MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL2

Total Repeats: 10065

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_008270	GACG	2	8	107996	108003	25 %	0 %	50 %	25 %	111026188
2502	NC_008270	TGGT	2	8	108017	108024	0 %	50 %	50 %	0 %	111026188
2503	NC_008270	CGG	2	6	108038	108043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026188
2504	NC_008270	GAT	2	6	108044	108049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026188
2505	NC_008270	CCGA	2	8	108076	108083	25 %	0 %	25 %	50 %	111026188
2506	NC_008270	AAG	2	6	108084	108089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026188
2507	NC_008270	GTC	2	6	108119	108124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026188
2508	NC_008270	GGA	2	6	108134	108139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026188
2509	NC_008270	TGG	2	6	108223	108228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026188
2510	NC_008270	CAC	2	6	108230	108235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026188
2511	NC_008270	ATC	2	6	108264	108269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026188
2512	NC_008270	AGC	2	6	108280	108285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026188
2513	NC_008270	CG	3	6	108400	108405	0 %	0 %	50 %	50 %	111026188
2514	NC_008270	GCAG	2	8	108418	108425	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2515	NC_008270	CAG	2	6	108501	108506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026189
2516	NC_008270	GA	3	6	108548	108553	50 %	0 %	50 %	0 %	111026189
2517	NC_008270	TCC	2	6	108562	108567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026189
2518	NC_008270	ATC	2	6	108598	108603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026189
2519	NC_008270	AG	3	6	108631	108636	50 %	0 %	50 %	0 %	111026189
2520	NC_008270	GCC	2	6	108666	108671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026189
2521	NC_008270	GGT	2	6	108678	108683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026189
2522	NC_008270	TCA	2	6	108716	108721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026189
2523	NC_008270	GACA	2	8	108732	108739	50 %	0 %	25 %	25 %	111026189
2524	NC_008270	CTC	2	6	108744	108749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026189
2525	NC_008270	CAC	2	6	108918	108923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026189
2526	NC_008270	CGGT	2	8	108968	108975	0 %	25 %	50 %	25 %	111026189
2527	NC_008270	CCA	2	6	108983	108988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026189
2528	NC_008270	CGT	2	6	108999	109004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026189
2529	NC_008270	TCC	2	6	109016	109021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026189
2530	NC_008270	GTC	2	6	109047	109052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026189
2531	NC_008270	AC	3	6	109053	109058	50 %	0 %	0 %	50 %	111026189
2532	NC_008270	ATC	2	6	109069	109074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026189
2533	NC_008270	CCA	2	6	109090	109095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026190
2534	NC_008270	TCG	2	6	109099	109104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026190
2535	NC_008270	TCCG	2	8	109135	109142	0 %	25 %	25 %	50 %	111026190
2536	NC_008270	AGGTCG	2	12	109203	109214	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	111026190
2537	NC_008270	GGC	2	6	109300	109305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026190
2538	NC_008270	CCG	2	6	109354	109359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026190
2539	NC_008270	TCG	2	6	109464	109469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026190
2540	NC_008270	TCG	2	6	109629	109634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026190
2541	NC_008270	CCT	2	6	109666	109671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026190
2542	NC_008270	GCTC	2	8	109771	109778	0 %	25 %	25 %	50 %	111026190
2543	NC_008270	CGA	2	6	109798	109803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026190
2544	NC_008270	CGT	2	6	109819	109824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026190
2545	NC_008270	GAC	2	6	109829	109834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026190
2546	NC_008270	CG	3	6	109957	109962	0 %	0 %	50 %	50 %	111026190
2547	NC_008270	GC	3	6	109976	109981	0 %	0 %	50 %	50 %	111026190
2548	NC_008270	GGT	2	6	109982	109987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026190
2549	NC_008270	TCG	2	6	110025	110030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026190
2550	NC_008270	CGA	2	6	110044	110049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026190
2551	NC_008270	TGC	2	6	110050	110055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026190
2552	NC_008270	CGA	2	6	110098	110103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026190
2553	NC_008270	CGA	2	6	110128	110133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026190
2554	NC_008270	CGG	2	6	110180	110185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026190
