MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 26508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_008269	CGG	2	6	103451	103456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024892
2502	NC_008269	CAC	2	6	103483	103488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2503	NC_008269	CGC	2	6	103551	103556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2504	NC_008269	GCG	2	6	103558	103563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_008269	CTT	2	6	103644	103649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2506	NC_008269	CGG	2	6	103658	103663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024893
2507	NC_008269	GCC	2	6	103673	103678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024893
2508	NC_008269	CGC	2	6	103683	103688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024893
2509	NC_008269	GTG	2	6	103743	103748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024893
2510	NC_008269	CAG	2	6	103799	103804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024893
2511	NC_008269	AAC	2	6	103839	103844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111024893
2512	NC_008269	CCGACG	2	12	103852	103863	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	111024893
2513	NC_008269	CCG	2	6	103875	103880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024893
2514	NC_008269	CAT	3	9	103964	103972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024893
2515	NC_008269	GACG	3	12	104038	104049	25 %	0 %	50 %	25 %	111024894
2516	NC_008269	TCG	2	6	104057	104062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024894
2517	NC_008269	TGT	2	6	104089	104094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111024894
2518	NC_008269	CTC	2	6	104111	104116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024894
2519	NC_008269	CCG	2	6	104171	104176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024894
2520	NC_008269	CAC	3	9	104240	104248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024894
2521	NC_008269	AAC	2	6	104260	104265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111024894
2522	NC_008269	CCG	2	6	104267	104272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024894
2523	NC_008269	ACC	2	6	104306	104311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024894
2524	NC_008269	CAC	2	6	104313	104318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024894
2525	NC_008269	GGT	2	6	104327	104332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024894
2526	NC_008269	CGAGC	2	10	104527	104536	20 %	0 %	40 %	40 %	111024894
2527	NC_008269	GAA	2	6	104559	104564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111024894
2528	NC_008269	GGT	2	6	104590	104595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024894
2529	NC_008269	AGC	2	6	104596	104601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024894
2530	NC_008269	TCG	2	6	104641	104646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024894
2531	NC_008269	AAC	2	6	104671	104676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111024894
2532	NC_008269	CGGCG	2	10	104690	104699	0 %	0 %	60 %	40 %	111024894
2533	NC_008269	GTCGA	2	10	104747	104756	20 %	20 %	40 %	20 %	111024894
2534	NC_008269	TCGA	2	8	104793	104800	25 %	25 %	25 %	25 %	111024894
2535	NC_008269	TCG	2	6	104803	104808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024894
2536	NC_008269	GCC	2	6	104839	104844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024894
2537	NC_008269	ACC	2	6	104902	104907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024894
2538	NC_008269	CCTGC	2	10	104985	104994	0 %	20 %	20 %	60 %	111024894
2539	NC_008269	TG	3	6	105006	105011	0 %	50 %	50 %	0 %	111024894
2540	NC_008269	GGT	2	6	105050	105055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024894
2541	NC_008269	GA	3	6	105135	105140	50 %	0 %	50 %	0 %	111024894
2542	NC_008269	CGGT	2	8	105179	105186	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2543	NC_008269	CCTG	2	8	105232	105239	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2544	NC_008269	TCG	2	6	105270	105275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2545	NC_008269	CAA	2	6	105299	105304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2546	NC_008269	CGG	2	6	105343	105348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2547	NC_008269	CGA	2	6	105385	105390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2548	NC_008269	CGA	2	6	105433	105438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2549	NC_008269	CCCG	2	8	105454	105461	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2550	NC_008269	CGC	2	6	105562	105567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2551	NC_008269	CAG	2	6	105569	105574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2552	NC_008269	ACA	2	6	105608	105613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2553	NC_008269	ATC	2	6	105623	105628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2554	NC_008269	ACT	2	6	105649	105654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2555	NC_008269	GCG	2	6	105692	105697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2556	NC_008269	ACT	2	6	105735	105740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_008269	GAAG	2	8	106018	106025	50 %	0 %	50 %	0 %	111024895
2558	NC_008269	CCTT	2	8	106046	106053	0 %	50 %	0 %	50 %	111024895
2559	NC_008269	GCT	2	6	106090	106095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024895
2560	NC_008269	GAG	2	6	106117	106122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111024895
2561	NC_008269	TCG	2	6	106128	106133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024895
2562	NC_008269	ATG	2	6	106142	106147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024895
2563	NC_008269	CGC	2	6	106241	106246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024895
2564	NC_008269	GC	3	6	106325	106330	0 %	0 %	50 %	50 %	111024895
2565	NC_008269	GGT	2	6	106355	106360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024895
2566	NC_008269	ACAGCC	2	12	106461	106472	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	111024896
2567	NC_008269	CTGC	2	8	106491	106498	0 %	25 %	25 %	50 %	111024896
2568	NC_008269	GCA	2	6	106539	106544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024896
2569	NC_008269	CG	3	6	106559	106564	0 %	0 %	50 %	50 %	111024896
2570	NC_008269	CGGC	2	8	106593	106600	0 %	0 %	50 %	50 %	111024896
