MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL2

Total Repeats: 10065

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008270	CGC	2	6	23395	23400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026091
502	NC_008270	TCGA	2	8	23420	23427	25 %	25 %	25 %	25 %	111026091
503	NC_008270	CCATC	2	10	23461	23470	20 %	20 %	0 %	60 %	111026091
504	NC_008270	GC	3	6	23525	23530	0 %	0 %	50 %	50 %	111026091
505	NC_008270	TCG	2	6	23606	23611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026091
506	NC_008270	TGC	2	6	23623	23628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026091
507	NC_008270	TGT	2	6	23659	23664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026091
508	NC_008270	CCT	2	6	23668	23673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026091
509	NC_008270	TCGGT	2	10	23703	23712	0 %	40 %	40 %	20 %	111026091
510	NC_008270	CGG	2	6	23746	23751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026091
511	NC_008270	CGG	2	6	23796	23801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026091
512	NC_008270	TCAGG	2	10	23885	23894	20 %	20 %	40 %	20 %	111026091
513	NC_008270	GTT	2	6	23959	23964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026091
514	NC_008270	TCAT	2	8	23986	23993	25 %	50 %	0 %	25 %	111026091
515	NC_008270	CAT	2	6	24007	24012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026092
516	NC_008270	CGC	2	6	24025	24030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026092
517	NC_008270	CAA	2	6	24040	24045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026092
518	NC_008270	GCT	2	6	24103	24108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026092
519	NC_008270	GCC	2	6	24119	24124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026092
520	NC_008270	TTC	2	6	24140	24145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026092
521	NC_008270	TCA	2	6	24186	24191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026092
522	NC_008270	GGT	2	6	24206	24211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026092
523	NC_008270	GCA	2	6	24212	24217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026092
524	NC_008270	GTC	2	6	24224	24229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026092
525	NC_008270	GAG	2	6	24263	24268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026092
526	NC_008270	CGC	2	6	24283	24288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026092
527	NC_008270	GCCGA	2	10	24302	24311	20 %	0 %	40 %	40 %	111026092
528	NC_008270	CGAC	2	8	24392	24399	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
529	NC_008270	TAGC	2	8	24429	24436	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
530	NC_008270	TGC	2	6	24489	24494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_008270	CGA	2	6	24501	24506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026093
532	NC_008270	CAC	2	6	24510	24515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026093
533	NC_008270	TCA	2	6	24524	24529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026093
534	NC_008270	AAG	2	6	24586	24591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026093
535	NC_008270	GCG	2	6	24629	24634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026093
536	NC_008270	TCG	2	6	24638	24643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026093
537	NC_008270	TTC	2	6	24706	24711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026093
538	NC_008270	GCCG	2	8	24760	24767	0 %	0 %	50 %	50 %	111026093
539	NC_008270	GCCG	2	8	24813	24820	0 %	0 %	50 %	50 %	111026093
540	NC_008270	GCC	2	6	24842	24847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026093
541	NC_008270	CCACC	2	10	24862	24871	20 %	0 %	0 %	80 %	111026093
542	NC_008270	GCC	2	6	24910	24915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026093
543	NC_008270	GTC	2	6	24931	24936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026093
544	NC_008270	CGC	3	9	24954	24962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026093
545	NC_008270	CGG	2	6	24983	24988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026093
546	NC_008270	CAC	2	6	24998	25003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026093
547	NC_008270	CCCA	2	8	25045	25052	25 %	0 %	0 %	75 %	111026093
548	NC_008270	GCCG	2	8	25057	25064	0 %	0 %	50 %	50 %	111026093
549	NC_008270	CTC	2	6	25081	25086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026093
550	NC_008270	GCT	2	6	25093	25098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026093
551	NC_008270	GCA	2	6	25317	25322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026094
552	NC_008270	CGT	2	6	25340	25345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026094
553	NC_008270	CTCGA	2	10	25413	25422	20 %	20 %	20 %	40 %	111026094
554	NC_008270	GTC	2	6	25485	25490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026094
555	NC_008270	TGA	3	9	25565	25573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026094
556	NC_008270	GCA	2	6	25676	25681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026094
557	NC_008270	CG	3	6	25690	25695	0 %	0 %	50 %	50 %	111026094
558	NC_008270	GCC	2	6	25755	25760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026094
559	NC_008270	CGA	2	6	25778	25783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026094
560	NC_008270	GA	3	6	25801	25806	50 %	0 %	50 %	0 %	111026094
561	NC_008270	TCG	2	6	25876	25881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026094
562	NC_008270	ACC	2	6	25882	25887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026094
563	NC_008270	CCT	2	6	25891	25896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026094
564	NC_008270	CTC	2	6	25905	25910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026094
565	NC_008270	CCG	2	6	25927	25932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026094
566	NC_008270	TTC	2	6	25959	25964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026094
