183924	183929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249617
4051	NC_008379	GCG	2	6	183944	183949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249617
4052	NC_008379	CTA	2	6	183966	183971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249617
4053	NC_008379	GC	3	6	183991	183996	0 %	0 %	50 %	50 %	116249617
4054	NC_008379	TGG	2	6	184073	184078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249617
4055	NC_008379	CCA	2	6	184082	184087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249617
4056	NC_008379	CCG	2	6	184101	184106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249617
4057	NC_008379	CAA	2	6	184137	184142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116249617
4058	NC_008379	TTCG	2	8	184216	184223	0 %	50 %	25 %	25 %	116249617
4059	NC_008379	TCG	2	6	184235	184240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249617
4060	NC_008379	TG	3	6	184251	184256	0 %	50 %	50 %	0 %	116249617
4061	NC_008379	GATC	2	8	184443	184450	25 %	25 %	25 %	25 %	116249617
4062	NC_008379	TCCG	2	8	184481	184488	0 %	25 %	25 %	50 %	116249617
4063	NC_008379	CCG	3	9	184486	184494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249617
4064	NC_008379	GCAT	2	8	184559	184566	25 %	25 %	25 %	25 %	116249617
4065	NC_008379	GAT	2	6	184575	184580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249617
4066	NC_008379	TC	3	6	184677	184682	0 %	50 %	0 %	50 %	116249617
4067	NC_008379	GGC	2	6	184697	184702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249617
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4069	NC_008379	TGC	2	6	184904	184909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249617
4070	NC_008379	TCG	2	6	184942	184947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249617
4071	NC_008379	CCG	2	6	184985	184990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249617
4072	NC_008379	GA	3	6	185006	185011	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_008379	CAAGA	2	10	185026	185035	60 %	0 %	20 %	20 %	116249618
4074	NC_008379	CAG	2	6	185084	185089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249618
4075	NC_008379	CAGGG	2	10	185111	185120	20 %	0 %	60 %	20 %	116249618
4076	NC_008379	GCCGT	2	10	185150	185159	0 %	20 %	40 %	40 %	116249618
4077	NC_008379	TTC	2	6	185192	185197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249618
4078	NC_008379	GATC	2	8	185233	185240	25 %	25 %	25 %	25 %	116249618
4079	NC_008379	CAG	2	6	185256	185261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249618
4080	NC_008379	CCTG	2	8	185431	185438	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4081	NC_008379	CTTC	2	8	185490	185497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4082	NC_008379	CCG	2	6	185607	185612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249620
4083	NC_008379	TCG	2	6	185634	185639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249620
4084	NC_008379	GACG	2	8	185701	185708	25 %	0 %	50 %	25 %	116249620
4085	NC_008379	G	6	6	185724	185729	0 %	0 %	100 %	0 %	116249620
4086	NC_008379	GCCG	2	8	185748	185755	0 %	0 %	50 %	50 %	116249620
4087	NC_008379	ACG	2	6	185786	185791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249620
4088	NC_008379	CAT	2	6	185802	185807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249620
4089	NC_008379	CATATC	2	12	185830	185841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249620
4090	NC_008379	GCG	2	6	185878	185883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249620
4091	NC_008379	CTC	2	6	185884	185889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249620
4092	NC_008379	ACG	3	9	185896	185904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249620
4093	NC_008379	TCT	2	6	185906	185911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249620
4094	NC_008379	CGA	2	6	186026	186031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249620
4095	NC_008379	CGGC	2	8	186047	186054	0 %	0 %	50 %	50 %	116249620
4096	NC_008379	CGA	2	6	186153	186158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249620
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4100	NC_008379	GCG	2	6	186335	186340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249620
4101	NC_008379	ACA	2	6	186349	186354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116249620
4102	NC_008379	CGA	2	6	186432	186437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249620
4103	NC_008379	CG	3	6	186482	186487	0 %	0 %	50 %	50 %	116249620
4104	NC_008379	GCG	2	6	186587	186592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249620
4105	NC_008379	GCGCC	2	10	186594	186603	0 %	0 %	40 %	60 %	116249620
4106	NC_008379	CGA	2	6	186621	186626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249620
4107	NC_008379	GGC	2	6	186652	186657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249620
4108	NC_008379	TCG	3	9	186662	186670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249620
4109	NC_008379	AAG	2	6	186676	186681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249620
4110	NC_008379	CGA	2	6	186696	186701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249620
