MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL3

Total Repeats: 7993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008271	CGA	2	6	231431	231436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027060
5502	NC_008271	ATC	2	6	231441	231446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111027060
5503	NC_008271	GTG	2	6	231564	231569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027060
5504	NC_008271	CGG	2	6	231578	231583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027060
5505	NC_008271	CGC	2	6	231599	231604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027060
5506	NC_008271	GCT	2	6	231608	231613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027060
5507	NC_008271	TCG	2	6	231646	231651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027060
5508	NC_008271	CAG	2	6	231675	231680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027060
5509	NC_008271	ACC	2	6	231734	231739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027061
5510	NC_008271	TCG	2	6	231795	231800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027061
5511	NC_008271	CGT	2	6	231810	231815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027061
5512	NC_008271	GTC	2	6	231856	231861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027061
5513	NC_008271	AGC	2	6	231909	231914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027061
5514	NC_008271	CGA	2	6	231948	231953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027061
5515	NC_008271	GCC	2	6	232003	232008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027061
5516	NC_008271	CGC	2	6	232009	232014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027061
5517	NC_008271	GAG	2	6	232019	232024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111027061
5518	NC_008271	ACACG	2	10	232063	232072	40 %	0 %	20 %	40 %	111027061
5519	NC_008271	ACG	2	6	232078	232083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027061
5520	NC_008271	GGCA	2	8	232098	232105	25 %	0 %	50 %	25 %	111027061
5521	NC_008271	GCC	2	6	232158	232163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5522	NC_008271	GCG	2	6	232285	232290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_008271	GAG	2	6	232323	232328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_008271	GAG	2	6	232355	232360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_008271	AGG	2	6	232441	232446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_008271	GGA	2	6	232469	232474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_008271	GAC	2	6	232487	232492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_008271	CCCGT	2	10	232503	232512	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5529	NC_008271	CGA	2	6	232532	232537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_008271	ACC	2	6	232555	232560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5531	NC_008271	CCCG	2	8	232619	232626	0 %	0 %	25 %	75 %	111027062
5532	NC_008271	GCC	2	6	232682	232687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027062
5533	NC_008271	AGCA	2	8	232748	232755	50 %	0 %	25 %	25 %	111027062
5534	NC_008271	CGC	2	6	232771	232776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027062
5535	NC_008271	CG	4	8	232780	232787	0 %	0 %	50 %	50 %	111027062
5536	NC_008271	GCA	2	6	232803	232808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027062
5537	NC_008271	CAC	2	6	232809	232814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027062
5538	NC_008271	AGC	2	6	232819	232824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027062
5539	NC_008271	TGA	2	6	232848	232853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111027062
5540	NC_008271	CGC	2	6	232891	232896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027062
5541	NC_008271	CCGG	2	8	232943	232950	0 %	0 %	50 %	50 %	111027062
5542	NC_008271	TCG	2	6	232981	232986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_008271	GC	3	6	233014	233019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5544	NC_008271	CGG	2	6	233093	233098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_008271	CGC	2	6	233215	233220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5546	NC_008271	CGA	2	6	233273	233278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_008271	TCG	2	6	233284	233289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_008271	GGC	2	6	233314	233319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_008271	CCG	2	6	233362	233367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5550	NC_008271	CCG	2	6	233372	233377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5551	NC_008271	CGGC	2	8	233391	233398	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5552	NC_008271	TG	3	6	233412	233417	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_008271	CCG	2	6	233436	233441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5554	NC_008271	GAA	2	6	233486	233491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_008271	AGC	2	6	233570	233575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027063
5556	NC_008271	GAG	2	6	233583	233588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111027063
5557	NC_008271	CCA	2	6	233593	233598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027063
5558	NC_008271	ACC	2	6	233634	233639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027063
5559	NC_008271	CA	3	6	233656	233661	50 %	0 %	0 %	50 %	111027063
5560	NC_008271	CAG	2	6	233694	233699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027063
5561	NC_008271	CGC	2	6	233717	233722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027063
5562	NC_008271	TTC	2	6	233742	233747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111027063
5563	NC_008271	GTC	2	6	233802	233807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027063
5564	NC_008271	CGA	2	6	233839	233844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027063
5565	NC_008271	TCG	2	6	233883	233888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027063
5566	NC_008271	ACG	2	6	233909	233914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027063
5567	NC_008271	CGG	2	6	233923	233928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027063
5568	NC_008271	CGT	3	9	233980	233988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027063
5569	NC_008271	GC	3	6	234030	234035	0 %	0 %	50 %	50 %	111027063
5570	NC_008271	GAG	2	6	234061	234066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111027063
5571	NC_008271	CTCGCA	2	12	234067	234078	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	111027063
5572	NC_008271	GGT	2	6	234081	234086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027063
5573	NC_008271	C	7	7	234161	234167	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5574	NC_008271	GAGATC	2	12	234229	234240	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	111027064
5575	NC_008271	GCG	2	6	234262	234267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027064
