MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL3

Total Repeats: 7993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008271	GCTACG	2	12	149222	149233	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111026980
3502	NC_008271	CCA	2	6	149300	149305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026980
3503	NC_008271	TGA	2	6	149360	149365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026980
3504	NC_008271	TCG	2	6	149366	149371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026980
3505	NC_008271	CAA	2	6	149373	149378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026980
3506	NC_008271	CTG	2	6	149404	149409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026980
3507	NC_008271	CGAAAC	2	12	149598	149609	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	111026980
3508	NC_008271	GCG	2	6	149635	149640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026980
3509	NC_008271	CCG	2	6	149651	149656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026980
3510	NC_008271	AAG	2	6	149749	149754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026980
3511	NC_008271	GGC	2	6	149811	149816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026980
3512	NC_008271	GTTC	2	8	149852	149859	0 %	50 %	25 %	25 %	111026980
3513	NC_008271	TCG	2	6	149888	149893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026980
3514	NC_008271	GAA	2	6	149916	149921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026980
3515	NC_008271	ATCT	2	8	149926	149933	25 %	50 %	0 %	25 %	111026980
3516	NC_008271	GA	3	6	150092	150097	50 %	0 %	50 %	0 %	111026980
3517	NC_008271	GCT	2	6	150204	150209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026980
3518	NC_008271	CCA	2	6	150260	150265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026980
3519	NC_008271	TCG	2	6	150272	150277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026980
3520	NC_008271	CGA	2	6	150291	150296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026980
3521	NC_008271	ACT	2	6	150350	150355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026980
3522	NC_008271	GTC	2	6	150418	150423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026980
3523	NC_008271	GAG	2	6	150427	150432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026980
3524	NC_008271	CGA	2	6	150466	150471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_008271	TAG	2	6	150621	150626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_008271	TGA	2	6	150858	150863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026981
3527	NC_008271	CTA	2	6	150904	150909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026981
3528	NC_008271	TTC	2	6	150920	150925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026981
3529	NC_008271	CGCGG	2	10	150995	151004	0 %	0 %	60 %	40 %	111026981
3530	NC_008271	GGAA	2	8	151029	151036	50 %	0 %	50 %	0 %	111026981
3531	NC_008271	GC	3	6	151069	151074	0 %	0 %	50 %	50 %	111026981
3532	NC_008271	TTA	2	6	151078	151083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111026981
3533	NC_008271	AGA	2	6	151180	151185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026981
3534	NC_008271	TC	3	6	151210	151215	0 %	50 %	0 %	50 %	111026981
3535	NC_008271	AGG	2	6	151289	151294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026981
3536	NC_008271	TCCGC	2	10	151367	151376	0 %	20 %	20 %	60 %	111026981
3537	NC_008271	CCT	2	6	151410	151415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026981
3538	NC_008271	GC	3	6	151442	151447	0 %	0 %	50 %	50 %	111026981
3539	NC_008271	GCA	2	6	151464	151469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026981
3540	NC_008271	TCA	2	6	151477	151482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026981
3541	NC_008271	CAG	2	6	151501	151506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026981
3542	NC_008271	ATCT	2	8	151541	151548	25 %	50 %	0 %	25 %	111026981
3543	NC_008271	CGA	2	6	151550	151555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026981
3544	NC_008271	GGC	2	6	151565	151570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026981
3545	NC_008271	GATC	2	8	151628	151635	25 %	25 %	25 %	25 %	111026981
3546	NC_008271	TG	3	6	151655	151660	0 %	50 %	50 %	0 %	111026981
3547	NC_008271	TGG	2	6	151723	151728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026981
3548	NC_008271	TCA	2	6	151737	151742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026981
3549	NC_008271	GGA	3	9	151748	151756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026981
3550	NC_008271	AT	3	6	151846	151851	50 %	50 %	0 %	0 %	111026981
3551	NC_008271	GACTT	2	10	151935	151944	20 %	40 %	20 %	20 %	111026981
3552	NC_008271	ATC	2	6	151971	151976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026981
3553	NC_008271	TGA	2	6	152080	152085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026981
3554	NC_008271	CCG	2	6	152119	152124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026981
3555	NC_008271	GCC	2	6	152180	152185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3556	NC_008271	CCGCT	2	10	152229	152238	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3557	NC_008271	GAG	2	6	152266	152271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_008271	CGA	2	6	152288	152293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_008271	CCA	2	6	152301	152306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3560	NC_008271	CGG	2	6	152377	152382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_008271	ACCTG	2	10	152409	152418	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3562	NC_008271	GAT	2	6	152445	152450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_008271	GGA	2	6	152472	152477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026982
3564	NC_008271	CCG	2	6	152481	152486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026982
3565	NC_008271	CGT	2	6	152490	152495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026982
