MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 26508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
26001	NC_008269	ATG	2	6	1102396	1102401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26002	NC_008269	GCG	2	6	1102431	1102436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26003	NC_008269	CGCC	2	8	1102483	1102490	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
26004	NC_008269	CA	3	6	1102576	1102581	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26005	NC_008269	AC	3	6	1102612	1102617	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26006	NC_008269	CGC	2	6	1102656	1102661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025926
26007	NC_008269	CGG	2	6	1102699	1102704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025926
26008	NC_008269	ACCA	2	8	1102883	1102890	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26009	NC_008269	TG	3	6	1103001	1103006	0 %	50 %	50 %	0 %	111025927
26010	NC_008269	TTG	2	6	1103021	1103026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111025927
26011	NC_008269	TGTT	2	8	1103109	1103116	0 %	75 %	25 %	0 %	111025927
26012	NC_008269	GGGTC	2	10	1103127	1103136	0 %	20 %	60 %	20 %	111025927
26013	NC_008269	CCG	2	6	1103153	1103158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025927
26014	NC_008269	AGC	2	6	1103201	1103206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025927
26015	NC_008269	GGC	2	6	1103222	1103227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025927
26016	NC_008269	CG	3	6	1103295	1103300	0 %	0 %	50 %	50 %	111025927
26017	NC_008269	CGC	2	6	1103326	1103331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025927
26018	NC_008269	CGC	2	6	1103398	1103403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025927
26019	NC_008269	ACG	2	6	1103418	1103423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025927
26020	NC_008269	TGC	2	6	1103448	1103453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025927
26021	NC_008269	ACC	2	6	1103501	1103506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025927
26022	NC_008269	ACG	2	6	1103523	1103528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025927
26023	NC_008269	GAG	2	6	1103555	1103560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025927
26024	NC_008269	GGATG	2	10	1103594	1103603	20 %	20 %	60 %	0 %	111025927
26025	NC_008269	GCC	2	6	1103621	1103626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025927
26026	NC_008269	CCG	2	6	1103675	1103680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025927
26027	NC_008269	TTC	2	6	1103684	1103689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111025927
26028	NC_008269	GCCA	2	8	1103713	1103720	25 %	0 %	25 %	50 %	111025927
26029	NC_008269	TGC	2	6	1103725	1103730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025927
26030	NC_008269	CGG	2	6	1103743	1103748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025927
26031	NC_008269	CGGT	2	8	1103754	1103761	0 %	25 %	50 %	25 %	111025927
26032	NC_008269	GC	3	6	1103773	1103778	0 %	0 %	50 %	50 %	111025927
26033	NC_008269	TCG	2	6	1103938	1103943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025927
26034	NC_008269	GTC	2	6	1104005	1104010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025927
26035	NC_008269	GAGAC	2	10	1104021	1104030	40 %	0 %	40 %	20 %	111025927
26036	NC_008269	CAA	2	6	1104076	1104081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111025927
26037	NC_008269	CGA	2	6	1104139	1104144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025927
26038	NC_008269	CTA	2	6	1104169	1104174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025927
26039	NC_008269	GGC	2	6	1104190	1104195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025927
26040	NC_008269	CGT	2	6	1104211	1104216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025927
26041	NC_008269	CAG	2	6	1104389	1104394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025927
26042	NC_008269	CGC	2	6	1104542	1104547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025927
26043	NC_008269	CGC	2	6	1104556	1104561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025927
26044	NC_008269	GTG	2	6	1104569	1104574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025927
26045	NC_008269	CGA	2	6	1104610	1104615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025927
26046	NC_008269	GGC	2	6	1104620	1104625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025927
26047	NC_008269	CCGA	2	8	1104636	1104643	25 %	0 %	25 %	50 %	111025927
26048	NC_008269	CGCT	2	8	1104723	1104730	0 %	25 %	25 %	50 %	111025927
26049	NC_008269	C	6	6	1104788	1104793	0 %	0 %	0 %	100 %	111025927
26050	NC_008269	GGCC	2	8	1104810	1104817	0 %	0 %	50 %	50 %	111025927
26051	NC_008269	CGC	2	6	1104907	1104912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025927
26052	NC_008269	TGG	2	6	1104918	1104923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025927
26053	NC_008269	CTG	2	6	1104926	1104931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025927
