MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL3

Total Repeats: 7993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008271	AGTG	2	8	126528	126535	25 %	25 %	50 %	0 %	111026958
3002	NC_008271	AAC	2	6	126567	126572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026959
3003	NC_008271	TCG	2	6	126589	126594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026959
3004	NC_008271	GCAC	2	8	126610	126617	25 %	0 %	25 %	50 %	111026959
3005	NC_008271	ACA	2	6	126697	126702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026959
3006	NC_008271	TGC	2	6	126749	126754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026959
3007	NC_008271	GGA	2	6	126824	126829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026959
3008	NC_008271	GCC	2	6	126921	126926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026959
3009	NC_008271	TGC	2	6	126946	126951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026959
3010	NC_008271	GCG	2	6	127028	127033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026959
3011	NC_008271	AGC	2	6	127059	127064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026959
3012	NC_008271	GCC	2	6	127129	127134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3013	NC_008271	GTCG	2	8	127166	127173	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3014	NC_008271	TCG	2	6	127180	127185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_008271	CTA	2	6	127199	127204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_008271	ACG	2	6	127212	127217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_008271	GGT	2	6	127254	127259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026960
3018	NC_008271	TGC	2	6	127306	127311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026960
3019	NC_008271	CGC	2	6	127340	127345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026960
3020	NC_008271	CCG	2	6	127461	127466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026960
3021	NC_008271	GCG	2	6	127510	127515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026960
3022	NC_008271	TGA	2	6	127528	127533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026960
3023	NC_008271	TCA	2	6	127573	127578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026960
3024	NC_008271	CGG	2	6	127698	127703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026961
3025	NC_008271	CCA	2	6	127815	127820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026961
3026	NC_008271	CCA	2	6	127851	127856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026961
3027	NC_008271	CGG	2	6	127873	127878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026961
3028	NC_008271	CGCC	2	8	127887	127894	0 %	0 %	25 %	75 %	111026961
3029	NC_008271	CGC	2	6	127933	127938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026961
3030	NC_008271	GCA	2	6	128025	128030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026961
3031	NC_008271	CCAC	2	8	128078	128085	25 %	0 %	0 %	75 %	111026961
3032	NC_008271	CGG	2	6	128199	128204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_008271	ATG	2	6	128221	128226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_008271	GGT	2	6	128259	128264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_008271	TCGC	2	8	128298	128305	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3036	NC_008271	ACA	2	6	128322	128327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_008271	CTCG	2	8	128416	128423	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3038	NC_008271	CGT	2	6	128479	128484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_008271	GAT	2	6	128500	128505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_008271	CCG	2	6	128566	128571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3041	NC_008271	ATG	2	6	128681	128686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026962
3042	NC_008271	GCG	2	6	128687	128692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026962
3043	NC_008271	TGA	2	6	128694	128699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026962
3044	NC_008271	CGC	2	6	128719	128724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026962
3045	NC_008271	ACC	2	6	128735	128740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026962
3046	NC_008271	CG	3	6	128785	128790	0 %	0 %	50 %	50 %	111026962
3047	NC_008271	GAC	2	6	128791	128796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026962
3048	NC_008271	CGAGG	2	10	128797	128806	20 %	0 %	60 %	20 %	111026962
3049	NC_008271	CGA	2	6	128823	128828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026962
3050	NC_008271	GCA	2	6	128829	128834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026962
3051	NC_008271	CGC	2	6	128877	128882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026962
3052	NC_008271	CAGC	2	8	128910	128917	25 %	0 %	25 %	50 %	111026962
3053	NC_008271	ACC	2	6	128927	128932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026962
3054	NC_008271	GTC	2	6	128947	128952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026962
3055	NC_008271	AAG	2	6	128987	128992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026962
3056	NC_008271	ACCG	2	8	129010	129017	25 %	0 %	25 %	50 %	111026962
3057	NC_008271	ATT	2	6	129035	129040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111026962
3058	NC_008271	GAA	2	6	129065	129070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026962
3059	NC_008271	AGA	2	6	129091	129096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026962
3060	NC_008271	GGC	2	6	129133	129138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026962
3061	NC_008271	ACGC	2	8	129153	129160	25 %	0 %	25 %	50 %	111026962
3062	NC_008271	CCA	2	6	129174	129179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026962
3063	NC_008271	CGG	2	6	129277	129282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026962
3064	NC_008271	CCAG	2	8	129284	129291	25 %	0 %	25 %	50 %	111026962
3065	NC_008271	CCA	2	6	129306	129311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026962
