MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL12

Total Repeats: 19681

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008378	GAC	2	6	45323	45328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248721
1002	NC_008378	GC	3	6	45348	45353	0 %	0 %	50 %	50 %	116248721
1003	NC_008378	CAT	2	6	45401	45406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248721
1004	NC_008378	TGCG	2	8	45442	45449	0 %	25 %	50 %	25 %	116248721
1005	NC_008378	TGA	2	6	45460	45465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248721
1006	NC_008378	GGCC	2	8	45517	45524	0 %	0 %	50 %	50 %	116248721
1007	NC_008378	CTTT	2	8	45612	45619	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1008	NC_008378	AGAA	2	8	45620	45627	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_008378	CAG	2	6	45693	45698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_008378	CCG	2	6	45741	45746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248722
1011	NC_008378	TC	3	6	45756	45761	0 %	50 %	0 %	50 %	116248722
1012	NC_008378	GCC	2	6	45822	45827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248722
1013	NC_008378	GAT	2	6	45844	45849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248722
1014	NC_008378	TC	3	6	45855	45860	0 %	50 %	0 %	50 %	116248722
1015	NC_008378	CCG	2	6	45897	45902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248722
1016	NC_008378	CCAGA	2	10	45942	45951	40 %	0 %	20 %	40 %	116248722
1017	NC_008378	GAGCCG	2	12	45958	45969	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	116248722
1018	NC_008378	GATC	2	8	45999	46006	25 %	25 %	25 %	25 %	116248722
1019	NC_008378	GGCT	2	8	46066	46073	0 %	25 %	50 %	25 %	116248722
1020	NC_008378	TTCA	2	8	46104	46111	25 %	50 %	0 %	25 %	116248722
1021	NC_008378	CG	3	6	46138	46143	0 %	0 %	50 %	50 %	116248722
1022	NC_008378	TGGC	2	8	46156	46163	0 %	25 %	50 %	25 %	116248722
1023	NC_008378	GC	3	6	46162	46167	0 %	0 %	50 %	50 %	116248722
1024	NC_008378	CGC	2	6	46184	46189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248722
1025	NC_008378	TGA	2	6	46238	46243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248722
1026	NC_008378	CGCCC	2	10	46248	46257	0 %	0 %	20 %	80 %	116248722
1027	NC_008378	CAT	2	6	46288	46293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248722
1028	NC_008378	CGA	2	6	46347	46352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248722
1029	NC_008378	GGC	2	6	46443	46448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248722
1030	NC_008378	TGA	2	6	46451	46456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248722
1031	NC_008378	GCAG	2	8	46466	46473	25 %	0 %	50 %	25 %	116248722
1032	NC_008378	GGC	2	6	46488	46493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248722
1033	NC_008378	ATC	2	6	46510	46515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248722
1034	NC_008378	GCC	2	6	46554	46559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248722
1035	NC_008378	CGC	2	6	46665	46670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248722
1036	NC_008378	ACGGC	2	10	46748	46757	20 %	0 %	40 %	40 %	116248722
1037	NC_008378	CGG	2	6	46811	46816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248722
1038	NC_008378	GGCC	2	8	46824	46831	0 %	0 %	50 %	50 %	116248722
1039	NC_008378	GGA	2	6	46893	46898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248722
1040	NC_008378	CCG	2	6	46961	46966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248722
1041	NC_008378	GCCG	2	8	46980	46987	0 %	0 %	50 %	50 %	116248722
1042	NC_008378	CGA	2	6	47006	47011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248722
1043	NC_008378	GCT	3	9	47076	47084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248722
1044	NC_008378	AAT	2	6	47125	47130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_008378	ATT	2	6	47140	47145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_008378	GA	3	6	47206	47211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_008378	CAT	2	6	47228	47233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248723
1048	NC_008378	ATA	2	6	47242	47247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116248723
1049	NC_008378	TCCGGC	2	12	47334	47345	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116248723
1050	NC_008378	GAC	2	6	47348	47353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248723
1051	NC_008378	TGA	2	6	47368	47373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248723
1052	NC_008378	GCG	2	6	47389	47394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248723
1053	NC_008378	GCCG	2	8	47453	47460	0 %	0 %	50 %	50 %	116248723
1054	NC_008378	CGG	2	6	47672	47677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248723
1055	NC_008378	AGC	2	6	47683	47688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248723
1056	NC_008378	GCGCTG	2	12	47706	47717	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116248723
1057	NC_008378	CGA	2	6	47738	47743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248723
1058	NC_008378	GCG	2	6	47795	47800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248723
1059	NC_008378	TTC	2	6	47883	47888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248723
1060	NC_008378	TCG	2	6	47902	47907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248723
1061	NC_008378	GCG	2	6	47982	47987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248723
1062	NC_008378	T	6	6	48073	48078	0 %	100 %	0 %	0 %	116248724
1063	NC_008378	GCC	2	6	48083	48088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248724
1064	NC_008378	CGG	2	6	48111	48116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248724
