MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 26508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008269	CGC	2	6	251157	251162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025044
6002	NC_008269	TCA	2	6	251192	251197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025044
6003	NC_008269	TTC	2	6	251215	251220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111025044
6004	NC_008269	TCGA	2	8	251248	251255	25 %	25 %	25 %	25 %	111025044
6005	NC_008269	ACC	2	6	251264	251269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025044
6006	NC_008269	TCG	2	6	251414	251419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025044
6007	NC_008269	TGC	2	6	251534	251539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025044
6008	NC_008269	GGT	2	6	251546	251551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025044
6009	NC_008269	ACC	2	6	251626	251631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025044
6010	NC_008269	GGC	2	6	251707	251712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025044
6011	NC_008269	GGCG	2	8	251733	251740	0 %	0 %	75 %	25 %	111025044
6012	NC_008269	AC	3	6	251786	251791	50 %	0 %	0 %	50 %	111025044
6013	NC_008269	GAC	3	9	251800	251808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025044
6014	NC_008269	CGA	2	6	251847	251852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025044
6015	NC_008269	ACA	2	6	251876	251881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111025044
6016	NC_008269	TCG	2	6	251882	251887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025044
6017	NC_008269	GC	3	6	251988	251993	0 %	0 %	50 %	50 %	111025044
6018	NC_008269	GACAA	2	10	252026	252035	60 %	0 %	20 %	20 %	111025044
6019	NC_008269	CGTCG	2	10	252038	252047	0 %	20 %	40 %	40 %	111025044
6020	NC_008269	GGT	2	6	252142	252147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_008269	CA	3	6	252172	252177	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6022	NC_008269	GCC	2	6	252259	252264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6023	NC_008269	GAA	2	6	252272	252277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_008269	CG	3	6	252279	252284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6025	NC_008269	TCG	2	6	252365	252370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025045
6026	NC_008269	TCC	2	6	252397	252402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111025045
6027	NC_008269	TGA	2	6	252408	252413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025045
6028	NC_008269	ACCGA	2	10	252416	252425	40 %	0 %	20 %	40 %	111025045
6029	NC_008269	CCA	2	6	252426	252431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025045
6030	NC_008269	CCG	2	6	252453	252458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025045
6031	NC_008269	TCG	2	6	252512	252517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025045
6032	NC_008269	CGC	2	6	252519	252524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025045
6033	NC_008269	CGA	2	6	252525	252530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025045
6034	NC_008269	CA	3	6	252552	252557	50 %	0 %	0 %	50 %	111025045
6035	NC_008269	TCG	2	6	252741	252746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_008269	TCG	2	6	252788	252793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_008269	CAC	2	6	252864	252869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6038	NC_008269	GCT	2	6	252917	252922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025046
6039	NC_008269	CGA	2	6	252938	252943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025046
6040	NC_008269	ACCG	2	8	252990	252997	25 %	0 %	25 %	50 %	111025046
6041	NC_008269	CGG	2	6	253067	253072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025046
6042	NC_008269	CTT	2	6	253128	253133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111025046
6043	NC_008269	TGC	2	6	253176	253181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025046
6044	NC_008269	AGT	2	6	253223	253228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025046
6045	NC_008269	ACCG	2	8	253234	253241	25 %	0 %	25 %	50 %	111025046
6046	NC_008269	CGA	2	6	253266	253271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025046
6047	NC_008269	ACGC	2	8	253369	253376	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6048	NC_008269	TCC	2	6	253388	253393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6049	NC_008269	CGCGC	2	10	253402	253411	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6050	NC_008269	TGG	2	6	253553	253558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_008269	GCT	3	9	253573	253581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_008269	AGG	2	6	253616	253621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_008269	CAC	2	6	253653	253658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025047
6054	NC_008269	TCGCGG	2	12	253775	253786	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111025047
6055	NC_008269	CGCC	2	8	253836	253843	0 %	0 %	25 %	75 %	111025047
6056	NC_008269	GGA	2	6	253860	253865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025047
6057	NC_008269	CGG	2	6	253889	253894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025047
6058	NC_008269	GGT	2	6	253906	253911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025047
6059	NC_008269	CAC	2	6	253962	253967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025047
6060	NC_008269	GC	3	6	254007	254012	0 %	0 %	50 %	50 %	111025048
6061	NC_008269	CAGAC	2	10	254029	254038	40 %	0 %	20 %	40 %	111025048
6062	NC_008269	GCC	2	6	254134	254139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025048
6063	NC_008269	CCT	2	6	254170	254175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111025048
6064	NC_008269	CGCC	2	8	254215	254222	0 %	0 %	25 %	75 %	111025048
6065	NC_008269	GT	3	6	254255	254260	0 %	50 %	50 %	0 %	111025048
6066	NC_008269	TGG	2	6	254269	254274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025048
6067	NC_008269	GCG	2	6	254302	254307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025048
