MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL12

Total Repeats: 19681

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_008378	TCG	2	6	597489	597494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13502	NC_008378	CGG	2	6	597508	597513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249214
13503	NC_008378	AGGGG	2	10	597524	597533	20 %	0 %	80 %	0 %	116249214
13504	NC_008378	CGT	2	6	597544	597549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249214
13505	NC_008378	TGA	2	6	597556	597561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249214
13506	NC_008378	CAG	2	6	597572	597577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249214
13507	NC_008378	CGC	2	6	597590	597595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249214
13508	NC_008378	AGC	2	6	597645	597650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249214
13509	NC_008378	AGA	2	6	597658	597663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249214
13510	NC_008378	CG	3	6	597700	597705	0 %	0 %	50 %	50 %	116249214
13511	NC_008378	GAACG	2	10	597746	597755	40 %	0 %	40 %	20 %	116249214
13512	NC_008378	GTT	2	6	597758	597763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249214
13513	NC_008378	GCT	2	6	597908	597913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13514	NC_008378	GCA	2	6	597917	597922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13515	NC_008378	TCG	2	6	597932	597937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13516	NC_008378	ACGG	2	8	597989	597996	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13517	NC_008378	GTC	2	6	598002	598007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13518	NC_008378	GAG	2	6	598093	598098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249215
13519	NC_008378	GCT	2	6	598152	598157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249215
13520	NC_008378	TCC	2	6	598287	598292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249215
13521	NC_008378	CCA	2	6	598337	598342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249215
13522	NC_008378	TGG	2	6	598360	598365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249215
13523	NC_008378	GA	3	6	598419	598424	50 %	0 %	50 %	0 %	116249215
13524	NC_008378	CGG	2	6	598546	598551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13525	NC_008378	TCGG	2	8	598577	598584	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13526	NC_008378	CG	3	6	598585	598590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13527	NC_008378	TC	3	6	598599	598604	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13528	NC_008378	CCTT	2	8	598680	598687	0 %	50 %	0 %	50 %	116249216
13529	NC_008378	TCG	2	6	598708	598713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249216
13530	NC_008378	CGG	2	6	598761	598766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249216
13531	NC_008378	CG	3	6	598780	598785	0 %	0 %	50 %	50 %	116249216
13532	NC_008378	TCT	2	6	598849	598854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249216
13533	NC_008378	CGA	2	6	598912	598917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249216
13534	NC_008378	AT	3	6	598974	598979	50 %	50 %	0 %	0 %	116249216
13535	NC_008378	CG	3	6	599037	599042	0 %	0 %	50 %	50 %	116249216
13536	NC_008378	TAA	2	6	599164	599169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13537	NC_008378	CCG	2	6	599234	599239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249217
13538	NC_008378	AGA	2	6	599243	599248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249217
13539	NC_008378	TCAT	2	8	599288	599295	25 %	50 %	0 %	25 %	116249217
13540	NC_008378	CG	3	6	599321	599326	0 %	0 %	50 %	50 %	116249217
13541	NC_008378	GC	3	6	599408	599413	0 %	0 %	50 %	50 %	116249217
13542	NC_008378	GA	3	6	599421	599426	50 %	0 %	50 %	0 %	116249217
13543	NC_008378	GAC	2	6	599468	599473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249217
13544	NC_008378	CCGA	2	8	599567	599574	25 %	0 %	25 %	50 %	116249218
13545	NC_008378	GC	3	6	599577	599582	0 %	0 %	50 %	50 %	116249218
13546	NC_008378	GCCG	2	8	599652	599659	0 %	0 %	50 %	50 %	116249218
13547	NC_008378	TGCC	2	8	599669	599676	0 %	25 %	25 %	50 %	116249218
13548	NC_008378	GC	3	6	599693	599698	0 %	0 %	50 %	50 %	116249218
13549	NC_008378	GCA	2	6	599727	599732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249218
13550	NC_008378	GC	3	6	599758	599763	0 %	0 %	50 %	50 %	116249218
13551	NC_008378	CCAG	2	8	599814	599821	25 %	0 %	25 %	50 %	116249218
13552	NC_008378	GCT	2	6	599854	599859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249218
13553	NC_008378	CGG	3	9	599935	599943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249218
13554	NC_008378	GCC	2	6	599963	599968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249218
13555	NC_008378	TCG	2	6	599979	599984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249218
13556	NC_008378	GC	4	8	600050	600057	0 %	0 %	50 %	50 %	116249218
13557	NC_008378	ATG	2	6	600101	600106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249218
13558	NC_008378	GC	3	6	600170	600175	0 %	0 %	50 %	50 %	116249218
13559	NC_008378	CGA	2	6	600213	600218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249218
13560	NC_008378	TTA	2	6	600238	600243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116249218
13561	NC_008378	GGCC	2	8	600364	600371	0 %	0 %	50 %	50 %	116249218
13562	NC_008378	TGA	2	6	600375	600380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249218
13563	NC_008378	GCT	2	6	600385	600390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249218
13564	NC_008378	GGA	2	6	600454	600459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249218
13565	NC_008378	GAG	2	6	600494	600499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249218
13566	NC_008378	CTTTG	2	10	600500	600509	0 %	60 %	20 %	20 %	116249218
13567	NC_008378	GGGCT	2	10	600533	600542	0 %	20 %	60 %	20 %	116249218
13568	NC_008378	TCG	2	6	600543	600548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249218
13569	NC_008378	CAT	2	6	600589	600594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249218
