MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL12

Total Repeats: 19681

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008378	CGC	2	6	221997	222002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248883
5002	NC_008378	CTC	2	6	222024	222029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248883
5003	NC_008378	CGA	2	6	222083	222088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248883
5004	NC_008378	CGAAAT	2	12	222118	222129	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116248884
5005	NC_008378	GAT	2	6	222148	222153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248884
5006	NC_008378	TCG	2	6	222222	222227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248884
5007	NC_008378	GGC	2	6	222307	222312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248884
5008	NC_008378	CGA	2	6	222379	222384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248884
5009	NC_008378	GTT	2	6	222425	222430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116248884
5010	NC_008378	GCT	2	6	222451	222456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248884
5011	NC_008378	CGT	2	6	222460	222465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248884
5012	NC_008378	AT	3	6	222490	222495	50 %	50 %	0 %	0 %	116248884
5013	NC_008378	CGAG	2	8	222574	222581	25 %	0 %	50 %	25 %	116248884
5014	NC_008378	GGCG	2	8	222657	222664	0 %	0 %	75 %	25 %	116248884
5015	NC_008378	TGT	2	6	222667	222672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116248884
5016	NC_008378	CCA	2	6	222682	222687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248884
5017	NC_008378	TCA	2	6	222735	222740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248884
5018	NC_008378	TCC	2	6	222789	222794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248884
5019	NC_008378	TC	3	6	222911	222916	0 %	50 %	0 %	50 %	116248884
5020	NC_008378	TCC	2	6	222945	222950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5021	NC_008378	CG	3	6	222968	222973	0 %	0 %	50 %	50 %	116248885
5022	NC_008378	CAA	2	6	222991	222996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116248885
5023	NC_008378	GCG	2	6	223049	223054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248885
5024	NC_008378	CTTC	2	8	223080	223087	0 %	50 %	0 %	50 %	116248885
5025	NC_008378	G	6	6	223110	223115	0 %	0 %	100 %	0 %	116248885
5026	NC_008378	GCC	2	6	223159	223164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248885
5027	NC_008378	GGC	2	6	223216	223221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248885
5028	NC_008378	GAA	2	6	223230	223235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248885
5029	NC_008378	GCTTC	2	10	223358	223367	0 %	40 %	20 %	40 %	116248885
5030	NC_008378	GC	4	8	223419	223426	0 %	0 %	50 %	50 %	116248885
5031	NC_008378	CAT	2	6	223441	223446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248885
5032	NC_008378	GCT	2	6	223513	223518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248885
5033	NC_008378	CAC	2	6	223567	223572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248885
5034	NC_008378	CGT	2	6	223600	223605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248885
5035	NC_008378	TCTG	2	8	223619	223626	0 %	50 %	25 %	25 %	116248885
5036	NC_008378	GTC	2	6	223661	223666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248885
5037	NC_008378	CCA	2	6	223668	223673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248885
5038	NC_008378	CGT	2	6	223686	223691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248885
5039	NC_008378	TTGCC	2	10	223704	223713	0 %	40 %	20 %	40 %	116248885
5040	NC_008378	TCG	2	6	223722	223727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248885
5041	NC_008378	CCG	2	6	223730	223735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248885
5042	NC_008378	GCC	2	6	223775	223780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248885
5043	NC_008378	CG	3	6	223783	223788	0 %	0 %	50 %	50 %	116248885
5044	NC_008378	TCG	2	6	223815	223820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248885
5045	NC_008378	CGC	2	6	223837	223842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248885
5046	NC_008378	GCC	2	6	223918	223923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248885
5047	NC_008378	CATCG	2	10	223933	223942	20 %	20 %	20 %	40 %	116248885
5048	NC_008378	ATCG	2	8	224020	224027	25 %	25 %	25 %	25 %	116248886
5049	NC_008378	TGG	2	6	224086	224091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248886
5050	NC_008378	GCA	2	6	224109	224114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248886
5051	NC_008378	AGCAT	2	10	224175	224184	40 %	20 %	20 %	20 %	116248886
5052	NC_008378	TGCG	2	8	224196	224203	0 %	25 %	50 %	25 %	116248886
5053	NC_008378	CGT	2	6	224216	224221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248886
5054	NC_008378	AAT	2	6	224242	224247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116248886
5055	NC_008378	CAT	2	6	224318	224323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248886
5056	NC_008378	GAT	2	6	224354	224359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248886
5057	NC_008378	AGCGC	2	10	224401	224410	20 %	0 %	40 %	40 %	116248886
5058	NC_008378	CGG	2	6	224416	224421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248886
5059	NC_008378	GAAC	2	8	224549	224556	50 %	0 %	25 %	25 %	116248886
5060	NC_008378	GTA	2	6	224573	224578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248886
5061	NC_008378	GCG	2	6	224581	224586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248886
5062	NC_008378	CGA	2	6	224629	224634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248886