567	NC_008270	GAC	2	6	25974	25979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026094
568	NC_008270	CCG	2	6	26023	26028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026094
569	NC_008270	GCGA	2	8	26042	26049	25 %	0 %	50 %	25 %	111026094
570	NC_008270	GC	4	8	26054	26061	0 %	0 %	50 %	50 %	111026094
571	NC_008270	CGG	2	6	26108	26113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026094
572	NC_008270	GCC	2	6	26136	26141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026094
573	NC_008270	GTT	2	6	26207	26212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026094
574	NC_008270	GAG	2	6	26232	26237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026094
575	NC_008270	CAG	2	6	26280	26285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026094
576	NC_008270	GGT	2	6	26294	26299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026094
577	NC_008270	TGG	2	6	26328	26333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026094
578	NC_008270	CAC	2	6	26387	26392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026094
579	NC_008270	CAC	2	6	26474	26479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026094
580	NC_008270	CAC	2	6	26499	26504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026094
581	NC_008270	GTC	2	6	26607	26612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026094
582	NC_008270	G	6	6	26619	26624	0 %	0 %	100 %	0 %	111026094
583	NC_008270	TCG	2	6	26707	26712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026094
584	NC_008270	GCA	2	6	26760	26765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026094
585	NC_008270	GTT	2	6	26783	26788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026094
586	NC_008270	CCT	2	6	26903	26908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026094
587	NC_008270	CGCCCA	2	12	26927	26938	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	111026094
588	NC_008270	CGCC	2	8	26966	26973	0 %	0 %	25 %	75 %	111026094
589	NC_008270	CGC	2	6	26981	26986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026094
590	NC_008270	CAT	2	6	27035	27040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026094
591	NC_008270	AGC	2	6	27088	27093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026094
592	NC_008270	CCGACC	2	12	27181	27192	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	111026094
593	NC_008270	GTT	2	6	27200	27205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026094
594	NC_008270	TCG	2	6	27208	27213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026094
595	NC_008270	CAC	2	6	27222	27227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026094
596	NC_008270	CGA	2	6	27239	27244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026094
597	NC_008270	TCG	2	6	27256	27261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026094
598	NC_008270	TGC	2	6	27271	27276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026094
599	NC_008270	GCC	2	6	27294	27299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026094
600	NC_008270	GC	3	6	27401	27406	0 %	0 %	50 %	50 %	111026094
601	NC_008270	GAC	2	6	27432	27437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026094
602	NC_008270	ACCGC	2	10	27503	27512	20 %	0 %	20 %	60 %	111026094
603	NC_008270	GTCG	2	8	27549	27556	0 %	25 %	50 %	25 %	111026094
604	NC_008270	GCT	2	6	27566	27571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026094
605	NC_008270	ACA	2	6	27619	27624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026094
606	NC_008270	CCGCGG	2	12	27642	27653	0 %	0 %	50 %	50 %	111026095
607	NC_008270	TCC	2	6	27656	27661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026095
608	NC_008270	GGT	2	6	27673	27678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026095
609	NC_008270	CCGCG	2	10	27712	27721	0 %	0 %	40 %	60 %	111026095
610	NC_008270	CTG	2	6	27734	27739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026095
611	NC_008270	GCTG	2	8	27810	27817	0 %	25 %	50 %	25 %	111026095
612	NC_008270	TGG	2	6	27827	27832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026095
613	NC_008270	CGGC	2	8	27870	27877	0 %	0 %	50 %	50 %	111026095
614	NC_008270	TGA	2	6	27885	27890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026095
615	NC_008270	CGG	4	12	27922	27933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026095
616	NC_008270	TTC	2	6	27944	27949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026095
617	NC_008270	GCG	2	6	28032	28037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026095
618	NC_008270	GAT	2	6	28045	28050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026095
619	NC_008270	CAT	2	6	28060	28065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026095
620	NC_008270	TCA	2	6	28116	28121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026095
621	NC_008270	GC	3	6	28168	28173	0 %	0 %	50 %	50 %	111026095
622	NC_008270	ATC	2	6	28262	28267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026095
623	NC_008270	CTC	2	6	28298	28303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026095
624	NC_008270	CGCGGC	2	12	28318	28329	0 %	0 %	50 %	50 %	111026095
625	NC_008270	TC	3	6	28339	28344	0 %	50 %	0 %	50 %	111026095
626	NC_008270	GAC	2	6	28370	28375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026095
627	NC_008270	GGT	2	6	28433	28438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026095
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756	NC_008270	GC	3	6	33509	33514	0 %	0 %	50 %	50 %	111026097
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759	NC_008270	CGC	2	6	33572	33577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026097
760	NC_008270	TTCGA	2	10	33727	33736	20 %	40 %	20 %	20 %	111026097
761	NC_008270	CGA	2	6	33842	33847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026097
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884	NC_008270	GAT	2	6	39030	39035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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