MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL2

Total Repeats: 10065

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_008270	TCCGA	2	10	85860	85869	20 %	20 %	20 %	40 %	111026156
2003	NC_008270	CGT	3	9	85913	85921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026156
2004	NC_008270	GCA	2	6	85971	85976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026156
2005	NC_008270	GCG	2	6	86045	86050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026156
2006	NC_008270	CGC	2	6	86072	86077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026156
2007	NC_008270	GCG	2	6	86113	86118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026156
2008	NC_008270	CGA	2	6	86243	86248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026156
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2011	NC_008270	GATC	2	8	86330	86337	25 %	25 %	25 %	25 %	111026156
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2377	NC_008270	TCG	2	6	102068	102073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026180
2378	NC_008270	CGCACC	2	12	102163	102174	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	111026180
2379	NC_008270	CTT	2	6	102210	102215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026180
2380	NC_008270	TCA	2	6	102287	102292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026180
2381	NC_008270	CG	3	6	102307	102312	0 %	0 %	50 %	50 %	111026180
2382	NC_008270	TG	3	6	102432	102437	0 %	50 %	50 %	0 %	111026180
2383	NC_008270	CAT	2	6	102439	102444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026180
2384	NC_008270	TG	3	6	102521	102526	0 %	50 %	50 %	0 %	111026180
2385	NC_008270	GT	3	6	102554	102559	0 %	50 %	50 %	0 %	111026180
2386	NC_008270	CAG	2	6	102598	102603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026180
2387	NC_008270	GTC	2	6	102605	102610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026180
2388	NC_008270	CAC	2	6	102625	102630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026180
2389	NC_008270	CTG	2	6	102633	102638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026180
2390	NC_008270	TGC	2	6	102666	102671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026180
2391	NC_008270	CTG	2	6	102689	102694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026180
2392	NC_008270	CGG	2	6	102738	102743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026180
2393	NC_008270	CCG	2	6	102857	102862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026181
2394	NC_008270	ATG	2	6	102919	102924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026181
2395	NC_008270	CGA	2	6	103054	103059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026182
2396	NC_008270	TTG	2	6	103140	103145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026182
2397	NC_008270	CCGC	2	8	103206	103213	0 %	0 %	25 %	75 %	111026182
2398	NC_008270	TGC	2	6	103279	103284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026182
2399	NC_008270	GCC	2	6	103358	103363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026182
2400	NC_008270	GCCT	2	8	103418	103425	0 %	25 %	25 %	50 %	111026182
2401	NC_008270	CCA	2	6	103435	103440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026182
2402	NC_008270	CGTC	2	8	103455	103462	0 %	25 %	25 %	50 %	111026182
2403	NC_008270	CGC	2	6	103498	103503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026182
2404	NC_008270	CG	3	6	103576	103581	0 %	0 %	50 %	50 %	111026182
2405	NC_008270	CAC	2	6	103608	103613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026183
2406	NC_008270	CCA	2	6	103808	103813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026183
2407	NC_008270	CAG	2	6	103866	103871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026183
2408	NC_008270	GCAA	2	8	103873	103880	50 %	0 %	25 %	25 %	111026183
2409	NC_008270	AAC	2	6	103917	103922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026183
2410	NC_008270	GCA	2	6	103944	103949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2411	NC_008270	CGT	2	6	103997	104002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026184
2412	NC_008270	CGT	2	6	104099	104104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026184
2413	NC_008270	AGG	2	6	104151	104156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026184
2414	NC_008270	GAT	2	6	104175	104180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026184
2415	NC_008270	GGT	2	6	104226	104231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026184
2416	NC_008270	CGA	2	6	104294	104299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026184
2417	NC_008270	GCC	2	6	104335	104340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026184
2418	NC_008270	TGG	2	6	104351	104356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026184
2419	NC_008270	ACC	2	6	104361	104366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026184
2420	NC_008270	GCT	2	6	104465	104470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026184
2421	NC_008270	GCC	2	6	104488	104493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026184
2422	NC_008270	CAG	2	6	104565	104570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026184
2423	NC_008270	GCG	2	6	104656	104661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026184
2424	NC_008270	CCCGA	2	10	104719	104728	20 %	0 %	20 %	60 %	111026184
2425	NC_008270	GC	3	6	104906	104911	0 %	0 %	50 %	50 %	111026185
2426	NC_008270	TGCA	2	8	104924	104931	25 %	25 %	25 %	25 %	111026185
2427	NC_008270	GC	3	6	104974	104979	0 %	0 %	50 %	50 %	111026185
2428	NC_008270	CATCGT	2	12	104990	105001	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	111026185
2429	NC_008270	AGGTCG	2	12	105012	105023	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	111026185
2430	NC_008270	CAC	2	6	105032	105037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026185
2431	NC_008270	ATC	2	6	105038	105043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026185
2432	NC_008270	CGA	2	6	105088	105093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026185
2433	NC_008270	CGA	2	6	105124	105129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026185