13570	NC_008378	CGC	2	6	600605	600610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249218
13571	NC_008378	CGA	2	6	600691	600696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249218
13572	NC_008378	GC	4	8	600747	600754	0 %	0 %	50 %	50 %	116249218
13573	NC_008378	GCT	2	6	600757	600762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249218
13574	NC_008378	GCATG	2	10	600880	600889	20 %	20 %	40 %	20 %	116249218
13575	NC_008378	CT	3	6	600897	600902	0 %	50 %	0 %	50 %	116249218
13576	NC_008378	ACG	2	6	600903	600908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249218
13577	NC_008378	GGAAA	2	10	600917	600926	60 %	0 %	40 %	0 %	116249218
13578	NC_008378	GCT	2	6	600976	600981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249218
13579	NC_008378	TCT	2	6	601000	601005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249218
13580	NC_008378	TCC	2	6	601022	601027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249218
13581	NC_008378	TCCGA	2	10	601043	601052	20 %	20 %	20 %	40 %	116249218
13582	NC_008378	CCG	2	6	601083	601088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249218
13583	NC_008378	TCG	2	6	601092	601097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249218
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13585	NC_008378	TCGCC	2	10	601134	601143	0 %	20 %	20 %	60 %	116249218
13586	NC_008378	TC	3	6	601189	601194	0 %	50 %	0 %	50 %	116249218
13587	NC_008378	GCT	2	6	601241	601246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249218
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13589	NC_008378	CG	3	6	601299	601304	0 %	0 %	50 %	50 %	116249218
13590	NC_008378	GTC	2	6	601334	601339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249218
13591	NC_008378	GAG	2	6	601364	601369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249218
13592	NC_008378	GGC	2	6	601414	601419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249218
13593	NC_008378	GCC	2	6	601423	601428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249218
13594	NC_008378	GCC	2	6	601439	601444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249218
13595	NC_008378	GCGG	2	8	601453	601460	0 %	0 %	75 %	25 %	116249218
13596	NC_008378	CTA	2	6	601573	601578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249218
13597	NC_008378	GC	3	6	601589	601594	0 %	0 %	50 %	50 %	116249218
13598	NC_008378	CGC	2	6	601684	601689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249218
13599	NC_008378	TGG	2	6	601695	601700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249218
13600	NC_008378	GGCG	2	8	601777	601784	0 %	0 %	75 %	25 %	116249218
13601	NC_008378	GGA	2	6	601849	601854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249218
13602	NC_008378	CGG	2	6	601966	601971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249218
13603	NC_008378	TCG	2	6	601986	601991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249218
13604	NC_008378	CTC	2	6	601993	601998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249218
13605	NC_008378	GGT	2	6	602014	602019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249218
13606	NC_008378	GCT	2	6	602061	602066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249218
13607	NC_008378	TCA	2	6	602190	602195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249218
13608	NC_008378	GCTGCC	2	12	602266	602277	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116249218
13609	NC_008378	CGG	2	6	602289	602294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249218
13610	NC_008378	ATC	2	6	602315	602320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249218
13611	NC_008378	GTC	2	6	602375	602380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249218
13612	NC_008378	CGA	2	6	602413	602418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249218
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13614	NC_008378	CAT	2	6	602530	602535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249218
13615	NC_008378	CGT	2	6	602542	602547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249218
13616	NC_008378	CGG	2	6	602563	602568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249218
13617	NC_008378	CGG	2	6	602599	602604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249218
13618	NC_008378	CGGC	2	8	602617	602624	0 %	0 %	50 %	50 %	116249218
13619	NC_008378	GCC	2	6	602644	602649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249218
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13854	NC_008378	GCG	2	6	613388	613393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13855	NC_008378	TTAG	2	8	613477	613484	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13856	NC_008378	GCCA	3	12	613635	613646	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13857	NC_008378	TGC	2	6	613664	613669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13859	NC_008378	CCA	2	6	613751	613756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13981	NC_008378	CGA	2	6	618656	618661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13982	NC_008378	CCA	2	6	618746	618751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13983	NC_008378	CGA	2	6	618770	618775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13984	NC_008378	CGG	2	6	618824	618829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13985	NC_008378	ATC	2	6	618863	618868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249232
13986	NC_008378	CCG	2	6	618917	618922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249232
13987	NC_008378	GCC	2	6	618931	618936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249232
13988	NC_008378	ACGA	2	8	618946	618953	50 %	0 %	25 %	25 %	116249232
13989	NC_008378	ACAGG	2	10	618983	618992	40 %	0 %	40 %	20 %	116249232
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13991	NC_008378	GCC	2	6	619069	619074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249232
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13998	NC_008378	TCG	2	6	619757	619762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249232
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