5063	NC_008378	TCG	2	6	224641	224646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248886
5064	NC_008378	TGC	2	6	224699	224704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248886
5065	NC_008378	ATC	2	6	224832	224837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248886
5066	NC_008378	CATC	2	8	224854	224861	25 %	25 %	0 %	50 %	116248886
5067	NC_008378	AGA	2	6	224889	224894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248886
5068	NC_008378	TTCC	2	8	224906	224913	0 %	50 %	0 %	50 %	116248886
5069	NC_008378	TTC	2	6	224972	224977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248886
5070	NC_008378	CTTGC	2	10	224987	224996	0 %	40 %	20 %	40 %	116248886
5071	NC_008378	CT	3	6	225005	225010	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5072	NC_008378	GGCC	2	8	225084	225091	0 %	0 %	50 %	50 %	116248887
5073	NC_008378	GCG	2	6	225256	225261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248887
5074	NC_008378	TGC	2	6	225323	225328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248887
5075	NC_008378	GGC	2	6	225361	225366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248887
5076	NC_008378	TCG	2	6	225405	225410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248887
5077	NC_008378	TTG	3	9	225425	225433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116248887
5078	NC_008378	CGC	2	6	225502	225507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248887
5079	NC_008378	GCTGC	2	10	225515	225524	0 %	20 %	40 %	40 %	116248887
5080	NC_008378	GAG	2	6	225547	225552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248887
5081	NC_008378	CGC	2	6	225793	225798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248887
5082	NC_008378	ACC	2	6	225862	225867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248887
5083	NC_008378	AGC	2	6	225911	225916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248887
5084	NC_008378	CCT	2	6	225939	225944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248887
5085	NC_008378	AGG	2	6	225992	225997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248887
5086	NC_008378	CGA	2	6	226027	226032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248887
5087	NC_008378	TCG	2	6	226073	226078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248887
5088	NC_008378	CGG	2	6	226116	226121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248887
5089	NC_008378	GCA	2	6	226125	226130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248887
5090	NC_008378	CG	4	8	226173	226180	0 %	0 %	50 %	50 %	116248887
5091	NC_008378	CAG	2	6	226198	226203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248887
5092	NC_008378	GCGAT	2	10	226208	226217	20 %	20 %	40 %	20 %	116248887
5093	NC_008378	GGC	2	6	226261	226266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248887
5094	NC_008378	GC	3	6	226321	226326	0 %	0 %	50 %	50 %	116248888
5095	NC_008378	GTC	2	6	226361	226366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248888
5096	NC_008378	CCA	2	6	226381	226386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248888
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5098	NC_008378	CAT	2	6	226472	226477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248888
5099	NC_008378	CTGC	2	8	226558	226565	0 %	25 %	25 %	50 %	116248888
5100	NC_008378	AGC	2	6	226605	226610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248888
5101	NC_008378	AGGT	2	8	226620	226627	25 %	25 %	50 %	0 %	116248888
5102	NC_008378	GAT	2	6	226643	226648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248888
5103	NC_008378	GA	3	6	226649	226654	50 %	0 %	50 %	0 %	116248888
5104	NC_008378	CGG	2	6	226681	226686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248888
5105	NC_008378	TCGA	2	8	226762	226769	25 %	25 %	25 %	25 %	116248888
5106	NC_008378	GCA	2	6	226812	226817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248888
5107	NC_008378	TCC	2	6	226833	226838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5108	NC_008378	ATT	2	6	226859	226864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_008378	GA	3	6	226986	226991	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_008378	CAG	2	6	227015	227020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_008378	TTCCG	2	10	227046	227055	0 %	40 %	20 %	40 %	116248889
5112	NC_008378	TCT	2	6	227058	227063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248889
5113	NC_008378	TCG	2	6	227231	227236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248889
5114	NC_008378	GAG	2	6	227395	227400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248889
5115	NC_008378	GCA	2	6	227404	227409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248889
5116	NC_008378	GAA	2	6	227412	227417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248889
5117	NC_008378	GGA	2	6	227575	227580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248890
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5120	NC_008378	TAT	2	6	227703	227708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116248890
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5122	NC_008378	ATC	3	9	227734	227742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248890
5123	NC_008378	CTG	2	6	227755	227760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248890
5124	NC_008378	TGC	2	6	227885	227890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248890
5125	NC_008378	GTC	2	6	227930	227935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248890
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5141	NC_008378	CTG	2	6	228409	228414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248890
