MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL12

Total Repeats: 19681

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008378	GCG	3	9	22164	22172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248699
502	NC_008378	GTC	2	6	22175	22180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248699
503	NC_008378	GCA	2	6	22185	22190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248699
504	NC_008378	ACG	2	6	22233	22238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248699
505	NC_008378	GC	3	6	22288	22293	0 %	0 %	50 %	50 %	116248699
506	NC_008378	CCG	2	6	22305	22310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248699
507	NC_008378	GC	3	6	22333	22338	0 %	0 %	50 %	50 %	116248699
508	NC_008378	GGCGC	2	10	22342	22351	0 %	0 %	60 %	40 %	116248699
509	NC_008378	TGC	2	6	22458	22463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248699
510	NC_008378	GC	3	6	22522	22527	0 %	0 %	50 %	50 %	116248699
511	NC_008378	CTC	2	6	22565	22570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248700
512	NC_008378	GAT	2	6	22717	22722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248700
513	NC_008378	GC	3	6	22836	22841	0 %	0 %	50 %	50 %	116248700
514	NC_008378	GCC	2	6	22864	22869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248700
515	NC_008378	GTCGGG	2	12	22876	22887	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	116248700
516	NC_008378	GGT	2	6	22926	22931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248700
517	NC_008378	AGG	2	6	22953	22958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248700
518	NC_008378	CAG	2	6	22993	22998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248700
519	NC_008378	GTG	2	6	23033	23038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248700
520	NC_008378	CCG	2	6	23055	23060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248700
521	NC_008378	TGA	2	6	23061	23066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248700
522	NC_008378	CGG	2	6	23105	23110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248700
523	NC_008378	CAT	2	6	23131	23136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248700
524	NC_008378	ATA	2	6	23143	23148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116248700
525	NC_008378	TAA	2	6	23186	23191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116248700
526	NC_008378	CAT	2	6	23230	23235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248700
527	NC_008378	GCC	2	6	23283	23288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248700
528	NC_008378	GCCGA	2	10	23327	23336	20 %	0 %	40 %	40 %	116248700
529	NC_008378	CGC	2	6	23350	23355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248700
530	NC_008378	GGC	2	6	23356	23361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248700
531	NC_008378	CCA	2	6	23364	23369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248700
532	NC_008378	GTC	2	6	23503	23508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248700
533	NC_008378	GC	3	6	23531	23536	0 %	0 %	50 %	50 %	116248700
534	NC_008378	CCG	2	6	23547	23552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248700
535	NC_008378	CG	3	6	23551	23556	0 %	0 %	50 %	50 %	116248700
536	NC_008378	GCA	2	6	23564	23569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248700
537	NC_008378	CGC	2	6	23604	23609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248700
538	NC_008378	GCG	2	6	23616	23621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248700
539	NC_008378	GCGA	2	8	23636	23643	25 %	0 %	50 %	25 %	116248700
540	NC_008378	CAC	2	6	23659	23664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248700
541	NC_008378	CCG	2	6	23847	23852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_008378	GCC	2	6	23865	23870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_008378	CGG	2	6	23876	23881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_008378	TCA	2	6	23958	23963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_008378	GCG	2	6	24053	24058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248701
546	NC_008378	GC	3	6	24075	24080	0 %	0 %	50 %	50 %	116248701
547	NC_008378	CGG	2	6	24090	24095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248701
548	NC_008378	GAT	2	6	24123	24128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248701
549	NC_008378	CGGCG	2	10	24260	24269	0 %	0 %	60 %	40 %	116248701
550	NC_008378	GCG	2	6	24283	24288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248701
551	NC_008378	CG	3	6	24344	24349	0 %	0 %	50 %	50 %	116248701
552	NC_008378	TCCT	2	8	24432	24439	0 %	50 %	0 %	50 %	116248701
553	NC_008378	GCT	2	6	24453	24458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248701
554	NC_008378	CT	3	6	24491	24496	0 %	50 %	0 %	50 %	116248701
555	NC_008378	TGGGT	2	10	24509	24518	0 %	40 %	60 %	0 %	116248701
556	NC_008378	GGC	2	6	24544	24549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248701
557	NC_008378	CAG	2	6	24550	24555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248701
558	NC_008378	CGA	2	6	24558	24563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248701
559	NC_008378	GGC	2	6	24570	24575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248701
560	NC_008378	CGG	2	6	24621	24626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248701
561	NC_008378	GAA	2	6	24724	24729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248701
562	NC_008378	CTG	2	6	24752	24757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248701
563	NC_008378	CCG	2	6	24758	24763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248701
564	NC_008378	CT	3	6	24856	24861	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
565	NC_008378	CT	3	6	24865	24870	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
566	NC_008378	TGA	2	6	24968	24973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248702
567	NC_008378	CG	3	6	24983	24988	0 %	0 %	50 %	50 %	116248702
