MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 26508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008269	CGCC	2	8	18370	18377	0 %	0 %	25 %	75 %	111024804
502	NC_008269	ACG	2	6	18425	18430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024804
503	NC_008269	CGC	2	6	18472	18477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024804
504	NC_008269	CTC	2	6	18536	18541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111024804
505	NC_008269	CG	3	6	18571	18576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
506	NC_008269	ACT	2	6	18603	18608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_008269	CAG	2	6	18611	18616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_008269	GCG	2	6	18670	18675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_008269	GCT	2	6	18698	18703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_008269	ACC	2	6	18713	18718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_008269	CA	3	6	18730	18735	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
512	NC_008269	CGC	2	6	18773	18778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_008269	CAC	2	6	18808	18813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_008269	CTAC	2	8	18854	18861	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
515	NC_008269	TCG	2	6	18862	18867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_008269	GTC	2	6	18868	18873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_008269	ACC	2	6	18937	18942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_008269	GCA	2	6	18948	18953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_008269	GGT	2	6	18982	18987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
520	NC_008269	TAG	2	6	19037	19042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_008269	CGT	2	6	19091	19096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024805
522	NC_008269	GGT	2	6	19098	19103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024805
523	NC_008269	GGC	2	6	19152	19157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024805
524	NC_008269	GTG	2	6	19269	19274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024805
525	NC_008269	GCGCGA	2	12	19289	19300	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	111024805
526	NC_008269	CGGC	2	8	19307	19314	0 %	0 %	50 %	50 %	111024805
527	NC_008269	CAC	2	6	19371	19376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024805
528	NC_008269	CGC	2	6	19465	19470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024805
529	NC_008269	CAG	2	6	19492	19497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024805
530	NC_008269	CTTC	2	8	19535	19542	0 %	50 %	0 %	50 %	111024805
531	NC_008269	CACG	2	8	19574	19581	25 %	0 %	25 %	50 %	111024805
532	NC_008269	GAG	2	6	19587	19592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111024805
533	NC_008269	CAC	2	6	19617	19622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024805
534	NC_008269	GGGC	2	8	19642	19649	0 %	0 %	75 %	25 %	111024805
535	NC_008269	TGG	2	6	19701	19706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_008269	CTT	2	6	19719	19724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024806
537	NC_008269	T	7	7	19745	19751	0 %	100 %	0 %	0 %	111024806
538	NC_008269	ACC	2	6	19831	19836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024806
539	NC_008269	GGC	2	6	19851	19856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024806
540	NC_008269	GCT	2	6	19930	19935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024806
541	NC_008269	CCA	2	6	19987	19992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024806
542	NC_008269	CTT	2	6	20036	20041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024806
543	NC_008269	CCA	2	6	20047	20052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024806
544	NC_008269	CCGA	2	8	20055	20062	25 %	0 %	25 %	50 %	111024806
545	NC_008269	ATC	2	6	20097	20102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024806
546	NC_008269	CTT	2	6	20177	20182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024806
547	NC_008269	ACA	2	6	20196	20201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111024806
548	NC_008269	AGGGGA	2	12	20216	20227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111024806
549	NC_008269	GCC	2	6	20233	20238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024806
550	NC_008269	AGC	2	6	20268	20273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024806
551	NC_008269	CTA	2	6	20280	20285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111024806
552	NC_008269	CGG	2	6	20391	20396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024807
553	NC_008269	GGC	2	6	20424	20429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024807
554	NC_008269	GGTG	2	8	20541	20548	0 %	25 %	75 %	0 %	111024807
555	NC_008269	CGG	2	6	20610	20615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024807
556	NC_008269	CGG	2	6	20646	20651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024807
557	NC_008269	TTG	2	6	20669	20674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111024807
558	NC_008269	CGGTGG	2	12	20769	20780	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	111024807
559	NC_008269	GGC	2	6	20797	20802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024807
560	NC_008269	GTT	2	6	20838	20843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111024807
561	NC_008269	GCA	2	6	20850	20855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024807
562	NC_008269	GTT	2	6	20935	20940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111024807
563	NC_008269	TGG	2	6	20943	20948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024807
564	NC_008269	CCG	2	6	20973	20978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024807
565	NC_008269	CGGT	2	8	20987	20994	0 %	25 %	50 %	25 %	111024807
