MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL2

Total Repeats: 10065

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008270	CAC	2	6	264987	264992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026342
6002	NC_008270	GCT	2	6	265008	265013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026342
6003	NC_008270	TCGG	2	8	265042	265049	0 %	25 %	50 %	25 %	111026342
6004	NC_008270	CCAC	2	8	265052	265059	25 %	0 %	0 %	75 %	111026342
6005	NC_008270	GGA	2	6	265152	265157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026342
6006	NC_008270	GAT	2	6	265158	265163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026342
6007	NC_008270	CTG	2	6	265201	265206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026342
6008	NC_008270	CACT	2	8	265255	265262	25 %	25 %	0 %	50 %	111026342
6009	NC_008270	CGG	2	6	265340	265345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026342
6010	NC_008270	GAA	2	6	265407	265412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026342
6011	NC_008270	ACC	2	6	265420	265425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026342
6012	NC_008270	CG	3	6	265428	265433	0 %	0 %	50 %	50 %	111026342
6013	NC_008270	GAG	2	6	265552	265557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026342
6014	NC_008270	CGC	2	6	265671	265676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026342
6015	NC_008270	CGA	2	6	265686	265691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026342
6016	NC_008270	CCG	2	6	265695	265700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026342
6017	NC_008270	CCG	3	9	265724	265732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026342
6018	NC_008270	CGG	2	6	265766	265771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026342
6019	NC_008270	GGA	2	6	265827	265832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026342
6020	NC_008270	CGC	2	6	265854	265859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026342
6021	NC_008270	TGC	2	6	265868	265873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026342
6022	NC_008270	CAC	2	6	265915	265920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026342
6023	NC_008270	CAC	2	6	265944	265949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026342
6024	NC_008270	GGT	2	6	265956	265961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026342
6025	NC_008270	GCT	2	6	265965	265970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026342
6026	NC_008270	CTG	2	6	266005	266010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026342
6027	NC_008270	ATC	2	6	266047	266052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026342
6028	NC_008270	CAC	2	6	266067	266072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026342
6029	NC_008270	ACG	2	6	266099	266104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026342
6030	NC_008270	CGC	2	6	266123	266128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026342
6031	NC_008270	GCT	2	6	266136	266141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026342
6032	NC_008270	GCTACG	2	12	266153	266164	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111026342
6033	NC_008270	GAC	2	6	266233	266238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026342
6034	NC_008270	TCA	2	6	266291	266296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026342
6035	NC_008270	CCA	2	6	266320	266325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026342
6036	NC_008270	CA	3	6	266324	266329	50 %	0 %	0 %	50 %	111026342
6037	NC_008270	CGA	2	6	266394	266399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026342
6038	NC_008270	CGG	3	9	266431	266439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026342
6039	NC_008270	CGA	2	6	266454	266459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026342
6040	NC_008270	CGC	2	6	266649	266654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026342
6041	NC_008270	GGCT	2	8	266680	266687	0 %	25 %	50 %	25 %	111026342
6042	NC_008270	CGC	3	9	266718	266726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026342
6043	NC_008270	CCTG	2	8	266880	266887	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6044	NC_008270	CCG	2	6	266889	266894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6045	NC_008270	CCA	2	6	266901	266906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6046	NC_008270	CGC	2	6	266972	266977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6047	NC_008270	GCC	2	6	267006	267011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6048	NC_008270	CGA	2	6	267026	267031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_008270	CAC	2	6	267053	267058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6050	NC_008270	CCG	2	6	267059	267064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6051	NC_008270	CGG	2	6	267070	267075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_008270	GAA	2	6	267087	267092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026343
6053	NC_008270	GCC	2	6	267117	267122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026343
6054	NC_008270	CA	3	6	267124	267129	50 %	0 %	0 %	50 %	111026343
6055	NC_008270	ACA	2	6	267164	267169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026343
6056	NC_008270	GAT	2	6	267174	267179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026343
6057	NC_008270	CG	3	6	267241	267246	0 %	0 %	50 %	50 %	111026343
6058	NC_008270	TCG	3	9	267272	267280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026343
6059	NC_008270	CCA	2	6	267282	267287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026343
6060	NC_008270	CG	3	6	267312	267317	0 %	0 %	50 %	50 %	111026343
6061	NC_008270	CGG	2	6	267322	267327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026343
6062	NC_008270	GCCC	2	8	267328	267335	0 %	0 %	25 %	75 %	111026343
6063	NC_008270	CGA	2	6	267353	267358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026343
6064	NC_008270	CGC	2	6	267367	267372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026343
6065	NC_008270	CCGG	2	8	267375	267382	0 %	0 %	50 %	50 %	111026343
6066	NC_008270	CGGTGC	2	12	267440	267451	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111026343
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6068	NC_008270	GCC	2	6	267471	267476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026343
6069	NC_008270	GCT	2	6	267533	267538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026343
6070	NC_008270	CGC	3	9	267572	267580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026343
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6072	NC_008270	CACC	2	8	267653	267660	25 %	0 %	0 %	75 %	111026343
6073	NC_008270	CGA	2	6	267665	267670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026343
6074	NC_008270	CCG	2	6	267694	267699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026343
6075	NC_008270	CCGA	2	8	267726	267733	25 %	0 %	25 %	50 %	111026343
6076	NC_008270	GGCGCC	2	12	267759	267770	0 %	0 %	50 %	50 %	111026343
6077	NC_008270	TGC	2	6	267817	267822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6078	NC_008270	AGG	2	6	267858	267863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_008270	CTA	2	6	267904	267909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026344
