MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL2

Total Repeats: 10065

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008270	CCG	2	6	155418	155423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026230
3502	NC_008270	CG	3	6	155422	155427	0 %	0 %	50 %	50 %	111026230
3503	NC_008270	CGA	2	6	155432	155437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026230
3504	NC_008270	CGAC	2	8	155452	155459	25 %	0 %	25 %	50 %	111026230
3505	NC_008270	CG	3	6	155467	155472	0 %	0 %	50 %	50 %	111026230
3506	NC_008270	AGG	2	6	155473	155478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026230
3507	NC_008270	CGT	2	6	155482	155487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026230
3508	NC_008270	CAG	2	6	155498	155503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026230
3509	NC_008270	TTC	2	6	155508	155513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026230
3510	NC_008270	TCG	2	6	155563	155568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026230
3511	NC_008270	AGGA	2	8	155574	155581	50 %	0 %	50 %	0 %	111026230
3512	NC_008270	CCG	2	6	155696	155701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026230
3513	NC_008270	ACC	2	6	155742	155747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026230
3514	NC_008270	GC	3	6	155750	155755	0 %	0 %	50 %	50 %	111026230
3515	NC_008270	GGT	2	6	155765	155770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026230
3516	NC_008270	TTG	2	6	155775	155780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026230
3517	NC_008270	GATCA	2	10	155852	155861	40 %	20 %	20 %	20 %	111026230
3518	NC_008270	CAC	2	6	155903	155908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026230
3519	NC_008270	GTC	2	6	155915	155920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026230
3520	NC_008270	GCA	2	6	156007	156012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026230
3521	NC_008270	GGTGAA	2	12	156110	156121	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	111026230
3522	NC_008270	CA	4	8	156135	156142	50 %	0 %	0 %	50 %	111026230
3523	NC_008270	CTC	2	6	156196	156201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3524	NC_008270	GCC	2	6	156217	156222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3525	NC_008270	GGCCAC	2	12	156232	156243	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3526	NC_008270	TGG	2	6	156314	156319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_008270	CGG	2	6	156369	156374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_008270	CGG	2	6	156452	156457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026231
3529	NC_008270	GCG	2	6	156479	156484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026231
3530	NC_008270	CCG	2	6	156485	156490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026231
3531	NC_008270	GCC	2	6	156517	156522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026231
3532	NC_008270	GGC	2	6	156527	156532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026231
3533	NC_008270	GGC	2	6	156552	156557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026231
3534	NC_008270	CGG	2	6	156561	156566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026231
3535	NC_008270	ACC	2	6	156595	156600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026231
3536	NC_008270	ATC	2	6	156628	156633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026231
3537	NC_008270	CG	4	8	156705	156712	0 %	0 %	50 %	50 %	111026231
3538	NC_008270	ACC	2	6	156718	156723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026231
3539	NC_008270	TCG	2	6	156842	156847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026231
3540	NC_008270	TGC	2	6	156974	156979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026231
3541	NC_008270	CTG	2	6	157021	157026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026231
3542	NC_008270	GCA	2	6	157044	157049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026231
3543	NC_008270	CAG	2	6	157094	157099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026231
3544	NC_008270	CGG	2	6	157110	157115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026231
3545	NC_008270	GAC	2	6	157222	157227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026231
3546	NC_008270	TCG	2	6	157304	157309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026231
3547	NC_008270	AGGA	2	8	157328	157335	50 %	0 %	50 %	0 %	111026231
3548	NC_008270	CG	3	6	157343	157348	0 %	0 %	50 %	50 %	111026231
3549	NC_008270	AC	3	6	157362	157367	50 %	0 %	0 %	50 %	111026231
3550	NC_008270	CAC	2	6	157377	157382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026231
3551	NC_008270	CCG	2	6	157394	157399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026231
3552	NC_008270	GCC	2	6	157421	157426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026231
3553	NC_008270	CGC	2	6	157454	157459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026231
3554	NC_008270	GGC	2	6	157463	157468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026231
3555	NC_008270	CGG	2	6	157487	157492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026231
3556	NC_008270	GCT	2	6	157512	157517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026231
3557	NC_008270	CGGGGA	2	12	157532	157543	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	111026231
3558	NC_008270	CCA	2	6	157569	157574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026231
3559	NC_008270	CGA	2	6	157611	157616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026231
3560	NC_008270	CGA	2	6	157743	157748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026231
3561	NC_008270	GCC	2	6	157860	157865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026231
3562	NC_008270	GCATC	2	10	157872	157881	20 %	20 %	20 %	40 %	111026231
3563	NC_008270	GAC	2	6	157882	157887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026231
3564	NC_008270	ACT	2	6	157908	157913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026231
3565	NC_008270	CT	3	6	157941	157946	0 %	50 %	0 %	50 %	111026231
3566	NC_008270	CGA	2	6	158007	158012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026231
3567	NC_008270	GGC	2	6	158022	158027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026231
3568	NC_008270	TCGA	2	8	158119	158126	25 %	25 %	25 %	25 %	111026231
3569	NC_008270	ACGCG	2	10	158127	158136	20 %	0 %	40 %	40 %	111026231
3570	NC_008270	CGG	2	6	158160	158165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026231
3571	NC_008270	CG	3	6	158199	158204	0 %	0 %	50 %	50 %	111026231
3572	NC_008270	TCG	2	6	158206	158211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026231
3573	NC_008270	CGA	2	6	158317	158322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026232
3574	NC_008270	CCG	2	6	158323	158328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026232
3575	NC_008270	GCC	2	6	158366	158371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026232
