MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL2

Total Repeats: 10065

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_008270	CGG	2	6	307321	307326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026383
7002	NC_008270	TGC	2	6	307335	307340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026383
7003	NC_008270	CG	3	6	307372	307377	0 %	0 %	50 %	50 %	111026383
7004	NC_008270	TGG	2	6	307407	307412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026383
7005	NC_008270	CTG	3	9	307430	307438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026383
7006	NC_008270	CGG	2	6	307442	307447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026383
7007	NC_008270	GCT	3	9	307471	307479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026383
7008	NC_008270	CTG	2	6	307497	307502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026383
7009	NC_008270	GC	3	6	307504	307509	0 %	0 %	50 %	50 %	111026383
7010	NC_008270	CGG	2	6	307512	307517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026383
7011	NC_008270	CGGCG	2	10	307546	307555	0 %	0 %	60 %	40 %	111026383
7012	NC_008270	GGA	2	6	307708	307713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026383
7013	NC_008270	AGG	2	6	307719	307724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026383
7014	NC_008270	ACT	2	6	307786	307791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7015	NC_008270	CCGCTC	2	12	307812	307823	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
7016	NC_008270	CA	3	6	307893	307898	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7017	NC_008270	GGT	2	6	307905	307910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_008270	CGG	2	6	307932	307937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7019	NC_008270	GT	3	6	307956	307961	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_008270	GGC	2	6	307994	307999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7021	NC_008270	GCT	2	6	308028	308033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7022	NC_008270	GACC	2	8	308068	308075	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7023	NC_008270	AGC	2	6	308115	308120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7024	NC_008270	GCCGG	2	10	308178	308187	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7025	NC_008270	AGC	2	6	308196	308201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7026	NC_008270	TCG	2	6	308240	308245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7027	NC_008270	TCT	2	6	308277	308282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7028	NC_008270	TCG	2	6	308283	308288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7029	NC_008270	CGG	2	6	308347	308352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7030	NC_008270	GCCG	2	8	308364	308371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7031	NC_008270	AGCC	2	8	308397	308404	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7032	NC_008270	CAGGT	2	10	308417	308426	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7033	NC_008270	ACC	2	6	308472	308477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026384
7034	NC_008270	CG	3	6	308516	308521	0 %	0 %	50 %	50 %	111026384
7035	NC_008270	CCA	2	6	308533	308538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026384
7036	NC_008270	GCT	2	6	308575	308580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026384
7037	NC_008270	ACCG	2	8	308597	308604	25 %	0 %	25 %	50 %	111026384
7038	NC_008270	CGCC	2	8	308662	308669	0 %	0 %	25 %	75 %	111026384
7039	NC_008270	TAC	2	6	308739	308744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026384
7040	NC_008270	CGA	2	6	308765	308770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026384
7041	NC_008270	CCG	2	6	308818	308823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026384
7042	NC_008270	CGCCGG	2	12	308943	308954	0 %	0 %	50 %	50 %	111026384
7043	NC_008270	CAC	2	6	308974	308979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026384
7044	NC_008270	AGC	2	6	308983	308988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026384
7045	NC_008270	GGTC	2	8	308989	308996	0 %	25 %	50 %	25 %	111026384
7046	NC_008270	TCG	2	6	309000	309005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026384
7047	NC_008270	TTC	2	6	309134	309139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026385
7048	NC_008270	ACC	2	6	309159	309164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026385
7049	NC_008270	CG	3	6	309225	309230	0 %	0 %	50 %	50 %	111026385
7050	NC_008270	ATG	2	6	309265	309270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026385
7051	NC_008270	CAC	2	6	309357	309362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026385
7052	NC_008270	TCG	2	6	309391	309396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026385
7053	NC_008270	TCC	2	6	309400	309405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026385
7054	NC_008270	CCA	2	6	309419	309424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026385
7055	NC_008270	ACG	2	6	309433	309438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026385
7056	NC_008270	GCT	2	6	309462	309467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026385
7057	NC_008270	GCA	2	6	309551	309556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7058	NC_008270	ACC	2	6	309557	309562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7059	NC_008270	CAC	2	6	309577	309582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7060	NC_008270	CTCC	2	8	309606	309613	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7061	NC_008270	CAA	2	6	309687	309692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7062	NC_008270	ATG	2	6	309731	309736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_008270	AG	3	6	309771	309776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_008270	ATCGA	2	10	309831	309840	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7065	NC_008270	CGA	2	6	309877	309882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7066	NC_008270	TGA	2	6	309890	309895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7067	NC_008270	TCG	2	6	310008	310013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026386
7068	NC_008270	GCC	2	6	310046	310051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026386
7069	NC_008270	GGC	2	6	310058	310063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026386