2555	NC_008270	CCA	2	6	110221	110226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026190
2556	NC_008270	GCG	2	6	110247	110252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026190
2557	NC_008270	TGC	2	6	110291	110296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026190
2558	NC_008270	AGA	2	6	110383	110388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026190
2559	NC_008270	ACC	2	6	110398	110403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026190
2560	NC_008270	AGC	2	6	110415	110420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026190
2561	NC_008270	GGT	2	6	110453	110458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026190
2562	NC_008270	CAGG	2	8	110460	110467	25 %	0 %	50 %	25 %	111026190
2563	NC_008270	AGC	2	6	110553	110558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026190
2564	NC_008270	CTGC	2	8	110563	110570	0 %	25 %	25 %	50 %	111026190
2565	NC_008270	CGT	2	6	110645	110650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026190
2566	NC_008270	GTC	2	6	110654	110659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026190
2567	NC_008270	GA	3	6	110683	110688	50 %	0 %	50 %	0 %	111026190
2568	NC_008270	CCGAT	2	10	110751	110760	20 %	20 %	20 %	40 %	111026190
2569	NC_008270	CG	3	6	110793	110798	0 %	0 %	50 %	50 %	111026190
2570	NC_008270	GGC	2	6	110897	110902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026190
2571	NC_008270	CGC	2	6	110918	110923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026190
2572	NC_008270	TCG	2	6	110931	110936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026190
2573	NC_008270	CCG	2	6	111004	111009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026190
2574	NC_008270	AGCG	2	8	111024	111031	25 %	0 %	50 %	25 %	111026190
2575	NC_008270	GCG	2	6	111052	111057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026190
2576	NC_008270	CGG	3	9	111085	111093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026190
2577	NC_008270	ACGC	2	8	111143	111150	25 %	0 %	25 %	50 %	111026190
2578	NC_008270	GGA	2	6	111154	111159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026190
2579	NC_008270	ACC	2	6	111193	111198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026190
2580	NC_008270	CGGCC	2	10	111264	111273	0 %	0 %	40 %	60 %	111026190
2581	NC_008270	CGG	2	6	111279	111284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026190
2582	NC_008270	CCAA	2	8	111290	111297	50 %	0 %	0 %	50 %	111026190
2583	NC_008270	CAT	2	6	111403	111408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026190
2584	NC_008270	GAG	2	6	111536	111541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026190
2585	NC_008270	GTC	2	6	111587	111592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026190
2586	NC_008270	CGCA	2	8	111683	111690	25 %	0 %	25 %	50 %	111026190
2587	NC_008270	CGTG	2	8	111859	111866	0 %	25 %	50 %	25 %	111026190
2588	NC_008270	CAG	2	6	111929	111934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026190
2589	NC_008270	CTG	2	6	112028	112033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026190
2590	NC_008270	CATC	2	8	112075	112082	25 %	25 %	0 %	50 %	111026190
2591	NC_008270	CCA	2	6	112162	112167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026190
2592	NC_008270	CGA	2	6	112196	112201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026190
2593	NC_008270	TAA	2	6	112223	112228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111026190
2594	NC_008270	TCG	2	6	112278	112283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026190
2595	NC_008270	TCC	2	6	112314	112319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026190
2596	NC_008270	TTC	2	6	112445	112450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026190
2597	NC_008270	TCG	2	6	112459	112464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026190
2598	NC_008270	GTC	2	6	112496	112501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026190
2599	NC_008270	GTC	2	6	112514	112519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026190
2600	NC_008270	GAC	2	6	112520	112525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026190
2601	NC_008270	GAA	2	6	112561	112566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026190
2602	NC_008270	GCG	2	6	112587	112592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026190
2603	NC_008270	CG	3	6	112598	112603	0 %	0 %	50 %	50 %	111026190
2604	NC_008270	TCG	2	6	112627	112632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026190
2605	NC_008270	TGC	2	6	112652	112657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026190
2606	NC_008270	AGT	2	6	112692	112697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026190
2607	NC_008270	GC	3	6	112710	112715	0 %	0 %	50 %	50 %	111026190
2608	NC_008270	GCGT	2	8	112851	112858	0 %	25 %	50 %	25 %	111026190
2609	NC_008270	GGC	2	6	112876	112881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026190
2610	NC_008270	GAC	2	6	112926	112931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026190