4111	NC_008379	GCC	2	6	186733	186738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249620
4112	NC_008379	A	6	6	186759	186764	100 %	0 %	0 %	0 %	116249620
4113	NC_008379	GTC	2	6	186799	186804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249620
4114	NC_008379	GGT	2	6	186921	186926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249620
4115	NC_008379	TCGG	2	8	187009	187016	0 %	25 %	50 %	25 %	116249620
4116	NC_008379	CAT	2	6	187032	187037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249620
4117	NC_008379	GTC	2	6	187111	187116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249620
4118	NC_008379	CGA	2	6	187194	187199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249620
4119	NC_008379	AGGC	2	8	187229	187236	25 %	0 %	50 %	25 %	116249620
4120	NC_008379	CTGGTG	2	12	187312	187323	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	116249620
4121	NC_008379	CGC	2	6	187340	187345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249620
4122	NC_008379	A	6	6	187368	187373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_008379	GCG	2	6	187386	187391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_008379	ATA	2	6	187405	187410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_008379	GCA	2	6	187430	187435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4224	NC_008379	ATTG	2	8	191608	191615	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4225	NC_008379	GAC	2	6	191624	191629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4226	NC_008379	TTGCA	2	10	191728	191737	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4227	NC_008379	ACTA	2	8	191755	191762	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4228	NC_008379	GAA	2	6	191780	191785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4229	NC_008379	GTA	2	6	191820	191825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4230	NC_008379	AGC	2	6	191908	191913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4231	NC_008379	GCA	2	6	191915	191920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4232	NC_008379	GGT	2	6	191984	191989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249624
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4245	NC_008379	GGT	2	6	192587	192592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249624
4246	NC_008379	TGC	2	6	192651	192656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249624
4247	NC_008379	GGC	2	6	192760	192765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249624
4248	NC_008379	CTGA	2	8	192773	192780	25 %	25 %	25 %	25 %	116249624
4249	NC_008379	GCC	2	6	192787	192792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249624
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4253	NC_008379	AT	3	6	193158	193163	50 %	50 %	0 %	0 %	116249625
4254	NC_008379	ATC	2	6	193165	193170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249625
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4274	NC_008379	CCAT	2	8	194152	194159	25 %	25 %	0 %	50 %	116249626
4275	NC_008379	CAC	2	6	194177	194182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249626
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4281	NC_008379	CGC	2	6	194386	194391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249626
4282	NC_008379	TCG	2	6	194392	194397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249626
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4286	NC_008379	GCATC	2	10	194614	194623	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4287	NC_008379	CTTCGG	2	12	194691	194702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4293	NC_008379	CGA	2	6	194841	194846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249627
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4358	NC_008379	AATG	2	8	197133	197140	50 %	25 %	25 %	0 %	116249627
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4455	NC_008379	CTGG	2	8	201734	201741	0 %	25 %	50 %	25 %	116249631
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4488	NC_008379	CCTTCC	2	12	202611	202622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249632
4489	NC_008379	ATC	2	6	202640	202645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249632
4490	NC_008379	GCC	2	6	202766	202771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249632
4491	NC_008379	GCC	2	6	202788	202793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249632
4492	NC_008379	CAT	2	6	202798	202803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249632
4493	NC_008379	TGC	2	6	202872	202877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249632
4494	NC_008379	GCG	2	6	202881	202886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249632
4495	NC_008379	GCC	2	6	202918	202923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249632
4496	NC_008379	TCA	2	6	202965	202970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249632
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4499	NC_008379	ATGA	2	8	203073	203080	50 %	25 %	25 %	0 %	116249632
4500	NC_008379	GTCC	2	8	203094	203101	0 %	25 %	25 %	50 %	116249633

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