6080	NC_008270	GCC	2	6	267917	267922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026344
6081	NC_008270	GC	4	8	267933	267940	0 %	0 %	50 %	50 %	111026344
6082	NC_008270	GGCG	2	8	267976	267983	0 %	0 %	75 %	25 %	111026344
6083	NC_008270	GCAA	2	8	268029	268036	50 %	0 %	25 %	25 %	111026344
6084	NC_008270	TGA	2	6	268089	268094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_008270	TCG	2	6	268190	268195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_008270	ACG	2	6	268196	268201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6087	NC_008270	TGC	2	6	268209	268214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026345
6088	NC_008270	ACG	2	6	268259	268264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026345
6089	NC_008270	ATCGA	2	10	268271	268280	40 %	20 %	20 %	20 %	111026345
6090	NC_008270	GGC	2	6	268369	268374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026345
6091	NC_008270	GGC	2	6	268386	268391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6092	NC_008270	GGT	2	6	268408	268413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_008270	GTT	2	6	268435	268440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_008270	CTC	2	6	268454	268459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6095	NC_008270	AGCG	2	8	268645	268652	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6096	NC_008270	GGC	2	6	268810	268815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026346
6097	NC_008270	GGGC	2	8	268823	268830	0 %	0 %	75 %	25 %	111026346
6098	NC_008270	GCG	2	6	268869	268874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026346
6099	NC_008270	CGC	2	6	268876	268881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026346
6100	NC_008270	GAG	2	6	268891	268896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026346
6101	NC_008270	GGCCTG	2	12	268927	268938	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111026346
6102	NC_008270	ACC	2	6	268971	268976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026346
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6104	NC_008270	GGGA	2	8	268988	268995	25 %	0 %	75 %	0 %	111026346
6105	NC_008270	CCG	2	6	269030	269035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026346
6106	NC_008270	CTG	2	6	269037	269042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026346
6107	NC_008270	GCCA	2	8	269209	269216	25 %	0 %	25 %	50 %	111026347
6108	NC_008270	GGT	2	6	269277	269282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026347
6109	NC_008270	CCG	2	6	269308	269313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026347
6110	NC_008270	GCC	2	6	269316	269321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026347
6111	NC_008270	CCGA	2	8	269346	269353	25 %	0 %	25 %	50 %	111026347
6112	NC_008270	CGG	2	6	269404	269409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026347
6113	NC_008270	ACCG	2	8	269442	269449	25 %	0 %	25 %	50 %	111026347
6114	NC_008270	CGA	2	6	269453	269458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026347
6115	NC_008270	GGGCA	2	10	269463	269472	20 %	0 %	60 %	20 %	111026347
6116	NC_008270	CGG	2	6	269477	269482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026347
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6118	NC_008270	CGT	2	6	269561	269566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026347
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6120	NC_008270	CGT	2	6	269627	269632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026347
6121	NC_008270	CGC	3	9	269693	269701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026347
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6123	NC_008270	GC	3	6	269796	269801	0 %	0 %	50 %	50 %	111026347
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6156	NC_008270	TCC	2	6	271259	271264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6157	NC_008270	GTC	2	6	271298	271303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026349
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6361	NC_008270	TTG	2	6	280145	280150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026358
6362	NC_008270	CTGG	2	8	280202	280209	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6363	NC_008270	TTGGG	2	10	280211	280220	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
6364	NC_008270	CGG	2	6	280248	280253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6365	NC_008270	CGC	2	6	280260	280265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026359
6366	NC_008270	TTC	2	6	280399	280404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026359
6367	NC_008270	GGT	2	6	280408	280413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026359
6368	NC_008270	GCG	2	6	280421	280426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026359
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6370	NC_008270	GC	3	6	280523	280528	0 %	0 %	50 %	50 %	111026359
6371	NC_008270	GCA	2	6	280580	280585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026359
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6379	NC_008270	CTG	2	6	281007	281012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6380	NC_008270	GTC	2	6	281033	281038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026360
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6385	NC_008270	GCC	2	6	281345	281350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6386	NC_008270	CGT	3	9	281478	281486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6391	NC_008270	CGG	2	6	281625	281630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6392	NC_008270	CCCGT	2	10	281653	281662	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6393	NC_008270	GCT	2	6	281685	281690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6394	NC_008270	ACCGA	2	10	281701	281710	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6395	NC_008270	GGT	2	6	281739	281744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6396	NC_008270	TCC	2	6	281753	281758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6491	NC_008270	CCT	2	6	285205	285210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026363
6492	NC_008270	TTG	2	6	285245	285250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026363
6493	NC_008270	CG	3	6	285282	285287	0 %	0 %	50 %	50 %	111026363
6494	NC_008270	GCG	2	6	285420	285425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026363
6495	NC_008270	CCA	2	6	285427	285432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026363
6496	NC_008270	CTG	2	6	285443	285448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026363
6497	NC_008270	ACG	2	6	285474	285479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026363
6498	NC_008270	CCG	2	6	285493	285498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026363
6499	NC_008270	GGA	2	6	285505	285510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026363
6500	NC_008270	CGC	2	6	285544	285549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026363

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