MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL3

Total Repeats: 7993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_008271	CGC	2	6	106416	106421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026935
2502	NC_008271	CGG	3	9	106494	106502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026935
2503	NC_008271	TGG	2	6	106538	106543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026935
2504	NC_008271	CCG	2	6	106562	106567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026935
2505	NC_008271	TGC	2	6	106640	106645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026935
2506	NC_008271	TGGG	2	8	106675	106682	0 %	25 %	75 %	0 %	111026935
2507	NC_008271	GCG	2	6	106726	106731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026935
2508	NC_008271	AC	3	6	106739	106744	50 %	0 %	0 %	50 %	111026935
2509	NC_008271	CCTA	2	8	106796	106803	25 %	25 %	0 %	50 %	111026935
2510	NC_008271	TGCG	2	8	106811	106818	0 %	25 %	50 %	25 %	111026935
2511	NC_008271	GCT	2	6	106859	106864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026935
2512	NC_008271	CGA	2	6	106881	106886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026935
2513	NC_008271	GGC	2	6	106895	106900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026935
2514	NC_008271	ACT	2	6	106903	106908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026935
2515	NC_008271	GCC	2	6	106958	106963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026935
2516	NC_008271	GCC	2	6	106982	106987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026935
2517	NC_008271	ACA	2	6	107033	107038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026935
2518	NC_008271	CCCA	2	8	107039	107046	25 %	0 %	0 %	75 %	111026935
2519	NC_008271	GCT	2	6	107114	107119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026935
2520	NC_008271	CGG	3	9	107126	107134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026935
2521	NC_008271	GGA	2	6	107188	107193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026935
2522	NC_008271	GA	3	6	107192	107197	50 %	0 %	50 %	0 %	111026935
2523	NC_008271	GCT	2	6	107205	107210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026935
2524	NC_008271	GA	3	6	107229	107234	50 %	0 %	50 %	0 %	111026935
2525	NC_008271	GCG	2	6	107312	107317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2526	NC_008271	GCC	2	6	107321	107326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2527	NC_008271	GGC	2	6	107343	107348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026936
2528	NC_008271	CCGGGT	2	12	107376	107387	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111026936
2529	NC_008271	GCC	2	6	107448	107453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026936
2530	NC_008271	CGT	2	6	107454	107459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026936
2531	NC_008271	CGC	3	9	107502	107510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026936
2532	NC_008271	CCG	2	6	107523	107528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026936
2533	NC_008271	ACCG	2	8	107593	107600	25 %	0 %	25 %	50 %	111026936
2534	NC_008271	CCGG	2	8	107619	107626	0 %	0 %	50 %	50 %	111026936
2535	NC_008271	ACCG	2	8	107695	107702	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2536	NC_008271	CGACC	2	10	107713	107722	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2537	NC_008271	ACC	2	6	107732	107737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2538	NC_008271	CGC	2	6	107748	107753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2539	NC_008271	CTG	2	6	107763	107768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2540	NC_008271	CCA	2	6	107769	107774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2541	NC_008271	CGCAA	2	10	107796	107805	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2542	NC_008271	GCGGTG	2	12	107842	107853	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	111026937
2543	NC_008271	CG	3	6	107860	107865	0 %	0 %	50 %	50 %	111026937
2544	NC_008271	CAG	2	6	107930	107935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026937
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2546	NC_008271	GGT	2	6	107978	107983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026937
2547	NC_008271	AGC	2	6	107998	108003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026937
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2549	NC_008271	GTC	2	6	108051	108056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026937
2550	NC_008271	CGT	2	6	108086	108091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026937
2551	NC_008271	GTC	2	6	108120	108125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026937
2552	NC_008271	ACG	2	6	108130	108135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026937
2553	NC_008271	CGG	3	9	108143	108151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026937
2554	NC_008271	CGT	2	6	108164	108169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026937
2555	NC_008271	GTC	2	6	108171	108176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026937
2556	NC_008271	GAT	2	6	108237	108242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026937
2557	NC_008271	CCG	2	6	108256	108261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026937
2558	NC_008271	AGT	2	6	108275	108280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026937
2559	NC_008271	CTT	2	6	108288	108293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026937
2560	NC_008271	TCAGC	2	10	108308	108317	20 %	20 %	20 %	40 %	111026937
2561	NC_008271	CGA	2	6	108442	108447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026937
2562	NC_008271	GTC	2	6	108525	108530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026938
2563	NC_008271	GCT	2	6	108535	108540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026938
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2565	NC_008271	TCA	2	6	108647	108652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026938