7070	NC_008270	AGG	2	6	310140	310145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026386
7071	NC_008270	CGG	2	6	310195	310200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026386
7072	NC_008270	CGG	2	6	310204	310209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026386
7073	NC_008270	TCA	2	6	310227	310232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026386
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7075	NC_008270	GGA	2	6	310273	310278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026386
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7078	NC_008270	GTC	2	6	310373	310378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026386
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7080	NC_008270	CGA	2	6	310494	310499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026386
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7083	NC_008270	CGA	2	6	310570	310575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026386
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7087	NC_008270	CGG	2	6	310810	310815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026386
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7092	NC_008270	GAC	2	6	310981	310986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026386
7093	NC_008270	GGAC	2	8	311041	311048	25 %	0 %	50 %	25 %	111026386
7094	NC_008270	GC	3	6	311163	311168	0 %	0 %	50 %	50 %	111026386
7095	NC_008270	GC	3	6	311365	311370	0 %	0 %	50 %	50 %	111026387
7096	NC_008270	CGT	2	6	311374	311379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026387
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7099	NC_008270	TCG	2	6	311473	311478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026387
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7107	NC_008270	TGG	2	6	311854	311859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026387
7108	NC_008270	CGG	2	6	311918	311923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026387
7109	NC_008270	CTGG	2	8	311978	311985	0 %	25 %	50 %	25 %	111026387
7110	NC_008270	GCT	2	6	312029	312034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026387
7111	NC_008270	CG	3	6	312102	312107	0 %	0 %	50 %	50 %	111026387
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7117	NC_008270	CTCG	2	8	312230	312237	0 %	25 %	25 %	50 %	111026387
7118	NC_008270	CTG	2	6	312240	312245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026387
7119	NC_008270	TGC	2	6	312278	312283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026387
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7121	NC_008270	TGG	2	6	312358	312363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026387
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7123	NC_008270	GCA	2	6	312467	312472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026387
7124	NC_008270	GCT	2	6	312473	312478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026387
7125	NC_008270	GCC	2	6	312517	312522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026387
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7128	NC_008270	TCG	3	9	312604	312612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026387
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7130	NC_008270	TGC	2	6	312640	312645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026387
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7134	NC_008270	GCT	2	6	312818	312823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026387
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7138	NC_008270	CTG	2	6	313014	313019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026387
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7243	NC_008270	GAT	2	6	317172	317177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7244	NC_008270	GAC	2	6	317249	317254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7245	NC_008270	CGA	2	6	317372	317377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7246	NC_008270	CGT	2	6	317401	317406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7247	NC_008270	TGG	2	6	317452	317457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026392
7248	NC_008270	GCG	2	6	317458	317463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026392
7249	NC_008270	GGC	2	6	317469	317474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026392
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7270	NC_008270	GAC	2	6	318092	318097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026392
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7272	NC_008270	CTG	2	6	318115	318120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026392
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7287	NC_008270	CGAAT	2	10	318972	318981	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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7372	NC_008270	CAG	2	6	322596	322601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026397
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7374	NC_008270	TCG	2	6	322613	322618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026397
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7395	NC_008270	TCAG	2	8	323789	323796	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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7491	NC_008270	CCA	2	6	327743	327748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7492	NC_008270	CGC	2	6	327758	327763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7493	NC_008270	TG	3	6	327832	327837	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7494	NC_008270	GC	3	6	327841	327846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7495	NC_008270	CGTC	2	8	327917	327924	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7496	NC_008270	GCG	2	6	327950	327955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7497	NC_008270	CGC	2	6	327960	327965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7498	NC_008270	TCAT	2	8	328022	328029	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7499	NC_008270	CGG	2	6	328068	328073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026403
7500	NC_008270	CTG	2	6	328161	328166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026403

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