1065	NC_008378	CCG	3	9	48129	48137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248724
1066	NC_008378	AGC	2	6	48150	48155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248724
1067	NC_008378	ATCGCC	2	12	48179	48190	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116248724
1068	NC_008378	GCC	2	6	48196	48201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248724
1069	NC_008378	GC	4	8	48254	48261	0 %	0 %	50 %	50 %	116248724
1070	NC_008378	GGCC	2	8	48337	48344	0 %	0 %	50 %	50 %	116248724
1071	NC_008378	ACG	2	6	48348	48353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248724
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1073	NC_008378	GC	3	6	48513	48518	0 %	0 %	50 %	50 %	116248724
1074	NC_008378	GCG	2	6	48522	48527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248724
1075	NC_008378	GAG	2	6	48533	48538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248724
1076	NC_008378	CG	3	6	48564	48569	0 %	0 %	50 %	50 %	116248724
1077	NC_008378	TCG	2	6	48579	48584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248724
1078	NC_008378	TGC	2	6	48612	48617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248724
1079	NC_008378	CGT	2	6	48712	48717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248724
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1082	NC_008378	GGC	2	6	48859	48864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248724
1083	NC_008378	CGA	2	6	48870	48875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248724
1084	NC_008378	CTGCG	2	10	48889	48898	0 %	20 %	40 %	40 %	116248724
1085	NC_008378	CTC	2	6	48995	49000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1086	NC_008378	GCC	2	6	49203	49208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248725
1087	NC_008378	CTT	2	6	49216	49221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248725
1088	NC_008378	TTC	2	6	49256	49261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248725
1089	NC_008378	TGC	2	6	49305	49310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248725
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1091	NC_008378	GGCG	2	8	49342	49349	0 %	0 %	75 %	25 %	116248725
1092	NC_008378	GCG	2	6	49382	49387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248725
1093	NC_008378	GTG	2	6	49391	49396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248725
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1095	NC_008378	CAA	2	6	49525	49530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116248725
1096	NC_008378	CGT	2	6	49558	49563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248725
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1098	NC_008378	CGA	2	6	49644	49649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248725
1099	NC_008378	CGA	2	6	49689	49694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248725
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1101	NC_008378	GCG	2	6	49708	49713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248725
1102	NC_008378	GAT	2	6	49850	49855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248726
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1108	NC_008378	CG	3	6	50095	50100	0 %	0 %	50 %	50 %	116248726
1109	NC_008378	GGC	2	6	50111	50116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248726
1110	NC_008378	CCA	2	6	50122	50127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248726
1111	NC_008378	GAT	2	6	50183	50188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248726
1112	NC_008378	ATT	2	6	50203	50208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116248726
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1115	NC_008378	TCA	2	6	50344	50349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248726
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1117	NC_008378	GGAT	2	8	50398	50405	25 %	25 %	50 %	0 %	116248726
1118	NC_008378	ATC	2	6	50432	50437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248727
1119	NC_008378	GCCG	3	12	50441	50452	0 %	0 %	50 %	50 %	116248727
1120	NC_008378	GGA	2	6	50461	50466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248727
1121	NC_008378	ACG	2	6	50516	50521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248727
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1124	NC_008378	GCC	2	6	50747	50752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248727
1125	NC_008378	CGT	2	6	50767	50772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248727
1126	NC_008378	CGG	2	6	50781	50786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248727
1127	NC_008378	CCG	2	6	50787	50792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248727
1128	NC_008378	GCCG	2	8	50859	50866	0 %	0 %	50 %	50 %	116248727
1129	NC_008378	ATT	2	6	50874	50879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116248727
1130	NC_008378	CG	3	6	50977	50982	0 %	0 %	50 %	50 %	116248727
1131	NC_008378	CGG	2	6	51027	51032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248727
1132	NC_008378	GCA	2	6	51038	51043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248727
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1134	NC_008378	GCG	2	6	51129	51134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248727
1135	NC_008378	TGA	2	6	51165	51170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248727
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1138	NC_008378	GCCG	2	8	51255	51262	0 %	0 %	50 %	50 %	116248728
1139	NC_008378	CAT	2	6	51339	51344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248728
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1141	NC_008378	GCGCG	2	10	51368	51377	0 %	0 %	60 %	40 %	116248728
1142	NC_008378	GCCG	2	8	51401	51408	0 %	0 %	50 %	50 %	116248728