568	NC_008378	GGA	2	6	25005	25010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248702
569	NC_008378	GAC	2	6	25047	25052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248702
570	NC_008378	CGA	2	6	25109	25114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248702
571	NC_008378	GATC	2	8	25127	25134	25 %	25 %	25 %	25 %	116248702
572	NC_008378	TGG	2	6	25156	25161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248702
573	NC_008378	CGA	2	6	25163	25168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248702
574	NC_008378	GCC	2	6	25170	25175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248702
575	NC_008378	GCC	2	6	25230	25235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248702
576	NC_008378	ACG	2	6	25306	25311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248702
577	NC_008378	TTG	2	6	25312	25317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116248702
578	NC_008378	GCA	2	6	25343	25348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248702
579	NC_008378	GAT	2	6	25386	25391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248702
580	NC_008378	GCT	2	6	25514	25519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248702
581	NC_008378	GAA	2	6	25572	25577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248702
582	NC_008378	GTGC	2	8	25594	25601	0 %	25 %	50 %	25 %	116248702
583	NC_008378	CTG	2	6	25632	25637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248702
584	NC_008378	CAA	2	6	25684	25689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_008378	TGC	2	6	25736	25741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_008378	TCA	2	6	25781	25786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_008378	GAAA	2	8	25800	25807	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
588	NC_008378	TTTG	2	8	25823	25830	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
589	NC_008378	GGGC	2	8	26010	26017	0 %	0 %	75 %	25 %	116248703
590	NC_008378	GGCGC	2	10	26086	26095	0 %	0 %	60 %	40 %	116248703
591	NC_008378	GGT	2	6	26143	26148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248703
592	NC_008378	CCG	2	6	26156	26161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248703
593	NC_008378	GCG	2	6	26246	26251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248703
594	NC_008378	CGC	3	9	26295	26303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248703
595	NC_008378	GTC	2	6	26320	26325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248703
596	NC_008378	CGG	2	6	26355	26360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248703
597	NC_008378	GCT	2	6	26529	26534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248703
598	NC_008378	GC	3	6	26565	26570	0 %	0 %	50 %	50 %	116248703
599	NC_008378	GTC	2	6	26587	26592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248703
600	NC_008378	TCAT	2	8	26651	26658	25 %	50 %	0 %	25 %	116248703
601	NC_008378	GGA	2	6	26673	26678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248703
602	NC_008378	GGC	3	9	26685	26693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248703
603	NC_008378	CAT	2	6	26757	26762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248704
604	NC_008378	CGGC	2	8	26783	26790	0 %	0 %	50 %	50 %	116248704
605	NC_008378	GGC	2	6	26824	26829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248704
606	NC_008378	TTG	2	6	26846	26851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116248704
607	NC_008378	CGG	2	6	26865	26870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248704
608	NC_008378	GGCT	2	8	26874	26881	0 %	25 %	50 %	25 %	116248704
609	NC_008378	GGCT	2	8	26887	26894	0 %	25 %	50 %	25 %	116248704
610	NC_008378	TCCGT	2	10	26990	26999	0 %	40 %	20 %	40 %	116248704
611	NC_008378	ATG	4	12	27038	27049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248704
612	NC_008378	TGC	2	6	27050	27055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248704
613	NC_008378	CTG	2	6	27106	27111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248704
614	NC_008378	GC	4	8	27148	27155	0 %	0 %	50 %	50 %	116248704
615	NC_008378	CGGT	2	8	27197	27204	0 %	25 %	50 %	25 %	116248704
616	NC_008378	CGAC	2	8	27209	27216	25 %	0 %	25 %	50 %	116248704
617	NC_008378	ATC	2	6	27236	27241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248704
618	NC_008378	GGAA	2	8	27263	27270	50 %	0 %	50 %	0 %	116248704
619	NC_008378	GAT	2	6	27294	27299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248704
620	NC_008378	CCG	2	6	27329	27334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248704
621	NC_008378	AG	3	6	27374	27379	50 %	0 %	50 %	0 %	116248704
622	NC_008378	CGG	2	6	27518	27523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248704
623	NC_008378	GCC	2	6	27526	27531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248704
624	NC_008378	ATGG	2	8	27591	27598	25 %	25 %	50 %	0 %	116248704
625	NC_008378	GCGG	2	8	27651	27658	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
626	NC_008378	CG	3	6	27768	27773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
627	NC_008378	A	6	6	27776	27781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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629	NC_008378	ATG	2	6	28071	28076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248705
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757	NC_008378	GGC	2	6	34694	34699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248711
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877	NC_008378	TGGG	2	8	40581	40588	0 %	25 %	75 %	0 %	116248717
878	NC_008378	GAT	2	6	40613	40618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248717
879	NC_008378	GAATC	2	10	40672	40681	40 %	20 %	20 %	20 %	116248717
880	NC_008378	GC	3	6	40733	40738	0 %	0 %	50 %	50 %	116248717
881	NC_008378	GC	3	6	40749	40754	0 %	0 %	50 %	50 %	116248717
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