MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL2

Total Repeats: 10065

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008270	GTG	2	6	245171	245176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026320
5502	NC_008270	GC	3	6	245182	245187	0 %	0 %	50 %	50 %	111026320
5503	NC_008270	GGTG	2	8	245188	245195	0 %	25 %	75 %	0 %	111026320
5504	NC_008270	CTGG	2	8	245214	245221	0 %	25 %	50 %	25 %	111026320
5505	NC_008270	CCT	2	6	245228	245233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026320
5506	NC_008270	GT	3	6	245243	245248	0 %	50 %	50 %	0 %	111026320
5507	NC_008270	GTC	2	6	245272	245277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026320
5508	NC_008270	GGT	2	6	245323	245328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026320
5509	NC_008270	GT	3	6	245327	245332	0 %	50 %	50 %	0 %	111026320
5510	NC_008270	CTG	2	6	245361	245366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026320
5511	NC_008270	GAG	2	6	245379	245384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111026320
5512	NC_008270	CCG	2	6	245430	245435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026320
5513	NC_008270	ACC	2	6	245438	245443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026320
5514	NC_008270	AGC	2	6	245447	245452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_008270	GC	3	6	245451	245456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5516	NC_008270	GCCG	2	8	245478	245485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5517	NC_008270	GGT	2	6	245510	245515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_008270	GT	3	6	245514	245519	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_008270	CCT	2	6	245575	245580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5520	NC_008270	CCGTA	2	10	245692	245701	20 %	20 %	20 %	40 %	111026321
5521	NC_008270	CGT	2	6	245712	245717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026321
5522	NC_008270	TGC	2	6	245730	245735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026321
5523	NC_008270	TGC	2	6	245745	245750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026321
5524	NC_008270	CGAG	2	8	245767	245774	25 %	0 %	50 %	25 %	111026321
5525	NC_008270	GAT	2	6	245789	245794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026321
5526	NC_008270	TTC	2	6	245801	245806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111026321
5527	NC_008270	CGTT	2	8	245811	245818	0 %	50 %	25 %	25 %	111026321
5528	NC_008270	GTC	2	6	245841	245846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026321
5529	NC_008270	ACCT	2	8	245864	245871	25 %	25 %	0 %	50 %	111026321
5530	NC_008270	CGGCT	2	10	245900	245909	0 %	20 %	40 %	40 %	111026321
5531	NC_008270	GGC	2	6	245949	245954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026321
5532	NC_008270	CGA	2	6	245994	245999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026321
5533	NC_008270	TGA	2	6	246003	246008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026321
5534	NC_008270	GAC	2	6	246013	246018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026321
5535	NC_008270	GCG	3	9	246029	246037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026321
5536	NC_008270	GCT	2	6	246058	246063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026321
5537	NC_008270	TGC	2	6	246087	246092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026321
5538	NC_008270	CAC	3	9	246094	246102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026321
5539	NC_008270	ACG	2	6	246116	246121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026321
5540	NC_008270	GTG	2	6	246122	246127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026321
5541	NC_008270	TTG	2	6	246161	246166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026321
5542	NC_008270	GCC	2	6	246212	246217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026321
5543	NC_008270	CAC	2	6	246232	246237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026321
5544	NC_008270	GCC	2	6	246308	246313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026321
5545	NC_008270	CGA	2	6	246319	246324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026321
5546	NC_008270	GGC	2	6	246331	246336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026321
5547	NC_008270	CAC	2	6	246346	246351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026321
5548	NC_008270	CCG	2	6	246378	246383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026321
5549	NC_008270	GCT	2	6	246400	246405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026321
5550	NC_008270	ACG	2	6	246474	246479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026321
5551	NC_008270	GCC	2	6	246489	246494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026321
5552	NC_008270	CGA	2	6	246520	246525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026321
5553	NC_008270	CGGA	2	8	246597	246604	25 %	0 %	50 %	25 %	111026321
5554	NC_008270	GAC	2	6	246752	246757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026322
5555	NC_008270	GTT	2	6	246768	246773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111026322
5556	NC_008270	TCCG	2	8	246882	246889	0 %	25 %	25 %	50 %	111026322
5557	NC_008270	GAA	2	6	246916	246921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111026322
5558	NC_008270	GACCC	2	10	246950	246959	20 %	0 %	20 %	60 %	111026322
5559	NC_008270	CGG	2	6	246986	246991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026322
5560	NC_008270	CGA	2	6	246999	247004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026322
5561	NC_008270	TGC	2	6	247009	247014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026322
5562	NC_008270	CAC	2	6	247062	247067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026322
5563	NC_008270	CAC	2	6	247141	247146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026322
5564	NC_008270	AAC	2	6	247181	247186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111026322
5565	NC_008270	CAC	2	6	247223	247228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026322
5566	NC_008270	TGC	2	6	247314	247319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026322
5567	NC_008270	TGCC	2	8	247328	247335	0 %	25 %	25 %	50 %	111026322
5568	NC_008270	CAC	2	6	247336	247341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026322