2611	NC_008270	TGCC	2	8	112977	112984	0 %	25 %	25 %	50 %	111026190
2612	NC_008270	GCG	2	6	112990	112995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026190
2613	NC_008270	GCG	2	6	113029	113034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026190
2614	NC_008270	GCA	2	6	113037	113042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026190
2615	NC_008270	CGC	2	6	113062	113067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026190
2616	NC_008270	GCC	2	6	113091	113096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026190
2617	NC_008270	CAG	2	6	113141	113146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026190
2618	NC_008270	CGA	2	6	113182	113187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026190
2619	NC_008270	CACC	2	8	113288	113295	25 %	0 %	0 %	75 %	111026190
2620	NC_008270	CGG	2	6	113311	113316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026190
2621	NC_008270	GAG	2	6	113432	113437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026190
2622	NC_008270	ATT	2	6	113447	113452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111026190
2623	NC_008270	ATG	2	6	113466	113471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026190
2624	NC_008270	CCG	2	6	113487	113492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026190
2625	NC_008270	TCGA	2	8	113562	113569	25 %	25 %	25 %	25 %	111026190
2626	NC_008270	ACGG	2	8	113620	113627	25 %	0 %	50 %	25 %	111026190
2627	NC_008270	GC	3	6	113654	113659	0 %	0 %	50 %	50 %	111026190
2628	NC_008270	GAGCC	2	10	113684	113693	20 %	0 %	40 %	40 %	111026190
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2631	NC_008270	CGT	3	9	113807	113815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026190
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2634	NC_008270	GCGG	2	8	113955	113962	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2635	NC_008270	CTG	2	6	113986	113991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2636	NC_008270	TGA	2	6	114093	114098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2638	NC_008270	CCT	2	6	114158	114163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2639	NC_008270	CTCG	2	8	114239	114246	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2640	NC_008270	CGT	2	6	114279	114284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026191
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2642	NC_008270	GCC	2	6	114476	114481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026191
2643	NC_008270	TGA	2	6	114486	114491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026191
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2660	NC_008270	GACT	2	8	115349	115356	25 %	25 %	25 %	25 %	111026192
2661	NC_008270	T	6	6	115379	115384	0 %	100 %	0 %	0 %	111026192
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2664	NC_008270	GTC	2	6	115749	115754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2726	NC_008270	CGACC	2	10	118827	118836	20 %	0 %	20 %	60 %	111026195
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2732	NC_008270	GCC	2	6	119113	119118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026195
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2734	NC_008270	G	7	7	119227	119233	0 %	0 %	100 %	0 %	111026195
2735	NC_008270	CAA	2	6	119289	119294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026195
2736	NC_008270	CGA	2	6	119325	119330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2737	NC_008270	GACC	2	8	119381	119388	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2738	NC_008270	CGAGGA	2	12	119454	119465	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2739	NC_008270	TCG	2	6	119524	119529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026196
2740	NC_008270	CG	4	8	119573	119580	0 %	0 %	50 %	50 %	111026196
2741	NC_008270	GC	3	6	119621	119626	0 %	0 %	50 %	50 %	111026196
2742	NC_008270	CGA	2	6	119630	119635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026196
2743	NC_008270	GGC	2	6	119667	119672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026196
2744	NC_008270	GAT	2	6	119705	119710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026196
2745	NC_008270	GC	4	8	119763	119770	0 %	0 %	50 %	50 %	111026196
2746	NC_008270	CGG	2	6	119870	119875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026196
2747	NC_008270	GCT	2	6	119927	119932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026196
2748	NC_008270	ATC	2	6	119970	119975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026196
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2753	NC_008270	TGC	2	6	120105	120110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026197
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2756	NC_008270	GCC	2	6	120247	120252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026197
2757	NC_008270	GGCTCG	2	12	120415	120426	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111026197