5576	NC_008271	CGT	2	6	234276	234281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027064
5577	NC_008271	GC	3	6	234326	234331	0 %	0 %	50 %	50 %	111027064
5578	NC_008271	TGC	2	6	234335	234340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027064
5579	NC_008271	CGGC	2	8	234377	234384	0 %	0 %	50 %	50 %	111027064
5580	NC_008271	GGT	2	6	234387	234392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027064
5581	NC_008271	CGG	2	6	234500	234505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027064
5582	NC_008271	TCCCGC	2	12	234555	234566	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	111027064
5583	NC_008271	ACC	2	6	234627	234632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111027065
5584	NC_008271	CGG	2	6	234638	234643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027065
5585	NC_008271	CACGAC	4	24	234650	234673	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	111027065
5586	NC_008271	CCG	2	6	234676	234681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027065
5587	NC_008271	CTG	2	6	234756	234761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027065
5588	NC_008271	AGC	2	6	234862	234867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027065
5589	NC_008271	GGT	2	6	234899	234904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027065
5590	NC_008271	CGC	2	6	235009	235014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027065
5591	NC_008271	CGA	2	6	235103	235108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027065
5592	NC_008271	CAA	2	6	235190	235195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111027065
5593	NC_008271	ACG	2	6	235204	235209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027065
5594	NC_008271	GAT	2	6	235211	235216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111027065
5595	NC_008271	TCG	2	6	235279	235284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027065
5596	NC_008271	CCG	2	6	235285	235290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027065
5597	NC_008271	GCT	2	6	235298	235303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027065
5598	NC_008271	GGC	2	6	235335	235340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027065
5599	NC_008271	ATG	2	6	235395	235400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111027065
5600	NC_008271	TCGCCC	2	12	235402	235413	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	111027065
5601	NC_008271	TCG	2	6	235438	235443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027065
5602	NC_008271	TCG	2	6	235473	235478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027065
5603	NC_008271	GCC	2	6	235485	235490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027065
5604	NC_008271	CCG	2	6	235510	235515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027065
5605	NC_008271	GTG	2	6	235524	235529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027065
5606	NC_008271	CCG	2	6	235561	235566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027065
5607	NC_008271	GCCG	2	8	235583	235590	0 %	0 %	50 %	50 %	111027065
5608	NC_008271	TTC	2	6	235626	235631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111027065
5609	NC_008271	CTT	2	6	235635	235640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111027065
5610	NC_008271	GC	3	6	235672	235677	0 %	0 %	50 %	50 %	111027065
5611	NC_008271	GGC	2	6	235680	235685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027065
5612	NC_008271	AC	3	6	235725	235730	50 %	0 %	0 %	50 %	111027065
5613	NC_008271	CGC	2	6	235735	235740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027065
5614	NC_008271	CGC	2	6	235745	235750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027065
5615	NC_008271	CTCC	2	8	235796	235803	0 %	25 %	0 %	75 %	111027065
5616	NC_008271	CTG	2	6	235806	235811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027065
5617	NC_008271	TCGA	2	8	235857	235864	25 %	25 %	25 %	25 %	111027065
5618	NC_008271	GGT	2	6	235865	235870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027065
5619	NC_008271	GC	3	6	235930	235935	0 %	0 %	50 %	50 %	111027065
5620	NC_008271	TGC	2	6	235942	235947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027065
5621	NC_008271	ATC	2	6	235950	235955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111027065
5622	NC_008271	CGA	2	6	235984	235989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027065
5623	NC_008271	GCC	2	6	235992	235997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027065
5624	NC_008271	CGAC	2	8	235999	236006	25 %	0 %	25 %	50 %	111027065
5625	NC_008271	GCCC	2	8	236033	236040	0 %	0 %	25 %	75 %	111027065
5626	NC_008271	CGG	2	6	236045	236050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027065
5627	NC_008271	TGC	2	6	236062	236067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027065
5628	NC_008271	CGG	2	6	236156	236161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111027065
5629	NC_008271	GCA	2	6	236186	236191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027065
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5631	NC_008271	CAT	2	6	236225	236230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111027065
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5633	NC_008271	GGT	2	6	236297	236302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111027065
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5641	NC_008271	CAT	2	6	236636	236641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111027065
5642	NC_008271	TCC	2	6	236656	236661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111027065
5643	NC_008271	CTG	2	6	236688	236693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027065
5644	NC_008271	TGC	2	6	236698	236703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111027065
5645	NC_008271	CGC	2	6	236720	236725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027065
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5648	NC_008271	GCAC	2	8	236817	236824	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5649	NC_008271	CG	3	6	236826	236831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5650	NC_008271	AGT	2	6	236851	236856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111027066
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5652	NC_008271	CGA	2	6	236890	236895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111027066
5653	NC_008271	GCATT	2	10	236901	236910	20 %	40 %	20 %	20 %	111027066
5654	NC_008271	CCG	2	6	236926	236931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111027066
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5660	NC_008271	TCC	2	6	237168	237173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5661	NC_008271	TCGACG	2	12	237176	237187	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5991	NC_008271	ACGC	2	8	248655	248662	25 %	0 %	25 %	50 %	111027083
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