MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL12

Total Repeats: 19681

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008378	GCG	2	6	244099	244104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248903
5502	NC_008378	ACCGG	2	10	244110	244119	20 %	0 %	40 %	40 %	116248903
5503	NC_008378	ACGC	2	8	244136	244143	25 %	0 %	25 %	50 %	116248903
5504	NC_008378	ATA	2	6	244202	244207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116248903
5505	NC_008378	GCA	2	6	244216	244221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248903
5506	NC_008378	CGT	2	6	244237	244242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248904
5507	NC_008378	CCG	2	6	244298	244303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248904
5508	NC_008378	GT	3	6	244353	244358	0 %	50 %	50 %	0 %	116248904
5509	NC_008378	GCC	2	6	244365	244370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248904
5510	NC_008378	TCG	2	6	244465	244470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248904
5511	NC_008378	GCT	2	6	244484	244489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248904
5512	NC_008378	TGG	2	6	244538	244543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248904
5513	NC_008378	CG	3	6	244564	244569	0 %	0 %	50 %	50 %	116248904
5514	NC_008378	GCA	2	6	244607	244612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248904
5515	NC_008378	GAA	2	6	244613	244618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248904
5516	NC_008378	CGC	2	6	244625	244630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248904
5517	NC_008378	GCC	2	6	244633	244638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248904
5518	NC_008378	CG	3	6	244646	244651	0 %	0 %	50 %	50 %	116248904
5519	NC_008378	GCGG	2	8	244719	244726	0 %	0 %	75 %	25 %	116248904
5520	NC_008378	ACC	2	6	244732	244737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248904
5521	NC_008378	ACC	2	6	244741	244746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248904
5522	NC_008378	GCC	2	6	244779	244784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248904
5523	NC_008378	CAG	2	6	244893	244898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248904
5524	NC_008378	CTC	2	6	244948	244953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5525	NC_008378	GCC	2	6	245084	245089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248905
5526	NC_008378	CCTT	2	8	245152	245159	0 %	50 %	0 %	50 %	116248905
5527	NC_008378	GCA	2	6	245170	245175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248905
5528	NC_008378	CGT	2	6	245200	245205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248905
5529	NC_008378	TCG	2	6	245215	245220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248905
5530	NC_008378	ACG	2	6	245283	245288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248905
5531	NC_008378	GCA	2	6	245394	245399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248905
5532	NC_008378	CGT	2	6	245443	245448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248905
5533	NC_008378	GCG	2	6	245485	245490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248905
5534	NC_008378	GCC	2	6	245505	245510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248905
5535	NC_008378	GGC	2	6	245513	245518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248905
5536	NC_008378	CGA	3	9	245548	245556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248905
5537	NC_008378	CGGC	2	8	245650	245657	0 %	0 %	50 %	50 %	116248905
5538	NC_008378	CCG	2	6	245745	245750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248905
5539	NC_008378	GCCG	2	8	245846	245853	0 %	0 %	50 %	50 %	116248905
5540	NC_008378	GAT	2	6	245894	245899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248905
5541	NC_008378	CAC	2	6	245933	245938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248905
5542	NC_008378	CGG	2	6	245950	245955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248905
5543	NC_008378	CGC	2	6	245974	245979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248905
5544	NC_008378	CGG	2	6	245980	245985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248905
5545	NC_008378	CCGGT	2	10	246080	246089	0 %	20 %	40 %	40 %	116248905
5546	NC_008378	GC	3	6	246118	246123	0 %	0 %	50 %	50 %	116248905
5547	NC_008378	GGT	2	6	246161	246166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248905
5548	NC_008378	CGC	2	6	246238	246243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248905
5549	NC_008378	GC	3	6	246282	246287	0 %	0 %	50 %	50 %	116248905
5550	NC_008378	TGC	2	6	246311	246316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248905
5551	NC_008378	AGC	2	6	246320	246325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248905
5552	NC_008378	TGCC	2	8	246383	246390	0 %	25 %	25 %	50 %	116248905
5553	NC_008378	GTC	2	6	246414	246419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248905
5554	NC_008378	CGG	2	6	246488	246493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_008378	GTT	2	6	246516	246521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_008378	TCG	2	6	246585	246590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248906
5557	NC_008378	CTTG	2	8	246622	246629	0 %	50 %	25 %	25 %	116248906
5558	NC_008378	TCG	2	6	246687	246692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248906
5559	NC_008378	TCG	2	6	246726	246731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248906
5560	NC_008378	ATG	2	6	246738	246743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248906
5561	NC_008378	TCG	2	6	246817	246822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248906
5562	NC_008378	GCC	2	6	246860	246865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248906
5563	NC_008378	GCC	2	6	246887	246892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248906
5564	NC_008378	GAC	2	6	246899	246904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248906
5565	NC_008378	CCG	2	6	246912	246917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248906
