MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL12

Total Repeats: 19681

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008378	GGCA	2	8	200264	200271	25 %	0 %	50 %	25 %	116248863
4502	NC_008378	AGG	2	6	200302	200307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248863
4503	NC_008378	GTG	2	6	200355	200360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248863
4504	NC_008378	CGG	2	6	200363	200368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248863
4505	NC_008378	CG	3	6	200369	200374	0 %	0 %	50 %	50 %	116248863
4506	NC_008378	GCG	2	6	200380	200385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248863
4507	NC_008378	TGC	2	6	200419	200424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248863
4508	NC_008378	GAT	2	6	200483	200488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248863
4509	NC_008378	ATC	2	6	200499	200504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248863
4510	NC_008378	CGG	2	6	200576	200581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248863
4511	NC_008378	GA	3	6	200599	200604	50 %	0 %	50 %	0 %	116248863
4512	NC_008378	TGA	2	6	200607	200612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248863
4513	NC_008378	CGC	2	6	200620	200625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248864
4514	NC_008378	CGC	2	6	200668	200673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248864
4515	NC_008378	GGC	2	6	200677	200682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248864
4516	NC_008378	GTC	2	6	200690	200695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248864
4517	NC_008378	TCGCC	2	10	200703	200712	0 %	20 %	20 %	60 %	116248864
4518	NC_008378	CGG	2	6	200806	200811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248864
4519	NC_008378	GGC	2	6	200882	200887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248864
4520	NC_008378	GCTCG	2	10	200914	200923	0 %	20 %	40 %	40 %	116248864
4521	NC_008378	GAT	3	9	201016	201024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248864
4522	NC_008378	CGG	2	6	201058	201063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248864
4523	NC_008378	GCA	2	6	201108	201113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248864
4524	NC_008378	CTGATC	2	12	201137	201148	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116248864
4525	NC_008378	GCCA	2	8	201161	201168	25 %	0 %	25 %	50 %	116248864
4526	NC_008378	CAT	3	9	201313	201321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248864
4527	NC_008378	CTG	2	6	201368	201373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248864
4528	NC_008378	CGG	2	6	201397	201402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248864
4529	NC_008378	CGG	2	6	201415	201420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248864
4530	NC_008378	TGC	2	6	201459	201464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248864
4531	NC_008378	TC	3	6	201469	201474	0 %	50 %	0 %	50 %	116248864
4532	NC_008378	CAC	2	6	201511	201516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248864
4533	NC_008378	TCG	2	6	201540	201545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248864
4534	NC_008378	TGC	2	6	201552	201557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248864
4535	NC_008378	TCA	2	6	201576	201581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248864
4536	NC_008378	GCT	2	6	201720	201725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248865
4537	NC_008378	AC	3	6	201750	201755	50 %	0 %	0 %	50 %	116248865
4538	NC_008378	GC	3	6	201783	201788	0 %	0 %	50 %	50 %	116248865
4539	NC_008378	GCTC	2	8	201794	201801	0 %	25 %	25 %	50 %	116248865
4540	NC_008378	TCCG	2	8	201826	201833	0 %	25 %	25 %	50 %	116248865
4541	NC_008378	AATG	2	8	201885	201892	50 %	25 %	25 %	0 %	116248865
4542	NC_008378	GGC	2	6	201919	201924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248865
4543	NC_008378	ACA	2	6	201968	201973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116248865
4544	NC_008378	GAA	2	6	202008	202013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248865
4545	NC_008378	ACC	2	6	202058	202063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248865
4546	NC_008378	GCA	2	6	202077	202082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248865
4547	NC_008378	TGG	2	6	202094	202099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116248865
4548	NC_008378	ACA	2	6	202115	202120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116248865
4549	NC_008378	GAG	2	6	202156	202161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248865
4550	NC_008378	CATC	2	8	202209	202216	25 %	25 %	0 %	50 %	116248865
4551	NC_008378	CGC	2	6	202284	202289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248865
4552	NC_008378	TCA	2	6	202325	202330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248865
4553	NC_008378	GCC	2	6	202335	202340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248865
4554	NC_008378	CAA	2	6	202425	202430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116248865
4555	NC_008378	TCC	3	9	202648	202656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4556	NC_008378	GGC	2	6	202725	202730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_008378	TCGA	2	8	202734	202741	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4558	NC_008378	TGC	2	6	202800	202805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248866
4559	NC_008378	GGA	2	6	202806	202811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248866
4560	NC_008378	AAT	2	6	202840	202845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116248866
4561	NC_008378	GCC	2	6	202873	202878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248866
4562	NC_008378	CG	3	6	202913	202918	0 %	0 %	50 %	50 %	116248866
4563	NC_008378	CAT	2	6	202941	202946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248866
4564	NC_008378	ATG	2	6	202957	202962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248866
4565	NC_008378	CGT	2	6	202968	202973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248866
4566	NC_008378	TGA	2	6	203069	203074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248866
4567	NC_008378	CGG	2	6	203166	203171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248866
4568	NC_008378	GCT	2	6	203274	203279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248866
4569	NC_008378	GAA	2	6	203416	203421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248866