2566	NC_008271	CGGG	2	8	108657	108664	0 %	0 %	75 %	25 %	111026938
2567	NC_008271	GTG	3	9	108691	108699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026938
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2570	NC_008271	CCA	2	6	108752	108757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026938
2571	NC_008271	CCG	2	6	108791	108796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026938
2572	NC_008271	GCT	2	6	108804	108809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026938
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2575	NC_008271	GCC	2	6	109005	109010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2576	NC_008271	CGG	2	6	109018	109023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2577	NC_008271	CGG	2	6	109029	109034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2578	NC_008271	CGT	2	6	109054	109059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2579	NC_008271	GGA	2	6	109063	109068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_008271	CAG	2	6	109075	109080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2581	NC_008271	CGC	2	6	109106	109111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2582	NC_008271	CCG	2	6	109126	109131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2583	NC_008271	GGT	2	6	109146	109151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_008271	CACGC	2	10	109196	109205	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2585	NC_008271	CCATAG	2	12	109228	109239	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2587	NC_008271	CGA	2	6	109292	109297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026939
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2589	NC_008271	CCAC	2	8	109352	109359	25 %	0 %	0 %	75 %	111026939
2590	NC_008271	CGG	2	6	109381	109386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026939
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2592	NC_008271	CCG	2	6	109417	109422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026939
2593	NC_008271	TGCGG	2	10	109551	109560	0 %	20 %	60 %	20 %	111026939
2594	NC_008271	CAC	2	6	109563	109568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026939
2595	NC_008271	CGG	2	6	109601	109606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026939
2596	NC_008271	GCG	2	6	109613	109618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026939
2597	NC_008271	TCG	2	6	109673	109678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2598	NC_008271	TCC	2	6	109714	109719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2599	NC_008271	ATCGG	2	10	109779	109788	20 %	20 %	40 %	20 %	111026940
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2601	NC_008271	CCG	2	6	109901	109906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026940
2602	NC_008271	ACGA	2	8	109939	109946	50 %	0 %	25 %	25 %	111026940
2603	NC_008271	TTC	2	6	109949	109954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026940
2604	NC_008271	GTG	2	6	110075	110080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026940
2605	NC_008271	GGC	2	6	110136	110141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026940
2606	NC_008271	CCA	2	6	110146	110151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026940
2607	NC_008271	GCC	2	6	110176	110181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026940
2608	NC_008271	CTT	2	6	110196	110201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026940
2609	NC_008271	G	7	7	110279	110285	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_008271	AGG	2	6	110302	110307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_008271	CGCC	2	8	110440	110447	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2612	NC_008271	ACC	2	6	110470	110475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2613	NC_008271	GGCA	2	8	110485	110492	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2614	NC_008271	CGTAC	2	10	110515	110524	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2615	NC_008271	CGG	2	6	110589	110594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026941
2616	NC_008271	TCG	2	6	110610	110615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026941
2617	NC_008271	TCG	2	6	110688	110693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026941
2618	NC_008271	CGC	2	6	110785	110790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026941
2619	NC_008271	TGG	2	6	110795	110800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026941
2620	NC_008271	ACG	2	6	110856	110861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026941
2621	NC_008271	CCG	2	6	110865	110870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026941
2622	NC_008271	C	6	6	110887	110892	0 %	0 %	0 %	100 %	111026941
2623	NC_008271	GGCGCC	2	12	110893	110904	0 %	0 %	50 %	50 %	111026941
2624	NC_008271	CACCGA	3	18	110907	110924	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	111026941
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2743	NC_008271	CGGG	2	8	115470	115477	0 %	0 %	75 %	25 %	111026944
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2991	NC_008271	GAC	2	6	126083	126088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026958
2992	NC_008271	TC	3	6	126146	126151	0 %	50 %	0 %	50 %	111026958
2993	NC_008271	ACG	2	6	126195	126200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026958
2994	NC_008271	TGGG	2	8	126271	126278	0 %	25 %	75 %	0 %	111026958
2995	NC_008271	CCG	2	6	126302	126307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026958
2996	NC_008271	CCGA	2	8	126356	126363	25 %	0 %	25 %	50 %	111026958
2997	NC_008271	GCA	2	6	126407	126412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026958
2998	NC_008271	CTC	2	6	126416	126421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026958
2999	NC_008271	CGT	2	6	126427	126432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026958
3000	NC_008271	GCC	2	6	126494	126499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026958

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