MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL3

Total Repeats: 7993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_008271	ACG	2	6	311376	311381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7502	NC_008271	AC	3	6	311494	311499	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7503	NC_008271	CCGG	2	8	311526	311533	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7504	NC_008271	TCCG	2	8	311559	311566	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7505	NC_008271	GCC	2	6	311567	311572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7506	NC_008271	CACC	2	8	311655	311662	25 %	0 %	0 %	75 %	111027142
7507	NC_008271	CGAT	2	8	311699	311706	25 %	25 %	25 %	25 %	111027142
7508	NC_008271	TTC	3	9	311717	311725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111027142
7509	NC_008271	CGA	2	6	311879	311884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027142
7510	NC_008271	CGGC	2	8	311888	311895	0 %	0 %	50 %	50 %	111027142
7511	NC_008271	CAC	2	6	311945	311950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7512	NC_008271	ACG	2	6	311956	311961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7513	NC_008271	GAG	2	6	312011	312016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7514	NC_008271	CGA	2	6	312073	312078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027143
7515	NC_008271	TCT	2	6	312084	312089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111027143
7516	NC_008271	GGC	2	6	312101	312106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027143
7517	NC_008271	GTC	2	6	312125	312130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027143
7518	NC_008271	CGC	2	6	312199	312204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027143
7519	NC_008271	CAG	2	6	312221	312226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027143
7520	NC_008271	TGG	3	9	312249	312257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027143
7521	NC_008271	CG	3	6	312302	312307	0 %	0 %	50 %	50 %	111027143
7522	NC_008271	ACC	2	6	312386	312391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027143
7523	NC_008271	CGA	2	6	312397	312402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027143
7524	NC_008271	TCG	2	6	312405	312410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027143
7525	NC_008271	GCT	2	6	312474	312479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027143
7526	NC_008271	AGA	2	6	312487	312492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111027143
7527	NC_008271	CGC	2	6	312502	312507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027143
7528	NC_008271	CATG	2	8	312523	312530	25 %	25 %	25 %	25 %	111027143
7529	NC_008271	CGC	2	6	312562	312567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027143
7530	NC_008271	GCG	2	6	312578	312583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027143
7531	NC_008271	GGTGCG	2	12	312629	312640	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	111027143
7532	NC_008271	CG	4	8	312670	312677	0 %	0 %	50 %	50 %	111027143
7533	NC_008271	GAT	2	6	312731	312736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111027143
7534	NC_008271	GGT	2	6	312791	312796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027143
7535	NC_008271	TCG	2	6	312810	312815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027143
7536	NC_008271	TCC	2	6	312839	312844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111027143
7537	NC_008271	GAG	2	6	312857	312862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111027143
7538	NC_008271	CCA	2	6	312870	312875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027143
7539	NC_008271	ATCG	2	8	312886	312893	25 %	25 %	25 %	25 %	111027143
7540	NC_008271	CCGGAA	2	12	312911	312922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027143
7541	NC_008271	ATCC	2	8	312923	312930	25 %	25 %	0 %	50 %	111027143
7542	NC_008271	TCG	2	6	312957	312962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027143
7543	NC_008271	CAA	2	6	312994	312999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111027143
7544	NC_008271	CCA	2	6	313047	313052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027143
7545	NC_008271	GGT	2	6	313099	313104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027143
7546	NC_008271	GGC	2	6	313210	313215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027143
7547	NC_008271	CGG	2	6	313269	313274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7548	NC_008271	GGGT	2	8	313289	313296	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7549	NC_008271	CGG	2	6	313302	313307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7550	NC_008271	CCTC	2	8	313308	313315	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7551	NC_008271	GCG	2	6	313323	313328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7552	NC_008271	GCC	2	6	313337	313342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7553	NC_008271	TCCGA	2	10	313425	313434	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7554	NC_008271	ACG	2	6	313482	313487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7555	NC_008271	TGG	2	6	313497	313502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7556	NC_008271	ACC	2	6	313508	313513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7557	NC_008271	GACGT	2	10	313551	313560	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7558	NC_008271	CGG	2	6	313585	313590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7559	NC_008271	GTGC	2	8	313720	313727	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7560	NC_008271	GGT	2	6	313747	313752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7561	NC_008271	GTC	2	6	313766	313771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7562	NC_008271	CGT	2	6	313814	313819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027144
