MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL2

Total Repeats: 10065

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008270	T	6	6	43927	43932	0 %	100 %	0 %	0 %	111026108
1002	NC_008270	TTC	2	6	43980	43985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026108
1003	NC_008270	GC	3	6	44055	44060	0 %	0 %	50 %	50 %	111026108
1004	NC_008270	ACC	2	6	44073	44078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026108
1005	NC_008270	GC	3	6	44112	44117	0 %	0 %	50 %	50 %	111026108
1006	NC_008270	CGA	2	6	44135	44140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026108
1007	NC_008270	ATC	2	6	44160	44165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026108
1008	NC_008270	GGC	2	6	44181	44186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026108
1009	NC_008270	CTC	2	6	44208	44213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026108
1010	NC_008270	ACG	2	6	44226	44231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026108
1011	NC_008270	GTG	2	6	44309	44314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026108
1012	NC_008270	C	6	6	44353	44358	0 %	0 %	0 %	100 %	111026108
1013	NC_008270	CGT	2	6	44389	44394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026108
1014	NC_008270	CAG	2	6	44411	44416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026108
1015	NC_008270	CCGG	2	8	44432	44439	0 %	0 %	50 %	50 %	111026108
1016	NC_008270	CGA	2	6	44462	44467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026108
1017	NC_008270	CGT	2	6	44468	44473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026108
1018	NC_008270	ATC	2	6	44508	44513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026108
1019	NC_008270	TGC	2	6	44579	44584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026108
1020	NC_008270	GGCC	2	8	44606	44613	0 %	0 %	50 %	50 %	111026108
1021	NC_008270	AC	3	6	44628	44633	50 %	0 %	0 %	50 %	111026108
1022	NC_008270	AGG	2	6	44688	44693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026109
1023	NC_008270	GCCG	2	8	44817	44824	0 %	0 %	50 %	50 %	111026109
1024	NC_008270	CTT	2	6	44832	44837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026109
1025	NC_008270	AG	3	6	44859	44864	50 %	0 %	50 %	0 %	111026109
1026	NC_008270	GTA	2	6	44911	44916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026109
1027	NC_008270	GGC	2	6	44953	44958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026109
1028	NC_008270	CCA	2	6	44973	44978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026109
1029	NC_008270	GAA	2	6	45004	45009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026109
1030	NC_008270	TCG	2	6	45029	45034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026109
1031	NC_008270	TCG	2	6	45092	45097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026109
1032	NC_008270	CCA	2	6	45105	45110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026109
1033	NC_008270	GTG	2	6	45191	45196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026109
1034	NC_008270	CAT	2	6	45252	45257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026109
1035	NC_008270	CG	3	6	45332	45337	0 %	0 %	50 %	50 %	111026109
1036	NC_008270	TTC	2	6	45361	45366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026109
1037	NC_008270	CGG	2	6	45448	45453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026109
1038	NC_008270	TTGG	2	8	45468	45475	0 %	50 %	50 %	0 %	111026109
1039	NC_008270	C	6	6	45555	45560	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1040	NC_008270	GGCA	2	8	45621	45628	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1041	NC_008270	GCA	2	6	45705	45710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026110
1042	NC_008270	CTC	2	6	45759	45764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026110
1043	NC_008270	GGCAC	2	10	45776	45785	20 %	0 %	40 %	40 %	111026110
1044	NC_008270	AGC	2	6	45821	45826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026110
1045	NC_008270	AGT	2	6	45899	45904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026110
1046	NC_008270	CGT	2	6	45953	45958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026110
1047	NC_008270	GCG	2	6	46026	46031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026110
1048	NC_008270	ACT	2	6	46035	46040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026110
1049	NC_008270	CGC	2	6	46061	46066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026110
1050	NC_008270	GCG	2	6	46110	46115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026110
1051	NC_008270	CT	3	6	46209	46214	0 %	50 %	0 %	50 %	111026110
1052	NC_008270	ACC	2	6	46266	46271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_008270	CTG	2	6	46283	46288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026111
1054	NC_008270	CG	5	10	46382	46391	0 %	0 %	50 %	50 %	111026111
1055	NC_008270	TCG	2	6	46431	46436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026111
1056	NC_008270	TGG	2	6	46437	46442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026111
1057	NC_008270	GC	3	6	46477	46482	0 %	0 %	50 %	50 %	111026111
1058	NC_008270	ACC	2	6	46484	46489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026111
1059	NC_008270	ACGA	2	8	46505	46512	50 %	0 %	25 %	25 %	111026111
1060	NC_008270	GCA	2	6	46516	46521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026111
1061	NC_008270	GCC	2	6	46550	46555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026111
1062	NC_008270	CGT	2	6	46612	46617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026111
1063	NC_008270	GCCG	2	8	46642	46649	0 %	0 %	50 %	50 %	111026111
1064	NC_008270	GTT	2	6	46685	46690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026111
1065	NC_008270	CCTCC	2	10	46738	46747	0 %	20 %	0 %	80 %	111026111
1066	NC_008270	AC	3	6	46785	46790	50 %	0 %	0 %	50 %	111026111
1067	NC_008270	GAC	2	6	46802	46807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026111
1068	NC_008270	CCA	2	6	46851	46856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026111
1069	NC_008270	CGC	2	6	46924	46929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026111
1070	NC_008270	CAC	2	6	47032	47037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026112
1071	NC_008270	GCCCTG	2	12	47045	47056	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	111026112
1072	NC_008270	ACCG	3	12	47062	47073	25 %	0 %	25 %	50 %	111026112