5566	NC_008378	CAT	2	6	246920	246925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248906
5567	NC_008378	GC	3	6	246960	246965	0 %	0 %	50 %	50 %	116248906
5568	NC_008378	CG	3	6	247075	247080	0 %	0 %	50 %	50 %	116248906
5569	NC_008378	ATC	2	6	247354	247359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248907
5570	NC_008378	TTC	2	6	247380	247385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248907
5571	NC_008378	GCG	2	6	247394	247399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248907
5572	NC_008378	GGC	2	6	247440	247445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248907
5573	NC_008378	GCGT	2	8	247507	247514	0 %	25 %	50 %	25 %	116248907
5574	NC_008378	GCC	2	6	247539	247544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248907
5575	NC_008378	CG	3	6	247547	247552	0 %	0 %	50 %	50 %	116248907
5576	NC_008378	TGAA	2	8	247564	247571	50 %	25 %	25 %	0 %	116248907
5577	NC_008378	TCG	2	6	247606	247611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248907
5578	NC_008378	CG	3	6	247655	247660	0 %	0 %	50 %	50 %	116248907
5579	NC_008378	GCCG	2	8	247736	247743	0 %	0 %	50 %	50 %	116248907
5580	NC_008378	CGT	2	6	247755	247760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248907
5581	NC_008378	ATC	2	6	247846	247851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248907
5582	NC_008378	CTTGAT	2	12	247869	247880	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116248907
5583	NC_008378	GCC	2	6	247881	247886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248907
5584	NC_008378	GCC	2	6	247950	247955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248907
5585	NC_008378	GGC	2	6	248058	248063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248907
5586	NC_008378	CCGA	2	8	248092	248099	25 %	0 %	25 %	50 %	116248907
5587	NC_008378	CAG	2	6	248110	248115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248907
5588	NC_008378	GC	3	6	248130	248135	0 %	0 %	50 %	50 %	116248907
5589	NC_008378	GGCC	2	8	248243	248250	0 %	0 %	50 %	50 %	116248907
5590	NC_008378	CTGC	2	8	248298	248305	0 %	25 %	25 %	50 %	116248907
5591	NC_008378	CGGAT	2	10	248369	248378	20 %	20 %	40 %	20 %	116248907
5592	NC_008378	GGAC	2	8	248391	248398	25 %	0 %	50 %	25 %	116248907
5593	NC_008378	AGCC	2	8	248408	248415	25 %	0 %	25 %	50 %	116248907
5594	NC_008378	GTG	2	6	248461	248466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_008378	CGT	2	6	248508	248513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248908
5596	NC_008378	GGC	2	6	248610	248615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248908
5597	NC_008378	CCG	2	6	248616	248621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248908
5598	NC_008378	TCT	2	6	248632	248637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248908
5599	NC_008378	CAG	2	6	248700	248705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248908
5600	NC_008378	GCA	2	6	248744	248749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248908
5601	NC_008378	ATC	2	6	248931	248936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248908
5602	NC_008378	GAT	2	6	248937	248942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248908
5603	NC_008378	CTT	2	6	248943	248948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248908
5604	NC_008378	CGATGG	2	12	248986	248997	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116248908
5605	NC_008378	GCC	2	6	249013	249018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248908
5606	NC_008378	TGA	2	6	249023	249028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248908
5607	NC_008378	CGT	2	6	249110	249115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248908
5608	NC_008378	CCA	2	6	249146	249151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248908
5609	NC_008378	TCA	2	6	249206	249211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248908
5610	NC_008378	GC	3	6	249214	249219	0 %	0 %	50 %	50 %	116248908
5611	NC_008378	TCC	2	6	249241	249246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248908
5612	NC_008378	AGGT	2	8	249250	249257	25 %	25 %	50 %	0 %	116248908
5613	NC_008378	CGT	2	6	249291	249296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248908
5614	NC_008378	ATC	2	6	249315	249320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248908
5615	NC_008378	GC	3	6	249340	249345	0 %	0 %	50 %	50 %	116248908
5616	NC_008378	ATG	2	6	249367	249372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248908
5617	NC_008378	TGG	2	6	249377	249382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248908
5618	NC_008378	AGC	2	6	249383	249388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248908
5619	NC_008378	TGA	2	6	249434	249439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248908
5620	NC_008378	TCC	2	6	249457	249462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248908
5621	NC_008378	CGA	2	6	249473	249478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248908
5622	NC_008378	GCG	2	6	249480	249485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248908
5623	NC_008378	GCC	2	6	249493	249498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248908
5624	NC_008378	TGG	2	6	249508	249513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248908
5625	NC_008378	TCG	2	6	249584	249589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248908
5626	NC_008378	CTC	2	6	249654	249659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248908
5627	NC_008378	CGGCG	2	10	249674	249683	0 %	0 %	60 %	40 %	116248908
5628	NC_008378	GCCG	2	8	249756	249763	0 %	0 %	50 %	50 %	116248908
5629	NC_008378	GTC	2	6	249817	249822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248908
5630	NC_008378	GGAAAG	2	12	249939	249950	50 %	0 %	50 %	0 %	116248908
5631	NC_008378	ACCC	2	8	249971	249978	25 %	0 %	0 %	75 %	116248908
5632	NC_008378	GAA	2	6	249983	249988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248908
5633	NC_008378	TCC	2	6	250090	250095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248908
5634	NC_008378	ATC	2	6	250146	250151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248908