2434	NC_008270	TGC	2	6	105137	105142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026185
2435	NC_008270	AGT	2	6	105246	105251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026185
2436	NC_008270	CGA	2	6	105373	105378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026185
2437	NC_008270	CCG	2	6	105380	105385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026185
2438	NC_008270	CGG	2	6	105433	105438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026185
2439	NC_008270	GGCA	2	8	105471	105478	25 %	0 %	50 %	25 %	111026185
2440	NC_008270	GCG	2	6	105516	105521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026185
2441	NC_008270	GT	3	6	105532	105537	0 %	50 %	50 %	0 %	111026185
2442	NC_008270	GTT	2	6	105582	105587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026185
2443	NC_008270	GGA	2	6	105629	105634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026186
2444	NC_008270	CGA	2	6	105650	105655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026186
2445	NC_008270	CGG	2	6	105659	105664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026186
2446	NC_008270	TGA	2	6	105792	105797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026186
2447	NC_008270	GCG	2	6	105808	105813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026186
2448	NC_008270	TGC	2	6	105822	105827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026186
2449	NC_008270	TCG	2	6	105883	105888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026186
2450	NC_008270	CGT	2	6	105909	105914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026186
2451	NC_008270	CT	3	6	105946	105951	0 %	50 %	0 %	50 %	111026186
2452	NC_008270	TCG	2	6	105953	105958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026186
2453	NC_008270	AGA	2	6	105985	105990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2454	NC_008270	CGG	2	6	106055	106060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026187
2455	NC_008270	CCCT	2	8	106189	106196	0 %	25 %	0 %	75 %	111026187
2456	NC_008270	CAT	2	6	106205	106210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026187
2457	NC_008270	GGC	2	6	106228	106233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026187
2458	NC_008270	GAA	2	6	106236	106241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026187
2459	NC_008270	CGA	3	9	106259	106267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026187
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2462	NC_008270	CGG	2	6	106416	106421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026187
2463	NC_008270	CGG	3	9	106460	106468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026187
2464	NC_008270	GAT	2	6	106473	106478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026187
2465	NC_008270	CGT	2	6	106493	106498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026187
2466	NC_008270	GCT	2	6	106517	106522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026187
2467	NC_008270	CGT	2	6	106595	106600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026187
2468	NC_008270	GCA	2	6	106655	106660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026187
2469	NC_008270	GTGC	2	8	106710	106717	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2470	NC_008270	CCA	2	6	106744	106749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2471	NC_008270	GTGTG	2	10	106821	106830	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
2472	NC_008270	TGACGT	2	12	106848	106859	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2473	NC_008270	CGA	2	6	106952	106957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026188
2474	NC_008270	GTCG	2	8	106976	106983	0 %	25 %	50 %	25 %	111026188
2475	NC_008270	GT	3	6	107016	107021	0 %	50 %	50 %	0 %	111026188
2476	NC_008270	CGT	2	6	107075	107080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026188
2477	NC_008270	GTCT	2	8	107161	107168	0 %	50 %	25 %	25 %	111026188
2478	NC_008270	CGG	2	6	107170	107175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026188
2479	NC_008270	TCG	2	6	107188	107193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026188
2480	NC_008270	GCG	2	6	107200	107205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026188
2481	NC_008270	CTT	2	6	107214	107219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026188
2482	NC_008270	GGA	2	6	107345	107350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026188
2483	NC_008270	CAA	2	6	107359	107364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026188
2484	NC_008270	CAC	2	6	107381	107386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026188
2485	NC_008270	CG	3	6	107387	107392	0 %	0 %	50 %	50 %	111026188
2486	NC_008270	CGTG	2	8	107460	107467	0 %	25 %	50 %	25 %	111026188
2487	NC_008270	TCC	2	6	107590	107595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026188
2488	NC_008270	GGA	2	6	107603	107608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026188
2489	NC_008270	CGG	2	6	107638	107643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026188
2490	NC_008270	GA	3	6	107683	107688	50 %	0 %	50 %	0 %	111026188
2491	NC_008270	CGGGTG	2	12	107703	107714	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	111026188
2492	NC_008270	CTC	2	6	107728	107733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026188
2493	NC_008270	CG	3	6	107750	107755	0 %	0 %	50 %	50 %	111026188
2494	NC_008270	AGC	2	6	107760	107765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026188
2495	NC_008270	GCA	2	6	107783	107788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026188
2496	NC_008270	CGC	2	6	107812	107817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026188
2497	NC_008270	CTGC	2	8	107838	107845	0 %	25 %	25 %	50 %	111026188
2498	NC_008270	TCTTGA	2	12	107855	107866	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	111026188
2499	NC_008270	CGT	2	6	107960	107965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026188
2500	NC_008270	AAC	2	6	107982	107987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026188

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