1143	NC_008378	CG	3	6	51415	51420	0 %	0 %	50 %	50 %	116248728
1144	NC_008378	CGT	2	6	51422	51427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248728
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1147	NC_008378	TCG	2	6	51568	51573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248728
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1150	NC_008378	ATC	2	6	51696	51701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248728
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1153	NC_008378	CGGC	2	8	51757	51764	0 %	0 %	50 %	50 %	116248728
1154	NC_008378	CGA	2	6	51793	51798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248728
1155	NC_008378	GAG	2	6	51876	51881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248728
1156	NC_008378	CTCG	2	8	51899	51906	0 %	25 %	25 %	50 %	116248728
1157	NC_008378	GCG	2	6	51907	51912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248728
1158	NC_008378	CGA	2	6	51962	51967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248728
1159	NC_008378	CTG	2	6	51975	51980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248728
1160	NC_008378	ATGCCT	2	12	52012	52023	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116248728
1161	NC_008378	TCG	2	6	52036	52041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248728
1162	NC_008378	TTGC	2	8	52071	52078	0 %	50 %	25 %	25 %	116248728
1163	NC_008378	TCG	2	6	52105	52110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248728
1164	NC_008378	AGC	2	6	52141	52146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248728
1165	NC_008378	CGG	2	6	52149	52154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248728
1166	NC_008378	GGC	2	6	52169	52174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248728
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1176	NC_008378	TGC	2	6	52693	52698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248729
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1180	NC_008378	CGG	2	6	52920	52925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248729
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1182	NC_008378	CCGG	2	8	53046	53053	0 %	0 %	50 %	50 %	116248729
1183	NC_008378	CGGCG	2	10	53190	53199	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1184	NC_008378	GAA	2	6	53213	53218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1185	NC_008378	CG	3	6	53262	53267	0 %	0 %	50 %	50 %	116248730
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1191	NC_008378	GCG	2	6	53626	53631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248730
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1200	NC_008378	CTT	2	6	53958	53963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248730
1201	NC_008378	GCT	2	6	53975	53980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248730
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1219	NC_008378	GAG	2	6	55019	55024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248731
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1221	NC_008378	CGG	4	12	55054	55065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248731
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1223	NC_008378	TGC	2	6	55116	55121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248731
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1228	NC_008378	C	6	6	55308	55313	0 %	0 %	0 %	100 %	116248731
1229	NC_008378	CGT	2	6	55393	55398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248731
1230	NC_008378	CTG	2	6	55453	55458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1231	NC_008378	AGC	2	6	55464	55469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248732
1232	NC_008378	GAC	2	6	55518	55523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248732
1233	NC_008378	GTGTCT	2	12	55532	55543	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	116248732
1234	NC_008378	CGGTT	2	10	55739	55748	0 %	40 %	40 %	20 %	116248732
1235	NC_008378	GAG	2	6	55780	55785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248732
1236	NC_008378	GATCT	2	10	55798	55807	20 %	40 %	20 %	20 %	116248732
1237	NC_008378	GGC	2	6	55812	55817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248732
1238	NC_008378	CGA	2	6	55856	55861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248732
1239	NC_008378	GC	4	8	55888	55895	0 %	0 %	50 %	50 %	116248732
1240	NC_008378	AGA	2	6	55921	55926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248732
1241	NC_008378	GGA	2	6	55977	55982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248732
1242	NC_008378	GGC	2	6	56004	56009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248732
1243	NC_008378	ACG	2	6	56023	56028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248732
1244	NC_008378	CAT	2	6	56064	56069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248732
1245	NC_008378	TTCAT	2	10	56116	56125	20 %	60 %	0 %	20 %	116248732
1246	NC_008378	CTG	2	6	56160	56165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248732
1247	NC_008378	GCCG	2	8	56205	56212	0 %	0 %	50 %	50 %	116248732
1248	NC_008378	CTTG	2	8	56225	56232	0 %	50 %	25 %	25 %	116248732
1249	NC_008378	CG	3	6	56292	56297	0 %	0 %	50 %	50 %	116248732
1250	NC_008378	GGC	3	9	56310	56318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248732
1251	NC_008378	CGAT	2	8	56383	56390	25 %	25 %	25 %	25 %	116248732
1252	NC_008378	CTC	2	6	56409	56414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248732
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1254	NC_008378	CCT	2	6	56489	56494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248732
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