1073	NC_008270	TCG	2	6	47169	47174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026112
1074	NC_008270	GTC	2	6	47236	47241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026112
1075	NC_008270	GATGC	2	10	47282	47291	20 %	20 %	40 %	20 %	111026112
1076	NC_008270	CGA	2	6	47338	47343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026112
1077	NC_008270	TCG	2	6	47355	47360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026112
1078	NC_008270	GCCG	2	8	47363	47370	0 %	0 %	50 %	50 %	111026112
1079	NC_008270	GC	3	6	47464	47469	0 %	0 %	50 %	50 %	111026112
1080	NC_008270	CAG	2	6	47489	47494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026112
1081	NC_008270	TCT	2	6	47628	47633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026112
1082	NC_008270	TGC	2	6	47770	47775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026112
1083	NC_008270	CGA	2	6	47811	47816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026113
1084	NC_008270	CTT	2	6	47856	47861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026113
1085	NC_008270	GCC	2	6	48018	48023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026113
1086	NC_008270	AAGGTC	2	12	48031	48042	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	111026113
1087	NC_008270	AGAA	2	8	48068	48075	75 %	0 %	25 %	0 %	111026113
1088	NC_008270	GAA	2	6	48132	48137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026113
1089	NC_008270	GAG	2	6	48166	48171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026113
1090	NC_008270	GAA	2	6	48172	48177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026113
1091	NC_008270	AGA	2	6	48227	48232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026113
1092	NC_008270	CGG	2	6	48243	48248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026113
1093	NC_008270	TCG	2	6	48263	48268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026113
1094	NC_008270	AAG	3	9	48269	48277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026113
1095	NC_008270	TCG	2	6	48332	48337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026113
1096	NC_008270	GTC	2	6	48424	48429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026113
1097	NC_008270	CTC	2	6	48445	48450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026113
1098	NC_008270	CTG	2	6	48463	48468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026113
1099	NC_008270	CGG	2	6	48486	48491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026113
1100	NC_008270	CGC	2	6	48633	48638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026113
1101	NC_008270	GAT	2	6	48648	48653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026113
1102	NC_008270	GGT	2	6	48705	48710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026113
1103	NC_008270	CGG	3	9	48714	48722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026113
1104	NC_008270	GAATCG	2	12	48785	48796	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	111026113
1105	NC_008270	CGA	2	6	48822	48827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026113
1106	NC_008270	GCG	2	6	48875	48880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026113
1107	NC_008270	CAG	2	6	48952	48957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026113
1108	NC_008270	TCG	2	6	48971	48976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026113
1109	NC_008270	AGG	2	6	49032	49037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026113
1110	NC_008270	ACG	2	6	49045	49050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026113
1111	NC_008270	CGA	2	6	49230	49235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026113
1112	NC_008270	GTC	2	6	49237	49242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026113
1113	NC_008270	CGA	2	6	49257	49262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026113
1114	NC_008270	AAG	2	6	49264	49269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026113
1115	NC_008270	CCA	2	6	49280	49285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026113
1116	NC_008270	GCT	2	6	49338	49343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026113
1117	NC_008270	GCT	2	6	49350	49355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026113
1118	NC_008270	CGG	2	6	49359	49364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026113
1119	NC_008270	CGA	2	6	49407	49412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026113
1120	NC_008270	ACG	2	6	49427	49432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026113
1121	NC_008270	TAC	2	6	49477	49482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026114
1122	NC_008270	CCG	2	6	49526	49531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026114
1123	NC_008270	GCGCCG	2	12	49556	49567	0 %	0 %	50 %	50 %	111026114
1124	NC_008270	TCG	2	6	49606	49611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026114
1125	NC_008270	CGC	2	6	49619	49624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026114
1126	NC_008270	TCG	2	6	49630	49635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026114
1127	NC_008270	GTC	2	6	49637	49642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026114
1128	NC_008270	GCT	2	6	49682	49687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026114
1129	NC_008270	CAG	2	6	49728	49733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026114
1130	NC_008270	GGC	2	6	49745	49750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026114
1131	NC_008270	CAG	2	6	49778	49783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026114
1132	NC_008270	CAT	2	6	49814	49819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026114
1133	NC_008270	GAG	2	6	49848	49853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026114
1134	NC_008270	TCA	2	6	49864	49869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026114
1135	NC_008270	GCC	2	6	49870	49875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026114
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1137	NC_008270	CG	3	6	50042	50047	0 %	0 %	50 %	50 %	111026114
1138	NC_008270	CGC	2	6	50052	50057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026114
1139	NC_008270	CAT	2	6	50105	50110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026114
1140	NC_008270	CTG	2	6	50199	50204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026114
1141	NC_008270	CCA	2	6	50242	50247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026114