3566	NC_008271	GAA	2	6	152568	152573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026982
3567	NC_008271	ACCCG	2	10	152605	152614	20 %	0 %	20 %	60 %	111026982
3568	NC_008271	CGA	2	6	152634	152639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026982
3569	NC_008271	GCT	2	6	152667	152672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026982
3570	NC_008271	CCTA	2	8	152708	152715	25 %	25 %	0 %	50 %	111026982
3571	NC_008271	CG	3	6	152717	152722	0 %	0 %	50 %	50 %	111026982
3572	NC_008271	ATG	2	6	152736	152741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026982
3573	NC_008271	GCC	2	6	152763	152768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026983
3574	NC_008271	CGC	2	6	152885	152890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026983
3575	NC_008271	CGA	2	6	152939	152944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026983
3576	NC_008271	ACCC	2	8	152948	152955	25 %	0 %	0 %	75 %	111026983
3577	NC_008271	TCG	2	6	152962	152967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026983
3578	NC_008271	GCA	2	6	152999	153004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026983
3579	NC_008271	TCT	2	6	153010	153015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026983
3580	NC_008271	GGT	2	6	153017	153022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026983
3581	NC_008271	GAA	2	6	153026	153031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026983
3582	NC_008271	TCG	2	6	153044	153049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026983
3583	NC_008271	GAC	2	6	153069	153074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026983
3584	NC_008271	GGC	2	6	153082	153087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026983
3585	NC_008271	AGC	2	6	153100	153105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026983
3586	NC_008271	TCG	2	6	153200	153205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026983
3587	NC_008271	GCG	2	6	153247	153252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026983
3588	NC_008271	CGT	2	6	153291	153296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026983
3589	NC_008271	GTTCC	2	10	153318	153327	0 %	40 %	20 %	40 %	111026983
3590	NC_008271	TTC	2	6	153418	153423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026984
3591	NC_008271	TGC	2	6	153428	153433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026984
3592	NC_008271	AGC	2	6	153463	153468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026984
3593	NC_008271	TCG	2	6	153491	153496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026984
3594	NC_008271	ACC	2	6	153515	153520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026984
3595	NC_008271	GGC	2	6	153521	153526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026984
3596	NC_008271	GT	3	6	153614	153619	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_008271	GTCCAG	2	12	153658	153669	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_008271	TCT	2	6	153688	153693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_008271	TCC	2	6	153696	153701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3600	NC_008271	CAC	2	6	153720	153725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3601	NC_008271	CAC	2	6	153733	153738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3602	NC_008271	GC	3	6	153800	153805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3603	NC_008271	GAC	2	6	153849	153854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_008271	TTC	3	9	153926	153934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026985
3605	NC_008271	GCC	2	6	153941	153946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026985
3606	NC_008271	CA	3	6	153948	153953	50 %	0 %	0 %	50 %	111026985
3607	NC_008271	CTTC	2	8	153994	154001	0 %	50 %	0 %	50 %	111026985
3608	NC_008271	AC	3	6	154016	154021	50 %	0 %	0 %	50 %	111026985
3609	NC_008271	GTA	2	6	154076	154081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026985
3610	NC_008271	GCG	2	6	154110	154115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026985
3611	NC_008271	CGA	2	6	154138	154143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026985
3612	NC_008271	CGG	2	6	154145	154150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026985
3613	NC_008271	GAT	2	6	154323	154328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026986
3614	NC_008271	CTT	2	6	154329	154334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026986
3615	NC_008271	CAAC	2	8	154373	154380	50 %	0 %	0 %	50 %	111026986
3616	NC_008271	C	6	6	154436	154441	0 %	0 %	0 %	100 %	111026986
3617	NC_008271	CAC	2	6	154461	154466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026986
3618	NC_008271	TC	3	6	154529	154534	0 %	50 %	0 %	50 %	111026986
3619	NC_008271	GAT	2	6	154542	154547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026986
3620	NC_008271	GCAT	2	8	154588	154595	25 %	25 %	25 %	25 %	111026986
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3622	NC_008271	GTA	2	6	154662	154667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026986
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3747	NC_008271	GCC	2	6	160316	160321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026992
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3850	NC_008271	TCGA	2	8	164428	164435	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3852	NC_008271	TCG	2	6	164584	164589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3854	NC_008271	CGATT	2	10	164637	164646	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3855	NC_008271	CAC	2	6	164658	164663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3856	NC_008271	TC	3	6	164720	164725	0 %	50 %	0 %	50 %	111026995
3857	NC_008271	TCT	2	6	164764	164769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026995
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3991	NC_008271	CG	3	6	170594	170599	0 %	0 %	50 %	50 %	111026999
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