3576	NC_008270	CGA	2	6	158389	158394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026232
3577	NC_008270	AGC	2	6	158484	158489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026232
3578	NC_008270	TCC	2	6	158493	158498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026232
3579	NC_008270	CG	3	6	158508	158513	0 %	0 %	50 %	50 %	111026232
3580	NC_008270	GTC	4	12	158561	158572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026232
3581	NC_008270	TC	3	6	158574	158579	0 %	50 %	0 %	50 %	111026232
3582	NC_008270	GTC	2	6	158642	158647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026232
3583	NC_008270	CGT	2	6	158677	158682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026232
3584	NC_008270	GAC	2	6	158699	158704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026232
3585	NC_008270	TCC	2	6	158759	158764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026232
3586	NC_008270	ACA	2	6	158778	158783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3587	NC_008270	GTT	2	6	158800	158805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_008270	CG	3	6	158812	158817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3589	NC_008270	AGAC	2	8	158837	158844	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3590	NC_008270	AGC	2	6	158845	158850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_008270	CG	3	6	158857	158862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3592	NC_008270	CACC	2	8	158953	158960	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3593	NC_008270	CGC	2	6	159004	159009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026233
3594	NC_008270	CCGG	2	8	159062	159069	0 %	0 %	50 %	50 %	111026233
3595	NC_008270	TGG	2	6	159096	159101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026233
3596	NC_008270	GA	3	6	159118	159123	50 %	0 %	50 %	0 %	111026233
3597	NC_008270	CGG	2	6	159145	159150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026233
3598	NC_008270	CCCG	2	8	159172	159179	0 %	0 %	25 %	75 %	111026233
3599	NC_008270	CGC	2	6	159180	159185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026233
3600	NC_008270	AGC	2	6	159234	159239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026233
3601	NC_008270	TCC	2	6	159333	159338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026233
3602	NC_008270	ACG	2	6	159385	159390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_008270	GAC	2	6	159422	159427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_008270	CACT	2	8	159445	159452	25 %	25 %	0 %	50 %	111026234
3605	NC_008270	TCC	2	6	159492	159497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026234
3606	NC_008270	GAA	2	6	159536	159541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026234
3607	NC_008270	TTC	2	6	159545	159550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026234
3608	NC_008270	GAC	2	6	159559	159564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026234
3609	NC_008270	AGA	2	6	159584	159589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026234
3610	NC_008270	ATC	2	6	159593	159598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026234
3611	NC_008270	AGG	2	6	159626	159631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026234
3612	NC_008270	GAC	2	6	159648	159653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026234
3613	NC_008270	CGA	2	6	159658	159663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026234
3614	NC_008270	CAC	3	9	159762	159770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026234
3615	NC_008270	GGC	2	6	159858	159863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_008270	GAG	2	6	159879	159884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_008270	AC	3	6	159936	159941	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3618	NC_008270	GC	3	6	159944	159949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3619	NC_008270	GCT	2	6	160010	160015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_008270	CGG	2	6	160057	160062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_008270	GCC	2	6	160106	160111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3622	NC_008270	CAG	2	6	160177	160182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026235
3623	NC_008270	ACG	2	6	160230	160235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026235
3624	NC_008270	GCG	2	6	160292	160297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026235
3625	NC_008270	CGA	2	6	160348	160353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026235
3626	NC_008270	CGAG	2	8	160422	160429	25 %	0 %	50 %	25 %	111026235
3627	NC_008270	ACCA	2	8	160440	160447	50 %	0 %	0 %	50 %	111026235
3628	NC_008270	CG	3	6	160511	160516	0 %	0 %	50 %	50 %	111026235
3629	NC_008270	CGC	2	6	160526	160531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026235
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3631	NC_008270	TCC	2	6	160582	160587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3632	NC_008270	GAT	2	6	160630	160635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026236
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3657	NC_008270	CGA	3	9	161777	161785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3659	NC_008270	CGA	3	9	161815	161823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3662	NC_008270	AAC	2	6	161913	161918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3733	NC_008270	CG	3	6	165433	165438	0 %	0 %	50 %	50 %	111026240
3734	NC_008270	CCG	2	6	165459	165464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026240
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3988	NC_008270	ACG	2	6	176057	176062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3989	NC_008270	CGA	2	6	176133	176138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3990	NC_008270	ATC	2	6	176146	176151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3991	NC_008270	GTC	2	6	176194	176199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3992	NC_008270	TCG	2	6	176276	176281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3993	NC_008270	TCG	2	6	176305	176310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3994	NC_008270	TCT	2	6	176327	176332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3995	NC_008270	CTGCC	2	10	176381	176390	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3996	NC_008270	CTG	2	6	176406	176411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3997	NC_008270	GCT	2	6	176415	176420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3998	NC_008270	CT	3	6	176427	176432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3999	NC_008270	CGG	2	6	176436	176441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4000	NC_008270	GCG	2	6	176443	176448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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