7563	NC_008271	CGA	2	6	313884	313889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027144
7564	NC_008271	CGG	2	6	313898	313903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027144
7565	NC_008271	CCAC	2	8	313917	313924	25 %	0 %	0 %	75 %	111027144
7566	NC_008271	ACA	2	6	314015	314020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111027144
7567	NC_008271	TCGA	2	8	314044	314051	25 %	25 %	25 %	25 %	111027144
7568	NC_008271	TCG	2	6	314117	314122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027144
7569	NC_008271	GGT	2	6	314136	314141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027144
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7571	NC_008271	CG	3	6	314218	314223	0 %	0 %	50 %	50 %	111027144
7572	NC_008271	GAT	2	6	314370	314375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111027144
7573	NC_008271	CTG	2	6	314425	314430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027144
7574	NC_008271	GGA	2	6	314454	314459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111027144
7575	NC_008271	CGG	2	6	314471	314476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027144
7576	NC_008271	CGCC	2	8	314486	314493	0 %	0 %	25 %	75 %	111027144
7577	NC_008271	TCA	2	6	314516	314521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111027144
7578	NC_008271	CG	3	6	314584	314589	0 %	0 %	50 %	50 %	111027144
7579	NC_008271	GAC	2	6	314668	314673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027144
7580	NC_008271	GTGC	2	8	314677	314684	0 %	25 %	50 %	25 %	111027144
7581	NC_008271	CGACAC	2	12	314691	314702	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	111027144
7582	NC_008271	GCCCA	2	10	314852	314861	20 %	0 %	20 %	60 %	111027145
7583	NC_008271	CCG	2	6	314920	314925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027145
7584	NC_008271	CTG	2	6	314949	314954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027145
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7589	NC_008271	CAC	3	9	315193	315201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027145
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7591	NC_008271	CGA	2	6	315261	315266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027145
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7593	NC_008271	CAC	2	6	315317	315322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027145
7594	NC_008271	GCC	2	6	315326	315331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027145
7595	NC_008271	GTCG	2	8	315359	315366	0 %	25 %	50 %	25 %	111027145
7596	NC_008271	TG	3	6	315403	315408	0 %	50 %	50 %	0 %	111027145
7597	NC_008271	AGA	2	6	315412	315417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111027145
7598	NC_008271	TGGT	2	8	315430	315437	0 %	50 %	50 %	0 %	111027145
7599	NC_008271	CCGG	2	8	315453	315460	0 %	0 %	50 %	50 %	111027145
7600	NC_008271	CGCT	2	8	315469	315476	0 %	25 %	25 %	50 %	111027145
7601	NC_008271	TCG	2	6	315550	315555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027145
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7604	NC_008271	CA	3	6	315895	315900	50 %	0 %	0 %	50 %	111027146
7605	NC_008271	GAG	2	6	316029	316034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111027146
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7608	NC_008271	CGA	2	6	316097	316102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027146
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7613	NC_008271	TG	4	8	316261	316268	0 %	50 %	50 %	0 %	111027146
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7618	NC_008271	CAGAC	2	10	316516	316525	40 %	0 %	20 %	40 %	111027146
7619	NC_008271	CGA	2	6	316646	316651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027146
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7621	NC_008271	ATG	2	6	316677	316682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111027146
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7623	NC_008271	AC	3	6	316791	316796	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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7991	NC_008271	TCGA	2	8	332249	332256	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7992	NC_008271	GAGCG	2	10	332307	332316	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7993	NC_008271	AGC	2	6	332349	332354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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