26054	NC_008269	ACG	2	6	1104969	1104974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025927
26055	NC_008269	CTC	2	6	1104977	1104982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111025927
26056	NC_008269	GCG	2	6	1104985	1104990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025927
26057	NC_008269	CAA	2	6	1105030	1105035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111025927
26058	NC_008269	TGT	2	6	1105054	1105059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111025927
26059	NC_008269	TC	3	6	1105106	1105111	0 %	50 %	0 %	50 %	111025927
26060	NC_008269	GACAC	2	10	1105125	1105134	40 %	0 %	20 %	40 %	111025927
26061	NC_008269	CGG	2	6	1105149	1105154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025927
26062	NC_008269	CTG	2	6	1105157	1105162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025927
26063	NC_008269	CCA	2	6	1105237	1105242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025927
26064	NC_008269	CG	3	6	1105255	1105260	0 %	0 %	50 %	50 %	111025927
26065	NC_008269	CGA	2	6	1105321	1105326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025927
26066	NC_008269	GC	3	6	1105338	1105343	0 %	0 %	50 %	50 %	111025927
26067	NC_008269	CCCG	2	8	1105389	1105396	0 %	0 %	25 %	75 %	111025927
26068	NC_008269	GGCG	2	8	1105437	1105444	0 %	0 %	75 %	25 %	111025927
26069	NC_008269	CCGGA	2	10	1105454	1105463	20 %	0 %	40 %	40 %	111025927
26070	NC_008269	CGCC	2	8	1105510	1105517	0 %	0 %	25 %	75 %	111025927
26071	NC_008269	TCA	2	6	1105542	1105547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025927
26072	NC_008269	CTG	2	6	1105550	1105555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025927
26073	NC_008269	CGA	2	6	1105657	1105662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025927
26074	NC_008269	TGC	2	6	1105677	1105682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025927
26075	NC_008269	CCG	2	6	1105707	1105712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025927
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26078	NC_008269	CGA	2	6	1105864	1105869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025927
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26083	NC_008269	TGC	2	6	1106055	1106060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025927
26084	NC_008269	GCT	2	6	1106122	1106127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025927
26085	NC_008269	CTG	2	6	1106132	1106137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025927
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26088	NC_008269	CCGCG	2	10	1106317	1106326	0 %	0 %	40 %	60 %	111025927
26089	NC_008269	CGA	2	6	1106341	1106346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025927
26090	NC_008269	TCG	2	6	1106358	1106363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025927
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26094	NC_008269	AGTCC	2	10	1106554	1106563	20 %	20 %	20 %	40 %	111025927
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26101	NC_008269	CTT	2	6	1106788	1106793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111025927
26102	NC_008269	CTG	2	6	1106798	1106803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025927
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26109	NC_008269	GCCG	2	8	1106974	1106981	0 %	0 %	50 %	50 %	111025927
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26113	NC_008269	GCT	2	6	1107121	1107126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025927
26114	NC_008269	CCGG	2	8	1107136	1107143	0 %	0 %	50 %	50 %	111025927
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26116	NC_008269	CGACGT	2	12	1107193	1107204	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111025927
26117	NC_008269	TCCC	2	8	1107206	1107213	0 %	25 %	0 %	75 %	111025927
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26234	NC_008269	AGC	2	6	1111969	1111974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025928
26235	NC_008269	CAC	2	6	1111980	1111985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025928
26236	NC_008269	GCA	3	9	1112000	1112008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025928
26237	NC_008269	GAG	2	6	1112061	1112066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025928
26238	NC_008269	TAC	2	6	1112103	1112108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025928
26239	NC_008269	TAC	2	6	1112112	1112117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025928
26240	NC_008269	GCGGA	2	10	1112145	1112154	20 %	0 %	60 %	20 %	111025928
26241	NC_008269	ACT	2	6	1112212	1112217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025928
26242	NC_008269	CGG	2	6	1112222	1112227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025928
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26244	NC_008269	ACA	3	9	1112296	1112304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111025928
26245	NC_008269	GAACTG	2	12	1112310	1112321	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	111025928