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5177	NC_008378	CTG	2	6	229972	229977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5244	NC_008378	GCC	2	6	232880	232885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248895
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5366	NC_008378	AGA	2	6	238135	238140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248899
5367	NC_008378	GCC	2	6	238186	238191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248899
5368	NC_008378	TCG	2	6	238222	238227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248899
5369	NC_008378	GAT	2	6	238248	238253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248899
5370	NC_008378	TCGCC	2	10	238334	238343	0 %	20 %	20 %	60 %	116248899
5371	NC_008378	AGCC	2	8	238393	238400	25 %	0 %	25 %	50 %	116248899
5372	NC_008378	GCCG	2	8	238404	238411	0 %	0 %	50 %	50 %	116248899
5373	NC_008378	GCG	2	6	238439	238444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248899
5374	NC_008378	GGGCTT	2	12	238587	238598	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	116248899
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5376	NC_008378	ATC	2	6	238618	238623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248899
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5380	NC_008378	TGCGCA	2	12	238754	238765	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116248899
5381	NC_008378	CTT	2	6	238845	238850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248899
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5384	NC_008378	CAT	2	6	239072	239077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248899
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5386	NC_008378	TGC	2	6	239105	239110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248899
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5388	NC_008378	CTC	2	6	239136	239141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248899
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5390	NC_008378	GCC	2	6	239229	239234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5391	NC_008378	GGC	2	6	239236	239241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5392	NC_008378	A	6	6	239303	239308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5393	NC_008378	CGC	2	6	239320	239325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5394	NC_008378	CTTG	2	8	239334	239341	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5395	NC_008378	ACC	2	6	239356	239361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5396	NC_008378	GC	3	6	239375	239380	0 %	0 %	50 %	50 %	116248900
5397	NC_008378	TCT	2	6	239396	239401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248900
5398	NC_008378	CAT	2	6	239402	239407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248900
5399	NC_008378	TGA	2	6	239413	239418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248900
5400	NC_008378	CGATA	2	10	239445	239454	40 %	20 %	20 %	20 %	116248900
5401	NC_008378	ATC	2	6	239544	239549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248900
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5403	NC_008378	GCG	2	6	239574	239579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248900
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5407	NC_008378	CAT	2	6	239843	239848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248900
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5432	NC_008378	GCG	2	6	241159	241164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5433	NC_008378	AAG	2	6	241171	241176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5434	NC_008378	GCG	2	6	241301	241306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248901
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5457	NC_008378	GAC	2	6	242042	242047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248901
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5461	NC_008378	TCG	2	6	242369	242374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248902
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5471	NC_008378	ACG	2	6	242926	242931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248902
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5473	NC_008378	CGAT	2	8	242986	242993	25 %	25 %	25 %	25 %	116248902
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5480	NC_008378	TCG	2	6	243322	243327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248902
5481	NC_008378	TCA	2	6	243365	243370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248902
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5487	NC_008378	GTC	3	9	243588	243596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248902
5488	NC_008378	GCC	2	6	243633	243638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248902
5489	NC_008378	CCA	2	6	243656	243661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248902
5490	NC_008378	GC	3	6	243705	243710	0 %	0 %	50 %	50 %	116248902
5491	NC_008378	CGA	2	6	243725	243730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248902
5492	NC_008378	GCC	2	6	243792	243797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248902
5493	NC_008378	TTG	2	6	243815	243820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116248902
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5495	NC_008378	TCC	2	6	243859	243864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5496	NC_008378	CTC	2	6	243880	243885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5497	NC_008378	ATCT	2	8	243921	243928	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5498	NC_008378	GCA	2	6	244047	244052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248903
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