4570	NC_008378	CATG	2	8	203454	203461	25 %	25 %	25 %	25 %	116248866
4571	NC_008378	ATC	2	6	203494	203499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248866
4572	NC_008378	GGC	2	6	203509	203514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248866
4573	NC_008378	CCG	2	6	203628	203633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248866
4574	NC_008378	TGC	2	6	203636	203641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248866
4575	NC_008378	AGG	2	6	203642	203647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116248866
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4577	NC_008378	CGGG	2	8	203848	203855	0 %	0 %	75 %	25 %	116248867
4578	NC_008378	CGG	3	9	203871	203879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248867
4579	NC_008378	GCTG	2	8	203919	203926	0 %	25 %	50 %	25 %	116248867
4580	NC_008378	CCGT	2	8	203949	203956	0 %	25 %	25 %	50 %	116248867
4581	NC_008378	GCC	2	6	203975	203980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248867
4582	NC_008378	CGT	2	6	204040	204045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248867
4583	NC_008378	GCG	2	6	204046	204051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248867
4584	NC_008378	GTTC	2	8	204081	204088	0 %	50 %	25 %	25 %	116248867
4585	NC_008378	TCG	2	6	204146	204151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248867
4586	NC_008378	GAA	2	6	204167	204172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248867
4587	NC_008378	CGT	2	6	204187	204192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248867
4588	NC_008378	CGC	3	9	204234	204242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248867
4589	NC_008378	GC	3	6	204241	204246	0 %	0 %	50 %	50 %	116248867
4590	NC_008378	GCT	2	6	204273	204278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248867
4591	NC_008378	GCC	3	9	204301	204309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248867
4592	NC_008378	GGCTGC	2	12	204333	204344	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116248867
4593	NC_008378	GA	3	6	204356	204361	50 %	0 %	50 %	0 %	116248867
4594	NC_008378	CGT	2	6	204397	204402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248867
4595	NC_008378	GCGG	2	8	204519	204526	0 %	0 %	75 %	25 %	116248867
4596	NC_008378	GCA	2	6	204576	204581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248867
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4599	NC_008378	CGT	2	6	204714	204719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248867
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4601	NC_008378	GATC	2	8	204843	204850	25 %	25 %	25 %	25 %	116248867
4602	NC_008378	GAC	2	6	204868	204873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248867
4603	NC_008378	CAT	2	6	204993	204998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248867
4604	NC_008378	GCC	2	6	205054	205059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248867
4605	NC_008378	CGA	2	6	205062	205067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248867
4606	NC_008378	GC	3	6	205096	205101	0 %	0 %	50 %	50 %	116248867
4607	NC_008378	TTC	2	6	205106	205111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116248867
4608	NC_008378	CG	3	6	205143	205148	0 %	0 %	50 %	50 %	116248867
4609	NC_008378	GAA	2	6	205153	205158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248867
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4611	NC_008378	CAC	2	6	205194	205199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116248867
4612	NC_008378	CG	3	6	205254	205259	0 %	0 %	50 %	50 %	116248867
4613	NC_008378	GCG	2	6	205305	205310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248867
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4616	NC_008378	GCG	2	6	205412	205417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248867
4617	NC_008378	CGA	2	6	205446	205451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248867
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4619	NC_008378	GAT	2	6	205516	205521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116248867
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4621	NC_008378	CGCC	2	8	205598	205605	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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4851	NC_008378	GCCG	2	8	215406	215413	0 %	0 %	50 %	50 %	116248875
4852	NC_008378	CAT	2	6	215532	215537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248875
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4861	NC_008378	GAC	2	6	215857	215862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248875
4862	NC_008378	CCG	2	6	215879	215884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248875
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4984	NC_008378	AGA	2	6	221301	221306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248882
4985	NC_008378	CTC	2	6	221308	221313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116248882
4986	NC_008378	CAT	3	9	221326	221334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248882
4987	NC_008378	CAT	2	6	221343	221348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116248882
4988	NC_008378	GTC	2	6	221434	221439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248882
4989	NC_008378	CCGC	2	8	221459	221466	0 %	0 %	25 %	75 %	116248882
4990	NC_008378	GGC	2	6	221467	221472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116248882
4991	NC_008378	GCT	3	9	221481	221489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116248882
4992	NC_008378	GCCG	2	8	221597	221604	0 %	0 %	50 %	50 %	116248882
4993	NC_008378	CCTCGT	2	12	221628	221639	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	116248882
4994	NC_008378	CGC	2	6	221739	221744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248882
4995	NC_008378	CAG	2	6	221777	221782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4996	NC_008378	AGA	2	6	221809	221814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116248883
4997	NC_008378	GCC	2	6	221828	221833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248883
4998	NC_008378	AT	3	6	221840	221845	50 %	50 %	0 %	0 %	116248883
4999	NC_008378	CCG	2	6	221957	221962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116248883
5000	NC_008378	CAG	2	6	221982	221987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116248883

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