5635	NC_008378	GCA	2	6	250154	250159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248908
5636	NC_008378	GCTT	2	8	250225	250232	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5637	NC_008378	AT	4	8	250270	250277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5638	NC_008378	GTT	2	6	250400	250405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116248909
5639	NC_008378	ATG	2	6	250431	250436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248909
5640	NC_008378	CAT	2	6	250450	250455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248909
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5642	NC_008378	GCC	3	9	250671	250679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248909
5643	NC_008378	GATCCG	3	18	250688	250705	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116248909
5644	NC_008378	ATC	2	6	250730	250735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248909
5645	NC_008378	GGC	2	6	250744	250749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248909
5646	NC_008378	CGA	2	6	250756	250761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248909
5647	NC_008378	CGA	2	6	250792	250797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248909
5648	NC_008378	GCA	2	6	250833	250838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248909
5649	NC_008378	CCA	2	6	250843	250848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248909
5650	NC_008378	TCG	2	6	250885	250890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248909
5651	NC_008378	CAT	2	6	250945	250950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248909
5652	NC_008378	ACT	2	6	251055	251060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248909
5653	NC_008378	GCCGC	2	10	251072	251081	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5654	NC_008378	CAG	2	6	251111	251116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248910
5655	NC_008378	GCCT	2	8	251119	251126	0 %	25 %	25 %	50 %	116248910
5656	NC_008378	GAA	2	6	251129	251134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248910
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5658	NC_008378	CG	3	6	251173	251178	0 %	0 %	50 %	50 %	116248910
5659	NC_008378	ATG	2	6	251198	251203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248910
5660	NC_008378	GCCG	2	8	251276	251283	0 %	0 %	50 %	50 %	116248910
5661	NC_008378	TCG	2	6	251325	251330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248910
5662	NC_008378	TGA	2	6	251353	251358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248910
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5666	NC_008378	ATA	2	6	251519	251524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116248910
5667	NC_008378	GGCCGA	2	12	251578	251589	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	116248910
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5677	NC_008378	TCC	2	6	251982	251987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248910
5678	NC_008378	CGA	2	6	252022	252027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248910
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5680	NC_008378	GGCG	2	8	252069	252076	0 %	0 %	75 %	25 %	116248911
5681	NC_008378	GGATCG	2	12	252101	252112	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116248911
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5684	NC_008378	ACC	2	6	252236	252241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248911
5685	NC_008378	TCG	2	6	252350	252355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248911
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5690	NC_008378	GGGTC	2	10	252585	252594	0 %	20 %	60 %	20 %	116248911
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5734	NC_008378	TG	3	6	254574	254579	0 %	50 %	50 %	0 %	116248912
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5863	NC_008378	GTC	2	6	260598	260603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248919
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5971	NC_008378	GC	3	6	265693	265698	0 %	0 %	50 %	50 %	116248924
5972	NC_008378	AAG	2	6	265763	265768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248924
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5981	NC_008378	CGG	2	6	266271	266276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248924
5982	NC_008378	ATCGC	2	10	266301	266310	20 %	20 %	20 %	40 %	116248924
5983	NC_008378	GCG	2	6	266358	266363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248924
5984	NC_008378	GCC	2	6	266367	266372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248924
5985	NC_008378	CTC	2	6	266405	266410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248924
5986	NC_008378	CCG	2	6	266465	266470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248924
5987	NC_008378	TTG	2	6	266577	266582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116248925
5988	NC_008378	GCG	2	6	266661	266666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248925
5989	NC_008378	CCGA	2	8	266727	266734	25 %	0 %	25 %	50 %	116248925
5990	NC_008378	TGGCGC	2	12	266802	266813	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116248925
5991	NC_008378	AAGA	2	8	266815	266822	75 %	0 %	25 %	0 %	116248925
5992	NC_008378	CCG	2	6	266900	266905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248925
5993	NC_008378	CAC	2	6	266911	266916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248925
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5995	NC_008378	GGT	2	6	267022	267027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248925
5996	NC_008378	GAT	2	6	267143	267148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248925
5997	NC_008378	GC	3	6	267160	267165	0 %	0 %	50 %	50 %	116248925
5998	NC_008378	CCA	2	6	267167	267172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248925
5999	NC_008378	CCT	2	6	267192	267197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248925
6000	NC_008378	TCGA	2	8	267313	267320	25 %	25 %	25 %	25 %	116248925

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