5569	NC_008270	GTG	2	6	247342	247347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111026322
5570	NC_008270	GTA	2	6	247531	247536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026322
5571	NC_008270	GCG	2	6	247615	247620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026322
5572	NC_008270	CTTCA	2	10	247624	247633	20 %	40 %	0 %	40 %	111026322
5573	NC_008270	CCT	2	6	247634	247639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026323
5574	NC_008270	CG	3	6	247711	247716	0 %	0 %	50 %	50 %	111026323
5575	NC_008270	CG	3	6	247722	247727	0 %	0 %	50 %	50 %	111026323
5576	NC_008270	CG	3	6	247732	247737	0 %	0 %	50 %	50 %	111026323
5577	NC_008270	GC	3	6	247785	247790	0 %	0 %	50 %	50 %	111026323
5578	NC_008270	GCG	2	6	247798	247803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026323
5579	NC_008270	CG	3	6	247890	247895	0 %	0 %	50 %	50 %	111026323
5580	NC_008270	TCC	2	6	247924	247929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111026323
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5582	NC_008270	TCG	2	6	248024	248029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026324
5583	NC_008270	CGA	2	6	248034	248039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026324
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5585	NC_008270	CCG	2	6	248153	248158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026324
5586	NC_008270	GAC	2	6	248188	248193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026324
5587	NC_008270	CGT	2	6	248217	248222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026324
5588	NC_008270	CGA	2	6	248284	248289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026324
5589	NC_008270	G	6	6	248464	248469	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_008270	AGCTA	2	10	248550	248559	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5591	NC_008270	GGCAC	2	10	248563	248572	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5592	NC_008270	CGAT	2	8	248590	248597	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5593	NC_008270	CCGC	2	8	248684	248691	0 %	0 %	25 %	75 %	111026325
5594	NC_008270	CCG	2	6	248763	248768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026325
5595	NC_008270	GGC	2	6	248790	248795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026325
5596	NC_008270	ATC	2	6	248812	248817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111026325
5597	NC_008270	CGA	2	6	248820	248825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026325
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5599	NC_008270	ACG	2	6	249008	249013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026325
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5602	NC_008270	CGA	2	6	249066	249071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026325
5603	NC_008270	CGA	2	6	249081	249086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026325
5604	NC_008270	CGG	2	6	249089	249094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026325
5605	NC_008270	CCGG	2	8	249109	249116	0 %	0 %	50 %	50 %	111026325
5606	NC_008270	CCCG	2	8	249122	249129	0 %	0 %	25 %	75 %	111026325
5607	NC_008270	GC	3	6	249158	249163	0 %	0 %	50 %	50 %	111026325
5608	NC_008270	CG	3	6	249186	249191	0 %	0 %	50 %	50 %	111026325
5609	NC_008270	CAC	2	6	249195	249200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111026325
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5611	NC_008270	CGG	2	6	249351	249356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026325
5612	NC_008270	CCG	2	6	249357	249362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026325
5613	NC_008270	CGC	2	6	249412	249417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026325
5614	NC_008270	CCG	2	6	249419	249424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026325
5615	NC_008270	TCG	2	6	249443	249448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026325
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5617	NC_008270	CGG	2	6	249507	249512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5618	NC_008270	CGA	2	6	249529	249534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5619	NC_008270	ACC	2	6	249552	249557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5620	NC_008270	AAC	2	6	249589	249594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5621	NC_008270	CCT	2	6	249674	249679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5622	NC_008270	AGC	2	6	249682	249687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_008270	TCG	2	6	249838	249843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026326
5624	NC_008270	CG	3	6	249846	249851	0 %	0 %	50 %	50 %	111026326
5625	NC_008270	TCAG	2	8	249882	249889	25 %	25 %	25 %	25 %	111026326
5626	NC_008270	CGA	2	6	249987	249992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111026326
5627	NC_008270	GA	3	6	249991	249996	50 %	0 %	50 %	0 %	111026326
5628	NC_008270	TGA	2	6	250039	250044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111026326
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5630	NC_008270	GCG	2	6	250077	250082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026326
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5638	NC_008270	AGC	2	6	250429	250434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5639	NC_008270	GCG	2	6	250513	250518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5640	NC_008270	CCG	2	6	250580	250585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111026327
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5645	NC_008270	CG	3	6	250813	250818	0 %	0 %	50 %	50 %	111026327
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5654	NC_008270	CACT	2	8	251283	251290	25 %	25 %	0 %	50 %	111026328
5655	NC_008270	GCCGTG	2	12	251293	251304	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111026328
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5663	NC_008270	TCG	2	6	251691	251696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111026329
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5740	NC_008270	CTGC	2	8	254483	254490	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5993	NC_008270	CGG	2	6	264758	264763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111026342
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