26246	NC_008269	CCGT	2	8	1112475	1112482	0 %	25 %	25 %	50 %	111025928
26247	NC_008269	GCT	2	6	1112519	1112524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025928
26248	NC_008269	GCA	2	6	1112527	1112532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025928
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26251	NC_008269	GCG	2	6	1112635	1112640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025928
26252	NC_008269	AAC	2	6	1112643	1112648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111025928
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26256	NC_008269	CCA	2	6	1112824	1112829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025928
26257	NC_008269	CTG	2	6	1112886	1112891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025928
26258	NC_008269	CAC	2	6	1112942	1112947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025928
26259	NC_008269	CAC	2	6	1112973	1112978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025928
26260	NC_008269	ACT	2	6	1112980	1112985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025928
26261	NC_008269	GCGAC	2	10	1113097	1113106	20 %	0 %	40 %	40 %	111025928
26262	NC_008269	CTG	2	6	1113157	1113162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025928
26263	NC_008269	CA	3	6	1113167	1113172	50 %	0 %	0 %	50 %	111025928
26264	NC_008269	TCG	2	6	1113208	1113213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025928
26265	NC_008269	GAA	2	6	1113237	1113242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26266	NC_008269	GAGC	2	8	1113245	1113252	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26267	NC_008269	GCC	2	6	1113385	1113390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025929
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26271	NC_008269	GGA	2	6	1113736	1113741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025929
26272	NC_008269	GAC	2	6	1113758	1113763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025929
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26294	NC_008269	GT	3	6	1114695	1114700	0 %	50 %	50 %	0 %	111025929
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26302	NC_008269	CG	3	6	1115105	1115110	0 %	0 %	50 %	50 %	111025929
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26465	NC_008269	CAG	2	6	1121526	1121531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025930
26466	NC_008269	TGA	2	6	1121546	1121551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025930
26467	NC_008269	GTC	2	6	1121633	1121638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025931
26468	NC_008269	GCA	2	6	1121661	1121666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025931
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26476	NC_008269	GGT	2	6	1121949	1121954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025931
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26479	NC_008269	AGG	2	6	1122045	1122050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26480	NC_008269	TGG	2	6	1122051	1122056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26481	NC_008269	GCT	2	6	1122102	1122107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26482	NC_008269	TTC	2	6	1122118	1122123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26483	NC_008269	CGG	2	6	1122151	1122156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26484	NC_008269	CTC	2	6	1122182	1122187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26485	NC_008269	TGC	2	6	1122234	1122239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26486	NC_008269	TGG	3	9	1122304	1122312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26487	NC_008269	CGG	2	6	1122327	1122332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26488	NC_008269	TC	3	6	1122369	1122374	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26489	NC_008269	CTCC	2	8	1122390	1122397	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
26490	NC_008269	CTG	2	6	1122427	1122432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26491	NC_008269	CTG	2	6	1122439	1122444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26492	NC_008269	TGA	2	6	1122538	1122543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26493	NC_008269	CGG	2	6	1122586	1122591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26494	NC_008269	GATC	2	8	1122623	1122630	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26495	NC_008269	TTG	2	6	1122638	1122643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26496	NC_008269	ACA	2	6	1122648	1122653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26497	NC_008269	TGA	2	6	1122670	1122675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26498	NC_008269	CAC	2	6	1122700	1122705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26499	NC_008269	TGT	2	6	1122728	1122733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26500	NC_008269	GTGG	2	8	1122787	1122794	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding

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