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2763	NC_008270	CCGGGG	2	12	120737	120748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2764	NC_008270	CCA	2	6	120749	120754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2765	NC_008270	ACG	2	6	120872	120877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026198
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2776	NC_008270	GTC	3	9	121376	121384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2777	NC_008270	GGCG	2	8	121408	121415	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2778	NC_008270	GAT	2	6	121487	121492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026199
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2780	NC_008270	GT	3	6	121525	121530	0 %	50 %	50 %	0 %	111026199
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2782	NC_008270	CGA	2	6	121561	121566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026199
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2801	NC_008270	TCGG	2	8	122379	122386	0 %	25 %	50 %	25 %	111026200
2802	NC_008270	GTG	2	6	122460	122465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2804	NC_008270	AGT	2	6	122561	122566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2805	NC_008270	CAG	2	6	122611	122616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2807	NC_008270	ACC	2	6	122707	122712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2808	NC_008270	TTCG	2	8	122734	122741	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2809	NC_008270	GAA	2	6	122772	122777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2810	NC_008270	TGA	2	6	122785	122790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2812	NC_008270	GCA	2	6	122824	122829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2813	NC_008270	GCGA	2	8	122856	122863	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2814	NC_008270	TGGAG	2	10	122960	122969	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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2826	NC_008270	GCTC	2	8	123869	123876	0 %	25 %	25 %	50 %	111026201
2827	NC_008270	TTTCT	2	10	123887	123896	0 %	80 %	0 %	20 %	111026201
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2835	NC_008270	CG	3	6	124310	124315	0 %	0 %	50 %	50 %	111026201
2836	NC_008270	GAAG	2	8	124348	124355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2837	NC_008270	ACG	2	6	124386	124391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026202
2838	NC_008270	CGTC	2	8	124400	124407	0 %	25 %	25 %	50 %	111026202
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2842	NC_008270	CCAC	2	8	124664	124671	25 %	0 %	0 %	75 %	111026202
2843	NC_008270	TCA	2	6	124686	124691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026202
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2852	NC_008270	CAC	2	6	125116	125121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026203
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2857	NC_008270	CCGACG	2	12	125249	125260	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	111026203
2858	NC_008270	GGC	2	6	125305	125310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026203
2859	NC_008270	TCT	2	6	125324	125329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026203
2860	NC_008270	CCT	2	6	125348	125353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026203
2861	NC_008270	GAC	2	6	125434	125439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026203
2862	NC_008270	CAC	2	6	125557	125562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026203
2863	NC_008270	GGTC	2	8	125577	125584	0 %	25 %	50 %	25 %	111026203
2864	NC_008270	ACC	2	6	125603	125608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026203
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2866	NC_008270	GCA	2	6	125664	125669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026203
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2988	NC_008270	CAC	2	6	132078	132083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026211
2989	NC_008270	CGA	2	6	132101	132106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026211
2990	NC_008270	GGC	2	6	132107	132112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026211
2991	NC_008270	GCT	2	6	132114	132119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026211
2992	NC_008270	T	6	6	132215	132220	0 %	100 %	0 %	0 %	111026211
2993	NC_008270	CG	3	6	132305	132310	0 %	0 %	50 %	50 %	111026211
2994	NC_008270	GAAG	2	8	132343	132350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2995	NC_008270	ACG	2	6	132381	132386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026212
2996	NC_008270	CGTC	2	8	132395	132402	0 %	25 %	25 %	50 %	111026212
2997	NC_008270	TCA	2	6	132411	132416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026212
2998	NC_008270	ACG	2	6	132471	132476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026212
2999	NC_008270	CTA	2	6	132583	132588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026212
3000	NC_008270	CCAC	2	8	132659	132666	25 %	0 %	0 %	75 %	111026212

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