6068	NC_008269	TCGG	2	8	254377	254384	0 %	25 %	50 %	25 %	111025048
6069	NC_008269	CAA	2	6	254426	254431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111025048
6070	NC_008269	GCA	2	6	254459	254464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025048
6071	NC_008269	CGA	2	6	254471	254476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025048
6072	NC_008269	GTG	2	6	254541	254546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025048
6073	NC_008269	AC	3	6	254557	254562	50 %	0 %	0 %	50 %	111025048
6074	NC_008269	GAT	2	6	254618	254623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025048
6075	NC_008269	CGG	2	6	254654	254659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025048
6076	NC_008269	GAGGCG	2	12	254664	254675	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	111025048
6077	NC_008269	CAC	2	6	254753	254758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025048
6078	NC_008269	GTC	2	6	254808	254813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025048
6079	NC_008269	CGA	3	9	254927	254935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025048
6080	NC_008269	AGC	2	6	254971	254976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025048
6081	NC_008269	TCG	2	6	254986	254991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025048
6082	NC_008269	GCTG	2	8	255158	255165	0 %	25 %	50 %	25 %	111025048
6083	NC_008269	CGA	2	6	255200	255205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025048
6084	NC_008269	CGA	2	6	255212	255217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025048
6085	NC_008269	CGATC	2	10	255233	255242	20 %	20 %	20 %	40 %	111025048
6086	NC_008269	CGGA	2	8	255265	255272	25 %	0 %	50 %	25 %	111025048
6087	NC_008269	CGG	2	6	255274	255279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025048
6088	NC_008269	GGT	2	6	255329	255334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111025048
6089	NC_008269	CGC	2	6	255380	255385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025048
6090	NC_008269	TGA	2	6	255421	255426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025048
6091	NC_008269	CTG	2	6	255438	255443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025048
6092	NC_008269	GAA	2	6	255446	255451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111025048
6093	NC_008269	ACT	2	6	255526	255531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025048
6094	NC_008269	CGGCT	2	10	255564	255573	0 %	20 %	40 %	40 %	111025048
6095	NC_008269	ACC	2	6	255597	255602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025048
6096	NC_008269	CGC	2	6	255748	255753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025048
6097	NC_008269	TCA	2	6	255757	255762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025048
6098	NC_008269	CGC	2	6	255798	255803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025048
6099	NC_008269	GAG	2	6	255867	255872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111025048
6100	NC_008269	CGA	2	6	255887	255892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025048
6101	NC_008269	CGA	2	6	255944	255949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111025048
6102	NC_008269	GCG	2	6	256016	256021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025048
6103	NC_008269	ACC	2	6	256113	256118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025048
6104	NC_008269	CCG	2	6	256145	256150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025048
6105	NC_008269	CCGG	2	8	256158	256165	0 %	0 %	50 %	50 %	111025048
6106	NC_008269	TGA	2	6	256240	256245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025048
6107	NC_008269	CTG	2	6	256281	256286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025048
6108	NC_008269	GCG	2	6	256303	256308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025048
6109	NC_008269	TGA	2	6	256336	256341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111025048
6110	NC_008269	CGC	2	6	256367	256372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111025048
6111	NC_008269	ATC	2	6	256389	256394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025048
6112	NC_008269	CG	3	6	256426	256431	0 %	0 %	50 %	50 %	111025048
6113	NC_008269	GGC	2	6	256436	256441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025048
6114	NC_008269	CTC	2	6	256455	256460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111025048
6115	NC_008269	CGT	2	6	256483	256488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025048
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6117	NC_008269	CCCG	2	8	256544	256551	0 %	0 %	25 %	75 %	111025048
6118	NC_008269	GGC	2	6	256614	256619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025048
6119	NC_008269	CG	4	8	256624	256631	0 %	0 %	50 %	50 %	111025048
6120	NC_008269	ACC	2	6	256663	256668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025048
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6122	NC_008269	TGC	2	6	256759	256764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025048
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6245	NC_008269	CGG	2	6	262361	262366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6491	NC_008269	CGG	2	6	271811	271816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025067
6492	NC_008269	GCT	2	6	271826	271831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025067
6493	NC_008269	CAT	2	6	271913	271918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025067
6494	NC_008269	GCT	3	9	271919	271927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111025067
6495	NC_008269	ATC	2	6	272049	272054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025067
6496	NC_008269	C	6	6	272113	272118	0 %	0 %	0 %	100 %	111025067
6497	NC_008269	GCG	2	6	272149	272154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111025067
6498	NC_008269	CAC	2	6	272219	272224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111025067
6499	NC_008269	CTGC	2	8	272231	272238	0 %	25 %	25 %	50 %	111025067
6500	NC_008269	TCA	2	6	272290	272295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111025067

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