1142	NC_008270	CCG	2	6	50250	50255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026114
1143	NC_008270	GC	3	6	50398	50403	0 %	0 %	50 %	50 %	111026115
1144	NC_008270	TTC	2	6	50543	50548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026115
1145	NC_008270	CTG	2	6	50573	50578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026115
1146	NC_008270	TCG	2	6	50613	50618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026115
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1148	NC_008270	TCG	2	6	50820	50825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026115
1149	NC_008270	CAC	2	6	50851	50856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026115
1150	NC_008270	GC	3	6	50869	50874	0 %	0 %	50 %	50 %	111026115
1151	NC_008270	CGA	2	6	50911	50916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026115
1152	NC_008270	CAT	2	6	51016	51021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026115
1153	NC_008270	AGC	2	6	51115	51120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026115
1154	NC_008270	TCA	2	6	51174	51179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026115
1155	NC_008270	TGC	3	9	51180	51188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026115
1156	NC_008270	CAT	2	6	51205	51210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026115
1157	NC_008270	GCC	2	6	51237	51242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026116
1158	NC_008270	CCG	2	6	51272	51277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026116
1159	NC_008270	ATC	2	6	51294	51299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026116
1160	NC_008270	CCA	2	6	51342	51347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026116
1161	NC_008270	CAC	2	6	51355	51360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026116
1162	NC_008270	CCGC	2	8	51384	51391	0 %	0 %	25 %	75 %	111026116
1163	NC_008270	ACC	2	6	51401	51406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026116
1164	NC_008270	ATG	2	6	51422	51427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026116
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1166	NC_008270	CTC	2	6	51452	51457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026116
1167	NC_008270	CGG	2	6	51466	51471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026116
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1170	NC_008270	TCG	2	6	51558	51563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026116
1171	NC_008270	GA	3	6	51629	51634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1172	NC_008270	TGG	2	6	51682	51687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1173	NC_008270	CGC	2	6	51692	51697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1174	NC_008270	TGGCCG	2	12	51726	51737	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1175	NC_008270	AGCC	2	8	51761	51768	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1176	NC_008270	CAA	2	6	51772	51777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1177	NC_008270	CGA	2	6	51833	51838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026117
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1179	NC_008270	TTC	2	6	51921	51926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026117
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1181	NC_008270	AAC	2	6	52094	52099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026117
1182	NC_008270	TCG	2	6	52153	52158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026117
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1202	NC_008270	GCC	2	6	52927	52932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026119
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1225	NC_008270	GCC	2	6	53987	53992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026120
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1230	NC_008270	CCT	2	6	54137	54142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026120
1231	NC_008270	ATC	2	6	54182	54187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026120
1232	NC_008270	CGT	2	6	54191	54196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026120
1233	NC_008270	TGC	2	6	54224	54229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026120
1234	NC_008270	TCG	2	6	54257	54262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026120
1235	NC_008270	GCAA	2	8	54265	54272	50 %	0 %	25 %	25 %	111026120
1236	NC_008270	CCG	4	12	54278	54289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026120
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1238	NC_008270	AGCA	2	8	54334	54341	50 %	0 %	25 %	25 %	111026120
1239	NC_008270	GCC	2	6	54348	54353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026120
1240	NC_008270	CAC	3	9	54365	54373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026120
1241	NC_008270	CAC	2	6	54405	54410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026120
1242	NC_008270	CTG	2	6	54441	54446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026120
1243	NC_008270	TCG	2	6	54454	54459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026120
1244	NC_008270	TCG	2	6	54484	54489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026120
1245	NC_008270	CGA	2	6	54524	54529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026120
1246	NC_008270	CAC	2	6	54530	54535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026120
1247	NC_008270	CGA	2	6	54623	54628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026120
1248	NC_008270	TGC	2	6	54706	54711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026120
1249	NC_008270	TCG	2	6	54769	54774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026120
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1373	NC_008270	GGA	2	6	59712	59717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1374	NC_008270	TGA	2	6	59742	59747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1375	NC_008270	ACG	2	6	59758	59763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1376	NC_008270	ACC	2	6	59773	59778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1377	NC_008270	GGT	2	6	59827	59832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1379	NC_008270	GGA	2	6	59895	59900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1499	NC_008270	GTC	2	6	65285	65290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026130
1500	NC_008270	GACC	2	8	65302	65309	25 %	0 %	25 %	50 %	111026130

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