3066	NC_008271	GCG	2	6	129390	129395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026962
3067	NC_008271	CTT	2	6	129415	129420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026962
3068	NC_008271	CGC	2	6	129421	129426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026962
3069	NC_008271	CCG	2	6	129528	129533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026962
3070	NC_008271	G	6	6	129570	129575	0 %	0 %	100 %	0 %	111026962
3071	NC_008271	CAT	2	6	129630	129635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026962
3072	NC_008271	CGA	2	6	129637	129642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026962
3073	NC_008271	CGGC	2	8	129705	129712	0 %	0 %	50 %	50 %	111026962
3074	NC_008271	CGA	2	6	129732	129737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026962
3075	NC_008271	CTT	2	6	129739	129744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026962
3076	NC_008271	CAG	2	6	129836	129841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026962
3077	NC_008271	AT	3	6	129853	129858	50 %	50 %	0 %	0 %	111026962
3078	NC_008271	GTC	2	6	129970	129975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026962
3079	NC_008271	TTC	2	6	130013	130018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026962
3080	NC_008271	CT	3	6	130027	130032	0 %	50 %	0 %	50 %	111026962
3081	NC_008271	AAC	2	6	130049	130054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026962
3082	NC_008271	TGGA	2	8	130069	130076	25 %	25 %	50 %	0 %	111026962
3083	NC_008271	CTG	2	6	130095	130100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026962
3084	NC_008271	TGG	2	6	130137	130142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026962
3085	NC_008271	GGAA	2	8	130168	130175	50 %	0 %	50 %	0 %	111026962
3086	NC_008271	ATC	2	6	130308	130313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026962
3087	NC_008271	TGC	2	6	130338	130343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026962
3088	NC_008271	CTA	2	6	130432	130437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026962
3089	NC_008271	CGT	2	6	130537	130542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026962
3090	NC_008271	CAACGA	2	12	130564	130575	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	111026962
3091	NC_008271	CAT	2	6	130579	130584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026962
3092	NC_008271	ACG	2	6	130623	130628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026963
3093	NC_008271	GGGTT	2	10	130640	130649	0 %	40 %	60 %	0 %	111026963
3094	NC_008271	C	6	6	130744	130749	0 %	0 %	0 %	100 %	111026963
3095	NC_008271	GCG	2	6	130829	130834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026963
3096	NC_008271	CTT	2	6	130851	130856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026963
3097	NC_008271	CGA	2	6	130857	130862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026963
3098	NC_008271	TCA	2	6	130931	130936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026963
3099	NC_008271	TAC	2	6	131008	131013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026963
3100	NC_008271	TTAG	2	8	131063	131070	25 %	50 %	25 %	0 %	111026963
3101	NC_008271	TCG	2	6	131078	131083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026963
3102	NC_008271	GAC	2	6	131107	131112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026963
3103	NC_008271	CTAC	2	8	131180	131187	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3104	NC_008271	CG	3	6	131287	131292	0 %	0 %	50 %	50 %	111026964
3105	NC_008271	CG	4	8	131298	131305	0 %	0 %	50 %	50 %	111026964
3106	NC_008271	AAGCCC	2	12	131336	131347	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	111026964
3107	NC_008271	CGG	2	6	131359	131364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026964
3108	NC_008271	ATC	2	6	131495	131500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026964
3109	NC_008271	GGT	2	6	131531	131536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026964
3110	NC_008271	CAC	2	6	131560	131565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026964
3111	NC_008271	ACC	3	9	131588	131596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026964
3112	NC_008271	CCG	2	6	131600	131605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026964
3113	NC_008271	AGC	2	6	131648	131653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026964
3114	NC_008271	CCG	2	6	131669	131674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026964
3115	NC_008271	CG	3	6	131700	131705	0 %	0 %	50 %	50 %	111026964
3116	NC_008271	CGG	2	6	131711	131716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026964
3117	NC_008271	CTG	2	6	131718	131723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026964
3118	NC_008271	CATC	2	8	131755	131762	25 %	25 %	0 %	50 %	111026964
3119	NC_008271	CCA	2	6	131782	131787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3120	NC_008271	GTG	2	6	131802	131807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_008271	G	6	6	131819	131824	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_008271	TGC	2	6	131833	131838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_008271	GTT	2	6	131918	131923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_008271	GACT	2	8	131955	131962	25 %	25 %	25 %	25 %	111026965
3125	NC_008271	TCTG	2	8	131987	131994	0 %	50 %	25 %	25 %	111026965
3126	NC_008271	CGG	2	6	132018	132023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026965
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3248	NC_008271	CGA	2	6	137731	137736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026970
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3258	NC_008271	CCGGT	2	10	138268	138277	0 %	20 %	40 %	40 %	111026971
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3491	NC_008271	CTT	2	6	148806	148811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026980
3492	NC_008271	CGGG	2	8	148854	148861	0 %	0 %	75 %	25 %	111026980
3493	NC_008271	TGG	2	6	148872	148877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026980
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