566	NC_008269	CGGTG	2	10	21007	21016	0 %	20 %	60 %	20 %	111024807
567	NC_008269	GAC	2	6	21145	21150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024807
568	NC_008269	GC	3	6	21163	21168	0 %	0 %	50 %	50 %	111024807
569	NC_008269	TGG	2	6	21177	21182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024807
570	NC_008269	GGC	2	6	21197	21202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024807
571	NC_008269	CCAA	2	8	21210	21217	50 %	0 %	0 %	50 %	111024807
572	NC_008269	ACG	2	6	21223	21228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024807
573	NC_008269	CGT	2	6	21247	21252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_008269	CCGG	2	8	21274	21281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
575	NC_008269	ACC	2	6	21298	21303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_008269	TCG	2	6	21311	21316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_008269	TCG	2	6	21384	21389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_008269	CGA	2	6	21426	21431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_008269	GTC	2	6	21445	21450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_008269	GGA	2	6	21479	21484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
581	NC_008269	GAT	2	6	21534	21539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111024808
582	NC_008269	GC	3	6	21578	21583	0 %	0 %	50 %	50 %	111024808
583	NC_008269	CAA	2	6	21591	21596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111024808
584	NC_008269	CCA	2	6	21599	21604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024808
585	NC_008269	TCGAT	2	10	21733	21742	20 %	40 %	20 %	20 %	111024808
586	NC_008269	TGG	2	6	21748	21753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024808
587	NC_008269	CCG	2	6	21775	21780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024808
588	NC_008269	GCA	2	6	21797	21802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024808
589	NC_008269	CGT	2	6	21809	21814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_008269	CGA	2	6	21815	21820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_008269	TCA	2	6	21919	21924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_008269	GCA	2	6	21960	21965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_008269	ATA	2	6	21996	22001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_008269	CGA	2	6	22059	22064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024809
595	NC_008269	TGC	2	6	22091	22096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024809
596	NC_008269	GCG	2	6	22116	22121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024809
597	NC_008269	TTTGGC	2	12	22122	22133	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	111024809
598	NC_008269	GCGG	2	8	22167	22174	0 %	0 %	75 %	25 %	111024809
599	NC_008269	CGGT	2	8	22184	22191	0 %	25 %	50 %	25 %	111024809
600	NC_008269	CCGACG	2	12	22246	22257	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	111024809
601	NC_008269	CCG	2	6	22266	22271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024809
602	NC_008269	GTT	2	6	22326	22331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111024809
603	NC_008269	GAC	2	6	22383	22388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024809
604	NC_008269	GAG	2	6	22411	22416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111024809
605	NC_008269	TTG	2	6	22462	22467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111024809
606	NC_008269	AGC	2	6	22517	22522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024809
607	NC_008269	GAA	3	9	22611	22619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111024809
608	NC_008269	GGC	2	6	22660	22665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024809
609	NC_008269	GGT	2	6	22685	22690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024809
610	NC_008269	TTC	2	6	22701	22706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111024809
611	NC_008269	ACC	2	6	22755	22760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024809
612	NC_008269	CCG	2	6	22798	22803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024810
613	NC_008269	CCG	2	6	22823	22828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024810
614	NC_008269	TGG	2	6	22830	22835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111024810
615	NC_008269	GCC	2	6	22848	22853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024810
616	NC_008269	GCT	2	6	22874	22879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024810
617	NC_008269	CCG	2	6	22885	22890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024810
618	NC_008269	CGG	2	6	22895	22900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111024810
619	NC_008269	TACCGG	2	12	22911	22922	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111024810
620	NC_008269	CCCG	2	8	22988	22995	0 %	0 %	25 %	75 %	111024810
621	NC_008269	CGT	2	6	23107	23112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111024810
622	NC_008269	CAC	2	6	23114	23119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024810
623	NC_008269	CGA	2	6	23162	23167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024810
624	NC_008269	CCA	2	6	23216	23221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024810
625	NC_008269	CATCCG	2	12	23274	23285	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	111024810
626	NC_008269	CGC	2	6	23340	23345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111024811
627	NC_008269	ACC	3	9	23377	23385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111024811
628	NC_008269	TCGG	2	8	23386	23393	0 %	25 %	50 %	25 %	111024811
629	NC_008269	CAG	2	6	23394	23399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111024811
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1000	NC_008269	GC	3	6	39438	39443	0 %	0 %	50 %	50 %	111024831

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