2571	NC_008269	GGC	2	6	106730	106735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2572	NC_008269	GAT	3	9	106838	106846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024897
2573	NC_008269	GGC	2	6	106898	106903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024897
2574	NC_008269	GCG	2	6	106928	106933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024897
2575	NC_008269	GCC	2	6	106937	106942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024897
2576	NC_008269	AGC	2	6	106962	106967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024897
2577	NC_008269	CGG	2	6	107017	107022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024897
2578	NC_008269	TCG	3	9	107052	107060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024897
2579	NC_008269	CG	3	6	107072	107077	0 %	0 %	50 %	50 %	111024897
2580	NC_008269	TCGG	2	8	107078	107085	0 %	25 %	50 %	25 %	111024897
2581	NC_008269	TGCC	2	8	107212	107219	0 %	25 %	25 %	50 %	111024897
2582	NC_008269	GCC	2	6	107222	107227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024897
2583	NC_008269	AC	3	6	107249	107254	50 %	0 %	0 %	50 %	111024897
2584	NC_008269	CGA	2	6	107346	107351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2585	NC_008269	ACA	2	6	107362	107367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2586	NC_008269	GGT	2	6	107470	107475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_008269	AGG	3	9	107497	107505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_008269	ACA	2	6	107515	107520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2589	NC_008269	CGG	2	6	107698	107703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024898
2590	NC_008269	TGCG	2	8	107717	107724	0 %	25 %	50 %	25 %	111024898
2591	NC_008269	GGT	2	6	107748	107753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024898
2592	NC_008269	GCC	2	6	107779	107784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024898
2593	NC_008269	GGT	2	6	107841	107846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024898
2594	NC_008269	GC	3	6	107855	107860	0 %	0 %	50 %	50 %	111024898
2595	NC_008269	GCT	2	6	107863	107868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024898
2596	NC_008269	CGG	2	6	107961	107966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024899
2597	NC_008269	GAG	2	6	107981	107986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111024899
2598	NC_008269	GCC	2	6	108005	108010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024899
2599	NC_008269	CGC	2	6	108038	108043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024899
2600	NC_008269	CGG	2	6	108046	108051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024899
2601	NC_008269	CGT	2	6	108080	108085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024899
2602	NC_008269	GAA	2	6	108118	108123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111024899
2603	NC_008269	GTC	2	6	108240	108245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2604	NC_008269	TC	3	6	108286	108291	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2605	NC_008269	TCT	2	6	108295	108300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2606	NC_008269	CAG	2	6	108308	108313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2607	NC_008269	GGC	3	9	108327	108335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2608	NC_008269	AGC	2	6	108398	108403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2609	NC_008269	G	6	6	108405	108410	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_008269	GCG	2	6	108465	108470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024900
2611	NC_008269	AAG	2	6	108491	108496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111024900
2612	NC_008269	TGG	2	6	108578	108583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024900
2613	NC_008269	ACCG	2	8	108619	108626	25 %	0 %	25 %	50 %	111024900
2614	NC_008269	GAA	2	6	108628	108633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111024900
2615	NC_008269	GCG	2	6	108662	108667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024900
2616	NC_008269	GCG	2	6	108695	108700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024900
2617	NC_008269	CGA	2	6	108714	108719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024900
2618	NC_008269	TCC	2	6	108750	108755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024900
2619	NC_008269	GGT	2	6	108756	108761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024900
2620	NC_008269	CAGGT	2	10	108790	108799	20 %	20 %	40 %	20 %	111024900
2621	NC_008269	CGA	2	6	108819	108824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024900
2622	NC_008269	CGG	2	6	108834	108839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024900
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2872	NC_008269	GCACC	2	10	119133	119142	20 %	0 %	20 %	60 %	111024907
2873	NC_008269	GACC	2	8	119151	119158	25 %	0 %	25 %	50 %	111024907
2874	NC_008269	ATC	2	6	119188	119193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024907
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2877	NC_008269	GAC	2	6	119266	119271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024907
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2880	NC_008269	GAT	2	6	119386	119391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024907
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2936	NC_008269	CAA	2	6	121690	121695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2979	NC_008269	TCC	2	6	123305	123310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2980	NC_008269	TGC	2	6	123328	123333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2982	NC_008269	GTC	2	6	123366	123371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2993	NC_008269	ACGA	2	8	124075	124082	50 %	0 %	25 %	25 %	111024910
2994	NC_008269	CTCCCC	2	12	124083	124094	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	111024910
2995	NC_008269	GCCCC	2	10	124117	124126	0 %	0 %	20 %	80 %	111024910
2996	NC_008269	ACC	2	6	124162	124167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024910
2997	NC_008269	TGG	2	6	124178	124183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024910
2998	NC_008269	ACG	2	6	124219	124224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024910
2999	NC_008269	CGG	2	6	124226	124231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024910
3000	NC_008269	CGC	2	6	124292	124297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024910

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